RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530579.6

NEDD8-MDP1-201, Transcript of NEDD8-MDP1 readthrough, humanhuman

TSL 2

Gene NEDD8-MDP1, Length 471 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SLC17A2O00624 439 aa7.25□□□□□ -1.25
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TPD52L2O43399 206 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TMEM225BP0DP42 221 aa7.25□□□□□ -1.25
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TNFSF4P23510 183 aa7.25□□□□□ -1.25
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 HTR2CP28335 458 aa7.25□□□□□ -1.25
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 THBS2P35442 1172 aa7.25□□□□□ -1.25
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 POU3F4P49335 361 aa7.25□□□□□ -1.25
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 MMP15P51511 669 aa7.25□□□□□ -1.25
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CLDN12P56749 244 aa7.25□□□□□ -1.25
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SNRPD2P62316 118 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 RNF144BQ7Z419 303 aa7.25□□□□□ -1.25
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 NR2C2APQ86WQ0 139 aa7.25□□□□□ -1.25
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ACBD4Q8NC06 268 aa7.25□□□□□ -1.25
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 OR10AD1Q8NGE0 317 aa7.25□□□□□ -1.25
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 OR6M1Q8NGM8 313 aa7.25□□□□□ -1.25
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TNFAIP8L1Q8WVP5 186 aa7.25□□□□□ -1.25
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ELMOD3Q96FG2 381 aa7.25□□□□□ -1.25
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 UQCC2Q9BRT2 126 aa7.25□□□□□ -1.25
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 BARHL1Q9BZE3 327 aa7.25□□□□□ -1.25
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 METTL17Q9H7H0 456 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CNTD2Q9H8S5 307 aa7.25□□□□□ -1.25
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 UBTD1Q9HAC8 227 aa7.25□□□□□ -1.25
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ELL3Q9HB65 397 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 FAIMQ9NVQ4 179 aa7.25□□□□□ -1.25
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 COMMD3Q9UBI1 195 aa7.25□□□□□ -1.25
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 STEAP1Q9UHE8 339 aa7.25□□□□□ -1.25
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 MRPS28Q9Y2Q9 187 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa7.24□□□□□ -1.25
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa7.24□□□□□ -1.25
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 A0A0B4J203 849 aa7.24□□□□□ -1.25
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 M0R233 179 aa7.24□□□□□ -1.25
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 AIPO00170 330 aa7.24□□□□□ -1.25
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 HS3ST1O14792 307 aa7.24□□□□□ -1.25
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 MLNRO43193 412 aa7.24□□□□□ -1.25
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 GOSR1O95249 250 aa7.24□□□□□ -1.25
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CYB5AP00167 134 aa7.24□□□□□ -1.25
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 BMP4P12644 408 aa7.24□□□□□ -1.25
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 C2orf76Q3KRA6 126 aa7.24□□□□□ -1.25
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ZNF404Q494X3 552 aa7.24□□□□□ -1.25
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 C1orf100Q5SVJ3 147 aa7.24□□□□□ -1.25
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 AGAP6Q5VW22 663 aa7.24□□□□□ -1.25
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 AWAT2Q6E213 333 aa7.24□□□□□ -1.25
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ACOT12Q8WYK0 555 aa7.24□□□□□ -1.25
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 FAM3DQ96BQ1 224 aa7.24□□□□□ -1.25
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 MS4A5Q9H3V2 200 aa7.24□□□□□ -1.25
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PTTG2Q9NZH5 202 aa7.24□□□□□ -1.25
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ABRACLQ9P1F3 81 aa7.24□□□□□ -1.25
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ZDHHC8Q9ULC8 765 aa7.24□□□□□ -1.25
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 LRP5LA4QPB2 252 aa7.23□□□□□ -1.25
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 A6NLC8 198 aa7.23□□□□□ -1.25
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TMEM210A6NLX4 147 aa7.23□□□□□ -1.25
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 C17orf100A8MU93 164 aa7.23□□□□□ -1.25
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 RGS5O15539 181 aa7.23□□□□□ -1.25
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SPRY1O43609 319 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ANGPTL7O43827 346 aa7.23□□□□□ -1.25
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CTAG2O75638 210 aa7.23□□□□□ -1.25
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PAHP00439 452 aa7.23□□□□□ -1.25
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 IGHV1-46P01743 117 aa7.23□□□□□ -1.25
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CD37P11049 281 aa7.23□□□□□ -1.25
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ARSBP15848 533 aa7.23□□□□□ -1.25
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 COL8A1P27658 744 aa7.23□□□□□ -1.25
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 S100A5P33763 92 aa7.23□□□□□ -1.25
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 BMXP51813 675 aa7.23□□□□□ -1.25
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TLE4Q04727 773 aa7.23□□□□□ -1.25
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PDZK1IP1Q13113 114 aa7.23□□□□□ -1.25
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 MAB21L1Q13394 359 aa7.23□□□□□ -1.25
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 RIN1Q13671 783 aa7.23□□□□□ -1.25
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 RSU1Q15404 277 aa7.23□□□□□ -1.25
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SWI5Q1ZZU3 235 aa7.23□□□□□ -1.25
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PRAMEF6Q5VXH4 476 aa7.23□□□□□ -1.25
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 HAGHLQ6PII5 290 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
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