RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602290.1

HCG18-241, Transcript of HLA complex group 18, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HCG18, Length 821 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCG18-241ENST00000602290 ZNF681Q96N22 645 aa9.91□□□□□ -0.82
HCG18-241ENST00000602290 FAIM2Q9BWQ8 316 aa9.91□□□□□ -0.82
HCG18-241ENST00000602290 SEC11CQ9BY50 192 aa9.91□□□□□ -0.82
HCG18-241ENST00000602290 TUBA4BQ9H853 241 aa9.91□□□□□ -0.82
HCG18-241ENST00000602290 DYNLRB1Q9NP97 96 aa9.91□□□□□ -0.82
HCG18-241ENST00000602290 GAR1Q9NY12 217 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
HCG18-241ENST00000602290 IGKV3D-15A0A087WSY6 115 aa9.9□□□□□ -0.82
HCG18-241ENST00000602290 MEX3AA1L020 520 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
HCG18-241ENST00000602290 NCF1BA6NI72 391 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
HCG18-241ENST00000602290 NCF1CA8MVU1 366 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
HCG18-241ENST00000602290 TMEM229AB2RXF0 380 aa9.9□□□□□ -0.82
HCG18-241ENST00000602290 LRRN3E7EW58 273 aa9.9□□□□□ -0.82
HCG18-241ENST00000602290 PRR23D1E9PI22 279 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
HCG18-241ENST00000602290 NPIPB9F8W1W9 429 aa9.9□□□□□ -0.82
HCG18-241ENST00000602290 K7EIL1 84 aa9.9□□□□□ -0.82
HCG18-241ENST00000602290 CSF1P09603 554 aa9.9□□□□□ -0.82
HCG18-241ENST00000602290 PRR23D2P0DMB1 279 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
HCG18-241ENST00000602290 ACP2P11117 423 aa9.9□□□□□ -0.82
HCG18-241ENST00000602290 NTF4P34130 210 aa9.9□□□□□ -0.82
HCG18-241ENST00000602290 CEACAM6P40199 344 aa9.9□□□□□ -0.82
HCG18-241ENST00000602290 CCR9P51686 369 aa9.9□□□□□ -0.82
HCG18-241ENST00000602290 HCCSP53701 268 aa9.9□□□□□ -0.82
HCG18-241ENST00000602290 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
HCG18-241ENST00000602290 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
HCG18-241ENST00000602290 MRPS11P82912 194 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
HCG18-241ENST00000602290 FABP5Q01469 135 aa9.9□□□□□ -0.82
HCG18-241ENST00000602290 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
HCG18-241ENST00000602290 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
HCG18-241ENST00000602290 ZNF345Q14585 488 aa9.9□□□□□ -0.82
HCG18-241ENST00000602290 SSX2Q16385 188 aa9.9□□□□□ -0.82
HCG18-241ENST00000602290 NKPD1Q17RQ9 610 aa9.9□□□□□ -0.82
HCG18-241ENST00000602290 GGTA1PQ4G0N0 100 aa9.9□□□□□ -0.82
HCG18-241ENST00000602290 TMEM255AQ5JRV8 349 aa9.9□□□□□ -0.82
HCG18-241ENST00000602290 NKAPLQ5M9Q1 402 aa9.9□□□□□ -0.82
HCG18-241ENST00000602290 ZNF626Q68DY1 528 aa9.9□□□□□ -0.82
HCG18-241ENST00000602290 ABLIM2Q6H8Q1 611 aa9.9□□□□□ -0.82
HCG18-241ENST00000602290 ZNF770Q6IQ21 691 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
HCG18-241ENST00000602290 LYPD4Q6UWN0 246 aa9.9□□□□□ -0.82
HCG18-241ENST00000602290 ALKAL2Q6UX46 152 aa9.9□□□□□ -0.82
HCG18-241ENST00000602290 ANGPTL5Q86XS5 388 aa9.9□□□□□ -0.82
HCG18-241ENST00000602290 SERPINA12Q8IW75 414 aa9.9□□□□□ -0.82
HCG18-241ENST00000602290 C10orf111Q8N326 155 aa9.9□□□□□ -0.82
HCG18-241ENST00000602290 POMGNT2Q8NAT1 580 aa9.9□□□□□ -0.82
HCG18-241ENST00000602290 ZNF485Q8NCK3 441 aa9.9□□□□□ -0.82
HCG18-241ENST00000602290 BEST4Q8NFU0 473 aa9.9□□□□□ -0.82
HCG18-241ENST00000602290 OR10K1Q8NGX5 313 aa9.9□□□□□ -0.82
HCG18-241ENST00000602290 RDH5Q92781 318 aa9.9□□□□□ -0.82
HCG18-241ENST00000602290 MALSU1Q96EH3 234 aa9.9□□□□□ -0.82
