RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489247.1

ATG4A-208, Transcript of autophagy related 4A cysteine peptidase, human

TSL 2

Gene ATG4A, Length 623 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATG4A-208	ENST00000489247	CHRM2	P08172	466 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	CSF1	P09603	554 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	TMIGD3	P0DMS9	266 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	FCGR2A	P12318	317 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	ZNF20	P17024	532 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	ZNF32	P17041	273 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	TBP	P20226	339 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	MAL	P21145	153 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	TPTE	P56180	551 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	RAB25	P57735	213 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	ACTB	P60709	375 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	RAB1A	P62820	205 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	ACTG1	P63261	375 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	NKX6-1	P78426	367 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	PSG4	Q00888	419 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	PLGLB1	Q02325	96 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	TLE1	Q04724	770 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	SPOCK1	Q08629	439 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	CD300C	Q08708	224 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	UNC119	Q13432	240 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	CNN3	Q15417	329 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	OR8B8	Q15620	311 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	ODF4	Q2M2E3	257 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	CEACAM16	Q2WEN9	425 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	GAGE13	Q4V321	117 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	ATP1A1-AS1	Q5TC04	95 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	TSPO2	Q5TGU0	170 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	ASCL4	Q6XD76	172 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	FAM57B	Q71RH2	274 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	SLC16A14	Q7RTX9	510 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	ABHD12B	Q7Z5M8	362 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	PAQR4	Q8N4S7	273 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	FAM89B	Q8N5H3	189 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	TMEM229B	Q8NBD8	167 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	OR52N4	Q8NGI2	321 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	OR4D6	Q8NGJ1	314 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	OR56B4	Q8NH76	319 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	SVIP	Q8NHG7	77 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	SPSB1	Q96BD6	273 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	SGK3	Q96BR1	496 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	PGAM5	Q96HS1	289 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	ZFP3	Q96NJ6	502 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	TECTB	Q96PL2	329 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	RBM24	Q9BX46	236 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	C1QTNF5	Q9BXJ0	243 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	CACNG6	Q9BXT2	260 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	MOV10	Q9HCE1	1003 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	MYOZ1	Q9NP98	299 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	GLRX2	Q9NS18	164 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	SLC7A10	Q9NS82	523 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	DLL3	Q9NYJ7	618 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	PLEK2	Q9NYT0	353 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	SPRR3	Q9UBC9	169 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	CLCF1	Q9UBD9	225 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	MRPS7	Q9Y2R9	242 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	NOSIP	Q9Y314	301 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	ALG5	Q9Y673	324 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	FRYL	O94915	3013 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	KNTC1	P50748	2209 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	RALGAPA1	Q6GYQ0	2036 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	TRAV18	A0A075B6X5	111 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247		A0A1B0GUH1	482 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	LINC00854	A0A1B0GVQ3	168 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	C5orf63	A6NC05	138 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	METTL21EP	A6NDL7	271 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	WIPF3	A6NGB9	483 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	ZNF587B	E7ETH6	402 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	TFEC	O14948	347 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	RBBP9	O75884	186 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	CCNK	O75909	580 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	KDM4B	O94953	1096 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	NDUFB6	O95139	128 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	TGM6	O95932	706 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	DHFR	P00374	187 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	F10	P00742	488 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	ABO	P16442	354 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	PSMB1	P20618	241 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	PRSS3	P35030	304 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	FAU	P35544	74 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	ZNF93	P35789	620 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	EIF2S3	P41091	472 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	SRP9	P49458	86 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	NOVA1	P51513	510 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	RRAS2	P62070	204 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	ARG2	P78540	354 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	PMPCA	Q10713	525 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	MADCAM1	Q13477	382 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	ZMYND11	Q15326	602 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	GSG1	Q2KHT4	349 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	ZNF260	Q3ZCT1	412 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	ATAD3C	Q5T2N8	411 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	RSBN1	Q5VWQ0	802 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	RPUSD3	Q6P087	351 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	ZNF585A	Q6P3V2	769 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	LUZP2	Q86TE4	346 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	VASH2	Q86V25	355 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	SKA3	Q8IX90	412 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	IZUMO1	Q8IYV9	350 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	JAGN1	Q8N5M9	183 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247		Q8NFD4	153 aa		4.8	□□□□□ -1.64

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