RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453216.1

TRAM2-AS1-201, Transcript of TRAM2 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene TRAM2-AS1, Length 664 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DPAGT1Q9H3H5 408 aa21.53■■□□□ 1.04
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HCCSP53701 268 aa21.52■■□□□ 1.04
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 APOFQ13790 326 aa21.52■■□□□ 1.04
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SPATA24Q86W54 205 aa21.52■■□□□ 1.04
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 YIPF3Q9GZM5 350 aa21.52■■□□□ 1.04
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DNAJB9Q9UBS3 223 aa21.51■■□□□ 1.03
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SLC25A10Q9UBX3 287 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TMEM269A0A1B0GVZ9 245 aa21.49■■□□□ 1.03
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OR2AT4A6NND4 320 aa21.49■■□□□ 1.03
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PSMD9O00233 223 aa21.49■■□□□ 1.03
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ACAA1P09110 424 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 A0A1W2PRM7 423 aa21.48■■□□□ 1.03
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 BTBD17A6NE02 478 aa21.48■■□□□ 1.03
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF732B4DXR9 585 aa21.48■■□□□ 1.03
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NPFFO15130 113 aa21.48■■□□□ 1.03
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GYG2O15488 501 aa21.48■■□□□ 1.03
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GABRA2P47869 451 aa21.48■■□□□ 1.03
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DLX1P56177 255 aa21.48■■□□□ 1.03
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CAV3P56539 151 aa21.48■■□□□ 1.03
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KLRD1Q13241 179 aa21.48■■□□□ 1.03
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CEACAM21Q3KPI0 293 aa21.48■■□□□ 1.03
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DNAL1Q4LDG9 190 aa21.48■■□□□ 1.03
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CEP78Q5JTW2 689 aa21.48■■□□□ 1.03
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LCN1P1Q5VSP4 162 aa21.48■■□□□ 1.03
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa21.48■■□□□ 1.03
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KRT74Q7RTS7 529 aa21.48■■□□□ 1.03
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DNAJC9Q8WXX5 260 aa21.48■■□□□ 1.03
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OR51I2Q9H344 312 aa21.48■■□□□ 1.03
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DEFA6Q01524 100 aa21.47■■□□□ 1.03
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TAF9Q16594 264 aa21.47■■□□□ 1.03
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OCLNQ16625 522 aa21.47■■□□□ 1.03
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa21.47■■□□□ 1.03
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 THAP5Q7Z6K1 395 aa21.47■■□□□ 1.03
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TMEM14AQ9Y6G1 99 aa21.47■■□□□ 1.03
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TCRBV3S1A0A5B6 114 aa21.46■■□□□ 1.03
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CCDC182A6NF36 153 aa21.46■■□□□ 1.03
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OR5B21A6NL26 309 aa21.46■■□□□ 1.03
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 M0QZ24 198 aa21.46■■□□□ 1.03
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 M0R1W7 72 aa21.46■■□□□ 1.03
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TIMM23O14925 209 aa21.46■■□□□ 1.03
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GSC2O15499 205 aa21.46■■□□□ 1.03
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF254O75437 659 aa21.46■■□□□ 1.03
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CRISP1P54107 249 aa21.46■■□□□ 1.03
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KRTAP10-3P60369 221 aa21.46■■□□□ 1.03
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ROM1Q03395 351 aa21.46■■□□□ 1.03
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RIPPLY1Q0D2K3 151 aa21.46■■□□□ 1.03
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