RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588815.5

CAPNS1-206, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,471 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-206ENST00000588815 C1QL1O75973 258 aa26.57■■□□□ 1.84
CAPNS1-206ENST00000588815 PTGFRP43088 359 aa26.57■■□□□ 1.84
CAPNS1-206ENST00000588815 PPP5CP53041 499 aa26.57■■□□□ 1.84
CAPNS1-206ENST00000588815 NCMAPQ5T1S8 102 aa26.57■■□□□ 1.84
CAPNS1-206ENST00000588815 CNIH2Q6PI25 160 aa26.57■■□□□ 1.84
CAPNS1-206ENST00000588815 CRIP3Q6Q6R5 217 aa26.57■■□□□ 1.84
CAPNS1-206ENST00000588815 OR8G5Q8NG78 346 aa26.57■■□□□ 1.84
CAPNS1-206ENST00000588815 SYNPRQ8TBG9 265 aa26.57■■□□□ 1.84
CAPNS1-206ENST00000588815 ITPKCQ96DU7 683 aa26.57■■□□□ 1.84
CAPNS1-206ENST00000588815 PLCE1Q9P212 2302 aa26.57■■□□□ 1.84
CAPNS1-206ENST00000588815 FAM230AA0A1W2PPH8 454 aa26.56■■□□□ 1.84
CAPNS1-206ENST00000588815 FABP12A6NFH5 140 aa26.56■■□□□ 1.84
CAPNS1-206ENST00000588815 LDLRAD4O15165 306 aa26.56■■□□□ 1.84
CAPNS1-206ENST00000588815 EIF4EP06730 217 aaKnown RBP26.56■■□□□ 1.84
CAPNS1-206ENST00000588815 NAT2P11245 290 aa26.56■■□□□ 1.84
CAPNS1-206ENST00000588815 RAB6AP20340 208 aa26.56■■□□□ 1.84
CAPNS1-206ENST00000588815 OR2W3Q7Z3T1 314 aa26.56■■□□□ 1.84
CAPNS1-206ENST00000588815 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP26.56■■□□□ 1.84
CAPNS1-206ENST00000588815 TMEM171Q8WVE6 324 aa26.56■■□□□ 1.84
CAPNS1-206ENST00000588815 BORCS5Q969J3 196 aa26.56■■□□□ 1.84
CAPNS1-206ENST00000588815 RHBDL2Q9NX52 303 aa26.56■■□□□ 1.84
CAPNS1-206ENST00000588815 PQLC2LA1A4F0 135 aa26.55■■□□□ 1.84
CAPNS1-206ENST00000588815 FABP6P51161 128 aa26.55■■□□□ 1.84
CAPNS1-206ENST00000588815 FAM189A2Q15884 450 aa26.55■■□□□ 1.84
CAPNS1-206ENST00000588815 BAIAP2L2Q6UXY1 529 aa26.55■■□□□ 1.84
CAPNS1-206ENST00000588815 OR5P3Q8WZ94 311 aa26.55■■□□□ 1.84
CAPNS1-206ENST00000588815 S100A16Q96FQ6 103 aaKnown RBP26.55■■□□□ 1.84
CAPNS1-206ENST00000588815 S100A13Q99584 98 aa26.55■■□□□ 1.84
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF442Q9H7R0 627 aa26.55■■□□□ 1.84
CAPNS1-206ENST00000588815 EXTL2Q9UBQ6 330 aa26.55■■□□□ 1.84
CAPNS1-206ENST00000588815 V9GYH0 126 aa26.55■■□□□ 1.84
CAPNS1-206ENST00000588815 TMEM272A0A1B0GTI8 110 aa26.55■■□□□ 1.84
CAPNS1-206ENST00000588815 TIMM8AO60220 97 aaPredicted RBP26.55■■□□□ 1.84
CAPNS1-206ENST00000588815 IGHV3-13P01766 116 aa26.55■■□□□ 1.84
CAPNS1-206ENST00000588815 GRNP28799 593 aaKnown RBP26.55■■□□□ 1.84
CAPNS1-206ENST00000588815 OR3A4PP47883 348 aa26.55■■□□□ 1.84
CAPNS1-206ENST00000588815 SELENOVP59797 346 aa26.55■■□□□ 1.84
CAPNS1-206ENST00000588815 ZP1P60852 638 aa26.55■■□□□ 1.84
CAPNS1-206ENST00000588815 HPSE2Q8WWQ2 592 aa26.55■■□□□ 1.84
CAPNS1-206ENST00000588815 SLC25A38Q96DW6 304 aa26.55■■□□□ 1.84
CAPNS1-206ENST00000588815 SOSTQ9BQB4 213 aa26.55■■□□□ 1.84
CAPNS1-206ENST00000588815 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP26.54■■□□□ 1.84
CAPNS1-206ENST00000588815 IGLV3-9A0A075B6K5 115 aa26.54■■□□□ 1.84
CAPNS1-206ENST00000588815 TPPPO94811 219 aa26.54■■□□□ 1.84
CAPNS1-206ENST00000588815 NR4A2P43354 598 aa26.54■■□□□ 1.84
CAPNS1-206ENST00000588815 KLF3P57682 345 aaPredicted RBP26.54■■□□□ 1.84
CAPNS1-206ENST00000588815 BEX5Q5H9J7 111 aa26.54■■□□□ 1.84
CAPNS1-206ENST00000588815 DMRTC1Q5HYR2 192 aa26.54■■□□□ 1.84
CAPNS1-206ENST00000588815 SLC22A25Q6T423 547 aa26.54■■□□□ 1.84
CAPNS1-206ENST00000588815 GLIPR1L1Q6UWM5 242 aa26.54■■□□□ 1.84
