RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462256.5

DDX39B-215, Transcript of DExD-box helicase 39B, humanhuman

TSL 2

Gene DDX39B, Length 4,027 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39B-215ENST00000462256 RNF7Q9UBF6 113 aa8.06□□□□□ -1.12
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DDX39B-215ENST00000462256 CACNG2Q9Y698 323 aa8.06□□□□□ -1.12
DDX39B-215ENST00000462256 JMJD1CQ15652 2540 aa8.06□□□□□ -1.12
DDX39B-215ENST00000462256 NCR1O76036 304 aa8.06□□□□□ -1.12
DDX39B-215ENST00000462256 IGF2P01344 180 aa8.06□□□□□ -1.12
DDX39B-215ENST00000462256 HCCSP53701 268 aa8.06□□□□□ -1.12
DDX39B-215ENST00000462256 EGR3Q06889 387 aa8.06□□□□□ -1.12
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DDX39B-215ENST00000462256 CLEC12BQ2HXU8 276 aa8.06□□□□□ -1.12
DDX39B-215ENST00000462256 AVPI1Q5T686 147 aa8.06□□□□□ -1.12
DDX39B-215ENST00000462256 LRRC29Q8WV35 223 aa8.06□□□□□ -1.12
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DDX39B-215ENST00000462256 LOC107986453A0A1B0GWG9 222 aa8.05□□□□□ -1.12
DDX39B-215ENST00000462256 A6NIN4 97 aa8.05□□□□□ -1.12
DDX39B-215ENST00000462256 KLK2P20151 261 aa8.05□□□□□ -1.12
DDX39B-215ENST00000462256 IL2RGP31785 369 aa8.05□□□□□ -1.12
DDX39B-215ENST00000462256 GP2P55259 537 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
DDX39B-215ENST00000462256 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP8.05□□□□□ -1.129e-11■□□□□ 9.9
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DDX39B-215ENST00000462256 SLC25A47Q6Q0C1 308 aa8.05□□□□□ -1.12
DDX39B-215ENST00000462256 BPIFB2Q8N4F0 458 aa8.05□□□□□ -1.12
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DDX39B-215ENST00000462256 GNG12Q9UBI6 72 aa8.05□□□□□ -1.12
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DDX39B-215ENST00000462256 ZNF281Q9Y2X9 895 aa8.05□□□□□ -1.12
DDX39B-215ENST00000462256 MPC1Q9Y5U8 109 aa8.05□□□□□ -1.12
DDX39B-215ENST00000462256 POLQO75417 2590 aa8.05□□□□□ -1.12
DDX39B-215ENST00000462256 IGHV2OR16-5A0A0B4J2B6 119 aa8.05□□□□□ -1.12
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DDX39B-215ENST00000462256 NPIPB4C9JG80 1138 aa8.05□□□□□ -1.12
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DDX39B-215ENST00000462256 BPNT1O95861 308 aa8.05□□□□□ -1.12
DDX39B-215ENST00000462256 ACHEP22303 614 aa8.05□□□□□ -1.12
DDX39B-215ENST00000462256 GLP1RP43220 463 aa8.05□□□□□ -1.12
DDX39B-215ENST00000462256 SFRP4Q6FHJ7 346 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
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DDX39B-215ENST00000462256 GABRG1Q8N1C3 465 aa8.05□□□□□ -1.12
DDX39B-215ENST00000462256 PRR18Q8N4B5 295 aa8.05□□□□□ -1.12
DDX39B-215ENST00000462256 DYNC2LI1Q8TCX1 351 aa8.05□□□□□ -1.12
DDX39B-215ENST00000462256 TMEM106AQ96A25 262 aa8.05□□□□□ -1.12
DDX39B-215ENST00000462256 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
DDX39B-215ENST00000462256 MS4A7Q9GZW8 240 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
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DDX39B-215ENST00000462256 MCRIP1C9JLW8 97 aa8.05□□□□□ -1.12
