RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488989.1

CLDN11-208, Transcript of claudin 11, human

TSL 4

Gene CLDN11, Length 600 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CLDN11-208	ENST00000488989	DYNC1I2	Q13409	638 aa	Known RBP	13.64	□□□□□ -0.23
CLDN11-208	ENST00000488989	RIN1	Q13671	783 aa		13.64	□□□□□ -0.23
CLDN11-208	ENST00000488989	DGUOK	Q16854	277 aa		13.64	□□□□□ -0.23
CLDN11-208	ENST00000488989	SWI5	Q1ZZU3	235 aa		13.64	□□□□□ -0.23
CLDN11-208	ENST00000488989	MST1L	Q2TV78	715 aa		13.64	□□□□□ -0.23
CLDN11-208	ENST00000488989	FAM76B	Q5HYJ3	339 aa		13.64	□□□□□ -0.23
CLDN11-208	ENST00000488989	SP5	Q6BEB4	398 aa	Predicted RBP	13.64	□□□□□ -0.23
CLDN11-208	ENST00000488989	BORCS8	Q96FH0	119 aa		13.64	□□□□□ -0.23
CLDN11-208	ENST00000488989	HIST1H2AA	Q96QV6	131 aa		13.64	□□□□□ -0.23
CLDN11-208	ENST00000488989	ADAT1	Q9BUB4	502 aa	Known RBP	13.64	□□□□□ -0.23
CLDN11-208	ENST00000488989	NXF2	Q9GZY0	626 aa	Known RBP	13.64	□□□□□ -0.23
CLDN11-208	ENST00000488989	PTTG2	Q9NZH5	202 aa		13.64	□□□□□ -0.23
CLDN11-208	ENST00000488989	A3GALT2	U3KPV4	340 aa		13.64	□□□□□ -0.23
CLDN11-208	ENST00000488989	PMF1-BGLAP	U3KQ54	211 aa		13.64	□□□□□ -0.23
CLDN11-208	ENST00000488989	HELZ2	Q9BYK8	2649 aa	Known RBP	13.64	□□□□□ -0.23
CLDN11-208	ENST00000488989	DOPEY2	Q9Y3R5	2298 aa		13.64	□□□□□ -0.23
CLDN11-208	ENST00000488989	DSCAM	O60469	2012 aa		13.63	□□□□□ -0.23
CLDN11-208	ENST00000488989	IGKV1-27	A0A075B6S5	117 aa		13.63	□□□□□ -0.23
CLDN11-208	ENST00000488989	ZSCAN5B	A6NJL1	495 aa		13.63	□□□□□ -0.23
CLDN11-208	ENST00000488989		H0YL77	283 aa		13.63	□□□□□ -0.23
CLDN11-208	ENST00000488989	HS3ST1	O14792	307 aa		13.63	□□□□□ -0.23
CLDN11-208	ENST00000488989	THBS2	P35442	1172 aa		13.63	□□□□□ -0.23
CLDN11-208	ENST00000488989	ZNF93	P35789	620 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
CLDN11-208	ENST00000488989	RBP2	P50120	134 aa		13.63	□□□□□ -0.23
CLDN11-208	ENST00000488989	ATP1B3	P54709	279 aa		13.63	□□□□□ -0.23
CLDN11-208	ENST00000488989	ZP1	P60852	638 aa		13.63	□□□□□ -0.23
CLDN11-208	ENST00000488989	GNG3	P63215	75 aa		13.63	□□□□□ -0.23
CLDN11-208	ENST00000488989	OR8G1	Q15617	311 aa		13.63	□□□□□ -0.23
CLDN11-208	ENST00000488989	KISS1	Q15726	138 aa		13.63	□□□□□ -0.23
CLDN11-208	ENST00000488989	DMRTC1	Q5HYR2	192 aa		13.63	□□□□□ -0.23
CLDN11-208	ENST00000488989	RNF144B	Q7Z419	303 aa		13.63	□□□□□ -0.23
CLDN11-208	ENST00000488989	OR6M1	Q8NGM8	313 aa		13.63	□□□□□ -0.23
CLDN11-208	ENST00000488989	NPRL2	Q8WTW4	380 aa		13.63	□□□□□ -0.23
CLDN11-208	ENST00000488989	DVL3	Q92997	716 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
CLDN11-208	ENST00000488989	FBXW5	Q969U6	566 aa		13.63	□□□□□ -0.23
CLDN11-208	ENST00000488989	KCTD12	Q96CX2	325 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
CLDN11-208	ENST00000488989	CPNE2	Q96FN4	548 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
CLDN11-208	ENST00000488989	MICU1	Q9BPX6	476 aa		13.63	□□□□□ -0.23
CLDN11-208	ENST00000488989	RTL8A	Q9BWD3	113 aa		13.63	□□□□□ -0.23
CLDN11-208	ENST00000488989	MSL2	Q9HCI7	577 aa		13.63	□□□□□ -0.23
CLDN11-208	ENST00000488989	HRNR	Q86YZ3	2850 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
CLDN11-208	ENST00000488989	CACNA1D	Q01668	2161 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CLDN11-208	ENST00000488989		A0A075B6Q4	140 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CLDN11-208	ENST00000488989	KIR2DP1	A0A0G2JNF4	349 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
CLDN11-208	ENST00000488989	PLSCR5	A0PG75	271 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CLDN11-208	ENST00000488989		A1L4Q6	167 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CLDN11-208	ENST00000488989	TMEM210	A6NLX4	147 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CLDN11-208	ENST00000488989	ZNF732	B4DXR9	585 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CLDN11-208	ENST00000488989	PTBP3	O95758	552 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
CLDN11-208	ENST00000488989	OCM	P0CE72	109 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
CLDN11-208	ENST00000488989	CD200	P41217	278 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CLDN11-208	ENST00000488989	ALDH3B1	P43353	468 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CLDN11-208	ENST00000488989	RANBP1	P43487	201 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CLDN11-208	ENST00000488989	NKPD1	Q17RQ9	610 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CLDN11-208	ENST00000488989	FBXL14	Q8N1E6	418 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CLDN11-208	ENST00000488989	MUC15	Q8N387	334 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CLDN11-208	ENST00000488989	JAGN1	Q8N5M9	183 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CLDN11-208	ENST00000488989	OR8S1	Q8NH09	359 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CLDN11-208	ENST00000488989	TRMT10A	Q8TBZ6	339 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
