RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497035.5

RPS8-208, Transcript of ribosomal protein S8, human

TSL 3

Gene RPS8, Length 694 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPS8-208	ENST00000497035	SC5D	O75845	299 aa		12.5	□□□□□ -0.41
RPS8-208	ENST00000497035	IGHV4-39	P01824	125 aa		12.5	□□□□□ -0.41
RPS8-208	ENST00000497035	HPX	P02790	462 aa		12.5	□□□□□ -0.41
RPS8-208	ENST00000497035	GRP	P07492	148 aa		12.5	□□□□□ -0.41
RPS8-208	ENST00000497035	ATF1	P18846	271 aa		12.5	□□□□□ -0.41
RPS8-208	ENST00000497035	TNFRSF1A	P19438	455 aa		12.5	□□□□□ -0.41
RPS8-208	ENST00000497035	RAB3A	P20336	220 aa		12.5	□□□□□ -0.41
RPS8-208	ENST00000497035	THBS2	P35442	1172 aa		12.5	□□□□□ -0.41
RPS8-208	ENST00000497035	ATP5J2	P56134	94 aa		12.5	□□□□□ -0.41
RPS8-208	ENST00000497035	GNG3	P63215	75 aa		12.5	□□□□□ -0.41
RPS8-208	ENST00000497035	UBE2V2	Q15819	145 aa		12.5	□□□□□ -0.41
RPS8-208	ENST00000497035	CEACAM21	Q3KPI0	293 aa		12.5	□□□□□ -0.41
RPS8-208	ENST00000497035	HSD17B12	Q53GQ0	312 aa		12.5	□□□□□ -0.41
RPS8-208	ENST00000497035	SPRN	Q5BIV9	151 aa		12.5	□□□□□ -0.41
RPS8-208	ENST00000497035	ASPHD2	Q6ICH7	369 aa		12.5	□□□□□ -0.41
RPS8-208	ENST00000497035	GPR141	Q7Z602	305 aa		12.5	□□□□□ -0.41
RPS8-208	ENST00000497035	WDR86	Q86TI4	376 aa		12.5	□□□□□ -0.41
RPS8-208	ENST00000497035	OR1M1	Q8NGA1	313 aa		12.5	□□□□□ -0.41
RPS8-208	ENST00000497035	OR51A2	Q8NGJ7	313 aa		12.5	□□□□□ -0.41
RPS8-208	ENST00000497035	OR5D14	Q8NGL3	314 aa		12.5	□□□□□ -0.41
RPS8-208	ENST00000497035	OR13F1	Q8NGS4	319 aa		12.5	□□□□□ -0.41
RPS8-208	ENST00000497035	NEU4	Q8WWR8	484 aa	Predicted RBP	12.5	□□□□□ -0.41
RPS8-208	ENST00000497035	NINJ1	Q92982	152 aa		12.5	□□□□□ -0.41
RPS8-208	ENST00000497035	BORCS8	Q96FH0	119 aa		12.5	□□□□□ -0.41
RPS8-208	ENST00000497035	RNF170	Q96K19	258 aa		12.5	□□□□□ -0.41
RPS8-208	ENST00000497035	CHCHD6	Q9BRQ6	235 aa		12.5	□□□□□ -0.41
RPS8-208	ENST00000497035	UFSP2	Q9NUQ7	469 aa		12.5	□□□□□ -0.41
RPS8-208	ENST00000497035	ARID1A	O14497	2285 aa		12.5	□□□□□ -0.41
RPS8-208	ENST00000497035	ITPR2	Q14571	2701 aa		12.5	□□□□□ -0.41
RPS8-208	ENST00000497035	NBPF19	A0A087WUL8	3843 aa		12.5	□□□□□ -0.41
RPS8-208	ENST00000497035	TRAV8-7	A0A075B6U6	113 aa		12.49	□□□□□ -0.41
RPS8-208	ENST00000497035	IGKV1-9	A0A0C4DH69	117 aa		12.49	□□□□□ -0.41
