RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000535535.5

LMO3-212, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene LMO3, Length 1,488 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-212ENST00000535535 INTS1Q8N201 2190 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
LMO3-212ENST00000535535 TMEM218A2RU14 115 aa6.79□□□□□ -1.32
LMO3-212ENST00000535535 E7EQ34 232 aa6.79□□□□□ -1.32
LMO3-212ENST00000535535 ZNF587BE7ETH6 402 aa6.79□□□□□ -1.32
LMO3-212ENST00000535535 H0Y980 276 aa6.79□□□□□ -1.32
LMO3-212ENST00000535535 H3BMH7 237 aa6.79□□□□□ -1.32
LMO3-212ENST00000535535 M0QXV9 152 aa6.79□□□□□ -1.32
LMO3-212ENST00000535535 PPIHO43447 177 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
LMO3-212ENST00000535535 MFSD11O43934 449 aa6.79□□□□□ -1.32
LMO3-212ENST00000535535 WDR1O75083 606 aa6.79□□□□□ -1.32
LMO3-212ENST00000535535 TFP02787 698 aa6.79□□□□□ -1.32
LMO3-212ENST00000535535 CD2P06729 351 aa6.79□□□□□ -1.32
LMO3-212ENST00000535535 UMODP07911 640 aa6.79□□□□□ -1.32
LMO3-212ENST00000535535 ST6GAL1P15907 406 aa6.79□□□□□ -1.32
LMO3-212ENST00000535535 AKR1C4P17516 323 aa6.79□□□□□ -1.32
LMO3-212ENST00000535535 S100A7P31151 101 aa6.79□□□□□ -1.32
LMO3-212ENST00000535535 CDKN1AP38936 164 aa6.79□□□□□ -1.32
LMO3-212ENST00000535535 NPBWR2P48146 333 aa6.79□□□□□ -1.32
LMO3-212ENST00000535535 HMGCS1Q01581 520 aa6.79□□□□□ -1.32
LMO3-212ENST00000535535 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
LMO3-212ENST00000535535 SKP2Q13309 424 aa6.79□□□□□ -1.32
LMO3-212ENST00000535535 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
LMO3-212ENST00000535535 RUNX2Q13950 521 aa6.79□□□□□ -1.32
LMO3-212ENST00000535535 TAF13Q15543 124 aa6.79□□□□□ -1.32
LMO3-212ENST00000535535 PYY3Q5JQD4 70 aa6.79□□□□□ -1.32
LMO3-212ENST00000535535 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa6.79□□□□□ -1.32
LMO3-212ENST00000535535 LAMTOR1Q6IAA8 161 aa6.79□□□□□ -1.32
LMO3-212ENST00000535535 LINC01551Q86U37 167 aa6.79□□□□□ -1.32
LMO3-212ENST00000535535 SIAH3Q8IW03 269 aa6.79□□□□□ -1.32
LMO3-212ENST00000535535 OR10G3Q8NGC4 313 aa6.79□□□□□ -1.32
LMO3-212ENST00000535535 OR14A16Q8NHC5 309 aa6.79□□□□□ -1.32
LMO3-212ENST00000535535 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
LMO3-212ENST00000535535 C10orf82Q8WW14 230 aa6.79□□□□□ -1.32
LMO3-212ENST00000535535 NRGNQ92686 78 aa6.79□□□□□ -1.32
LMO3-212ENST00000535535 TFGQ92734 400 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
LMO3-212ENST00000535535 PAFAH2Q99487 392 aa6.79□□□□□ -1.32
LMO3-212ENST00000535535 SLC6A7Q99884 636 aa6.79□□□□□ -1.32
LMO3-212ENST00000535535 SULT4A1Q9BR01 284 aa6.79□□□□□ -1.32
LMO3-212ENST00000535535 ATG101Q9BSB4 218 aa6.79□□□□□ -1.32
LMO3-212ENST00000535535 ST6GALNAC5Q9BVH7 336 aa6.79□□□□□ -1.32
LMO3-212ENST00000535535 SUCNR1Q9BXA5 334 aa6.79□□□□□ -1.32
LMO3-212ENST00000535535 SNHG12Q9BXW3 62 aa6.79□□□□□ -1.32
LMO3-212ENST00000535535 TLNRD1Q9H1K6 362 aa6.79□□□□□ -1.32
LMO3-212ENST00000535535 PPIL3Q9H2H8 161 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
LMO3-212ENST00000535535 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP6.79□□□□□ -1.32
LMO3-212ENST00000535535 OR14J1Q9UGF5 321 aa6.79□□□□□ -1.32
LMO3-212ENST00000535535 VPS13CQ709C8 3753 aa6.79□□□□□ -1.32
LMO3-212ENST00000535535 AKAP6Q13023 2319 aa6.79□□□□□ -1.32
