RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496549.5

CRNKL1-205, Transcript of crooked neck pre-mRNA splicing factor 1, human

TSL 1 (best)

Gene CRNKL1, Length 4,093 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CRNKL1-205	ENST00000496549	UCP3	P55916	312 aa		7.32	□□□□□ -1.24
CRNKL1-205	ENST00000496549	BID	P55957	195 aa		7.32	□□□□□ -1.24
CRNKL1-205	ENST00000496549	ZP2	Q05996	745 aa		7.32	□□□□□ -1.24
CRNKL1-205	ENST00000496549	NR0B2	Q15466	257 aa		7.32	□□□□□ -1.24
CRNKL1-205	ENST00000496549	MSMO1	Q15800	293 aa		7.32	□□□□□ -1.24
CRNKL1-205	ENST00000496549	ALG10B	Q5I7T1	473 aa		7.32	□□□□□ -1.24
CRNKL1-205	ENST00000496549	SLC24A5	Q71RS6	500 aa		7.32	□□□□□ -1.24
CRNKL1-205	ENST00000496549	LRRC3B	Q96PB8	259 aa		7.32	□□□□□ -1.24
CRNKL1-205	ENST00000496549	ABHD6	Q9BV23	337 aa		7.32	□□□□□ -1.24
CRNKL1-205	ENST00000496549	ULBP3	Q9BZM4	244 aa		7.32	□□□□□ -1.24
CRNKL1-205	ENST00000496549	CXCL16	Q9H2A7	254 aa		7.32	□□□□□ -1.24
CRNKL1-205	ENST00000496549	TXNRD2	Q9NNW7	524 aa		7.32	□□□□□ -1.24
CRNKL1-205	ENST00000496549	CGGBP1	Q9UFW8	167 aa	Predicted RBP	7.32	□□□□□ -1.24
CRNKL1-205	ENST00000496549	PRSS50	Q9UI38	385 aa		7.32	□□□□□ -1.24
CRNKL1-205	ENST00000496549	LSM7	Q9UK45	103 aa	Known RBP	7.32	□□□□□ -1.24
CRNKL1-205	ENST00000496549	RNF150	Q9ULK6	438 aa		7.32	□□□□□ -1.24
CRNKL1-205	ENST00000496549	POLR3K	Q9Y2Y1	108 aa	Predicted RBP	7.32	□□□□□ -1.24
CRNKL1-205	ENST00000496549	OTOF	Q9HC10	1997 aa		7.32	□□□□□ -1.24
CRNKL1-205	ENST00000496549	CLEC18A	A5D8T8	446 aa		7.32	□□□□□ -1.24
CRNKL1-205	ENST00000496549	ZNF10	P21506	573 aa	Predicted RBP	7.32	□□□□□ -1.24
CRNKL1-205	ENST00000496549	CTSS	P25774	331 aa		7.32	□□□□□ -1.24
CRNKL1-205	ENST00000496549	HERV-K104	P61576	105 aa		7.32	□□□□□ -1.24
CRNKL1-205	ENST00000496549	WDR73	Q6P4I2	378 aa		7.32	□□□□□ -1.24
CRNKL1-205	ENST00000496549	UNQ9370/PRO34162	Q6UXP9	181 aa		7.32	□□□□□ -1.24
CRNKL1-205	ENST00000496549	FAM219A	Q8IW50	185 aa		7.32	□□□□□ -1.24
CRNKL1-205	ENST00000496549	CCDC71L	Q8N9Z2	235 aa		7.32	□□□□□ -1.24
CRNKL1-205	ENST00000496549	CLEC18C	Q8NCF0	446 aa		7.32	□□□□□ -1.24
CRNKL1-205	ENST00000496549	ZNF439	Q8NDP4	499 aa		7.32	□□□□□ -1.24
CRNKL1-205	ENST00000496549	PFN4	Q8NHR9	129 aa		7.32	□□□□□ -1.24
CRNKL1-205	ENST00000496549	KTI12	Q96EK9	354 aa	Predicted RBP	7.32	□□□□□ -1.24
CRNKL1-205	ENST00000496549	NMNAT3	Q96T66	252 aa		7.32	□□□□□ -1.24