CAPNS1-206ENST00000588815 FAM131AQ6UXB0 335 aa26.54■■□□□ 1.84
CAPNS1-206ENST00000588815 LINC01560Q8TB33 94 aa26.54■■□□□ 1.84
CAPNS1-206ENST00000588815 TNFAIP8L1Q8WVP5 186 aa26.54■■□□□ 1.84
CAPNS1-206ENST00000588815 MICU1Q9BPX6 476 aa26.54■■□□□ 1.84
CAPNS1-206ENST00000588815 PPP1R3EQ9H7J1 279 aa26.54■■□□□ 1.84
CAPNS1-206ENST00000588815 PALMDQ9NP74 551 aa26.54■■□□□ 1.84
CAPNS1-206ENST00000588815 TMEM100Q9NV29 134 aa26.54■■□□□ 1.84
CAPNS1-206ENST00000588815 CRIM1Q9NZV1 1036 aa26.54■■□□□ 1.84
CAPNS1-206ENST00000588815 RAB22AQ9UL26 194 aa26.54■■□□□ 1.84
CAPNS1-206ENST00000588815 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa26.53■■□□□ 1.84
CAPNS1-206ENST00000588815 VSTM5A8MXK1 200 aa26.53■■□□□ 1.84
CAPNS1-206ENST00000588815 LILRA1O75019 489 aa26.53■■□□□ 1.84
CAPNS1-206ENST00000588815 CA6P23280 308 aa26.53■■□□□ 1.84
CAPNS1-206ENST00000588815 GNG3P63215 75 aa26.53■■□□□ 1.84
CAPNS1-206ENST00000588815 CMTM4Q8IZR5 234 aa26.53■■□□□ 1.84
CAPNS1-206ENST00000588815 SPERTQ8NA61 448 aa26.53■■□□□ 1.84
CAPNS1-206ENST00000588815 ZSCAN4Q8NAM6 433 aaPredicted RBP26.53■■□□□ 1.84
CAPNS1-206ENST00000588815 PXT1Q8NFP0 134 aa26.53■■□□□ 1.84
CAPNS1-206ENST00000588815 KCNG3Q8TAE7 436 aa26.53■■□□□ 1.84
CAPNS1-206ENST00000588815 NKX3-1Q99801 234 aaPredicted RBP26.53■■□□□ 1.84
CAPNS1-206ENST00000588815 RTL8AQ9BWD3 113 aa26.53■■□□□ 1.84
CAPNS1-206ENST00000588815 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa26.52■■□□□ 1.84
CAPNS1-206ENST00000588815 A0A1B0GWJ7 208 aa26.52■■□□□ 1.84
CAPNS1-206ENST00000588815 QRFPP83859 136 aa26.52■■□□□ 1.84
CAPNS1-206ENST00000588815 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP26.52■■□□□ 1.84
CAPNS1-206ENST00000588815 GPR176Q14439 515 aa26.52■■□□□ 1.84
CAPNS1-206ENST00000588815 ASCL4Q6XD76 172 aa26.52■■□□□ 1.84
CAPNS1-206ENST00000588815 RNF144BQ7Z419 303 aa26.52■■□□□ 1.84
CAPNS1-206ENST00000588815 CDH24Q86UP0 819 aa26.52■■□□□ 1.84
CAPNS1-206ENST00000588815 OR8S1Q8NH09 359 aa26.52■■□□□ 1.84
CAPNS1-206ENST00000588815 RFT1Q96AA3 541 aa26.52■■□□□ 1.84
CAPNS1-206ENST00000588815 RNF170Q96K19 258 aa26.52■■□□□ 1.84
CAPNS1-206ENST00000588815 C1orf147Q96MC9 270 aaPredicted RBP26.52■■□□□ 1.84
CAPNS1-206ENST00000588815 CST11Q9H112 138 aa26.52■■□□□ 1.84
CAPNS1-206ENST00000588815 CA10Q9NS85 328 aa26.52■■□□□ 1.84
CAPNS1-206ENST00000588815 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP26.52■■□□□ 1.84
CAPNS1-206ENST00000588815 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP26.51■■□□□ 1.83
CAPNS1-206ENST00000588815 TMEM14DPA8MWL7 114 aa26.51■■□□□ 1.83
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF780AO75290 641 aaPredicted RBP26.51■■□□□ 1.83
CAPNS1-206ENST00000588815 MMP15P51511 669 aa26.51■■□□□ 1.83
CAPNS1-206ENST00000588815 ALKBH6Q3KRA9 238 aa26.51■■□□□ 1.83
CAPNS1-206ENST00000588815 OR4M1Q8NGD0 313 aa26.51■■□□□ 1.83
CAPNS1-206ENST00000588815 OR13G1Q8NGZ3 307 aa26.51■■□□□ 1.83
CAPNS1-206ENST00000588815 PLPPR2Q96GM1 343 aa26.51■■□□□ 1.83
CAPNS1-206ENST00000588815 ADAT1Q9BUB4 502 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.83
CAPNS1-206ENST00000588815 PCDHB16Q9NRJ7 776 aa26.51■■□□□ 1.83
CAPNS1-206ENST00000588815 A0A0A6YYH2 397 aa26.5■■□□□ 1.83
CAPNS1-206ENST00000588815 A6NJ64 397 aa26.5■■□□□ 1.83
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF732B4DXR9 585 aa26.5■■□□□ 1.83
CAPNS1-206ENST00000588815 SCGNO76038 276 aa26.5■■□□□ 1.83
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