RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465425.1

SYNE4-204, Transcript of spectrin repeat containing nuclear envelope family member 4, humanhuman

TSL 2

Gene SYNE4, Length 2,339 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4-204ENST00000465425 CD63P08962 238 aa16.06■□□□□ 0.16
SYNE4-204ENST00000465425 OTX1P32242 354 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
SYNE4-204ENST00000465425 SUPT4H1P63272 117 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
SYNE4-204ENST00000465425 AIMP2Q13155 320 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
SYNE4-204ENST00000465425 RTL6Q6ICC9 239 aa16.06■□□□□ 0.16
SYNE4-204ENST00000465425 CRIP3Q6Q6R5 217 aa16.06■□□□□ 0.16
SYNE4-204ENST00000465425 SLC16A14Q7RTX9 510 aa16.06■□□□□ 0.16
SYNE4-204ENST00000465425 BOLLQ8N9W6 283 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
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SYNE4-204ENST00000465425 ROBO4Q8WZ75 1007 aa16.06■□□□□ 0.16
SYNE4-204ENST00000465425 MARC2Q969Z3 335 aa16.06■□□□□ 0.16
SYNE4-204ENST00000465425 INTS12Q96CB8 462 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
SYNE4-204ENST00000465425 PIGQQ9BRB3 760 aa16.06■□□□□ 0.16
SYNE4-204ENST00000465425 RNF126Q9BV68 326 aa16.06■□□□□ 0.16
SYNE4-204ENST00000465425 ASF1BQ9NVP2 202 aa16.06■□□□□ 0.16
SYNE4-204ENST00000465425 OSGIN2Q9Y236 505 aa16.06■□□□□ 0.16
SYNE4-204ENST00000465425 KLF7O75840 302 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
SYNE4-204ENST00000465425 GLRA1P23415 457 aa16.05■□□□□ 0.16
SYNE4-204ENST00000465425 RAC1P63000 192 aa16.05■□□□□ 0.16
SYNE4-204ENST00000465425 ANKRD55Q3KP44 614 aa16.05■□□□□ 0.16
SYNE4-204ENST00000465425 PLEKHN1Q494U1 663 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
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SYNE4-204ENST00000465425 ZSCAN4Q8NAM6 433 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
SYNE4-204ENST00000465425 LRRC46Q96FV0 321 aa16.05■□□□□ 0.16
SYNE4-204ENST00000465425 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
SYNE4-204ENST00000465425 TM2D1Q9BX74 207 aa16.05■□□□□ 0.16
SYNE4-204ENST00000465425 PROK2Q9HC23 129 aa16.05■□□□□ 0.16
SYNE4-204ENST00000465425 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa16.05■□□□□ 0.16
SYNE4-204ENST00000465425 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
SYNE4-204ENST00000465425 NSG1A0A0A6YYJ2 146 aa16.05■□□□□ 0.16
SYNE4-204ENST00000465425 GJE1A6NN92 205 aa16.05■□□□□ 0.16
SYNE4-204ENST00000465425 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
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SYNE4-204ENST00000465425 TPD52L2O43399 206 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
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SYNE4-204ENST00000465425 GABRR1P24046 479 aa16.05■□□□□ 0.16
SYNE4-204ENST00000465425 HIST1H3AP68431 136 aa16.05■□□□□ 0.16
SYNE4-204ENST00000465425 RSPO1Q2MKA7 263 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
SYNE4-204ENST00000465425 HIST2H3PS2Q5TEC6 136 aa16.05■□□□□ 0.16
SYNE4-204ENST00000465425 HIST2H3AQ71DI3 136 aa16.05■□□□□ 0.16
SYNE4-204ENST00000465425 CCDC54Q8NEL0 328 aa16.05■□□□□ 0.16
SYNE4-204ENST00000465425 OR52H1Q8NGJ2 320 aa16.05■□□□□ 0.16
SYNE4-204ENST00000465425 OR1S2Q8NGQ3 325 aa16.05■□□□□ 0.16
SYNE4-204ENST00000465425 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
