RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460558.5

ECHDC1-211, Transcript of ethylmalonyl-CoA decarboxylase 1, humanhuman

TSL 5

Gene ECHDC1, Length 301 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC1-211ENST00000460558 POLR3HQ9Y535 204 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
ECHDC1-211ENST00000460558 DNAH11Q96DT5 4516 aa3.12□□□□□ -1.91
ECHDC1-211ENST00000460558 HSPG2P98160 4391 aa3.12□□□□□ -1.91
ECHDC1-211ENST00000460558 PRSS51A0A1B0GVH4 220 aa3.11□□□□□ -1.91
ECHDC1-211ENST00000460558 hDV102S1A0JD36 115 aa3.11□□□□□ -1.91
ECHDC1-211ENST00000460558 ZNF320A2RRD8 509 aa3.11□□□□□ -1.91
ECHDC1-211ENST00000460558 CFAP73A6NFT4 308 aa3.11□□□□□ -1.91
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ECHDC1-211ENST00000460558 C5orf52A6NGY3 159 aa3.11□□□□□ -1.91
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ECHDC1-211ENST00000460558 ALDH3A2P51648 485 aa3.11□□□□□ -1.91
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ECHDC1-211ENST00000460558 LYPD6Q86Y78 171 aa3.11□□□□□ -1.91
ECHDC1-211ENST00000460558 ZNF440Q8IYI8 595 aa3.11□□□□□ -1.91
ECHDC1-211ENST00000460558 CENPLQ8N0S6 344 aaPredicted RBP3.11□□□□□ -1.91
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ECHDC1-211ENST00000460558 CADM2Q8N3J6 435 aa3.11□□□□□ -1.91
ECHDC1-211ENST00000460558 LRRC18Q8N456 261 aa3.11□□□□□ -1.91
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ECHDC1-211ENST00000460558 CAPSLQ8WWF8 208 aa3.11□□□□□ -1.91
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ECHDC1-211ENST00000460558 VNN3Q9NY84 501 aa3.11□□□□□ -1.91
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ECHDC1-211ENST00000460558 C11orf21Q9P2W6 132 aa3.11□□□□□ -1.91
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ECHDC1-211ENST00000460558 SLC28A1O00337 649 aa3.1□□□□□ -1.91
ECHDC1-211ENST00000460558 TBX19O60806 448 aa3.1□□□□□ -1.91
ECHDC1-211ENST00000460558 SMIM24O75264 130 aa3.1□□□□□ -1.91
ECHDC1-211ENST00000460558 FCN3O75636 299 aa3.1□□□□□ -1.91
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ECHDC1-211ENST00000460558 CSN3P07498 182 aa3.1□□□□□ -1.91
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ECHDC1-211ENST00000460558 MPZP25189 248 aa3.1□□□□□ -1.91
ECHDC1-211ENST00000460558 GRPRP30550 384 aa3.1□□□□□ -1.91
ECHDC1-211ENST00000460558 SPRP35270 261 aaPredicted RBP3.1□□□□□ -1.91
ECHDC1-211ENST00000460558 MAGEA4P43358 317 aa3.1□□□□□ -1.91
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ECHDC1-211ENST00000460558 POU3F4P49335 361 aa3.1□□□□□ -1.91
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ECHDC1-211ENST00000460558 GUCY2DQ02846 1103 aa3.1□□□□□ -1.91
ECHDC1-211ENST00000460558 MZT1Q08AG7 82 aa3.1□□□□□ -1.91
ECHDC1-211ENST00000460558 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP3.1□□□□□ -1.91
ECHDC1-211ENST00000460558 GNA13Q14344 377 aa3.1□□□□□ -1.91
ECHDC1-211ENST00000460558 ZNF674Q2M3X9 581 aa3.1□□□□□ -1.91
ECHDC1-211ENST00000460558 DEFB136Q30KP8 78 aa3.1□□□□□ -1.91
ECHDC1-211ENST00000460558 ABCA11PQ4W5N1 156 aa3.1□□□□□ -1.91
ECHDC1-211ENST00000460558 CLEC12AQ5QGZ9 265 aa3.1□□□□□ -1.91
ECHDC1-211ENST00000460558 ATAD3BQ5T9A4 648 aa3.1□□□□□ -1.91
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