RPS8-208	ENST00000497035	LOC100506127	A0A0U1RQW1	187 aa		12.49	□□□□□ -0.41
RPS8-208	ENST00000497035	TMEM210	A6NLX4	147 aa		12.49	□□□□□ -0.41
RPS8-208	ENST00000497035	CDC14B	O60729	498 aa		12.49	□□□□□ -0.41
RPS8-208	ENST00000497035	ARL6IP5	O75915	188 aa		12.49	□□□□□ -0.41
RPS8-208	ENST00000497035	UCHL1	P09936	223 aa		12.49	□□□□□ -0.41
RPS8-208	ENST00000497035	PRKACB	P22694	351 aa		12.49	□□□□□ -0.41
RPS8-208	ENST00000497035	CALR	P27797	417 aa	Known RBP	12.49	□□□□□ -0.41
RPS8-208	ENST00000497035	EFNA4	P52798	201 aa		12.49	□□□□□ -0.41
RPS8-208	ENST00000497035	ZNF154	Q13106	437 aa		12.49	□□□□□ -0.41
RPS8-208	ENST00000497035	MAB21L1	Q13394	359 aa		12.49	□□□□□ -0.41
RPS8-208	ENST00000497035	CARTPT	Q16568	116 aa		12.49	□□□□□ -0.41
RPS8-208	ENST00000497035	DEFB113	Q30KQ7	82 aa		12.49	□□□□□ -0.41
RPS8-208	ENST00000497035	TIMM50	Q3ZCQ8	353 aa		12.49	□□□□□ -0.41
RPS8-208	ENST00000497035	C22orf42	Q6IC83	251 aa		12.49	□□□□□ -0.41
RPS8-208	ENST00000497035	CD200R1L	Q6Q8B3	271 aa		12.49	□□□□□ -0.41
RPS8-208	ENST00000497035	TMEM91	Q6ZNR0	172 aa		12.49	□□□□□ -0.41
RPS8-208	ENST00000497035	KRT74	Q7RTS7	529 aa		12.49	□□□□□ -0.41
RPS8-208	ENST00000497035	MOGAT3	Q86VF5	341 aa		12.49	□□□□□ -0.41
RPS8-208	ENST00000497035	CELF2-AS1	Q8N7Q2	184 aa		12.49	□□□□□ -0.41
RPS8-208	ENST00000497035	SPSB1	Q96BD6	273 aa		12.49	□□□□□ -0.41
RPS8-208	ENST00000497035	YIPF6	Q96EC8	236 aa		12.49	□□□□□ -0.41
RPS8-208	ENST00000497035	SPACA5	Q96QH8	159 aa		12.49	□□□□□ -0.41
RPS8-208	ENST00000497035	GSX2	Q9BZM3	304 aa		12.49	□□□□□ -0.41
RPS8-208	ENST00000497035	OR51E2	Q9H255	320 aa		12.49	□□□□□ -0.41
RPS8-208	ENST00000497035	BARX1	Q9HBU1	254 aa	Predicted RBP	12.49	□□□□□ -0.41
RPS8-208	ENST00000497035	NEK6	Q9HC98	313 aa		12.49	□□□□□ -0.41
RPS8-208	ENST00000497035	TCF7L1	Q9HCS4	588 aa		12.49	□□□□□ -0.41
RPS8-208	ENST00000497035	ZNF701	Q9NV72	531 aa	Predicted RBP	12.49	□□□□□ -0.41
RPS8-208	ENST00000497035	SSR3	Q9UNL2	185 aa		12.49	□□□□□ -0.41
RPS8-208	ENST00000497035	IGHV1-69-2	A0A0G2JMI3	117 aa		12.48	□□□□□ -0.41
RPS8-208	ENST00000497035	LOC100289279	A0A1B0GTE1	492 aa		12.48	□□□□□ -0.41
RPS8-208	ENST00000497035	TRDV1	A0A1B0GX56	115 aa		12.48	□□□□□ -0.41
RPS8-208	ENST00000497035	hCG_1807616	A0A1W2PRN6	198 aa		12.48	□□□□□ -0.41
RPS8-208	ENST00000497035	PQLC2L	A1A4F0	135 aa		12.48	□□□□□ -0.41