HCG18-241ENST00000602290 CNRIP1Q96F85 164 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
HCG18-241ENST00000602290 NEU1Q99519 415 aa9.9□□□□□ -0.82
HCG18-241ENST00000602290 C20orf85Q9H1P6 137 aa9.9□□□□□ -0.82
HCG18-241ENST00000602290 SLC6A13Q9NSD5 602 aa9.9□□□□□ -0.82
HCG18-241ENST00000602290 ACER3Q9NUN7 267 aa9.9□□□□□ -0.82
HCG18-241ENST00000602290 ABRACLQ9P1F3 81 aa9.9□□□□□ -0.82
HCG18-241ENST00000602290 RNF114Q9Y508 228 aa9.9□□□□□ -0.82
HCG18-241ENST00000602290 ENPP4Q9Y6X5 453 aa9.9□□□□□ -0.82
HCG18-241ENST00000602290 PPIAL4EA0A075B759 164 aa9.89□□□□□ -0.83
HCG18-241ENST00000602290 PPIAL4CA0A0B4J2A2 164 aa9.89□□□□□ -0.83
HCG18-241ENST00000602290 PPIAL4DF5H284 164 aa9.89□□□□□ -0.83
HCG18-241ENST00000602290 FOXE1O00358 373 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
HCG18-241ENST00000602290 MANBAO00462 879 aa9.89□□□□□ -0.83
HCG18-241ENST00000602290 FAAHO00519 579 aa9.89□□□□□ -0.83
HCG18-241ENST00000602290 CREBL2O60519 120 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
HCG18-241ENST00000602290 EIF4E2O60573 245 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
HCG18-241ENST00000602290 ERAL1O75616 437 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
HCG18-241ENST00000602290 STK16O75716 305 aa9.89□□□□□ -0.83
HCG18-241ENST00000602290 NCR1O76036 304 aa9.89□□□□□ -0.83
HCG18-241ENST00000602290 PPIAL4FP0DN26 164 aa9.89□□□□□ -0.83
HCG18-241ENST00000602290 PRG2P13727 222 aa9.89□□□□□ -0.83
HCG18-241ENST00000602290 CSNK2A2P19784 350 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
HCG18-241ENST00000602290 FPR3P25089 353 aa9.89□□□□□ -0.83
HCG18-241ENST00000602290 SDHAP31040 664 aa9.89□□□□□ -0.83
HCG18-241ENST00000602290 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
HCG18-241ENST00000602290 RAB5CP51148 216 aa9.89□□□□□ -0.83
HCG18-241ENST00000602290 RAC3P60763 192 aa9.89□□□□□ -0.83
HCG18-241ENST00000602290 RAB2AP61019 212 aa9.89□□□□□ -0.83
HCG18-241ENST00000602290 NAAAQ02083 359 aa9.89□□□□□ -0.83
HCG18-241ENST00000602290 HGFACQ04756 655 aa9.89□□□□□ -0.83
HCG18-241ENST00000602290 SLC3A1Q07837 685 aa9.89□□□□□ -0.83
HCG18-241ENST00000602290 FOXF1Q12946 379 aa9.89□□□□□ -0.83
HCG18-241ENST00000602290 SNTB2Q13425 540 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
HCG18-241ENST00000602290 PEA15Q15121 130 aa9.89□□□□□ -0.83
HCG18-241ENST00000602290 OXLD1Q5BKU9 147 aa9.89□□□□□ -0.83
HCG18-241ENST00000602290 ZNF311Q5JNZ3 666 aa9.89□□□□□ -0.83
HCG18-241ENST00000602290 ATPAF1Q5TC12 328 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
HCG18-241ENST00000602290 GRHL2Q6ISB3 625 aa9.89□□□□□ -0.83
HCG18-241ENST00000602290 LRRN1Q6UXK5 716 aa9.89□□□□□ -0.83
HCG18-241ENST00000602290 ZNF527Q8NB42 609 aa9.89□□□□□ -0.83
HCG18-241ENST00000602290 LINC01006Q8NI28 216 aa9.89□□□□□ -0.83
HCG18-241ENST00000602290 THAP6Q8TBB0 222 aa9.89□□□□□ -0.83
HCG18-241ENST00000602290 RXFP4Q8TDU9 374 aa9.89□□□□□ -0.83
HCG18-241ENST00000602290 C15orf40Q8WUR7 153 aa9.89□□□□□ -0.83
HCG18-241ENST00000602290 XAGE5Q8WWM1 108 aa9.89□□□□□ -0.83
HCG18-241ENST00000602290 EXOSC8Q96B26 276 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
HCG18-241ENST00000602290 APH1AQ96BI3 265 aa9.89□□□□□ -0.83
HCG18-241ENST00000602290 RAB39BQ96DA2 213 aa9.89□□□□□ -0.83
HCG18-241ENST00000602290 BOD1Q96IK1 185 aa9.89□□□□□ -0.83
HCG18-241ENST00000602290 PFDN5Q99471 154 aa9.89□□□□□ -0.83
HCG18-241ENST00000602290 CMSS1Q9BQ75 279 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
HCG18-241ENST00000602290 ARL6Q9H0F7 186 aa9.89□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59.7 ms