CRNKL1-205	ENST00000496549	TPSD1	Q9BZJ3	242 aa		7.32	□□□□□ -1.24
CRNKL1-205	ENST00000496549		Q9N2J8	555 aa		7.32	□□□□□ -1.24
CRNKL1-205	ENST00000496549	COL4A1	P02462	1669 aa		7.32	□□□□□ -1.24
CRNKL1-205	ENST00000496549	KIR2DL5B	A0A0G2JN68	375 aa		7.32	□□□□□ -1.24
CRNKL1-205	ENST00000496549	KIR2DL5B	A0A0G2JPC4	375 aa		7.32	□□□□□ -1.24
CRNKL1-205	ENST00000496549	CDC14C	A4D256	554 aa		7.32	□□□□□ -1.24
CRNKL1-205	ENST00000496549		A8MVM7	634 aa		7.32	□□□□□ -1.24
CRNKL1-205	ENST00000496549	ZNF207	O43670	478 aa	Known RBP	7.32	□□□□□ -1.24
CRNKL1-205	ENST00000496549	TBL1X	O60907	577 aa		7.32	□□□□□ -1.24
CRNKL1-205	ENST00000496549	OR10J4	P0C629	311 aa		7.32	□□□□□ -1.24
CRNKL1-205	ENST00000496549	CRISP2	P16562	243 aa		7.32	□□□□□ -1.24
CRNKL1-205	ENST00000496549	KCNMB1	Q16558	191 aa		7.32	□□□□□ -1.24
CRNKL1-205	ENST00000496549	SLC18B1	Q6NT16	456 aa		7.32	□□□□□ -1.24
CRNKL1-205	ENST00000496549	LCN15	Q6UWW0	184 aa		7.32	□□□□□ -1.24
CRNKL1-205	ENST00000496549	KIR2DL5A	Q8N109	375 aa		7.32	□□□□□ -1.24
CRNKL1-205	ENST00000496549	OR51A4	Q8NGJ6	313 aa		7.32	□□□□□ -1.24
CRNKL1-205	ENST00000496549	TMEM170A	Q8WVE7	144 aa		7.32	□□□□□ -1.24
CRNKL1-205	ENST00000496549	ZNF48	Q96MX3	618 aa	Predicted RBP	7.32	□□□□□ -1.24
CRNKL1-205	ENST00000496549	ALKBH3	Q96Q83	286 aa	Predicted RBP	7.32	□□□□□ -1.24
CRNKL1-205	ENST00000496549	SLC2A4RG	Q9NR83	387 aa		7.32	□□□□□ -1.24
CRNKL1-205	ENST00000496549	CLEC5A	Q9NY25	188 aa		7.32	□□□□□ -1.24
CRNKL1-205	ENST00000496549	CDC42EP3	Q9UKI2	254 aa		7.32	□□□□□ -1.24
CRNKL1-205	ENST00000496549	B3GALT1	Q9Y5Z6	326 aa		7.32	□□□□□ -1.24
CRNKL1-205	ENST00000496549		A0A0U1RQV5	110 aa		7.32	□□□□□ -1.24
CRNKL1-205	ENST00000496549	NPIPA5	E9PKD4	350 aa		7.32	□□□□□ -1.24
CRNKL1-205	ENST00000496549	NPIPA3	F8WFD2	350 aa		7.32	□□□□□ -1.24
CRNKL1-205	ENST00000496549		M0QZ24	198 aa		7.32	□□□□□ -1.24
CRNKL1-205	ENST00000496549	HRAS	P01112	189 aa		7.32	□□□□□ -1.24
CRNKL1-205	ENST00000496549	APOA2	P02652	100 aa		7.32	□□□□□ -1.24
CRNKL1-205	ENST00000496549	SRP19	P09132	144 aa	Known RBP	7.32	□□□□□ -1.24
CRNKL1-205	ENST00000496549	CD46	P15529	392 aa		7.32	□□□□□ -1.24
CRNKL1-205	ENST00000496549	ARL3	P36405	182 aa		7.32	□□□□□ -1.24
CRNKL1-205	ENST00000496549	EFNB2	P52799	333 aa		7.32	□□□□□ -1.24
CRNKL1-205	ENST00000496549	OR2L13	Q8N349	312 aa		7.32	□□□□□ -1.24
CRNKL1-205	ENST00000496549	RNF39	Q9H2S5	420 aa		7.32	□□□□□ -1.24
