RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574205.5

CTDNEP1-209, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDNEP1, Length 1,506 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-209ENST00000574205 C1orf87Q8N0U7 546 aa27.91■■■□□ 2.06
CTDNEP1-209ENST00000574205 OR11L1Q8NGX0 322 aa27.91■■■□□ 2.06
CTDNEP1-209ENST00000574205 FGF23Q9GZV9 251 aaPredicted RBP27.91■■■□□ 2.06
CTDNEP1-209ENST00000574205 GPR173Q9NS66 373 aa27.91■■■□□ 2.06
CTDNEP1-209ENST00000574205 LSM2Q9Y333 95 aaKnown RBP27.91■■■□□ 2.06
CTDNEP1-209ENST00000574205 WIPI2Q9Y4P8 454 aa27.91■■■□□ 2.06
CTDNEP1-209ENST00000574205 A6NLC8 198 aa27.9■■■□□ 2.06
CTDNEP1-209ENST00000574205 SERPINA3P01011 423 aa27.9■■■□□ 2.06
CTDNEP1-209ENST00000574205 IRF2P14316 349 aa27.9■■■□□ 2.06
CTDNEP1-209ENST00000574205 GNG3P63215 75 aa27.9■■■□□ 2.06
CTDNEP1-209ENST00000574205 KCTD8Q6ZWB6 473 aa27.9■■■□□ 2.06
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZFP41Q8N8Y5 198 aa27.9■■■□□ 2.06
CTDNEP1-209ENST00000574205 FGGYQ96C11 551 aa27.9■■■□□ 2.06
CTDNEP1-209ENST00000574205 ADAT3Q96EY9 351 aaPredicted RBP27.9■■■□□ 2.06
CTDNEP1-209ENST00000574205 TECTBQ96PL2 329 aa27.9■■■□□ 2.06
CTDNEP1-209ENST00000574205 TLNRD1Q9H1K6 362 aa27.9■■■□□ 2.06
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF281Q9Y2X9 895 aa27.9■■■□□ 2.06
CTDNEP1-209ENST00000574205 NPTNQ9Y639 398 aa27.9■■■□□ 2.06
CTDNEP1-209ENST00000574205 GATBO75879 557 aaKnown RBP27.89■■■□□ 2.06
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF20P17024 532 aa27.89■■■□□ 2.06
CTDNEP1-209ENST00000574205 GPM6AP51674 278 aa27.89■■■□□ 2.06
CTDNEP1-209ENST00000574205 DOC2BQ14184 412 aa27.89■■■□□ 2.06
CTDNEP1-209ENST00000574205 DMRTC1Q5HYR2 192 aa27.89■■■□□ 2.06
CTDNEP1-209ENST00000574205 GPR148Q8TDV2 347 aa27.89■■■□□ 2.06
CTDNEP1-209ENST00000574205 OR5M11Q96RB7 305 aa27.89■■■□□ 2.06
CTDNEP1-209ENST00000574205 MED13LQ71F56 2210 aa27.89■■■□□ 2.05
CTDNEP1-209ENST00000574205 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa27.88■■■□□ 2.05
CTDNEP1-209ENST00000574205 FOSL1P15407 271 aa27.88■■■□□ 2.05
CTDNEP1-209ENST00000574205 RBMXP38159 391 aaKnown RBP27.88■■■□□ 2.05
CTDNEP1-209ENST00000574205 MED22Q15528 200 aa27.88■■■□□ 2.05
CTDNEP1-209ENST00000574205 AVPI1Q5T686 147 aa27.88■■■□□ 2.05
CTDNEP1-209ENST00000574205 MAPK1IP1LQ8NDC0 245 aa27.88■■■□□ 2.05
CTDNEP1-209ENST00000574205 GHSRQ92847 366 aa27.88■■■□□ 2.05
CTDNEP1-209ENST00000574205 PGLYRP3Q96LB9 341 aa27.88■■■□□ 2.05
CTDNEP1-209ENST00000574205 C1orf123Q9NWV4 160 aa27.88■■■□□ 2.05
CTDNEP1-209ENST00000574205 DHDHQ9UQ10 334 aa27.88■■■□□ 2.05
CTDNEP1-209ENST00000574205 LRRC42Q9Y546 428 aa27.88■■■□□ 2.05
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF732B4DXR9 585 aa27.87■■■□□ 2.05
CTDNEP1-209ENST00000574205 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP27.87■■■□□ 2.05
CTDNEP1-209ENST00000574205 PLPP2O43688 288 aa27.87■■■□□ 2.05
CTDNEP1-209ENST00000574205 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP27.87■■■□□ 2.05
CTDNEP1-209ENST00000574205 CYB5R3P00387 301 aaPredicted RBP27.87■■■□□ 2.05
CTDNEP1-209ENST00000574205 TSEN15Q8WW01 171 aaKnown RBP27.87■■■□□ 2.05
CTDNEP1-209ENST00000574205 RGP1Q92546 391 aaPredicted RBP27.87■■■□□ 2.05
CTDNEP1-209ENST00000574205 RNF7Q9UBF6 113 aa27.87■■■□□ 2.05
CTDNEP1-209ENST00000574205 CELP19835 753 aa27.87■■■□□ 2.05
CTDNEP1-209ENST00000574205 UBE2V2Q15819 145 aa27.87■■■□□ 2.05
CTDNEP1-209ENST00000574205 UTS2BQ765I0 119 aa27.87■■■□□ 2.05
CTDNEP1-209ENST00000574205 C11orf53Q8IXP5 236 aa27.87■■■□□ 2.05
