RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442510.6

PTPRC-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 5,164 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-209ENST00000442510 CXCL11O14625 94 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 LAMP2P13473 410 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 CLRN1P58418 232 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 IL13RA2Q14627 380 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 ELOCQ15369 112 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 AGTRAPQ6RW13 159 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 H1FOOQ8IZA3 346 aaPredicted RBP5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa5.03□□□□□ -1.6
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PTPRC-209ENST00000442510 TEX38Q6PEX7 206 aa5.03□□□□□ -1.6
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PTPRC-209ENST00000442510 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa5.03□□□□□ -1.6
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PTPRC-209ENST00000442510 C5orf64Q2M2E5 130 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 C2orf27AQ580R0 203 aa5.03□□□□□ -1.6
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PTPRC-209ENST00000442510 Q8WTZ3 238 aa5.03□□□□□ -1.6
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PTPRC-209ENST00000442510 ST6GAL1P15907 406 aa5.02□□□□□ -1.61
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PTPRC-209ENST00000442510 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP5.02□□□□□ -1.61
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PTPRC-209ENST00000442510 TIMD4Q96H15 378 aa5.02□□□□□ -1.61
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PTPRC-209ENST00000442510 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa5.02□□□□□ -1.61
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PTPRC-209ENST00000442510 SHBQ15464 509 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRC-209ENST00000442510 SYPL1Q16563 259 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRC-209ENST00000442510 C18orf21Q32NC0 220 aaPredicted RBP5.02□□□□□ -1.61
PTPRC-209ENST00000442510 CT45A1Q5HYN5 189 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRC-209ENST00000442510 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP5.02□□□□□ -1.61
PTPRC-209ENST00000442510 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP5.02□□□□□ -1.61
PTPRC-209ENST00000442510 AMZ2Q86W34 360 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRC-209ENST00000442510 OR2Z1Q8NG97 314 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRC-209ENST00000442510 CT45A3Q8NHU0 189 aa5.02□□□□□ -1.61
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