RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509355.5

PDE4D-217, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 847 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-217ENST00000509355 DMKNQ6E0U4 476 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
PDE4D-217ENST00000509355 ADNP2Q6IQ32 1131 aa3.55□□□□□ -1.84
PDE4D-217ENST00000509355 FCRLAQ7L513 359 aa3.55□□□□□ -1.84
PDE4D-217ENST00000509355 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
PDE4D-217ENST00000509355 KATNAL2Q8IYT4 538 aa3.55□□□□□ -1.84
PDE4D-217ENST00000509355 OFCC1Q8IZS5 231 aa3.55□□□□□ -1.84
PDE4D-217ENST00000509355 ZCCHC24Q8N2G6 241 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
PDE4D-217ENST00000509355 POM121L12Q8N7R1 296 aa3.55□□□□□ -1.84
PDE4D-217ENST00000509355 TCEANCQ8N8B7 351 aa3.55□□□□□ -1.84
PDE4D-217ENST00000509355 OR2M3Q8NG83 312 aa3.55□□□□□ -1.84
PDE4D-217ENST00000509355 OR7G1Q8NGA0 311 aa3.55□□□□□ -1.84
PDE4D-217ENST00000509355 C11orf45Q8TAV5 145 aa3.55□□□□□ -1.84
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PDE4D-217ENST00000509355 TMBIM1Q969X1 311 aa3.55□□□□□ -1.84
PDE4D-217ENST00000509355 CPNE4Q96A23 557 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
PDE4D-217ENST00000509355 SH3YL1Q96HL8 342 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
PDE4D-217ENST00000509355 GPR21Q99679 349 aa3.55□□□□□ -1.84
PDE4D-217ENST00000509355 SH3GL1Q99961 368 aa3.55□□□□□ -1.84
PDE4D-217ENST00000509355 GAL3ST1Q99999 423 aa3.55□□□□□ -1.84
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PDE4D-217ENST00000509355 TPK1Q9H3S4 243 aa3.55□□□□□ -1.84
PDE4D-217ENST00000509355 TMEM185BQ9H7F4 350 aa3.55□□□□□ -1.84
PDE4D-217ENST00000509355 CXorf21Q9HAI6 301 aa3.55□□□□□ -1.84
PDE4D-217ENST00000509355 C3orf14Q9HBI5 128 aa3.55□□□□□ -1.84
PDE4D-217ENST00000509355 RAB18Q9NP72 206 aa3.55□□□□□ -1.84
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PDE4D-217ENST00000509355 MED17Q9NVC6 651 aa3.55□□□□□ -1.84
PDE4D-217ENST00000509355 NDE1Q9NXR1 346 aa3.55□□□□□ -1.84
PDE4D-217ENST00000509355 SLC22A14Q9Y267 594 aa3.55□□□□□ -1.84
PDE4D-217ENST00000509355 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa3.55□□□□□ -1.84
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PDE4D-217ENST00000509355 SLC25A15Q9Y619 301 aa3.55□□□□□ -1.84
PDE4D-217ENST00000509355 NPTNQ9Y639 398 aa3.55□□□□□ -1.84
PDE4D-217ENST00000509355 U3KQK5 164 aa3.55□□□□□ -1.84
PDE4D-217ENST00000509355 TENM3Q9P273 2699 aa3.55□□□□□ -1.84
PDE4D-217ENST00000509355 ALPK2Q86TB3 2170 aa3.54□□□□□ -1.84
PDE4D-217ENST00000509355 SMCO3A2RU48 225 aa3.54□□□□□ -1.84
PDE4D-217ENST00000509355 C17orf51A8MQB3 221 aa3.54□□□□□ -1.84
PDE4D-217ENST00000509355 C9JVG2 144 aa3.54□□□□□ -1.84
PDE4D-217ENST00000509355 PSTPIP1O43586 416 aa3.54□□□□□ -1.84
PDE4D-217ENST00000509355 SAP30O75446 220 aa3.54□□□□□ -1.84
PDE4D-217ENST00000509355 LGI1O95970 557 aa3.54□□□□□ -1.84
PDE4D-217ENST00000509355 IGHV3-9P01782 118 aa3.54□□□□□ -1.84
PDE4D-217ENST00000509355 ADRA2AP08913 450 aa3.54□□□□□ -1.84
PDE4D-217ENST00000509355 FREM3P0C091 2139 aa3.54□□□□□ -1.84
PDE4D-217ENST00000509355 SLC2A2P11168 524 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
