RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469529.6

TRAF4-208, Transcript of TNF receptor associated factor 4, human

TSL 2

Gene TRAF4, Length 788 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TRAF4-208	ENST00000469529	ADAM5	Q6NVV9	412 aa		10.9	□□□□□ -0.66
TRAF4-208	ENST00000469529	CDH24	Q86UP0	819 aa		10.9	□□□□□ -0.66
TRAF4-208	ENST00000469529	TMEM200A	Q86VY9	491 aa		10.9	□□□□□ -0.66
TRAF4-208	ENST00000469529	LRRC28	Q86X40	367 aa	Predicted RBP	10.9	□□□□□ -0.66
TRAF4-208	ENST00000469529	ZDHHC23	Q8IYP9	409 aa		10.9	□□□□□ -0.66
TRAF4-208	ENST00000469529	SAXO1	Q8IYX7	474 aa		10.9	□□□□□ -0.66
TRAF4-208	ENST00000469529	OR13G1	Q8NGZ3	307 aa		10.9	□□□□□ -0.66
TRAF4-208	ENST00000469529	LINC01560	Q8TB33	94 aa		10.9	□□□□□ -0.66
TRAF4-208	ENST00000469529	RAB40A	Q8WXH6	277 aa		10.9	□□□□□ -0.66
TRAF4-208	ENST00000469529	HIST1H2AA	Q96QV6	131 aa		10.9	□□□□□ -0.66
TRAF4-208	ENST00000469529	C6orf62	Q9GZU0	229 aa	Predicted RBP	10.9	□□□□□ -0.66
TRAF4-208	ENST00000469529	MIXL1	Q9H2W2	232 aa		10.9	□□□□□ -0.66
TRAF4-208	ENST00000469529	LIN7B	Q9HAP6	207 aa		10.9	□□□□□ -0.66
TRAF4-208	ENST00000469529	PLGRKT	Q9HBL7	147 aa		10.9	□□□□□ -0.66
TRAF4-208	ENST00000469529	AKIP1	Q9NQ31	210 aa		10.9	□□□□□ -0.66
TRAF4-208	ENST00000469529	GPR173	Q9NS66	373 aa		10.9	□□□□□ -0.66
TRAF4-208	ENST00000469529	TMEM100	Q9NV29	134 aa		10.9	□□□□□ -0.66
TRAF4-208	ENST00000469529	COMMD3	Q9UBI1	195 aa		10.9	□□□□□ -0.66
TRAF4-208	ENST00000469529	OR5V1	Q9UGF6	321 aa		10.9	□□□□□ -0.66
TRAF4-208	ENST00000469529	ADAM30	Q9UKF2	790 aa		10.9	□□□□□ -0.66
TRAF4-208	ENST00000469529	CMAHP	Q9Y471	501 aa		10.9	□□□□□ -0.66
TRAF4-208	ENST00000469529	KLF2	Q9Y5W3	355 aa	Predicted RBP	10.9	□□□□□ -0.66
TRAF4-208	ENST00000469529	SMIM30	A4D0T7	59 aa		10.89	□□□□□ -0.67
TRAF4-208	ENST00000469529	DEFB108A	A8MXU0	73 aa		10.89	□□□□□ -0.67
TRAF4-208	ENST00000469529	SHISA9	B4DS77	424 aa		10.89	□□□□□ -0.67
TRAF4-208	ENST00000469529	CLDN25	C9JDP6	229 aa		10.89	□□□□□ -0.67
TRAF4-208	ENST00000469529	PRSS44	E7EML9	344 aa		10.89	□□□□□ -0.67
TRAF4-208	ENST00000469529	ATP6V1G2-DDX39B	F2Z307	99 aa		10.89	□□□□□ -0.67
TRAF4-208	ENST00000469529	ABCD4	O14678	606 aa		10.89	□□□□□ -0.67
TRAF4-208	ENST00000469529	PTBP3	O95758	552 aa	Known RBP	10.89	□□□□□ -0.67
TRAF4-208	ENST00000469529	CD3E	P07766	207 aa		10.89	□□□□□ -0.67
TRAF4-208	ENST00000469529	ADH4	P08319	380 aa		10.89	□□□□□ -0.67