CLDN11-208	ENST00000488989	SLC25A28	Q96A46	364 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CLDN11-208	ENST00000488989	RNF170	Q96K19	258 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CLDN11-208	ENST00000488989	SORCS2	Q96PQ0	1159 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CLDN11-208	ENST00000488989	SPACA5	Q96QH8	159 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CLDN11-208	ENST00000488989	DIRC2	Q96SL1	478 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CLDN11-208	ENST00000488989	MRI1	Q9BV20	369 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CLDN11-208	ENST00000488989	CXXC4	Q9H2H0	198 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CLDN11-208	ENST00000488989	CNTD2	Q9H8S5	307 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CLDN11-208	ENST00000488989	STEAP1	Q9UHE8	339 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CLDN11-208	ENST00000488989	ZDHHC8	Q9ULC8	765 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CLDN11-208	ENST00000488989	TENM4	Q6N022	2769 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CLDN11-208	ENST00000488989	USP9Y	O00507	2555 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
CLDN11-208	ENST00000488989	FAM230A	A0A1W2PPH8	454 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CLDN11-208	ENST00000488989	CTAG2	O75638	210 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CLDN11-208	ENST00000488989	CD55	P08174	381 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CLDN11-208	ENST00000488989	DANCR	P0C864	163 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CLDN11-208	ENST00000488989	SLC2A2	P11168	524 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
CLDN11-208	ENST00000488989	NAT2	P11245	290 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CLDN11-208	ENST00000488989	COX6B1	P14854	86 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CLDN11-208	ENST00000488989	HTR2C	P28335	458 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CLDN11-208	ENST00000488989	ZNF81	P51508	661 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CLDN11-208	ENST00000488989	GPM6A	P51674	278 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CLDN11-208	ENST00000488989	MTCP1	P56278	107 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CLDN11-208	ENST00000488989	SCAND1	P57086	179 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CLDN11-208	ENST00000488989	TLE4	Q04727	773 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CLDN11-208	ENST00000488989	MZT1	Q08AG7	82 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CLDN11-208	ENST00000488989	MAB21L1	Q13394	359 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CLDN11-208	ENST00000488989	HES5	Q5TA89	166 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CLDN11-208	ENST00000488989	ASCL4	Q6XD76	172 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CLDN11-208	ENST00000488989	WDR86	Q86TI4	376 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CLDN11-208	ENST00000488989	DTX2	Q86UW9	622 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CLDN11-208	ENST00000488989	CELF2-AS1	Q8N7Q2	184 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CLDN11-208	ENST00000488989	ZNF611	Q8N823	705 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CLDN11-208	ENST00000488989	OR4D6	Q8NGJ1	314 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CLDN11-208	ENST00000488989	ACOT12	Q8WYK0	555 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CLDN11-208	ENST00000488989	AP3S1	Q92572	193 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CLDN11-208	ENST00000488989	GTF3A	Q92664	365 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
CLDN11-208	ENST00000488989	PSMG3-AS1	Q96PY0	264 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CLDN11-208	ENST00000488989	OR51I2	Q9H344	312 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CLDN11-208	ENST00000488989	PLGRKT	Q9HBL7	147 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CLDN11-208	ENST00000488989	ABRACL	Q9P1F3	81 aa		13.61	□□□□□ -0.23

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.9 ms