RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475558.5

SHQ1-207, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 5

Gene SHQ1, Length 666 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-207ENST00000475558 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
SHQ1-207ENST00000475558 PPP1CBP62140 327 aa6.05□□□□□ -1.44
SHQ1-207ENST00000475558 FAM3AP98173 230 aa6.05□□□□□ -1.44
SHQ1-207ENST00000475558 MXD1Q05195 221 aa6.05□□□□□ -1.44
SHQ1-207ENST00000475558 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
SHQ1-207ENST00000475558 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
SHQ1-207ENST00000475558 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
SHQ1-207ENST00000475558 OR8B8Q15620 311 aa6.05□□□□□ -1.44
SHQ1-207ENST00000475558 DEFB113Q30KQ7 82 aa6.05□□□□□ -1.44
SHQ1-207ENST00000475558 CEP78Q5JTW2 689 aa6.05□□□□□ -1.44
SHQ1-207ENST00000475558 C1orf100Q5SVJ3 147 aa6.05□□□□□ -1.44
SHQ1-207ENST00000475558 IDNKQ5T6J7 187 aa6.05□□□□□ -1.44
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SHQ1-207ENST00000475558 CLEC9AQ6UXN8 241 aa6.05□□□□□ -1.44
SHQ1-207ENST00000475558 LHFPL2Q6ZUX7 228 aa6.05□□□□□ -1.44
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SHQ1-207ENST00000475558 LRRC28Q86X40 367 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
SHQ1-207ENST00000475558 LIX1LQ8IVB5 337 aa6.05□□□□□ -1.44
SHQ1-207ENST00000475558 ZSCAN4Q8NAM6 433 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
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SHQ1-207ENST00000475558 PPP1R14AQ96A00 147 aa6.05□□□□□ -1.44
SHQ1-207ENST00000475558 MRPS24Q96EL2 167 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
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SHQ1-207ENST00000475558 CHST5Q9GZS9 411 aa6.05□□□□□ -1.44
SHQ1-207ENST00000475558 C6orf62Q9GZU0 229 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
SHQ1-207ENST00000475558 ESRP2Q9H6T0 727 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
SHQ1-207ENST00000475558 METTL17Q9H7H0 456 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
SHQ1-207ENST00000475558 DIABLOQ9NR28 239 aa6.05□□□□□ -1.44
SHQ1-207ENST00000475558 CYSLTR2Q9NS75 346 aa6.05□□□□□ -1.44
SHQ1-207ENST00000475558 FBLN5Q9UBX5 448 aa6.05□□□□□ -1.44
SHQ1-207ENST00000475558 RAB22AQ9UL26 194 aa6.05□□□□□ -1.44
SHQ1-207ENST00000475558 PIGLQ9Y2B2 252 aa6.05□□□□□ -1.44
SHQ1-207ENST00000475558 AK6Q9Y3D8 172 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
SHQ1-207ENST00000475558 CMAHPQ9Y471 501 aa6.05□□□□□ -1.44
SHQ1-207ENST00000475558 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa6.04□□□□□ -1.44
SHQ1-207ENST00000475558 FABP12A6NFH5 140 aa6.04□□□□□ -1.44
SHQ1-207ENST00000475558 CD300LBA8K4G0 201 aa6.04□□□□□ -1.44
SHQ1-207ENST00000475558 GMDSO60547 372 aa6.04□□□□□ -1.44
SHQ1-207ENST00000475558 SLC2A1P11166 492 aa6.04□□□□□ -1.44
SHQ1-207ENST00000475558 ARSBP15848 533 aa6.04□□□□□ -1.44
SHQ1-207ENST00000475558 RAB6AP20340 208 aa6.04□□□□□ -1.44
SHQ1-207ENST00000475558 TNFSF8P32971 234 aa6.04□□□□□ -1.44
SHQ1-207ENST00000475558 ZNF93P35789 620 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
