RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553686.5

ATXN3-223, Transcript of ataxin 3, human

TSL 1 (best)

Gene ATXN3, Length 869 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATXN3-223	ENST00000553686	C12orf10	Q9HB07	376 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ATXN3-223	ENST00000553686	CACYBP	Q9HB71	228 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
ATXN3-223	ENST00000553686	PCDHB16	Q9NRJ7	776 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ATXN3-223	ENST00000553686	ZFP57	Q9NU63	452 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ATXN3-223	ENST00000553686	TMEM100	Q9NV29	134 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ATXN3-223	ENST00000553686	MRPL15	Q9P015	296 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
ATXN3-223	ENST00000553686	KAAG1	Q9UBP8	84 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ATXN3-223	ENST00000553686	HAO1	Q9UJM8	370 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ATXN3-223	ENST00000553686	ADAM18	Q9Y3Q7	739 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ATXN3-223	ENST00000553686	RNF103-CHMP3	A0A140T963	221 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ATXN3-223	ENST00000553686	FAM172BP	A6NC97	362 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ATXN3-223	ENST00000553686		A6NDX4	124 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ATXN3-223	ENST00000553686	OOEP	A6NGQ2	149 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ATXN3-223	ENST00000553686	NKX6-3	A6NJ46	265 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ATXN3-223	ENST00000553686	SEC14L6	B5MCN3	397 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ATXN3-223	ENST00000553686		F5H5P2	479 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ATXN3-223	ENST00000553686	PLPP3	O14495	311 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ATXN3-223	ENST00000553686	HDAC3	O15379	428 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ATXN3-223	ENST00000553686	IGHG1	P01857	330 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ATXN3-223	ENST00000553686	GYPA	P02724	150 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ATXN3-223	ENST00000553686	HOXB5	P09067	269 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ATXN3-223	ENST00000553686	NEFH	P12036	1026 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ATXN3-223	ENST00000553686	MYOD1	P15172	320 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ATXN3-223	ENST00000553686	RPL23A	P62750	156 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
ATXN3-223	ENST00000553686	HBA1	P69905	142 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ATXN3-223	ENST00000553686	MRPS34	P82930	218 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
ATXN3-223	ENST00000553686	PRB3	Q04118	309 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
ATXN3-223	ENST00000553686	ECH1	Q13011	328 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ATXN3-223	ENST00000553686	SGCA	Q16586	387 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ATXN3-223	ENST00000553686	LIN52	Q52LA3	116 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ATXN3-223	ENST00000553686	RFTN2	Q52LD8	501 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
ATXN3-223	ENST00000553686	TNFAIP8L2	Q6P589	184 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
ATXN3-223	ENST00000553686	ZNF836	Q6ZNA1	936 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ATXN3-223	ENST00000553686	PQLC2	Q6ZP29	291 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ATXN3-223	ENST00000553686	LRRC74B	Q6ZQY2	392 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ATXN3-223	ENST00000553686	ZCCHC23	Q6ZST2	131 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ATXN3-223	ENST00000553686	SLC35D2	Q76EJ3	337 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ATXN3-223	ENST00000553686	SLC36A1	Q7Z2H8	476 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ATXN3-223	ENST00000553686	OR5AS1	Q8N127	324 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ATXN3-223	ENST00000553686	RPP25L	Q8N5L8	163 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
ATXN3-223	ENST00000553686	C10orf53	Q8N6V4	93 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ATXN3-223	ENST00000553686	CLDN22	Q8N7P3	220 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ATXN3-223	ENST00000553686	OR5L1	Q8NGL2	311 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ATXN3-223	ENST00000553686	NFKBID	Q8NI38	313 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ATXN3-223	ENST00000553686	ACTRT1	Q8TDG2	376 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ATXN3-223	ENST00000553686	CAPSL	Q8WWF8	208 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ATXN3-223	ENST00000553686	MCHR2	Q969V1	340 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ATXN3-223	ENST00000553686	ORAI1	Q96D31	301 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ATXN3-223	ENST00000553686	AKR1E2	Q96JD6	320 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ATXN3-223	ENST00000553686	FCRL1	Q96LA6	429 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ATXN3-223	ENST00000553686	OR2H1	Q9GZK4	316 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ATXN3-223	ENST00000553686	MRPL39	Q9NYK5	338 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