CRNKL1-205	ENST00000496549	SLC39A9	Q9NUM3	307 aa		7.32	□□□□□ -1.24
CRNKL1-205	ENST00000496549	TMEM106B	Q9NUM4	274 aa		7.32	□□□□□ -1.24
CRNKL1-205	ENST00000496549	TMEM242	Q9NWH2	141 aa		7.32	□□□□□ -1.24
CRNKL1-205	ENST00000496549	ABT1	Q9ULW3	272 aa	Known RBP	7.32	□□□□□ -1.24
CRNKL1-205	ENST00000496549	NPIPA1	Q9UND3	350 aa		7.32	□□□□□ -1.24
CRNKL1-205	ENST00000496549	COX11	Q9Y6N1	276 aa		7.32	□□□□□ -1.24
CRNKL1-205	ENST00000496549	ARID2	Q68CP9	1835 aa		7.31	□□□□□ -1.24
CRNKL1-205	ENST00000496549	CCL25	O15444	150 aa		7.31	□□□□□ -1.24
CRNKL1-205	ENST00000496549	SOCS5	O75159	536 aa		7.31	□□□□□ -1.24
CRNKL1-205	ENST00000496549	LEFTY1	O75610	366 aa		7.31	□□□□□ -1.24
CRNKL1-205	ENST00000496549	MMP9	P14780	707 aa		7.31	□□□□□ -1.24
CRNKL1-205	ENST00000496549	CTXN3	Q4LDR2	81 aa		7.31	□□□□□ -1.24
CRNKL1-205	ENST00000496549	PHYHD1	Q5SRE7	291 aa		7.31	□□□□□ -1.24
CRNKL1-205	ENST00000496549	C16orf82	Q7Z2V1	217 aa		7.31	□□□□□ -1.24
CRNKL1-205	ENST00000496549	OR8G5	Q8NG78	346 aa		7.31	□□□□□ -1.24
CRNKL1-205	ENST00000496549	ADAMTS18	Q8TE60	1221 aa		7.31	□□□□□ -1.24
CRNKL1-205	ENST00000496549	TMEM234	Q8WY98	164 aa		7.31	□□□□□ -1.24
CRNKL1-205	ENST00000496549		Q96M85	177 aa		7.31	□□□□□ -1.24
CRNKL1-205	ENST00000496549	DCBLD2	Q96PD2	775 aa		7.31	□□□□□ -1.24
CRNKL1-205	ENST00000496549	CLDND1	Q9NY35	253 aa		7.31	□□□□□ -1.24
CRNKL1-205	ENST00000496549		A0A1W2PRS3	328 aa		7.31	□□□□□ -1.24
CRNKL1-205	ENST00000496549	GAGE10	A6NGK3	116 aa		7.31	□□□□□ -1.24
CRNKL1-205	ENST00000496549	HIDE1	A8MVS5	230 aa		7.31	□□□□□ -1.24
CRNKL1-205	ENST00000496549	CDC42EP2	O14613	210 aa		7.31	□□□□□ -1.24
CRNKL1-205	ENST00000496549	PIN1P1	O15428	100 aa		7.31	□□□□□ -1.24
CRNKL1-205	ENST00000496549	GNG7	O60262	68 aa		7.31	□□□□□ -1.24
CRNKL1-205	ENST00000496549	IGLV3-25	P01717	112 aa		7.31	□□□□□ -1.24
CRNKL1-205	ENST00000496549	HIST1H1C	P16403	213 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24
CRNKL1-205	ENST00000496549	ADRA2C	P18825	462 aa		7.31	□□□□□ -1.24
CRNKL1-205	ENST00000496549	WNT5A	P41221	380 aa		7.31	□□□□□ -1.24
CRNKL1-205	ENST00000496549	AMT	P48728	403 aa		7.31	□□□□□ -1.24
CRNKL1-205	ENST00000496549	VASP	P50552	380 aa	Predicted RBP	7.31	□□□□□ -1.24
CRNKL1-205	ENST00000496549	RPS15	P62841	145 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24
CRNKL1-205	ENST00000496549	RAB31	Q13636	194 aa		7.31	□□□□□ -1.24

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