RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000437078.6

RABGEF1-210, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene RABGEF1, Length 4,319 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-210ENST00000437078 NFAM1Q8NET5 270 aaPredicted RBP11.99□□□□□ -0.49
RABGEF1-210ENST00000437078 CT55Q8WUE5 264 aa11.99□□□□□ -0.49
RABGEF1-210ENST00000437078 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa11.99□□□□□ -0.49
RABGEF1-210ENST00000437078 GUCD1Q96NT3 240 aa11.99□□□□□ -0.49
RABGEF1-210ENST00000437078 TAS2R8Q9NYW2 309 aa11.99□□□□□ -0.49
RABGEF1-210ENST00000437078 DHHO43323 396 aa11.99□□□□□ -0.49
RABGEF1-210ENST00000437078 MRPL33O75394 65 aaKnown RBP11.99□□□□□ -0.49
RABGEF1-210ENST00000437078 OR7C1O76099 320 aaPredicted RBP11.99□□□□□ -0.49
RABGEF1-210ENST00000437078 TNFSF15O95150 251 aa11.99□□□□□ -0.49
RABGEF1-210ENST00000437078 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP11.99□□□□□ -0.493e-7■■■□□ 15.6
RABGEF1-210ENST00000437078 RIN1Q13671 783 aa11.99□□□□□ -0.49
RABGEF1-210ENST00000437078 PEG10Q86TG7 708 aaKnown RBP11.99□□□□□ -0.49
RABGEF1-210ENST00000437078 ZNF546Q86UE3 836 aa11.99□□□□□ -0.49
RABGEF1-210ENST00000437078 PHYHIPQ92561 330 aa11.99□□□□□ -0.49
RABGEF1-210ENST00000437078 RAB33BQ9H082 229 aa11.99□□□□□ -0.49
RABGEF1-210ENST00000437078 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP11.99□□□□□ -0.49
RABGEF1-210ENST00000437078 H7C417 338 aa11.98□□□□□ -0.49
RABGEF1-210ENST00000437078 NFYAP23511 347 aaPredicted RBP11.98□□□□□ -0.49
RABGEF1-210ENST00000437078 RNF212Q495C1 297 aa11.98□□□□□ -0.49
RABGEF1-210ENST00000437078 TCTE3Q8IZS6 198 aa11.98□□□□□ -0.49
RABGEF1-210ENST00000437078 C15orf40Q8WUR7 153 aa11.98□□□□□ -0.49
RABGEF1-210ENST00000437078 PNPLA2Q96AD5 504 aa11.98□□□□□ -0.49
RABGEF1-210ENST00000437078 BORCS8Q96FH0 119 aa11.98□□□□□ -0.49
RABGEF1-210ENST00000437078 MTFP1Q9UDX5 166 aa11.98□□□□□ -0.49
RABGEF1-210ENST00000437078 C3orf80F5H4A9 247 aa11.98□□□□□ -0.49
RABGEF1-210ENST00000437078 EIF1P41567 113 aaKnown RBP11.98□□□□□ -0.49
RABGEF1-210ENST00000437078 PPT1P50897 306 aa11.98□□□□□ -0.49
RABGEF1-210ENST00000437078 CCL11P51671 97 aa11.98□□□□□ -0.49
RABGEF1-210ENST00000437078 PLCXD3Q63HM9 321 aa11.98□□□□□ -0.49
RABGEF1-210ENST00000437078 SOSTQ9BQB4 213 aa11.98□□□□□ -0.49
RABGEF1-210ENST00000437078 LHFPL6Q9Y693 200 aa11.98□□□□□ -0.49
RABGEF1-210ENST00000437078 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa11.98□□□□□ -0.49
RABGEF1-210ENST00000437078 NAP1L6A6NFF2 107 aa11.98□□□□□ -0.49
RABGEF1-210ENST00000437078 TNFSF12O43508 249 aa11.98□□□□□ -0.49
RABGEF1-210ENST00000437078 CFDP00746 253 aaPredicted RBP11.98□□□□□ -0.49
RABGEF1-210ENST00000437078 PRH1P02810 166 aa11.98□□□□□ -0.49
RABGEF1-210ENST00000437078 ITGB2P05107 769 aa11.98□□□□□ -0.49
RABGEF1-210ENST00000437078 LPLP06858 475 aa11.98□□□□□ -0.49
RABGEF1-210ENST00000437078 MSX1P28360 303 aa11.98□□□□□ -0.49
RABGEF1-210ENST00000437078 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP11.98□□□□□ -0.49
RABGEF1-210ENST00000437078 P4HA3Q7Z4N8 544 aa11.98□□□□□ -0.49
RABGEF1-210ENST00000437078 OR5AS1Q8N127 324 aa11.98□□□□□ -0.49
RABGEF1-210ENST00000437078 OR2Y1Q8NGV0 311 aa11.98□□□□□ -0.49
RABGEF1-210ENST00000437078 SPTSSAQ969W0 71 aa11.98□□□□□ -0.49
RABGEF1-210ENST00000437078 KCNK17Q96T54 332 aa11.98□□□□□ -0.49
RABGEF1-210ENST00000437078 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP11.98□□□□□ -0.49
RABGEF1-210ENST00000437078 TCFL5Q9UL49 500 aa11.98□□□□□ -0.49
RABGEF1-210ENST00000437078 NOSIPQ9Y314 301 aaKnown RBP11.98□□□□□ -0.49