ATXN3-223	ENST00000553686	STARD10	Q9Y365	291 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ATXN3-223	ENST00000553686	NOP16	Q9Y3C1	178 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
ATXN3-223	ENST00000553686	CCL27	Q9Y4X3	112 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ATXN3-223	ENST00000553686	CAPN7	Q9Y6W3	813 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ATXN3-223	ENST00000553686	ALMS1	Q8TCU4	4167 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATXN3-223	ENST00000553686	HECTD4	Q9Y4D8	3996 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATXN3-223	ENST00000553686		H0YAE9	185 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATXN3-223	ENST00000553686	CCL24	O00175	119 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATXN3-223	ENST00000553686	NDUFB3	O43676	98 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATXN3-223	ENST00000553686	SERPINE1	P05121	402 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATXN3-223	ENST00000553686	ADORA3	P0DMS8	318 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATXN3-223	ENST00000553686	NR2F1	P10589	423 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATXN3-223	ENST00000553686	COX5B	P10606	129 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATXN3-223	ENST00000553686	PRPS1L1	P21108	318 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATXN3-223	ENST00000553686	RPS4Y1	P22090	263 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
ATXN3-223	ENST00000553686	AZGP1	P25311	298 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
ATXN3-223	ENST00000553686	ISL1	P61371	349 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATXN3-223	ENST00000553686	RPL38	P63173	70 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
ATXN3-223	ENST00000553686	DR1	Q01658	176 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATXN3-223	ENST00000553686	C2orf54	Q08AI8	447 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATXN3-223	ENST00000553686	CALCOCO2	Q13137	446 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATXN3-223	ENST00000553686	UAP1	Q16222	522 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
ATXN3-223	ENST00000553686	LRRC10	Q5BKY1	277 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATXN3-223	ENST00000553686	CLEC12A	Q5QGZ9	265 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATXN3-223	ENST00000553686	C6orf141	Q5SZD1	244 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATXN3-223	ENST00000553686	FAM27B	Q5VT28	67 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATXN3-223	ENST00000553686	OR2T2	Q6IF00	324 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATXN3-223	ENST00000553686	OR2W3	Q7Z3T1	314 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATXN3-223	ENST00000553686	CSNK2A3	Q8NEV1	391 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATXN3-223	ENST00000553686	DNAJA4	Q8WW22	397 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
ATXN3-223	ENST00000553686	RASD2	Q96D21	266 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATXN3-223	ENST00000553686	ITCH	Q96J02	903 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATXN3-223	ENST00000553686	ECSIT	Q9BQ95	431 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATXN3-223	ENST00000553686	WNT5B	Q9H1J7	359 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATXN3-223	ENST00000553686	SLC38A1	Q9H2H9	487 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATXN3-223	ENST00000553686	MEAF6	Q9HAF1	191 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATXN3-223	ENST00000553686	UFSP2	Q9NUQ7	469 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATXN3-223	ENST00000553686	PRPF19	Q9UMS4	504 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
ATXN3-223	ENST00000553686	AURKC	Q9UQB9	309 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATXN3-223	ENST00000553686	LYVE1	Q9Y5Y7	322 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATXN3-223	ENST00000553686	IGLV1-36	A0A0B4J1U3	117 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATXN3-223	ENST00000553686		A0A1W2PQ09	198 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATXN3-223	ENST00000553686	GMNC	A6NCL1	334 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATXN3-223	ENST00000553686	CENPBD1	B2RD01	187 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATXN3-223	ENST00000553686	C11orf98	E9PRG8	122 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATXN3-223	ENST00000553686	MT-ATP6	P00846	226 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATXN3-223	ENST00000553686	HCK	P08631	526 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATXN3-223	ENST00000553686	PGA4	P0DJD7	388 aa		4.55	□□□□□ -1.68

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59 ms