RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559202.1

TMOD3-206, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 3

Gene TMOD3, Length 413 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-206ENST00000559202 TFPTP0C1Z6 253 aa2.19□□□□□ -2.06
TMOD3-206ENST00000559202 PABPC4LP0CB38 370 aaKnown RBP2.19□□□□□ -2.06
TMOD3-206ENST00000559202 UBTFL6P0CB48 400 aaPredicted RBP2.19□□□□□ -2.06
TMOD3-206ENST00000559202 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP2.19□□□□□ -2.06
TMOD3-206ENST00000559202 DBTP11182 482 aaKnown RBP2.19□□□□□ -2.06
TMOD3-206ENST00000559202 CD99P14209 185 aa2.19□□□□□ -2.06
TMOD3-206ENST00000559202 ZNF44P15621 663 aa2.19□□□□□ -2.06
TMOD3-206ENST00000559202 GPX2P18283 190 aa2.19□□□□□ -2.06
TMOD3-206ENST00000559202 ELK4P28324 431 aa2.19□□□□□ -2.06
TMOD3-206ENST00000559202 RBMXP38159 391 aaKnown RBP2.19□□□□□ -2.06
TMOD3-206ENST00000559202 CRATP43155 626 aa2.19□□□□□ -2.06
TMOD3-206ENST00000559202 SLC6A8P48029 635 aa2.19□□□□□ -2.06
TMOD3-206ENST00000559202 CCR4P51679 360 aa2.19□□□□□ -2.06
TMOD3-206ENST00000559202 CRISP3P54108 245 aa2.19□□□□□ -2.06
TMOD3-206ENST00000559202 DSTNP60981 165 aa2.19□□□□□ -2.06
TMOD3-206ENST00000559202 GNGT1P63211 74 aa2.19□□□□□ -2.06
TMOD3-206ENST00000559202 CSNK2BP67870 215 aa2.19□□□□□ -2.06
TMOD3-206ENST00000559202 HPCAP84074 193 aa2.19□□□□□ -2.06
TMOD3-206ENST00000559202 SRYQ05066 204 aa2.19□□□□□ -2.06
TMOD3-206ENST00000559202 PJVKQ0ZLH3 352 aa2.19□□□□□ -2.06
TMOD3-206ENST00000559202 SELENBP1Q13228 472 aa2.19□□□□□ -2.06
TMOD3-206ENST00000559202 CAPRIN1Q14444 709 aaKnown RBP2.19□□□□□ -2.06
TMOD3-206ENST00000559202 SLC10A1Q14973 349 aa2.19□□□□□ -2.06
TMOD3-206ENST00000559202 P2RY14Q15391 338 aa2.19□□□□□ -2.06
TMOD3-206ENST00000559202 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa2.19□□□□□ -2.06
TMOD3-206ENST00000559202 TRMT5Q32P41 509 aaKnown RBP2.19□□□□□ -2.06
TMOD3-206ENST00000559202 ANKRD55Q3KP44 614 aa2.19□□□□□ -2.06
TMOD3-206ENST00000559202 LIN52Q52LA3 116 aa2.19□□□□□ -2.06
TMOD3-206ENST00000559202 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP2.19□□□□□ -2.06
TMOD3-206ENST00000559202 HSP90B2PQ58FF3 399 aa2.19□□□□□ -2.06
TMOD3-206ENST00000559202 WLSQ5T9L3 541 aa2.19□□□□□ -2.06
TMOD3-206ENST00000559202 LCN1P1Q5VSP4 162 aa2.19□□□□□ -2.06
TMOD3-206ENST00000559202 RAET1LQ5VY80 246 aa2.19□□□□□ -2.06
TMOD3-206ENST00000559202 TTC23Q5W5X9 447 aa2.19□□□□□ -2.06
TMOD3-206ENST00000559202 C3orf33Q6P1S2 294 aa2.19□□□□□ -2.06
TMOD3-206ENST00000559202 NIPAL3Q6P499 406 aa2.19□□□□□ -2.06
TMOD3-206ENST00000559202 METAP1DQ6UB28 335 aaPredicted RBP2.19□□□□□ -2.06
TMOD3-206ENST00000559202 LRRC74BQ6ZQY2 392 aa2.19□□□□□ -2.06
TMOD3-206ENST00000559202 ZNF621Q6ZSS3 439 aa2.19□□□□□ -2.06
TMOD3-206ENST00000559202 RFPL4BQ6ZWI9 263 aa2.19□□□□□ -2.06
TMOD3-206ENST00000559202 CALHM3Q86XJ0 350 aa2.19□□□□□ -2.06
TMOD3-206ENST00000559202 CCDC71Q8IV32 467 aaPredicted RBP2.19□□□□□ -2.06
TMOD3-206ENST00000559202 CENPSQ8N2Z9 138 aa2.19□□□□□ -2.06
TMOD3-206ENST00000559202 GTPBP8Q8N3Z3 284 aaPredicted RBP2.19□□□□□ -2.06
TMOD3-206ENST00000559202 TRIML2Q8N7C3 387 aa2.19□□□□□ -2.06
TMOD3-206ENST00000559202 TMEM99Q8N816 258 aa2.19□□□□□ -2.06
TMOD3-206ENST00000559202 LRTM2Q8N967 370 aa2.19□□□□□ -2.06
TMOD3-206ENST00000559202 GPR32P1Q8NGA4 272 aa2.19□□□□□ -2.06
TMOD3-206ENST00000559202 OR4D11Q8NGI4 311 aa2.19□□□□□ -2.06