DDX39B-215ENST00000462256 PTP4A3O75365 173 aa8.05□□□□□ -1.12
DDX39B-215ENST00000462256 GCM2O75603 506 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
DDX39B-215ENST00000462256 APOA1P02647 267 aa8.05□□□□□ -1.12
DDX39B-215ENST00000462256 DAOP14920 347 aa8.05□□□□□ -1.12
DDX39B-215ENST00000462256 FAHP16930 419 aa8.05□□□□□ -1.12
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DDX39B-215ENST00000462256 GPR50Q13585 617 aa8.05□□□□□ -1.12
DDX39B-215ENST00000462256 LTC4SQ16873 150 aa8.05□□□□□ -1.12
DDX39B-215ENST00000462256 IDNKQ5T6J7 187 aa8.05□□□□□ -1.12
DDX39B-215ENST00000462256 SERPINA12Q8IW75 414 aa8.05□□□□□ -1.12
DDX39B-215ENST00000462256 BBS1Q8NFJ9 593 aa8.05□□□□□ -1.12
DDX39B-215ENST00000462256 MCFD2Q8NI22 146 aa8.05□□□□□ -1.12
DDX39B-215ENST00000462256 OR8B4Q96RC9 309 aa8.05□□□□□ -1.12
DDX39B-215ENST00000462256 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
DDX39B-215ENST00000462256 NUFIP1Q9UHK0 495 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
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DDX39B-215ENST00000462256 HECTD1Q9ULT8 2610 aa8.05□□□□□ -1.12
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DDX39B-215ENST00000462256 ZAR1LA6NP61 321 aa8.04□□□□□ -1.12
DDX39B-215ENST00000462256 PPIAL4DF5H284 164 aa8.04□□□□□ -1.12
DDX39B-215ENST00000462256 ZNF205O95201 554 aa8.04□□□□□ -1.12
DDX39B-215ENST00000462256 LY86O95711 162 aa8.04□□□□□ -1.12
DDX39B-215ENST00000462256 PPIAL4FP0DN26 164 aa8.04□□□□□ -1.12
DDX39B-215ENST00000462256 SERPINA2P20848 420 aa8.04□□□□□ -1.12
DDX39B-215ENST00000462256 CRHBPP24387 322 aa8.04□□□□□ -1.12
DDX39B-215ENST00000462256 PITPNBP48739 271 aa8.04□□□□□ -1.12
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DDX39B-215ENST00000462256 ARL6IP1Q15041 203 aa8.04□□□□□ -1.12
DDX39B-215ENST00000462256 PLGLAQ15195 96 aa8.04□□□□□ -1.12
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DDX39B-215ENST00000462256 ADGRG7Q96K78 797 aa8.04□□□□□ -1.12
DDX39B-215ENST00000462256 WFDC6Q9BQY6 131 aa8.04□□□□□ -1.12
DDX39B-215ENST00000462256 GINS4Q9BRT9 223 aa8.04□□□□□ -1.12
DDX39B-215ENST00000462256 SHARPINQ9H0F6 387 aa8.04□□□□□ -1.12
DDX39B-215ENST00000462256 AASSQ9UDR5 926 aa8.04□□□□□ -1.12
DDX39B-215ENST00000462256 PPIAL4AQ9Y536 164 aa8.04□□□□□ -1.12
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DDX39B-215ENST00000462256 IGHV1-69-2A0A0G2JMI3 117 aa8.04□□□□□ -1.12
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DDX39B-215ENST00000462256 DEGS1O15121 323 aa8.04□□□□□ -1.12
DDX39B-215ENST00000462256 LDLRAD4O15165 306 aa8.04□□□□□ -1.12
DDX39B-215ENST00000462256 NPIPB7O75200 414 aa8.04□□□□□ -1.12
DDX39B-215ENST00000462256 ACTL6BO94805 426 aa8.04□□□□□ -1.12
DDX39B-215ENST00000462256 GPM6AP51674 278 aa8.04□□□□□ -1.12
DDX39B-215ENST00000462256 PRSS12P56730 875 aa8.04□□□□□ -1.12
DDX39B-215ENST00000462256 CDK5R2Q13319 367 aa8.04□□□□□ -1.12
DDX39B-215ENST00000462256 SLC25A26Q70HW3 274 aa8.04□□□□□ -1.12
DDX39B-215ENST00000462256 Q8NFD4 153 aa8.04□□□□□ -1.12
DDX39B-215ENST00000462256 SLC26A10Q8NG04 563 aa8.04□□□□□ -1.12
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