RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534617.5

BRMS1-209, Transcript of BRMS1, transcriptional repressor and anoikis regulator, human

TSL 2

Gene BRMS1, Length 905 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BRMS1-209	ENST00000534617		R4GMQ9	66 aa		11.64	□□□□□ -0.55
BRMS1-209	ENST00000534617	ANK2	Q01484	3957 aa		11.63	□□□□□ -0.55
BRMS1-209	ENST00000534617	DNAJC9-AS1	A6NH13	148 aa		11.63	□□□□□ -0.55
BRMS1-209	ENST00000534617	NKX6-3	A6NJ46	265 aa		11.63	□□□□□ -0.55
BRMS1-209	ENST00000534617	ZNF879	B4DU55	563 aa		11.63	□□□□□ -0.55
BRMS1-209	ENST00000534617	ZNF732	B4DXR9	585 aa		11.63	□□□□□ -0.55
BRMS1-209	ENST00000534617		H3BNX3	289 aa		11.63	□□□□□ -0.55
BRMS1-209	ENST00000534617	AKR7A2	O43488	359 aa		11.63	□□□□□ -0.55
BRMS1-209	ENST00000534617	SRSF10	O75494	262 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
BRMS1-209	ENST00000534617	FCN3	O75636	299 aa		11.63	□□□□□ -0.55
BRMS1-209	ENST00000534617	DHRS3	O75911	302 aa		11.63	□□□□□ -0.55
BRMS1-209	ENST00000534617	RPP14	O95059	124 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
BRMS1-209	ENST00000534617	PLAT	P00750	562 aa		11.63	□□□□□ -0.55
BRMS1-209	ENST00000534617	IGLV3-1	P01715	115 aa		11.63	□□□□□ -0.55
BRMS1-209	ENST00000534617	KRT8	P05787	483 aa		11.63	□□□□□ -0.55
BRMS1-209	ENST00000534617	SFTPB	P07988	381 aa		11.63	□□□□□ -0.55
BRMS1-209	ENST00000534617	ATP6V1B1	P15313	513 aa		11.63	□□□□□ -0.55
BRMS1-209	ENST00000534617	ATP6V1E1	P36543	226 aa		11.63	□□□□□ -0.55
BRMS1-209	ENST00000534617	CFHR2	P36980	270 aa		11.63	□□□□□ -0.55
BRMS1-209	ENST00000534617	GNG3	P63215	75 aa		11.63	□□□□□ -0.55
BRMS1-209	ENST00000534617	BAMBI	Q13145	260 aa		11.63	□□□□□ -0.55
BRMS1-209	ENST00000534617	IKZF1	Q13422	519 aa		11.63	□□□□□ -0.55
BRMS1-209	ENST00000534617	ZFP1	Q6P2D0	407 aa		11.63	□□□□□ -0.55
BRMS1-209	ENST00000534617	BRD3OS	Q6XYD6	125 aa		11.63	□□□□□ -0.55
BRMS1-209	ENST00000534617	MOB3C	Q70IA8	216 aa		11.63	□□□□□ -0.55
BRMS1-209	ENST00000534617	BTN2A1	Q7KYR7	527 aa		11.63	□□□□□ -0.55
BRMS1-209	ENST00000534617	SLC36A1	Q7Z2H8	476 aa		11.63	□□□□□ -0.55
BRMS1-209	ENST00000534617	FGFRL1	Q8N441	504 aa		11.63	□□□□□ -0.55
BRMS1-209	ENST00000534617	YIPF7	Q8N8F6	280 aa		11.63	□□□□□ -0.55
BRMS1-209	ENST00000534617	PNLDC1	Q8NA58	520 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
BRMS1-209	ENST00000534617	OR10H4	Q8NGA5	316 aa		11.63	□□□□□ -0.55
BRMS1-209	ENST00000534617	OR5T2	Q8NGG2	359 aa		11.63	□□□□□ -0.55
