RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469025.1

OPTN-209, Transcript of optineurin, humanhuman

TSL 3

Gene OPTN, Length 642 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPTN-209ENST00000469025 WNT5BQ9H1J7 359 aa3.59□□□□□ -1.83
OPTN-209ENST00000469025 TMEM38BQ9NVV0 291 aa3.59□□□□□ -1.83
OPTN-209ENST00000469025 MRPL39Q9NYK5 338 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
OPTN-209ENST00000469025 IGHV3OR15-7A0A075B7D8 119 aa3.58□□□□□ -1.84
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OPTN-209ENST00000469025 A0A0B4J293 547 aa3.58□□□□□ -1.84
OPTN-209ENST00000469025 PGPEP1LA6NFU8 196 aa3.58□□□□□ -1.84
OPTN-209ENST00000469025 ANKHD1-EIF4EBP3H7C0V5 636 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
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OPTN-209ENST00000469025 SMARCD3Q6STE5 483 aa3.58□□□□□ -1.84
OPTN-209ENST00000469025 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
OPTN-209ENST00000469025 SLC16A13Q7RTY0 426 aa3.58□□□□□ -1.84
OPTN-209ENST00000469025 OR5AS1Q8N127 324 aa3.58□□□□□ -1.84
OPTN-209ENST00000469025 KDM8Q8N371 416 aa3.58□□□□□ -1.84
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OPTN-209ENST00000469025 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa3.58□□□□□ -1.84
OPTN-209ENST00000469025 ZNF114Q8NC26 417 aa3.58□□□□□ -1.84
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OPTN-209ENST00000469025 ZNF563Q8TA94 476 aa3.58□□□□□ -1.84
OPTN-209ENST00000469025 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
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OPTN-209ENST00000469025 ELP4Q96EB1 424 aa3.58□□□□□ -1.84
OPTN-209ENST00000469025 FAM210BQ96KR6 192 aa3.58□□□□□ -1.84
OPTN-209ENST00000469025 OXGR1Q96P68 337 aa3.58□□□□□ -1.84
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OPTN-209ENST00000469025 KIFC1Q9BW19 673 aa3.58□□□□□ -1.84
OPTN-209ENST00000469025 BARHL1Q9BZE3 327 aa3.58□□□□□ -1.84
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OPTN-209ENST00000469025 P2RX2Q9UBL9 471 aa3.58□□□□□ -1.84
OPTN-209ENST00000469025 SLC25A10Q9UBX3 287 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
OPTN-209ENST00000469025 OSGIN1Q9UJX0 560 aa3.58□□□□□ -1.84
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OPTN-209ENST00000469025 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa3.57□□□□□ -1.84
OPTN-209ENST00000469025 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa3.57□□□□□ -1.84
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OPTN-209ENST00000469025 H0YIV9 168 aa3.57□□□□□ -1.84
OPTN-209ENST00000469025 ITM2AO43736 263 aa3.57□□□□□ -1.84
OPTN-209ENST00000469025 SCN2BO60939 215 aa3.57□□□□□ -1.84
OPTN-209ENST00000469025 SERPINI2O75830 405 aa3.57□□□□□ -1.84
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OPTN-209ENST00000469025 ATP6V1C1P21283 382 aa3.57□□□□□ -1.84
OPTN-209ENST00000469025 VDAC1P21796 283 aa3.57□□□□□ -1.84
OPTN-209ENST00000469025 POU1F1P28069 291 aa3.57□□□□□ -1.84
OPTN-209ENST00000469025 C21orf33P30042 268 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
OPTN-209ENST00000469025 POLR2HP52434 150 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
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OPTN-209ENST00000469025 RAB40BQ12829 278 aa3.57□□□□□ -1.84
OPTN-209ENST00000469025 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
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OPTN-209ENST00000469025 Q6ZSA8 131 aa3.57□□□□□ -1.84
OPTN-209ENST00000469025 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
OPTN-209ENST00000469025 ZSCAN2Q7Z7L9 614 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
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OPTN-209ENST00000469025 METTL4Q8N3J2 472 aa3.57□□□□□ -1.84
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OPTN-209ENST00000469025 USE1Q9NZ43 259 aa3.57□□□□□ -1.84
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OPTN-209ENST00000469025 BAG5Q9UL15 447 aa3.57□□□□□ -1.84
OPTN-209ENST00000469025 BLOC1S6Q9UL45 172 aa3.57□□□□□ -1.84
OPTN-209ENST00000469025 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
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