CTDNEP1-209ENST00000574205 PNMA8CA0A1B0GUJ8 204 aa27.86■■■□□ 2.05
CTDNEP1-209ENST00000574205 LRP5LA4QPB2 252 aa27.86■■■□□ 2.05
CTDNEP1-209ENST00000574205 CD1AP06126 327 aa27.86■■■□□ 2.05
CTDNEP1-209ENST00000574205 INHBBP09529 407 aa27.86■■■□□ 2.05
CTDNEP1-209ENST00000574205 CHN2P52757 468 aa27.86■■■□□ 2.05
CTDNEP1-209ENST00000574205 BTG1P62324 171 aa27.86■■■□□ 2.05
CTDNEP1-209ENST00000574205 TBCEQ15813 527 aaPredicted RBP27.86■■■□□ 2.05
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF826PQ6ZT77 177 aa27.86■■■□□ 2.05
CTDNEP1-209ENST00000574205 SLC7A11Q9UPY5 501 aa27.86■■■□□ 2.05
CTDNEP1-209ENST00000574205 hCG_1807616A0A1W2PRN6 198 aa27.85■■■□□ 2.05
CTDNEP1-209ENST00000574205 YIF1BQ5BJH7 314 aa27.85■■■□□ 2.05
CTDNEP1-209ENST00000574205 OR51I2Q9H344 312 aa27.85■■■□□ 2.05
CTDNEP1-209ENST00000574205 CDIPTO14735 213 aa27.84■■■□□ 2.05
CTDNEP1-209ENST00000574205 IGHV2-70P01814 119 aa27.84■■■□□ 2.05
CTDNEP1-209ENST00000574205 WDR82Q6UXN9 313 aa27.84■■■□□ 2.05
CTDNEP1-209ENST00000574205 SERPINA12Q8IW75 414 aa27.84■■■□□ 2.05
CTDNEP1-209ENST00000574205 PARP16Q8N5Y8 322 aa27.84■■■□□ 2.05
CTDNEP1-209ENST00000574205 SCCPDHQ8NBX0 429 aa27.84■■■□□ 2.05
CTDNEP1-209ENST00000574205 RPL3LQ92901 407 aaKnown RBP27.84■■■□□ 2.05
CTDNEP1-209ENST00000574205 YLPM1P49750 1951 aaKnown RBP27.83■■■□□ 2.05
CTDNEP1-209ENST00000574205 ISPDA4D126 451 aa27.83■■■□□ 2.05
CTDNEP1-209ENST00000574205 WNT9BO14905 357 aa27.83■■■□□ 2.05
CTDNEP1-209ENST00000574205 FSTL3O95633 263 aa27.83■■■□□ 2.05
CTDNEP1-209ENST00000574205 CD2P06729 351 aa27.83■■■□□ 2.05
CTDNEP1-209ENST00000574205 CFHR2P36980 270 aa27.83■■■□□ 2.05
CTDNEP1-209ENST00000574205 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP27.83■■■□□ 2.05
CTDNEP1-209ENST00000574205 NARFLQ9H6Q4 476 aa27.83■■■□□ 2.05
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZANQ9Y493 2812 aa27.83■■■□□ 2.05
CTDNEP1-209ENST00000574205 PQLC2LA1A4F0 135 aa27.82■■■□□ 2.04
CTDNEP1-209ENST00000574205 OCM2P0CE71 109 aa27.82■■■□□ 2.04
CTDNEP1-209ENST00000574205 MAP2K4P45985 399 aa27.82■■■□□ 2.04
CTDNEP1-209ENST00000574205 CLDND2Q8NHS1 167 aa27.82■■■□□ 2.04
CTDNEP1-209ENST00000574205 SOX2P48431 317 aa27.82■■■□□ 2.04
CTDNEP1-209ENST00000574205 FUT6P51993 359 aa27.82■■■□□ 2.04
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZMYND11Q15326 602 aa27.82■■■□□ 2.04
CTDNEP1-209ENST00000574205 LRRC28Q86X40 367 aaPredicted RBP27.82■■■□□ 2.04
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF573Q86YE8 665 aa27.82■■■□□ 2.04
CTDNEP1-209ENST00000574205 GCSAMQ8N6F7 178 aa27.82■■■□□ 2.04
CTDNEP1-209ENST00000574205 OR5D14Q8NGL3 314 aa27.82■■■□□ 2.04
CTDNEP1-209ENST00000574205 TRMT10AQ8TBZ6 339 aaKnown RBP27.82■■■□□ 2.04
CTDNEP1-209ENST00000574205 NPRL2Q8WTW4 380 aa27.82■■■□□ 2.04
CTDNEP1-209ENST00000574205 TMEM106AQ96A25 262 aa27.82■■■□□ 2.04
CTDNEP1-209ENST00000574205 ISYNA1Q9NPH2 558 aa27.82■■■□□ 2.04
CTDNEP1-209ENST00000574205 PPIAL4EA0A075B759 164 aa27.81■■■□□ 2.04
CTDNEP1-209ENST00000574205 PPIAL4DF5H284 164 aa27.81■■■□□ 2.04
CTDNEP1-209ENST00000574205 PPIAL4FP0DN26 164 aa27.81■■■□□ 2.04
CTDNEP1-209ENST00000574205 MDH2P40926 338 aaKnown RBP27.81■■■□□ 2.04
CTDNEP1-209ENST00000574205 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP27.81■■■□□ 2.04
CTDNEP1-209ENST00000574205 MUC20Q8N307 709 aaPredicted RBP27.81■■■□□ 2.04
CTDNEP1-209ENST00000574205 DNAAF1Q8NEP3 725 aa27.81■■■□□ 2.04
CTDNEP1-209ENST00000574205 GAL3ST1Q99999 423 aa27.81■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.6 ms