BRMS1-209	ENST00000534617	OR8J1	Q8NGP2	316 aa		11.63	□□□□□ -0.55
BRMS1-209	ENST00000534617	OR10Z1	Q8NGY1	313 aa		11.63	□□□□□ -0.55
BRMS1-209	ENST00000534617	GCDH	Q92947	438 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
BRMS1-209	ENST00000534617	C12orf43	Q96C57	262 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
BRMS1-209	ENST00000534617	WDR13	Q9H1Z4	485 aa		11.63	□□□□□ -0.55
BRMS1-209	ENST00000534617	KAAG1	Q9UBP8	84 aa		11.63	□□□□□ -0.55
BRMS1-209	ENST00000534617	ENPP5	Q9UJA9	477 aa		11.63	□□□□□ -0.55
BRMS1-209	ENST00000534617	OR52A1	Q9UKL2	312 aa		11.63	□□□□□ -0.55
BRMS1-209	ENST00000534617	SOX21	Q9Y651	276 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
BRMS1-209	ENST00000534617	MDFIC2	A0A1B0GVS7	189 aa		11.62	□□□□□ -0.55
BRMS1-209	ENST00000534617		A0A1W2PQL4	384 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
BRMS1-209	ENST00000534617	P2RY10	O00398	339 aa		11.62	□□□□□ -0.55
BRMS1-209	ENST00000534617	EBAG9	O00559	213 aa		11.62	□□□□□ -0.55
BRMS1-209	ENST00000534617	NDUFB3	O43676	98 aa		11.62	□□□□□ -0.55
BRMS1-209	ENST00000534617	MTRF1	O75570	445 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
BRMS1-209	ENST00000534617	TOX4	O94842	621 aa		11.62	□□□□□ -0.55
BRMS1-209	ENST00000534617	ALPL	P05186	524 aa		11.62	□□□□□ -0.55
BRMS1-209	ENST00000534617	SELL	P14151	372 aa		11.62	□□□□□ -0.55
BRMS1-209	ENST00000534617	MTNR1A	P48039	350 aa		11.62	□□□□□ -0.55
BRMS1-209	ENST00000534617	CEACAM21	Q3KPI0	293 aa		11.62	□□□□□ -0.55
BRMS1-209	ENST00000534617	ZNF684	Q5T5D7	378 aa		11.62	□□□□□ -0.55
BRMS1-209	ENST00000534617	ZBTB37	Q5TC79	503 aa		11.62	□□□□□ -0.55
BRMS1-209	ENST00000534617	GPR157	Q5UAW9	335 aa		11.62	□□□□□ -0.55
BRMS1-209	ENST00000534617	METTL11B	Q5VVY1	283 aa		11.62	□□□□□ -0.55
BRMS1-209	ENST00000534617	STUM	Q69YW2	141 aa		11.62	□□□□□ -0.55
BRMS1-209	ENST00000534617	ELMOD2	Q8IZ81	293 aa		11.62	□□□□□ -0.55
BRMS1-209	ENST00000534617	RFK	Q969G6	155 aa		11.62	□□□□□ -0.55
BRMS1-209	ENST00000534617	EME1	Q96AY2	570 aa		11.62	□□□□□ -0.55
BRMS1-209	ENST00000534617	RAB3IP	Q96QF0	476 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
BRMS1-209	ENST00000534617	SNX5	Q9Y5X3	404 aa		11.62	□□□□□ -0.55
BRMS1-209	ENST00000534617	OR5B21	A6NL26	309 aa		11.61	□□□□□ -0.55
BRMS1-209	ENST00000534617	RHBDL1	O75783	438 aa		11.61	□□□□□ -0.55
BRMS1-209	ENST00000534617	ECD	O95905	644 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