SHQ1-207ENST00000475558 EVX1P49640 407 aa6.04□□□□□ -1.44
SHQ1-207ENST00000475558 RBP2P50120 134 aa6.04□□□□□ -1.44
SHQ1-207ENST00000475558 IDH3GP51553 393 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
SHQ1-207ENST00000475558 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
SHQ1-207ENST00000475558 NAAAQ02083 359 aa6.04□□□□□ -1.44
SHQ1-207ENST00000475558 FAM27E3Q08E93 113 aa6.04□□□□□ -1.44
SHQ1-207ENST00000475558 GK2Q14410 553 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
SHQ1-207ENST00000475558 TAB1Q15750 504 aa6.04□□□□□ -1.44
SHQ1-207ENST00000475558 RAB11BQ15907 218 aa6.04□□□□□ -1.44
SHQ1-207ENST00000475558 ODF4Q2M2E3 257 aa6.04□□□□□ -1.44
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SHQ1-207ENST00000475558 MBNL2Q5VZF2 373 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
SHQ1-207ENST00000475558 OTPQ5XKR4 325 aa6.04□□□□□ -1.44
SHQ1-207ENST00000475558 Q71RC1 249 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
SHQ1-207ENST00000475558 ZNF573Q86YE8 665 aa6.04□□□□□ -1.44
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SHQ1-207ENST00000475558 SAXO1Q8IYX7 474 aa6.04□□□□□ -1.44
SHQ1-207ENST00000475558 GDPD1Q8N9F7 314 aa6.04□□□□□ -1.44
SHQ1-207ENST00000475558 WFDC11Q8NEX6 87 aa6.04□□□□□ -1.44
SHQ1-207ENST00000475558 NUP37Q8NFH4 326 aa6.04□□□□□ -1.44
SHQ1-207ENST00000475558 SPATA3Q8NHX4 192 aa6.04□□□□□ -1.44
SHQ1-207ENST00000475558 KCNG3Q8TAE7 436 aa6.04□□□□□ -1.44
SHQ1-207ENST00000475558 TBC1D15Q8TC07 691 aa6.04□□□□□ -1.44
SHQ1-207ENST00000475558 DEDD2Q8WXF8 326 aa6.04□□□□□ -1.44
SHQ1-207ENST00000475558 RGP1Q92546 391 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
SHQ1-207ENST00000475558 BORCS5Q969J3 196 aa6.04□□□□□ -1.44
SHQ1-207ENST00000475558 S100PBPQ96BU1 408 aa6.04□□□□□ -1.44
SHQ1-207ENST00000475558 BORCS8Q96FH0 119 aa6.04□□□□□ -1.44
SHQ1-207ENST00000475558 TRMT61AQ96FX7 289 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
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SHQ1-207ENST00000475558 SMR3AQ99954 134 aa6.04□□□□□ -1.44
SHQ1-207ENST00000475558 MICU1Q9BPX6 476 aa6.04□□□□□ -1.44
SHQ1-207ENST00000475558 NUDT16L1Q9BRJ7 211 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
SHQ1-207ENST00000475558 CST11Q9H112 138 aa6.04□□□□□ -1.44
SHQ1-207ENST00000475558 ABCG5Q9H222 651 aa6.04□□□□□ -1.44
SHQ1-207ENST00000475558 TMEM100Q9NV29 134 aa6.04□□□□□ -1.44
SHQ1-207ENST00000475558 CRIM1Q9NZV1 1036 aa6.04□□□□□ -1.44
SHQ1-207ENST00000475558 ZNF319Q9P2F9 582 aa6.04□□□□□ -1.44
SHQ1-207ENST00000475558 COMMD3Q9UBI1 195 aa6.04□□□□□ -1.44
SHQ1-207ENST00000475558 DAPK2Q9UIK4 370 aa6.04□□□□□ -1.44
SHQ1-207ENST00000475558 STARD10Q9Y365 291 aa6.04□□□□□ -1.44
SHQ1-207ENST00000475558 FN1P02751 2386 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
SHQ1-207ENST00000475558 hCG_38984A0A1B0GV85 526 aa6.03□□□□□ -1.44
SHQ1-207ENST00000475558 ISPDA4D126 451 aa6.03□□□□□ -1.44
SHQ1-207ENST00000475558 OR5B21A6NL26 309 aa6.03□□□□□ -1.44
SHQ1-207ENST00000475558 SMPD2O60906 423 aa6.03□□□□□ -1.44
SHQ1-207ENST00000475558 HEXAP06865 529 aa6.03□□□□□ -1.44
SHQ1-207ENST00000475558 HCKP08631 526 aa6.03□□□□□ -1.44
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