RPS8-208	ENST00000497035	LRP5L	A4QPB2	252 aa		12.48	□□□□□ -0.41
RPS8-208	ENST00000497035	C3orf80	F5H4A9	247 aa		12.48	□□□□□ -0.41
RPS8-208	ENST00000497035	PIN1P1	O15428	100 aa		12.48	□□□□□ -0.41
RPS8-208	ENST00000497035	PLAT	P00750	562 aa		12.48	□□□□□ -0.41
RPS8-208	ENST00000497035	TFAP2A	P05549	437 aa		12.48	□□□□□ -0.41
RPS8-208	ENST00000497035	DAO	P14920	347 aa		12.48	□□□□□ -0.41
RPS8-208	ENST00000497035	MYL9	P24844	172 aa		12.48	□□□□□ -0.41
RPS8-208	ENST00000497035	BDKRB2	P30411	391 aa		12.48	□□□□□ -0.41
RPS8-208	ENST00000497035	ALDH3B2	P48448	385 aa		12.48	□□□□□ -0.41
RPS8-208	ENST00000497035	POU3F4	P49335	361 aa		12.48	□□□□□ -0.41
RPS8-208	ENST00000497035	HNRNPA0	Q13151	305 aa	Known RBP	12.48	□□□□□ -0.41
RPS8-208	ENST00000497035	DDI2	Q5TDH0	399 aa		12.48	□□□□□ -0.41
RPS8-208	ENST00000497035	LHFPL2	Q6ZUX7	228 aa		12.48	□□□□□ -0.41
RPS8-208	ENST00000497035	OR5A2	Q8NGI9	324 aa		12.48	□□□□□ -0.41
RPS8-208	ENST00000497035	ZNF420	Q8TAQ5	688 aa	Predicted RBP	12.48	□□□□□ -0.41
RPS8-208	ENST00000497035	RFT1	Q96AA3	541 aa		12.48	□□□□□ -0.41
RPS8-208	ENST00000497035	TMIGD2	Q96BF3	282 aa		12.48	□□□□□ -0.41
RPS8-208	ENST00000497035	SLITRK2	Q9H156	845 aa		12.48	□□□□□ -0.41
RPS8-208	ENST00000497035	FN3KRP	Q9HA64	309 aa		12.48	□□□□□ -0.41
RPS8-208	ENST00000497035	TREM2	Q9NZC2	230 aa		12.48	□□□□□ -0.41
RPS8-208	ENST00000497035	PPP1R3C	Q9UQK1	317 aa		12.48	□□□□□ -0.41
RPS8-208	ENST00000497035	LYNX1	G3V0Z9	82 aa		12.47	□□□□□ -0.41
RPS8-208	ENST00000497035	MAGEB3	O15480	346 aa		12.47	□□□□□ -0.41
RPS8-208	ENST00000497035	SSX4	O60224	188 aa		12.47	□□□□□ -0.41
RPS8-208	ENST00000497035	GPX5	O75715	221 aa		12.47	□□□□□ -0.41
RPS8-208	ENST00000497035	MAS1	P04201	325 aa		12.47	□□□□□ -0.41
RPS8-208	ENST00000497035	LYNX1	P0DP58	116 aa		12.47	□□□□□ -0.41
RPS8-208	ENST00000497035	IGFBP3	P17936	291 aa	Predicted RBP	12.47	□□□□□ -0.41
RPS8-208	ENST00000497035	GAL	P22466	123 aa		12.47	□□□□□ -0.41
RPS8-208	ENST00000497035	CRYBB2	P43320	205 aa		12.47	□□□□□ -0.41
RPS8-208	ENST00000497035	GATA4	P43694	442 aa		12.47	□□□□□ -0.41
RPS8-208	ENST00000497035	RPL5	P46777	297 aa	Known RBP	12.47	□□□□□ -0.41
RPS8-208	ENST00000497035	HAAO	P46952	286 aa		12.47	□□□□□ -0.41
RPS8-208	ENST00000497035	RBP2	P50120	134 aa		12.47	□□□□□ -0.41

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.9 ms