BRMS1-209	ENST00000534617	TFF1	P04155	84 aa		11.61	□□□□□ -0.55
BRMS1-209	ENST00000534617	LIPF	P07098	398 aa		11.61	□□□□□ -0.55
BRMS1-209	ENST00000534617	OR2T7	P0C7T2	308 aa		11.61	□□□□□ -0.55
BRMS1-209	ENST00000534617	GLRA1	P23415	457 aa		11.61	□□□□□ -0.55
BRMS1-209	ENST00000534617	ODF4	Q2M2E3	257 aa		11.61	□□□□□ -0.55
BRMS1-209	ENST00000534617	TUSC1	Q2TAM9	212 aa		11.61	□□□□□ -0.55
BRMS1-209	ENST00000534617	ZIK1	Q3SY52	487 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
BRMS1-209	ENST00000534617	FAM76B	Q5HYJ3	339 aa		11.61	□□□□□ -0.55
BRMS1-209	ENST00000534617	RUSC1-AS1	Q66K80	236 aa		11.61	□□□□□ -0.55
BRMS1-209	ENST00000534617	HAGHL	Q6PII5	290 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
BRMS1-209	ENST00000534617	C9orf139	Q6ZV77	190 aa		11.61	□□□□□ -0.55
BRMS1-209	ENST00000534617	OR5A2	Q8NGI9	324 aa		11.61	□□□□□ -0.55
BRMS1-209	ENST00000534617	OR2T27	Q8NH04	317 aa		11.61	□□□□□ -0.55
BRMS1-209	ENST00000534617	ITFG2	Q969R8	447 aa		11.61	□□□□□ -0.55
BRMS1-209	ENST00000534617	WDFY2	Q96P53	400 aa		11.61	□□□□□ -0.55
BRMS1-209	ENST00000534617	TBX15	Q96SF7	602 aa		11.61	□□□□□ -0.55
BRMS1-209	ENST00000534617	OR51I2	Q9H344	312 aa		11.61	□□□□□ -0.55
BRMS1-209	ENST00000534617	GPR173	Q9NS66	373 aa		11.61	□□□□□ -0.55
BRMS1-209	ENST00000534617	USE1	Q9NZ43	259 aa		11.61	□□□□□ -0.55
BRMS1-209	ENST00000534617	ONECUT1	Q9UBC0	465 aa		11.61	□□□□□ -0.55
BRMS1-209	ENST00000534617	RPUSD1	Q9UJJ7	312 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
BRMS1-209	ENST00000534617	SLC22A13	Q9Y226	551 aa		11.61	□□□□□ -0.55
BRMS1-209	ENST00000534617	TMEM89	A2RUT3	159 aa		11.6	□□□□□ -0.55
BRMS1-209	ENST00000534617		A6NIN4	97 aa		11.6	□□□□□ -0.55
BRMS1-209	ENST00000534617		H3BSH0	61 aa		11.6	□□□□□ -0.55
BRMS1-209	ENST00000534617	NRAS	P01111	189 aa		11.6	□□□□□ -0.55
BRMS1-209	ENST00000534617	MMP9	P14780	707 aa		11.6	□□□□□ -0.55
BRMS1-209	ENST00000534617	AMY2B	P19961	511 aa		11.6	□□□□□ -0.55
BRMS1-209	ENST00000534617	PRTN3	P24158	256 aa		11.6	□□□□□ -0.55
BRMS1-209	ENST00000534617	ALDH3A2	P51648	485 aa		11.6	□□□□□ -0.55
BRMS1-209	ENST00000534617	ARF6	P62330	175 aa		11.6	□□□□□ -0.55
BRMS1-209	ENST00000534617	LRRC10	Q5BKY1	277 aa		11.6	□□□□□ -0.55
BRMS1-209	ENST00000534617	CLVS2	Q5SYC1	327 aa		11.6	□□□□□ -0.55
BRMS1-209	ENST00000534617	KRT74	Q7RTS7	529 aa		11.6	□□□□□ -0.55
BRMS1-209	ENST00000534617	FAM220A	Q7Z4H9	259 aa		11.6	□□□□□ -0.55

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