RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483282.1

C1orf43-208, Transcript of chromosome 1 open reading frame 43, humanhuman

TSL 3

Gene C1orf43, Length 456 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf43-208ENST00000483282 HCSTQ9UBK5 93 aa7.41□□□□□ -1.22
C1orf43-208ENST00000483282 FBXL17Q9UF56 701 aa7.41□□□□□ -1.22
C1orf43-208ENST00000483282 ZNF230Q9UIE0 474 aaPredicted RBP7.41□□□□□ -1.22
C1orf43-208ENST00000483282 POLR1DQ9Y2S0 133 aa7.41□□□□□ -1.22
C1orf43-208ENST00000483282 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
C1orf43-208ENST00000483282 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa7.4□□□□□ -1.22
C1orf43-208ENST00000483282 TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 330 aa7.4□□□□□ -1.22
C1orf43-208ENST00000483282 KIR2DS1A0A191URI9 304 aa7.4□□□□□ -1.22
C1orf43-208ENST00000483282 POM121BA6NF01 834 aa7.4□□□□□ -1.22
C1orf43-208ENST00000483282 GJE1A6NN92 205 aa7.4□□□□□ -1.22
C1orf43-208ENST00000483282 ZNF726A6NNF4 738 aa7.4□□□□□ -1.22
C1orf43-208ENST00000483282 CDRT15L2A8MXV6 281 aa7.4□□□□□ -1.22
C1orf43-208ENST00000483282 LINC00587B1AMM8 73 aa7.4□□□□□ -1.22
C1orf43-208ENST00000483282 TRDCB7Z8K6 153 aa7.4□□□□□ -1.22
C1orf43-208ENST00000483282 RPL36A-HNRNPH2H7BZ11 118 aa7.4□□□□□ -1.22
C1orf43-208ENST00000483282 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
C1orf43-208ENST00000483282 TOX3O15405 576 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
C1orf43-208ENST00000483282 DHRS3O75911 302 aa7.4□□□□□ -1.22
C1orf43-208ENST00000483282 VENTXO95231 258 aa7.4□□□□□ -1.22
C1orf43-208ENST00000483282 CYB5R3P00387 301 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
C1orf43-208ENST00000483282 IGKV1D-16P01601 117 aa7.4□□□□□ -1.22
C1orf43-208ENST00000483282 PMP2P02689 132 aa7.4□□□□□ -1.22
C1orf43-208ENST00000483282 CT62P0C5K7 136 aa7.4□□□□□ -1.22
C1orf43-208ENST00000483282 ZNF728P0DKX0 622 aa7.4□□□□□ -1.22
C1orf43-208ENST00000483282 DAOP14920 347 aa7.4□□□□□ -1.22
C1orf43-208ENST00000483282 ITGA3P26006 1051 aa7.4□□□□□ -1.22
C1orf43-208ENST00000483282 GRPRP30550 384 aa7.4□□□□□ -1.22
C1orf43-208ENST00000483282 KIR2DS4P43632 304 aa7.4□□□□□ -1.22
C1orf43-208ENST00000483282 LPAR6P43657 344 aa7.4□□□□□ -1.22
C1orf43-208ENST00000483282 P2RY4P51582 365 aa7.4□□□□□ -1.22
C1orf43-208ENST00000483282 ZNF41P51814 821 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
C1orf43-208ENST00000483282 RND2P52198 227 aa7.4□□□□□ -1.22
C1orf43-208ENST00000483282 CLDN2P57739 230 aa7.4□□□□□ -1.22
C1orf43-208ENST00000483282 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
C1orf43-208ENST00000483282 HERV-K104P61576 105 aa7.4□□□□□ -1.22
C1orf43-208ENST00000483282 RPL23AP62750 156 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
C1orf43-208ENST00000483282 HLA-DRB3P79483 266 aa7.4□□□□□ -1.22
C1orf43-208ENST00000483282 LCN2P80188 198 aa7.4□□□□□ -1.22
C1orf43-208ENST00000483282 HSF1Q00613 529 aa7.4□□□□□ -1.22
C1orf43-208ENST00000483282 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
C1orf43-208ENST00000483282 HHEXQ03014 270 aa7.4□□□□□ -1.22
C1orf43-208ENST00000483282 KIR2DS1Q14954 304 aa7.4□□□□□ -1.22
C1orf43-208ENST00000483282 EBPQ15125 230 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
C1orf43-208ENST00000483282 IQCJQ1A5X6 159 aa7.4□□□□□ -1.22
C1orf43-208ENST00000483282 COX19Q49B96 90 aa7.4□□□□□ -1.22
C1orf43-208ENST00000483282 BEX5Q5H9J7 111 aa7.4□□□□□ -1.22
C1orf43-208ENST00000483282 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