TMOD3-206ENST00000559202 OR8J1Q8NGP2 316 aa2.19□□□□□ -2.06
TMOD3-206ENST00000559202 OR52J3Q8NH60 311 aa2.19□□□□□ -2.06
TMOD3-206ENST00000559202 OR5W2Q8NH69 310 aa2.19□□□□□ -2.06
TMOD3-206ENST00000559202 ZNF671Q8TAW3 534 aa2.19□□□□□ -2.06
TMOD3-206ENST00000559202 GPR119Q8TDV5 335 aa2.19□□□□□ -2.06
TMOD3-206ENST00000559202 GATAD1Q8WUU5 269 aa2.19□□□□□ -2.06
TMOD3-206ENST00000559202 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP2.19□□□□□ -2.06
TMOD3-206ENST00000559202 TMEM37Q8WXS4 190 aa2.19□□□□□ -2.06
TMOD3-206ENST00000559202 MCHR2Q969V1 340 aa2.19□□□□□ -2.06
TMOD3-206ENST00000559202 RCN3Q96D15 328 aa2.19□□□□□ -2.06
TMOD3-206ENST00000559202 RASD2Q96D21 266 aa2.19□□□□□ -2.06
TMOD3-206ENST00000559202 BPIFA2Q96DR5 249 aa2.19□□□□□ -2.06
TMOD3-206ENST00000559202 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP2.19□□□□□ -2.06
TMOD3-206ENST00000559202 ITCHQ96J02 903 aa2.19□□□□□ -2.06
TMOD3-206ENST00000559202 ANKRD27Q96NW4 1050 aa2.19□□□□□ -2.06
TMOD3-206ENST00000559202 TRNT1Q96Q11 434 aaKnown RBP2.19□□□□□ -2.06
TMOD3-206ENST00000559202 TTYH2Q9BSA4 534 aa2.19□□□□□ -2.06
TMOD3-206ENST00000559202 PINK1Q9BXM7 581 aa2.19□□□□□ -2.06
TMOD3-206ENST00000559202 TBL1XR1Q9BZK7 514 aa2.19□□□□□ -2.06
TMOD3-206ENST00000559202 C5orf66Q9H5L9 145 aa2.19□□□□□ -2.06
TMOD3-206ENST00000559202 TMEM38AQ9H6F2 299 aa2.19□□□□□ -2.06
TMOD3-206ENST00000559202 EXO5Q9H790 373 aa2.19□□□□□ -2.06
TMOD3-206ENST00000559202 TMEM185BQ9H7F4 350 aa2.19□□□□□ -2.06
TMOD3-206ENST00000559202 ZNF665Q9H7R5 613 aa2.19□□□□□ -2.06
TMOD3-206ENST00000559202 KAT8Q9H7Z6 458 aaKnown RBP2.19□□□□□ -2.06
TMOD3-206ENST00000559202 GNB4Q9HAV0 340 aa2.19□□□□□ -2.06
TMOD3-206ENST00000559202 EXOSC3Q9NQT5 275 aaKnown RBP2.19□□□□□ -2.06
TMOD3-206ENST00000559202 CTPS2Q9NRF8 586 aa2.19□□□□□ -2.06
TMOD3-206ENST00000559202 UBQLN4Q9NRR5 601 aa2.19□□□□□ -2.06
TMOD3-206ENST00000559202 MAN2C1Q9NTJ4 1040 aa2.19□□□□□ -2.06
TMOD3-206ENST00000559202 EXD2Q9NVH0 621 aa2.19□□□□□ -2.06
TMOD3-206ENST00000559202 ZNF319Q9P2F9 582 aa2.19□□□□□ -2.06
TMOD3-206ENST00000559202 ABCD2Q9UBJ2 740 aa2.19□□□□□ -2.06
TMOD3-206ENST00000559202 ZNF443Q9Y2A4 671 aaPredicted RBP2.19□□□□□ -2.06
TMOD3-206ENST00000559202 SLC35A3Q9Y2D2 325 aa2.19□□□□□ -2.06
TMOD3-206ENST00000559202 ZNF337Q9Y3M9 751 aa2.19□□□□□ -2.06
TMOD3-206ENST00000559202 MAB21L2Q9Y586 359 aa2.19□□□□□ -2.06
TMOD3-206ENST00000559202 FKBP7Q9Y680 259 aa2.19□□□□□ -2.06
TMOD3-206ENST00000559202 AP4B1Q9Y6B7 739 aa2.19□□□□□ -2.06
TMOD3-206ENST00000559202 HIVEP1P15822 2718 aa2.19□□□□□ -2.06
TMOD3-206ENST00000559202 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP2.18□□□□□ -2.06
TMOD3-206ENST00000559202 IGKV1D-42A0A075B6H8 117 aa2.18□□□□□ -2.06
TMOD3-206ENST00000559202 IGHV3-15A0A0B4J1V0 119 aa2.18□□□□□ -2.06
TMOD3-206ENST00000559202 FAM240BA0A1B0GVZ2 78 aa2.18□□□□□ -2.06
TMOD3-206ENST00000559202 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa2.18□□□□□ -2.06
TMOD3-206ENST00000559202 A0A1W2PNV4 684 aa2.18□□□□□ -2.06
TMOD3-206ENST00000559202 CCT8L1PA6NM43 557 aa2.18□□□□□ -2.06
TMOD3-206ENST00000559202 ZNF716A6NP11 495 aa2.18□□□□□ -2.06
TMOD3-206ENST00000559202 ZNF732B4DXR9 585 aa2.18□□□□□ -2.06
TMOD3-206ENST00000559202 PPIAL4DF5H284 164 aa2.18□□□□□ -2.06
TMOD3-206ENST00000559202 FAAHO00519 579 aa2.18□□□□□ -2.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.3 ms