TRAF4-208	ENST00000469529	ARSB	P15848	533 aa		10.89	□□□□□ -0.67
TRAF4-208	ENST00000469529	RAB6A	P20340	208 aa		10.89	□□□□□ -0.67
TRAF4-208	ENST00000469529	LOX	P28300	417 aa	Predicted RBP	10.89	□□□□□ -0.67
TRAF4-208	ENST00000469529	GRN	P28799	593 aa	Known RBP	10.89	□□□□□ -0.67
TRAF4-208	ENST00000469529	FABP6	P51161	128 aa		10.89	□□□□□ -0.67
TRAF4-208	ENST00000469529	MTCP1	P56278	107 aa		10.89	□□□□□ -0.67
TRAF4-208	ENST00000469529	ZP1	P60852	638 aa		10.89	□□□□□ -0.67
TRAF4-208	ENST00000469529	GNG3	P63215	75 aa		10.89	□□□□□ -0.67
TRAF4-208	ENST00000469529	MZT1	Q08AG7	82 aa		10.89	□□□□□ -0.67
TRAF4-208	ENST00000469529	FAM189A2	Q15884	450 aa		10.89	□□□□□ -0.67
TRAF4-208	ENST00000469529	SPATA46	Q5T0L3	261 aa		10.89	□□□□□ -0.67
TRAF4-208	ENST00000469529	MOB3C	Q70IA8	216 aa		10.89	□□□□□ -0.67
TRAF4-208	ENST00000469529	OR2W3	Q7Z3T1	314 aa		10.89	□□□□□ -0.67
TRAF4-208	ENST00000469529	ANGPTL5	Q86XS5	388 aa		10.89	□□□□□ -0.67
TRAF4-208	ENST00000469529	DMRTC2	Q8IXT2	367 aa	Predicted RBP	10.89	□□□□□ -0.67
TRAF4-208	ENST00000469529	JAGN1	Q8N5M9	183 aa		10.89	□□□□□ -0.67
TRAF4-208	ENST00000469529	PNLDC1	Q8NA58	520 aa	Known RBP	10.89	□□□□□ -0.67
TRAF4-208	ENST00000469529	OR4D6	Q8NGJ1	314 aa		10.89	□□□□□ -0.67
TRAF4-208	ENST00000469529	ZNF671	Q8TAW3	534 aa		10.89	□□□□□ -0.67
TRAF4-208	ENST00000469529	TRMT10A	Q8TBZ6	339 aa	Known RBP	10.89	□□□□□ -0.67
TRAF4-208	ENST00000469529	HPSE2	Q8WWQ2	592 aa		10.89	□□□□□ -0.67
TRAF4-208	ENST00000469529	MRPL24	Q96A35	216 aa	Known RBP	10.89	□□□□□ -0.67
TRAF4-208	ENST00000469529	BORCS8	Q96FH0	119 aa		10.89	□□□□□ -0.67
TRAF4-208	ENST00000469529	ZC3HAV1L	Q96H79	300 aa	Known RBP	10.89	□□□□□ -0.67
TRAF4-208	ENST00000469529	C1orf147	Q96MC9	270 aa	Predicted RBP	10.89	□□□□□ -0.67
TRAF4-208	ENST00000469529	PAPOLG	Q9BWT3	736 aa	Known RBP	10.89	□□□□□ -0.67
TRAF4-208	ENST00000469529	RHOF	Q9HBH0	211 aa		10.89	□□□□□ -0.67
TRAF4-208	ENST00000469529	CA10	Q9NS85	328 aa		10.89	□□□□□ -0.67
TRAF4-208	ENST00000469529	DIDO1	Q9BTC0	2240 aa	Known RBP	10.89	□□□□□ -0.67
TRAF4-208	ENST00000469529		A0A0A6YYH2	397 aa		10.88	□□□□□ -0.67
TRAF4-208	ENST00000469529	MBD3L2B	A0A1B0GVZ6	204 aa	Predicted RBP	10.88	□□□□□ -0.67
TRAF4-208	ENST00000469529		A6NJ64	397 aa		10.88	□□□□□ -0.67
TRAF4-208	ENST00000469529	TMEM210	A6NLX4	147 aa		10.88	□□□□□ -0.67
TRAF4-208	ENST00000469529	TMEM14DP	A8MWL7	114 aa		10.88	□□□□□ -0.67
