RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583254.1

CTC1-211, Transcript of CST telomere replication complex component 1, humanhuman

TSL 2

Gene CTC1, Length 469 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTC1-211ENST00000583254 OR2AT4A6NND4 320 aa5.55□□□□□ -1.52
CTC1-211ENST00000583254 ANKRD30BLA7E2S9 258 aa5.55□□□□□ -1.52
CTC1-211ENST00000583254 FAM90A22PA8MWA6 464 aa5.55□□□□□ -1.52
CTC1-211ENST00000583254 CCL24O00175 119 aa5.55□□□□□ -1.52
CTC1-211ENST00000583254 CXCR6O00574 342 aa5.55□□□□□ -1.52
CTC1-211ENST00000583254 DYNC1I1O14576 645 aa5.55□□□□□ -1.52
CTC1-211ENST00000583254 AHCYL1O43865 530 aa5.55□□□□□ -1.52
CTC1-211ENST00000583254 SNX3O60493 162 aa5.55□□□□□ -1.52
CTC1-211ENST00000583254 CD14P08571 375 aa5.55□□□□□ -1.52
CTC1-211ENST00000583254 HCKP08631 526 aa5.55□□□□□ -1.52
CTC1-211ENST00000583254 MYF6P23409 242 aa5.55□□□□□ -1.52
CTC1-211ENST00000583254 CD24P25063 80 aa5.55□□□□□ -1.52
CTC1-211ENST00000583254 IFNA8P32881 189 aa5.55□□□□□ -1.52
CTC1-211ENST00000583254 YAP1P46937 504 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
CTC1-211ENST00000583254 OR3A4PP47883 348 aa5.55□□□□□ -1.52
CTC1-211ENST00000583254 CRYBA2P53672 197 aa5.55□□□□□ -1.52
CTC1-211ENST00000583254 TPTEP56180 551 aa5.55□□□□□ -1.52
CTC1-211ENST00000583254 PSME3P61289 254 aa5.55□□□□□ -1.52
CTC1-211ENST00000583254 RPL31P62899 125 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
CTC1-211ENST00000583254 SPIBQ01892 262 aa5.55□□□□□ -1.52
CTC1-211ENST00000583254 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
CTC1-211ENST00000583254 ZNF273Q14593 569 aa5.55□□□□□ -1.52
CTC1-211ENST00000583254 RFX4Q33E94 735 aa5.55□□□□□ -1.52
CTC1-211ENST00000583254 ZNF260Q3ZCT1 412 aa5.55□□□□□ -1.52
CTC1-211ENST00000583254 ZNF626Q68DY1 528 aa5.55□□□□□ -1.52
CTC1-211ENST00000583254 SLC18B1Q6NT16 456 aa5.55□□□□□ -1.52
CTC1-211ENST00000583254 C16orf89Q6UX73 402 aa5.55□□□□□ -1.52
CTC1-211ENST00000583254 PTCHD4Q6ZW05 846 aa5.55□□□□□ -1.52
CTC1-211ENST00000583254 FKBP9P1Q75LS8 142 aa5.55□□□□□ -1.52
CTC1-211ENST00000583254 FAM122BQ7Z309 247 aa5.55□□□□□ -1.52
CTC1-211ENST00000583254 TSEN54Q7Z6J9 526 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
CTC1-211ENST00000583254 OAFQ86UD1 273 aa5.55□□□□□ -1.52
CTC1-211ENST00000583254 OR6V1Q8N148 313 aa5.55□□□□□ -1.52
CTC1-211ENST00000583254 SLC26A10Q8NG04 563 aa5.55□□□□□ -1.52
CTC1-211ENST00000583254 OR4M1Q8NGD0 313 aa5.55□□□□□ -1.52
CTC1-211ENST00000583254 GATAD1Q8WUU5 269 aa5.55□□□□□ -1.52
CTC1-211ENST00000583254 CAPSLQ8WWF8 208 aa5.55□□□□□ -1.52
CTC1-211ENST00000583254 LZICQ8WZA0 190 aa5.55□□□□□ -1.52
CTC1-211ENST00000583254 RPL3LQ92901 407 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
CTC1-211ENST00000583254 FAM162AQ96A26 154 aa5.55□□□□□ -1.52
CTC1-211ENST00000583254 TSSK2Q96PF2 358 aa5.55□□□□□ -1.52
CTC1-211ENST00000583254 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
CTC1-211ENST00000583254 SLC25A33Q9BSK2 321 aa5.55□□□□□ -1.52
CTC1-211ENST00000583254 NUAK2Q9H093 628 aa5.55□□□□□ -1.52
CTC1-211ENST00000583254 TLNRD1Q9H1K6 362 aa5.55□□□□□ -1.52
CTC1-211ENST00000583254 VNN3Q9NY84 501 aa5.55□□□□□ -1.52
CTC1-211ENST00000583254 USE1Q9NZ43 259 aa5.55□□□□□ -1.52
CTC1-211ENST00000583254 NLKQ9UBE8 527 aa5.55□□□□□ -1.52