PDE4D-217ENST00000509355 OGNP20774 298 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
PDE4D-217ENST00000509355 GLRA1P23415 457 aa3.54□□□□□ -1.84
PDE4D-217ENST00000509355 CDKN1BP46527 198 aa3.54□□□□□ -1.84
PDE4D-217ENST00000509355 OR3A2P47893 321 aa3.54□□□□□ -1.84
PDE4D-217ENST00000509355 RFX3P48380 749 aa3.54□□□□□ -1.84
PDE4D-217ENST00000509355 TMEM33P57088 247 aa3.54□□□□□ -1.84
PDE4D-217ENST00000509355 CRADDP78560 199 aa3.54□□□□□ -1.84
PDE4D-217ENST00000509355 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
PDE4D-217ENST00000509355 XKR7Q5GH72 579 aa3.54□□□□□ -1.84
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PDE4D-217ENST00000509355 REP15Q6BDI9 236 aa3.54□□□□□ -1.84
PDE4D-217ENST00000509355 FRRS1Q6ZNA5 592 aa3.54□□□□□ -1.84
PDE4D-217ENST00000509355 Q6ZRG5 221 aa3.54□□□□□ -1.84
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PDE4D-217ENST00000509355 WDFY1Q8IWB7 410 aa3.54□□□□□ -1.84
PDE4D-217ENST00000509355 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
PDE4D-217ENST00000509355 FAM89BQ8N5H3 189 aa3.54□□□□□ -1.84
PDE4D-217ENST00000509355 ZNF433Q8N7K0 673 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
PDE4D-217ENST00000509355 ZNF615Q8N8J6 731 aa3.54□□□□□ -1.84
PDE4D-217ENST00000509355 AQP11Q8NBQ7 271 aa3.54□□□□□ -1.84
PDE4D-217ENST00000509355 SLC37A3Q8NCC5 494 aa3.54□□□□□ -1.84
PDE4D-217ENST00000509355 STXBP6Q8NFX7 210 aa3.54□□□□□ -1.84
PDE4D-217ENST00000509355 OR6S1Q8NH40 331 aa3.54□□□□□ -1.84
PDE4D-217ENST00000509355 MUC7Q8TAX7 377 aa3.54□□□□□ -1.84
PDE4D-217ENST00000509355 CD200R1Q8TD46 325 aa3.54□□□□□ -1.84
PDE4D-217ENST00000509355 ACMSDQ8TDX5 336 aa3.54□□□□□ -1.84
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PDE4D-217ENST00000509355 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa3.54□□□□□ -1.84
PDE4D-217ENST00000509355 AMDHD1Q96NU7 426 aa3.54□□□□□ -1.84
PDE4D-217ENST00000509355 EGLN3Q9H6Z9 239 aa3.54□□□□□ -1.84
PDE4D-217ENST00000509355 AUNIPQ9H7T9 357 aa3.54□□□□□ -1.84
PDE4D-217ENST00000509355 MRPL22Q9NWU5 206 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
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PDE4D-217ENST00000509355 OPN4Q9UHM6 478 aa3.54□□□□□ -1.84
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PDE4D-217ENST00000509355 WIPI2Q9Y4P8 454 aa3.54□□□□□ -1.84
PDE4D-217ENST00000509355 YLPM1P49750 1951 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
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PDE4D-217ENST00000509355 ACOD1A6NK06 481 aa3.53□□□□□ -1.84
PDE4D-217ENST00000509355 GJE1A6NN92 205 aa3.53□□□□□ -1.84
PDE4D-217ENST00000509355 VGLL3A8MV65 326 aa3.53□□□□□ -1.84
PDE4D-217ENST00000509355 SNURFLB1AK76 121 aa3.53□□□□□ -1.84
PDE4D-217ENST00000509355 ZNF879B4DU55 563 aa3.53□□□□□ -1.84
PDE4D-217ENST00000509355 K7EIL1 84 aa3.53□□□□□ -1.84
PDE4D-217ENST00000509355 AKR7A2O43488 359 aa3.53□□□□□ -1.84
PDE4D-217ENST00000509355 ZNF254O75437 659 aa3.53□□□□□ -1.84
PDE4D-217ENST00000509355 EEDO75530 441 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
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