SYNE4-204ENST00000465425 C14orf166Q9Y224 244 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
SYNE4-204ENST00000465425 TMEM265A0A087WTH1 108 aa16.04■□□□□ 0.16
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SYNE4-204ENST00000465425 YKT6O15498 198 aa16.04■□□□□ 0.16
SYNE4-204ENST00000465425 CBR3O75828 277 aa16.04■□□□□ 0.16
SYNE4-204ENST00000465425 KNG1P01042 644 aa16.04■□□□□ 0.16
SYNE4-204ENST00000465425 UQCC3Q6UW78 93 aa16.04■□□□□ 0.16
SYNE4-204ENST00000465425 EMG1Q92979 244 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
SYNE4-204ENST00000465425 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
SYNE4-204ENST00000465425 A0A0J9YW62 118 aa16.03■□□□□ 0.16
SYNE4-204ENST00000465425 H0YIZ8 118 aa16.03■□□□□ 0.16
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SYNE4-204ENST00000465425 NAAAQ02083 359 aa16.03■□□□□ 0.16
SYNE4-204ENST00000465425 SIGLEC14Q08ET2 396 aa16.03■□□□□ 0.16
SYNE4-204ENST00000465425 PPA1Q15181 289 aa16.03■□□□□ 0.16
SYNE4-204ENST00000465425 SURF2Q15527 256 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
SYNE4-204ENST00000465425 SNAI3Q3KNW1 292 aa16.03■□□□□ 0.16
SYNE4-204ENST00000465425 NKAPLQ5M9Q1 402 aa16.03■□□□□ 0.16
SYNE4-204ENST00000465425 PRSS54Q6PEW0 395 aa16.03■□□□□ 0.16
SYNE4-204ENST00000465425 ATRAIDQ6UW56 229 aa16.03■□□□□ 0.16
SYNE4-204ENST00000465425 OR2Y1Q8NGV0 311 aa16.03■□□□□ 0.16
SYNE4-204ENST00000465425 FBXO17Q96EF6 278 aa16.03■□□□□ 0.16
SYNE4-204ENST00000465425 RRNAD1Q96FB5 475 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
SYNE4-204ENST00000465425 FAM117AQ9C073 453 aa16.03■□□□□ 0.16
SYNE4-204ENST00000465425 CCDC85CA6NKD9 419 aa16.03■□□□□ 0.16
SYNE4-204ENST00000465425 TMEM225BP0DP42 221 aa16.03■□□□□ 0.16
SYNE4-204ENST00000465425 MTCP1P56278 107 aa16.03■□□□□ 0.16
SYNE4-204ENST00000465425 MRPS34P82930 218 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
SYNE4-204ENST00000465425 FAM27BQ5VT28 67 aa16.03■□□□□ 0.16
SYNE4-204ENST00000465425 C6orf201Q7Z4U5 140 aa16.03■□□□□ 0.16
SYNE4-204ENST00000465425 DTX1Q86Y01 620 aa16.03■□□□□ 0.16
SYNE4-204ENST00000465425 SLC30A7Q8NEW0 376 aa16.03■□□□□ 0.16
SYNE4-204ENST00000465425 SEMA6DQ8NFY4 1073 aa16.03■□□□□ 0.16
SYNE4-204ENST00000465425 RHBDD1Q8TEB9 315 aa16.03■□□□□ 0.16
SYNE4-204ENST00000465425 RNF141Q8WVD5 230 aa16.03■□□□□ 0.16
SYNE4-204ENST00000465425 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
SYNE4-204ENST00000465425 RAB19A4D1S5 217 aa16.02■□□□□ 0.16
SYNE4-204ENST00000465425 FIGNL2A6NMB9 653 aa16.02■□□□□ 0.16
SYNE4-204ENST00000465425 CDK2AP1O14519 115 aa16.02■□□□□ 0.16
SYNE4-204ENST00000465425 SGCEO43556 437 aa16.02■□□□□ 0.16
SYNE4-204ENST00000465425 CSTBP04080 98 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
SYNE4-204ENST00000465425 CHAF1BQ13112 559 aa16.02■□□□□ 0.16
SYNE4-204ENST00000465425 C20orf196Q8IYI0 205 aa16.02■□□□□ 0.16
SYNE4-204ENST00000465425 ZIC4Q8N9L1 334 aa16.02■□□□□ 0.16
SYNE4-204ENST00000465425 OR10C1Q96KK4 312 aa16.02■□□□□ 0.16
SYNE4-204ENST00000465425 C2orf50Q96LR7 162 aa16.02■□□□□ 0.16
SYNE4-204ENST00000465425 SRXN1Q9BYN0 137 aa16.02■□□□□ 0.16
SYNE4-204ENST00000465425 GPR173Q9NS66 373 aa16.02■□□□□ 0.16
SYNE4-204ENST00000465425 OR5AC2Q9NZP5 309 aa16.02■□□□□ 0.16
SYNE4-204ENST00000465425 GSKIPQ9P0R6 139 aa16.02■□□□□ 0.16
SYNE4-204ENST00000465425 MEMO1Q9Y316 297 aa16.02■□□□□ 0.16
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