C1orf43-208ENST00000483282 ZNF506Q5JVG8 444 aa7.4□□□□□ -1.22
C1orf43-208ENST00000483282 CYB5R2Q6BCY4 276 aa7.4□□□□□ -1.22
C1orf43-208ENST00000483282 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
C1orf43-208ENST00000483282 KCNIP4Q6PIL6 250 aa7.4□□□□□ -1.22
C1orf43-208ENST00000483282 CBLN3Q6UW01 205 aa7.4□□□□□ -1.22
C1orf43-208ENST00000483282 NPSR1Q6W5P4 371 aa7.4□□□□□ -1.22
C1orf43-208ENST00000483282 LHFPL2Q6ZUX7 228 aa7.4□□□□□ -1.22
C1orf43-208ENST00000483282 TMPRSS9Q7Z410 1059 aa7.4□□□□□ -1.22
C1orf43-208ENST00000483282 BIVMQ86UB2 503 aa7.4□□□□□ -1.22
C1orf43-208ENST00000483282 UEVLDQ8IX04 471 aa7.4□□□□□ -1.22
C1orf43-208ENST00000483282 OR4D6Q8NGJ1 314 aa7.4□□□□□ -1.22
C1orf43-208ENST00000483282 OR51A4Q8NGJ6 313 aa7.4□□□□□ -1.22
C1orf43-208ENST00000483282 OR2I1PQ8NGU4 316 aa7.4□□□□□ -1.22
C1orf43-208ENST00000483282 OR10G6Q8NH81 332 aa7.4□□□□□ -1.22
C1orf43-208ENST00000483282 C2CD4CQ8TF44 421 aa7.4□□□□□ -1.22
C1orf43-208ENST00000483282 TMEM18Q96B42 140 aa7.4□□□□□ -1.22
C1orf43-208ENST00000483282 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
C1orf43-208ENST00000483282 RCC1LQ96I51 464 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
C1orf43-208ENST00000483282 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
C1orf43-208ENST00000483282 TGM7Q96PF1 710 aa7.4□□□□□ -1.22
C1orf43-208ENST00000483282 OR5B12Q96R08 314 aa7.4□□□□□ -1.22
C1orf43-208ENST00000483282 PIGQQ9BRB3 760 aa7.4□□□□□ -1.22
C1orf43-208ENST00000483282 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
C1orf43-208ENST00000483282 PLK3Q9H4B4 646 aa7.4□□□□□ -1.22
C1orf43-208ENST00000483282 PTGES2Q9H7Z7 377 aa7.4□□□□□ -1.22
C1orf43-208ENST00000483282 FN3KRPQ9HA64 309 aa7.4□□□□□ -1.22
C1orf43-208ENST00000483282 FGF22Q9HCT0 170 aa7.4□□□□□ -1.22
C1orf43-208ENST00000483282 MRPL22Q9NWU5 206 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
C1orf43-208ENST00000483282 ANXA10Q9UJ72 324 aa7.4□□□□□ -1.22
C1orf43-208ENST00000483282 FBXO4Q9UKT5 387 aa7.4□□□□□ -1.22
C1orf43-208ENST00000483282 CYP8B1Q9UNU6 501 aa7.4□□□□□ -1.22
C1orf43-208ENST00000483282 KLHDC2Q9Y2U9 406 aa7.4□□□□□ -1.22
C1orf43-208ENST00000483282 BRCA2P51587 3418 aa7.39□□□□□ -1.23
C1orf43-208ENST00000483282 HTTP42858 3142 aa7.39□□□□□ -1.23
C1orf43-208ENST00000483282 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa7.39□□□□□ -1.23
C1orf43-208ENST00000483282 NPIPA5A0A0B4J1W7 369 aa7.39□□□□□ -1.23
C1orf43-208ENST00000483282 NPIPA7E9PJI5 369 aa7.39□□□□□ -1.23
C1orf43-208ENST00000483282 TMEM250H0YL14 139 aa7.39□□□□□ -1.23
C1orf43-208ENST00000483282 PSMD9O00233 223 aa7.39□□□□□ -1.23
C1orf43-208ENST00000483282 CCSO14618 274 aa7.39□□□□□ -1.23
C1orf43-208ENST00000483282 MSTNO14793 375 aa7.39□□□□□ -1.23
C1orf43-208ENST00000483282 TSPAN2O60636 221 aa7.39□□□□□ -1.23
C1orf43-208ENST00000483282 DDAH2O95865 285 aa7.39□□□□□ -1.23
C1orf43-208ENST00000483282 MPIG6BO95866 241 aa7.39□□□□□ -1.23
C1orf43-208ENST00000483282 PNPP00491 289 aa7.39□□□□□ -1.23
C1orf43-208ENST00000483282 HLA-HP01893 362 aa7.39□□□□□ -1.23
C1orf43-208ENST00000483282 TTRP02766 147 aa7.39□□□□□ -1.23
C1orf43-208ENST00000483282 IGKV3-11P04433 115 aa7.39□□□□□ -1.23
C1orf43-208ENST00000483282 CSN2P05814 226 aa7.39□□□□□ -1.23
C1orf43-208ENST00000483282 NPIPA8P0DM63 369 aa7.39□□□□□ -1.23
C1orf43-208ENST00000483282 CD99P14209 185 aa7.39□□□□□ -1.23
C1orf43-208ENST00000483282 GNB3P16520 340 aa7.39□□□□□ -1.23
C1orf43-208ENST00000483282 ZNF708P17019 499 aa7.39□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.8 ms