LMO3-212ENST00000535535 OR5H14A6NHG9 310 aa6.79□□□□□ -1.32
LMO3-212ENST00000535535 NPIPB13A6NJU9 1138 aa6.79□□□□□ -1.32
LMO3-212ENST00000535535 A8MZ25 164 aa6.79□□□□□ -1.32
LMO3-212ENST00000535535 NPIPB4C9JG80 1138 aa6.79□□□□□ -1.32
LMO3-212ENST00000535535 H0YIZ8 118 aa6.79□□□□□ -1.32
LMO3-212ENST00000535535 C19orf84I3L1E1 186 aa6.79□□□□□ -1.32
LMO3-212ENST00000535535 M0QYG6 137 aa6.79□□□□□ -1.32
LMO3-212ENST00000535535 P2RY10O00398 339 aa6.79□□□□□ -1.32
LMO3-212ENST00000535535 SLC17A3O00476 420 aa6.79□□□□□ -1.32
LMO3-212ENST00000535535 CCL21O00585 134 aa6.79□□□□□ -1.32
LMO3-212ENST00000535535 ALOX12BO75342 701 aa6.79□□□□□ -1.32
LMO3-212ENST00000535535 SH3BGRLO75368 114 aa6.79□□□□□ -1.32
LMO3-212ENST00000535535 CA11O75493 328 aa6.79□□□□□ -1.32
LMO3-212ENST00000535535 OR2F2O95006 317 aa6.79□□□□□ -1.32
LMO3-212ENST00000535535 UTS2O95399 124 aa6.79□□□□□ -1.32
LMO3-212ENST00000535535 PIRTP0C851 137 aa6.79□□□□□ -1.32
LMO3-212ENST00000535535 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
LMO3-212ENST00000535535 ETFAP13804 333 aa6.79□□□□□ -1.32
LMO3-212ENST00000535535 GABRB1P18505 474 aa6.79□□□□□ -1.32
LMO3-212ENST00000535535 ACHEP22303 614 aa6.79□□□□□ -1.32
LMO3-212ENST00000535535 CA7P43166 264 aa6.79□□□□□ -1.32
LMO3-212ENST00000535535 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
LMO3-212ENST00000535535 CTSCP53634 463 aa6.79□□□□□ -1.32
LMO3-212ENST00000535535 RANP62826 216 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
LMO3-212ENST00000535535 EIF5AP63241 154 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
LMO3-212ENST00000535535 BTN3A2P78410 334 aa6.79□□□□□ -1.32
LMO3-212ENST00000535535 UBE2V1Q13404 147 aa6.79□□□□□ -1.32
LMO3-212ENST00000535535 PLPPR5Q32ZL2 321 aa6.79□□□□□ -1.32
LMO3-212ENST00000535535 DPCR1Q3MIW9 517 aa6.79□□□□□ -1.32
LMO3-212ENST00000535535 OCIAD2Q56VL3 154 aa6.79□□□□□ -1.32
LMO3-212ENST00000535535 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa6.79□□□□□ -1.32
LMO3-212ENST00000535535 GLYATQ6IB77 296 aa6.79□□□□□ -1.32
LMO3-212ENST00000535535 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa6.79□□□□□ -1.32
LMO3-212ENST00000535535 STEAP1BQ6NZ63 245 aa6.79□□□□□ -1.32
LMO3-212ENST00000535535 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa6.79□□□□□ -1.32
LMO3-212ENST00000535535 RNF44Q7L0R7 432 aa6.79□□□□□ -1.32
LMO3-212ENST00000535535 SSX6Q7RTT6 188 aa6.79□□□□□ -1.32
LMO3-212ENST00000535535 SLC36A1Q7Z2H8 476 aa6.79□□□□□ -1.32
LMO3-212ENST00000535535 MAVSQ7Z434 540 aa6.79□□□□□ -1.32
LMO3-212ENST00000535535 CPNE9Q8IYJ1 553 aa6.79□□□□□ -1.32
LMO3-212ENST00000535535 TMEM251Q8N6I4 163 aa6.79□□□□□ -1.32
LMO3-212ENST00000535535 YIPF7Q8N8F6 280 aa6.79□□□□□ -1.32
LMO3-212ENST00000535535 UBAC2Q8NBM4 344 aa6.79□□□□□ -1.32
LMO3-212ENST00000535535 CCDC107Q8WV48 283 aa6.79□□□□□ -1.32
LMO3-212ENST00000535535 ROPN1LQ96C74 230 aa6.79□□□□□ -1.32
LMO3-212ENST00000535535 NTNG2Q96CW9 530 aa6.79□□□□□ -1.32
LMO3-212ENST00000535535 SMIM8Q96KF7 97 aa6.79□□□□□ -1.32
LMO3-212ENST00000535535 TRIB3Q96RU7 358 aa6.79□□□□□ -1.32
LMO3-212ENST00000535535 SDHCQ99643 169 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
LMO3-212ENST00000535535 SYT11Q9BT88 431 aa6.79□□□□□ -1.32
LMO3-212ENST00000535535 CHST5Q9GZS9 411 aa6.79□□□□□ -1.32
LMO3-212ENST00000535535 DSN1Q9H410 356 aa6.79□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.2 ms