RABGEF1-210ENST00000437078 HLA-HP01893 362 aa11.97□□□□□ -0.49
RABGEF1-210ENST00000437078 RAB5CP51148 216 aa11.97□□□□□ -0.49
RABGEF1-210ENST00000437078 SMIM15Q7Z3B0 74 aa11.97□□□□□ -0.49
RABGEF1-210ENST00000437078 C14orf79Q96F83 325 aa11.97□□□□□ -0.49
RABGEF1-210ENST00000437078 SCMH1Q96GD3 660 aa11.97□□□□□ -0.49
RABGEF1-210ENST00000437078 ZNF319Q9P2F9 582 aa11.97□□□□□ -0.49
RABGEF1-210ENST00000437078 IL17BQ9UHF5 180 aa11.97□□□□□ -0.49
RABGEF1-210ENST00000437078 C14orf166Q9Y224 244 aaKnown RBP11.97□□□□□ -0.49
RABGEF1-210ENST00000437078 DMDP11532 3685 aa11.97□□□□□ -0.49
RABGEF1-210ENST00000437078 CCDC187A0A096LP49 1063 aa11.97□□□□□ -0.49
RABGEF1-210ENST00000437078 A0A1W2PPC1 479 aa11.97□□□□□ -0.49
RABGEF1-210ENST00000437078 OR4E1P0C645 316 aa11.97□□□□□ -0.49
RABGEF1-210ENST00000437078 RRADP55042 308 aa11.97□□□□□ -0.49
RABGEF1-210ENST00000437078 ARG2P78540 354 aa11.97□□□□□ -0.49
RABGEF1-210ENST00000437078 PCOLCEQ15113 449 aa11.97□□□□□ -0.49
RABGEF1-210ENST00000437078 EXT1Q16394 746 aa11.97□□□□□ -0.49
RABGEF1-210ENST00000437078 LGALSLQ3ZCW2 172 aaPredicted RBP11.97□□□□□ -0.49
RABGEF1-210ENST00000437078 UNQ9370/PRO34162Q6UXP9 181 aa11.97□□□□□ -0.49
RABGEF1-210ENST00000437078 C6orf201Q7Z4U5 140 aa11.97□□□□□ -0.49
RABGEF1-210ENST00000437078 GCNT2Q8N0V5 402 aa11.97□□□□□ -0.49
RABGEF1-210ENST00000437078 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP11.97□□□□□ -0.49
RABGEF1-210ENST00000437078 SEH1LQ96EE3 360 aa11.97□□□□□ -0.49
RABGEF1-210ENST00000437078 LINC00052Q96N35 136 aa11.97□□□□□ -0.49
RABGEF1-210ENST00000437078 RGCCQ9H4X1 137 aa11.97□□□□□ -0.49
RABGEF1-210ENST00000437078 ADAMTS9Q9P2N4 1935 aa11.97□□□□□ -0.49
RABGEF1-210ENST00000437078 CEP295Q9C0D2 2601 aa11.97□□□□□ -0.49
RABGEF1-210ENST00000437078 ERCC1P07992 297 aaPredicted RBP11.97□□□□□ -0.49
RABGEF1-210ENST00000437078 NAGAP17050 411 aa11.97□□□□□ -0.49
RABGEF1-210ENST00000437078 CD96P40200 585 aa11.97□□□□□ -0.49
RABGEF1-210ENST00000437078 FABP9Q0Z7S8 132 aa11.97□□□□□ -0.49
RABGEF1-210ENST00000437078 C9orf62Q8N4C0 152 aa11.97□□□□□ -0.49
RABGEF1-210ENST00000437078 BMPERQ8N8U9 685 aa11.97□□□□□ -0.49
RABGEF1-210ENST00000437078 EXD3Q8N9H8 876 aa11.97□□□□□ -0.49
RABGEF1-210ENST00000437078 GJC3Q8NFK1 279 aa11.97□□□□□ -0.49
RABGEF1-210ENST00000437078 OR10D3Q8NH80 312 aa11.97□□□□□ -0.49
RABGEF1-210ENST00000437078 SFT2D1Q8WV19 159 aa11.97□□□□□ -0.49
RABGEF1-210ENST00000437078 ZCCHC4Q9H5U6 513 aa11.97□□□□□ -0.49
RABGEF1-210ENST00000437078 ABI3Q9P2A4 366 aa11.97□□□□□ -0.49
RABGEF1-210ENST00000437078 NXT1Q9UKK6 140 aaKnown RBP11.97□□□□□ -0.49
RABGEF1-210ENST00000437078 FTCDNL1E5RQL4 147 aa11.97□□□□□ -0.49
RABGEF1-210ENST00000437078 SYNGR4O95473 234 aa11.97□□□□□ -0.49
RABGEF1-210ENST00000437078 UMODP07911 640 aa11.97□□□□□ -0.49
RABGEF1-210ENST00000437078 CELA3AP09093 270 aa11.97□□□□□ -0.49
RABGEF1-210ENST00000437078 ABCA11PQ4W5N1 156 aa11.97□□□□□ -0.49
RABGEF1-210ENST00000437078 MEX3BQ6ZN04 569 aaKnown RBP11.97□□□□□ -0.49
RABGEF1-210ENST00000437078 CNEP1R1Q8N9A8 125 aa11.97□□□□□ -0.49
RABGEF1-210ENST00000437078 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa11.96□□□□□ -0.49
RABGEF1-210ENST00000437078 TRBV5-5A0A0J9YX44 114 aa11.96□□□□□ -0.49
RABGEF1-210ENST00000437078 TMEM200CA6NKL6 621 aa11.96□□□□□ -0.49
RABGEF1-210ENST00000437078 TRAPPC2P0DI81 140 aa11.96□□□□□ -0.49
RABGEF1-210ENST00000437078 TRAPPC2BP0DI82 140 aa11.96□□□□□ -0.49
RABGEF1-210ENST00000437078 VSIG8P0DPA2 414 aa11.96□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.4 ms