RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533873.1

ACER3-213, Transcript of alkaline ceramidase 3, human

TSL 2 BASIC

Gene ACER3, Length 929 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ACER3-213	ENST00000533873	NLRC3	Q7RTR2	1065 aa		5.82	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	PRSS48	Q7RTY5	328 aa		5.82	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	KLB	Q86Z14	1044 aa		5.82	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	HIST2H2AB	Q8IUE6	130 aa	Predicted RBP	5.82	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	SNX29P2	Q8IUI4	249 aa		5.82	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	CBR4	Q8N4T8	237 aa		5.82	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	IQCF1	Q8N6M8	205 aa		5.82	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	CELF2-AS1	Q8N7Q2	184 aa		5.82	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	DTX3	Q8N9I9	347 aa		5.82	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	PAPD5	Q8NDF8	572 aa	Known RBP	5.82	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	OR10AD1	Q8NGE0	317 aa		5.82	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	OR52H1	Q8NGJ2	320 aa		5.82	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	OR6F1	Q8NGZ6	308 aa		5.82	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	RHOXF1	Q8NHV9	184 aa		5.82	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	ITLN1	Q8WWA0	313 aa		5.82	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	ERGIC1	Q969X5	290 aa		5.82	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	SLAMF6	Q96DU3	332 aa		5.82	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	C1orf159	Q96HA4	380 aa		5.82	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	OR2V2	Q96R30	315 aa		5.82	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	KCNJ15	Q99712	375 aa		5.82	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	FUNDC2	Q9BWH2	189 aa		5.82	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	NMNAT2	Q9BZQ4	307 aa		5.82	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	OR51V1	Q9H2C8	321 aa		5.82	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	POFUT1	Q9H488	388 aa		5.82	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	RGCC	Q9H4X1	137 aa		5.82	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	WDR76	Q9H967	626 aa		5.82	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	PNRC2	Q9NPJ4	139 aa	Known RBP	5.82	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	ACOXL	Q9NUZ1	547 aa		5.82	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	DCAF16	Q9NXF7	216 aa		5.82	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	SMPD3	Q9NY59	655 aa	Predicted RBP	5.82	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	CCDC59	Q9P031	241 aa	Known RBP	5.82	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	NPTN	Q9Y639	398 aa		5.82	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	CACNG2	Q9Y698	323 aa		5.82	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	HMX3	A6NHT5	357 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	FAM183A	A6NL82	134 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	ANKRD30BL	A7E2S9	258 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	CD300LB	A8K4G0	201 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	FAM157A	C9JC47	383 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873		H0YAE9	185 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	TRIM77	I1YAP6	450 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	CTDSP2	O14595	271 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	TOR1A	O14656	332 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	TSPAN4	O14817	238 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	TBX1	O43435	398 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	GLCE	O94923	617 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	IGHV2-5	P01817	119 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	ANXA2	P07355	339 aa	Known RBP	5.81	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	H2BFM	P0C1H6	154 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	SBK2	P0C263	348 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	SPN	P16150	400 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	ERP29	P30040	261 aa	Known RBP	5.81	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	OTX1	P32242	354 aa	Predicted RBP	5.81	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	GNAL	P38405	381 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	RPS27	P42677	84 aa	Known RBP	5.81	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	CX3CR1	P49238	355 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	PRKX	P51817	358 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	LMO4	P61968	165 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	GK2	Q14410	553 aa	Predicted RBP	5.81	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	SNAPC1	Q16533	368 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	PCK2	Q16822	640 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	TIGD6	Q17RP2	521 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	SLC35D3	Q5M8T2	416 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	DCAF12L2	Q5VW00	463 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	FAHD2B	Q6P2I3	314 aa	Predicted RBP	5.81	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	PLBD1	Q6P4A8	553 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	ZNF600	Q6ZNG1	722 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873		Q6ZR03	302 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	IL17REL	Q6ZVW7	336 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	RHOU	Q7L0Q8	258 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	LINC00518	Q8N0U6	118 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	LILRB2	Q8N423	598 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	RFLNB	Q8N5W9	214 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	OR5K1	Q8NHB7	308 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	MCFD2	Q8NI22	146 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	RNF133	Q8WVZ7	376 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	SNAPC3	Q92966	411 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	UBE2F	Q969M7	185 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	MUL1	Q969V5	352 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	SLCO4A1	Q96BD0	722 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	FAHD2A	Q96GK7	314 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	DDO	Q99489	341 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	SLC30A2	Q9BRI3	323 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	SOX7	Q9BT81	388 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	ADAT1	Q9BUB4	502 aa	Known RBP	5.81	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	OR10A2	Q9H208	303 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	PPA2	Q9H2U2	334 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	NIPAL2	Q9H841	368 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	FN3KRP	Q9HA64	309 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	SLC25A19	Q9HC21	320 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	ABCB9	Q9NP78	766 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	TRIM36	Q9NQ86	728 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	KRT84	Q9NSB2	600 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	C14orf119	Q9NWQ9	140 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	PAK1IP1	Q9NWT1	392 aa	Predicted RBP	5.81	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	MRPL15	Q9P015	296 aa	Known RBP	5.81	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	OR5V1	Q9UGF6	321 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	ADAM30	Q9UKF2	790 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	TMEM14A	Q9Y6G1	99 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	ZNF469	Q96JG9	3925 aa	Predicted RBP	5.81	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873		A0A0B4J203	849 aa		5.8	□□□□□ -1.48

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