CTC1-211ENST00000583254 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa5.55□□□□□ -1.52
CTC1-211ENST00000583254 IGLV1-36A0A0B4J1U3 117 aa5.54□□□□□ -1.52
CTC1-211ENST00000583254 hCG_1809904A0A1W2PP81 198 aa5.54□□□□□ -1.52
CTC1-211ENST00000583254 A0A1W2PPE2 198 aa5.54□□□□□ -1.52
CTC1-211ENST00000583254 A0A1W2PPH5 198 aa5.54□□□□□ -1.52
CTC1-211ENST00000583254 A0A1W2PR64 198 aa5.54□□□□□ -1.52
CTC1-211ENST00000583254 A0A1W2PRV1 198 aa5.54□□□□□ -1.52
CTC1-211ENST00000583254 EFCAB9A8MZ26 197 aa5.54□□□□□ -1.52
CTC1-211ENST00000583254 DCTN6O00399 190 aa5.54□□□□□ -1.52
CTC1-211ENST00000583254 NME4O00746 187 aa5.54□□□□□ -1.52
CTC1-211ENST00000583254 SOCS2O14508 198 aa5.54□□□□□ -1.52
CTC1-211ENST00000583254 NDUFAB1O14561 156 aa5.54□□□□□ -1.52
CTC1-211ENST00000583254 GMNNO75496 209 aa5.54□□□□□ -1.52
CTC1-211ENST00000583254 TIPRLO75663 272 aa5.54□□□□□ -1.52
CTC1-211ENST00000583254 AMY1AP04745 511 aa5.54□□□□□ -1.52
CTC1-211ENST00000583254 AMY2AP04746 511 aa5.54□□□□□ -1.52
CTC1-211ENST00000583254 PGA5P0DJD9 388 aa5.54□□□□□ -1.52
CTC1-211ENST00000583254 NCK1P16333 377 aa5.54□□□□□ -1.52
CTC1-211ENST00000583254 PRDX6P30041 224 aa5.54□□□□□ -1.52
CTC1-211ENST00000583254 SLC6A1P30531 599 aa5.54□□□□□ -1.52
CTC1-211ENST00000583254 GNALP38405 381 aa5.54□□□□□ -1.52
CTC1-211ENST00000583254 OR12D2P58182 307 aa5.54□□□□□ -1.52
CTC1-211ENST00000583254 SELENOWP63302 87 aa5.54□□□□□ -1.52
CTC1-211ENST00000583254 TMEM200BQ69YZ2 307 aa5.54□□□□□ -1.52
CTC1-211ENST00000583254 ZNF770Q6IQ21 691 aaPredicted RBP5.54□□□□□ -1.52
CTC1-211ENST00000583254 PGM2L1Q6PCE3 622 aa5.54□□□□□ -1.52
CTC1-211ENST00000583254 HACD2Q6Y1H2 254 aa5.54□□□□□ -1.52
CTC1-211ENST00000583254 TMPRSS11FQ6ZWK6 438 aa5.54□□□□□ -1.52
CTC1-211ENST00000583254 C16orf82Q7Z2V1 217 aa5.54□□□□□ -1.52
CTC1-211ENST00000583254 VTCN1Q7Z7D3 282 aa5.54□□□□□ -1.52
CTC1-211ENST00000583254 EGFL6Q8IUX8 553 aa5.54□□□□□ -1.52
CTC1-211ENST00000583254 ZNF695Q8IW36 515 aa5.54□□□□□ -1.52
CTC1-211ENST00000583254 NRMQ8IXM6 262 aa5.54□□□□□ -1.52
CTC1-211ENST00000583254 RNF148Q8N7C7 305 aa5.54□□□□□ -1.52
CTC1-211ENST00000583254 OR13D1Q8NGV5 346 aa5.54□□□□□ -1.52
CTC1-211ENST00000583254 OR10Z1Q8NGY1 313 aa5.54□□□□□ -1.52
CTC1-211ENST00000583254 OR4Q3Q8NH05 313 aa5.54□□□□□ -1.52
CTC1-211ENST00000583254 NDNFQ8TB73 568 aa5.54□□□□□ -1.52
CTC1-211ENST00000583254 LINC00476Q8WZB0 136 aa5.54□□□□□ -1.52
CTC1-211ENST00000583254 AKR1E2Q96JD6 320 aa5.54□□□□□ -1.52
CTC1-211ENST00000583254 NOL4LQ96MY1 436 aaPredicted RBP5.54□□□□□ -1.52
CTC1-211ENST00000583254 LIN7BQ9HAP6 207 aa5.54□□□□□ -1.52
CTC1-211ENST00000583254 ZNF222Q9UK12 451 aa5.54□□□□□ -1.52
CTC1-211ENST00000583254 LRP12Q9Y561 859 aa5.54□□□□□ -1.52
CTC1-211ENST00000583254 N6AMT1Q9Y5N5 214 aa5.54□□□□□ -1.52
CTC1-211ENST00000583254 LYVE1Q9Y5Y7 322 aa5.54□□□□□ -1.52
CTC1-211ENST00000583254 SORL1Q92673 2214 aa5.54□□□□□ -1.52
CTC1-211ENST00000583254 MEX3AA1L020 520 aaKnown RBP5.53□□□□□ -1.52
CTC1-211ENST00000583254 PRR23D1E9PI22 279 aaPredicted RBP5.53□□□□□ -1.52
CTC1-211ENST00000583254 CDC42EP2O14613 210 aa5.53□□□□□ -1.52
CTC1-211ENST00000583254 DCTN3O75935 186 aa5.53□□□□□ -1.52
CTC1-211ENST00000583254 SERPINA1P01009 418 aa5.53□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.5 ms