TRAF4-208	ENST00000469529	ZNF780A	O75290	641 aa	Predicted RBP	10.88	□□□□□ -0.67
TRAF4-208	ENST00000469529	PAH	P00439	452 aa		10.88	□□□□□ -0.67
TRAF4-208	ENST00000469529	HCK	P08631	526 aa		10.88	□□□□□ -0.67
TRAF4-208	ENST00000469529	OCM	P0CE72	109 aa	Predicted RBP	10.88	□□□□□ -0.67
TRAF4-208	ENST00000469529	SNRPB	P14678	240 aa	Known RBP	10.88	□□□□□ -0.67
TRAF4-208	ENST00000469529	MPZ	P25189	248 aa		10.88	□□□□□ -0.67
TRAF4-208	ENST00000469529	CD40LG	P29965	261 aa		10.88	□□□□□ -0.67
TRAF4-208	ENST00000469529	MNDA	P41218	407 aa		10.88	□□□□□ -0.67
TRAF4-208	ENST00000469529	KIR2DL3	P43628	341 aa		10.88	□□□□□ -0.67
TRAF4-208	ENST00000469529	MMP15	P51511	669 aa		10.88	□□□□□ -0.67
TRAF4-208	ENST00000469529	KLF3	P57682	345 aa	Predicted RBP	10.88	□□□□□ -0.67
TRAF4-208	ENST00000469529	PDZK1IP1	Q13113	114 aa		10.88	□□□□□ -0.67
TRAF4-208	ENST00000469529	GPR176	Q14439	515 aa		10.88	□□□□□ -0.67
TRAF4-208	ENST00000469529	MSMP	Q1L6U9	139 aa		10.88	□□□□□ -0.67
TRAF4-208	ENST00000469529	ALKBH6	Q3KRA9	238 aa		10.88	□□□□□ -0.67
TRAF4-208	ENST00000469529	TMEM255A	Q5JRV8	349 aa		10.88	□□□□□ -0.67
TRAF4-208	ENST00000469529	HES5	Q5TA89	166 aa		10.88	□□□□□ -0.67
TRAF4-208	ENST00000469529	PLCXD3	Q63HM9	321 aa		10.88	□□□□□ -0.67
TRAF4-208	ENST00000469529	ZNF573	Q86YE8	665 aa		10.88	□□□□□ -0.67
TRAF4-208	ENST00000469529	MFSD4A	Q8N468	514 aa		10.88	□□□□□ -0.67
TRAF4-208	ENST00000469529	CELF2-AS1	Q8N7Q2	184 aa		10.88	□□□□□ -0.67
TRAF4-208	ENST00000469529	OR51D1	Q8NGF3	324 aa		10.88	□□□□□ -0.67
TRAF4-208	ENST00000469529	OR5H6	Q8NGV6	325 aa		10.88	□□□□□ -0.67
TRAF4-208	ENST00000469529	KCNG3	Q8TAE7	436 aa		10.88	□□□□□ -0.67
TRAF4-208	ENST00000469529	MRPS24	Q96EL2	167 aa	Known RBP	10.88	□□□□□ -0.67
TRAF4-208	ENST00000469529	PLPPR2	Q96GM1	343 aa		10.88	□□□□□ -0.67
TRAF4-208	ENST00000469529	MICU1	Q9BPX6	476 aa		10.88	□□□□□ -0.67
TRAF4-208	ENST00000469529	NUDT16L1	Q9BRJ7	211 aa	Known RBP	10.88	□□□□□ -0.67
TRAF4-208	ENST00000469529	PKIB	Q9C010	78 aa		10.88	□□□□□ -0.67
TRAF4-208	ENST00000469529	OR51B6	Q9H340	312 aa		10.88	□□□□□ -0.67
TRAF4-208	ENST00000469529	HMG20A	Q9NP66	347 aa		10.88	□□□□□ -0.67
TRAF4-208	ENST00000469529	PCDHB16	Q9NRJ7	776 aa		10.88	□□□□□ -0.67
TRAF4-208	ENST00000469529	IL36G	Q9NZH8	169 aa		10.88	□□□□□ -0.67
TRAF4-208	ENST00000469529	CRIM1	Q9NZV1	1036 aa		10.88	□□□□□ -0.67

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