RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428394.6

HCLS1-202, Transcript of hematopoietic cell-specific Lyn substrate 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HCLS1, Length 1,560 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCLS1-202ENST00000428394 S100A13Q99584 98 aa14.83□□□□□ -0.04
HCLS1-202ENST00000428394 TUBA4BQ9H853 241 aa14.83□□□□□ -0.04
HCLS1-202ENST00000428394 OR5AC2Q9NZP5 309 aa14.83□□□□□ -0.04
HCLS1-202ENST00000428394 FCGR3AP08637 254 aa14.82□□□□□ -0.04
HCLS1-202ENST00000428394 HKR1P10072 659 aa14.82□□□□□ -0.04
HCLS1-202ENST00000428394 PNLIPP16233 465 aa14.82□□□□□ -0.04
HCLS1-202ENST00000428394 MSR1P21757 451 aa14.82□□□□□ -0.04
HCLS1-202ENST00000428394 UCP2P55851 309 aa14.82□□□□□ -0.04
HCLS1-202ENST00000428394 Q6ZS52 159 aa14.82□□□□□ -0.04
HCLS1-202ENST00000428394 FAM71E2Q8N5Q1 922 aa14.82□□□□□ -0.04
HCLS1-202ENST00000428394 LRTM2Q8N967 370 aa14.82□□□□□ -0.04
HCLS1-202ENST00000428394 FADS6Q8N9I5 356 aa14.82□□□□□ -0.04
HCLS1-202ENST00000428394 OR2M3Q8NG83 312 aa14.82□□□□□ -0.04
HCLS1-202ENST00000428394 SPSB1Q96BD6 273 aa14.82□□□□□ -0.04
HCLS1-202ENST00000428394 PGAM5Q96HS1 289 aa14.82□□□□□ -0.04
HCLS1-202ENST00000428394 ATPIF1Q9UII2 106 aa14.82□□□□□ -0.04
HCLS1-202ENST00000428394 VDAC3Q9Y277 283 aa14.82□□□□□ -0.04
HCLS1-202ENST00000428394 RP1P56715 2156 aa14.82□□□□□ -0.04
HCLS1-202ENST00000428394 XIRP2A4UGR9 3374 aa14.82□□□□□ -0.04
HCLS1-202ENST00000428394 PHF3Q92576 2039 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
HCLS1-202ENST00000428394 MSGN1A6NI15 193 aa14.81□□□□□ -0.04
HCLS1-202ENST00000428394 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa14.81□□□□□ -0.04
HCLS1-202ENST00000428394 K7EPK0 472 aa14.81□□□□□ -0.04
HCLS1-202ENST00000428394 EFNA2O43921 213 aa14.81□□□□□ -0.04
HCLS1-202ENST00000428394 DEDDO75618 318 aa14.81□□□□□ -0.04
HCLS1-202ENST00000428394 ADAP1O75689 374 aa14.81□□□□□ -0.04
HCLS1-202ENST00000428394 SEC11BP0C7V7 166 aa14.81□□□□□ -0.04
HCLS1-202ENST00000428394 RPL12P30050 165 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
HCLS1-202ENST00000428394 OTX1P32242 354 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
HCLS1-202ENST00000428394 PMELP40967 661 aa14.81□□□□□ -0.04
HCLS1-202ENST00000428394 PTGDSP41222 190 aa14.81□□□□□ -0.04
HCLS1-202ENST00000428394 RAB5BP61020 215 aa14.81□□□□□ -0.04
HCLS1-202ENST00000428394 CFHR1Q03591 330 aa14.81□□□□□ -0.04
HCLS1-202ENST00000428394 PEA15Q15121 130 aa14.81□□□□□ -0.04
HCLS1-202ENST00000428394 HYAL4Q2M3T9 481 aa14.81□□□□□ -0.04
HCLS1-202ENST00000428394 GPR157Q5UAW9 335 aa14.81□□□□□ -0.04
HCLS1-202ENST00000428394 C1orf189Q5VU69 101 aa14.81□□□□□ -0.04
HCLS1-202ENST00000428394 SULF2Q8IWU5 870 aa14.81□□□□□ -0.04
HCLS1-202ENST00000428394 PRSS58Q8IYP2 241 aa14.81□□□□□ -0.04
HCLS1-202ENST00000428394 HLA-CQ95604 372 aa14.81□□□□□ -0.04
HCLS1-202ENST00000428394 FAM71F1Q96KD3 344 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
HCLS1-202ENST00000428394 OR10C1Q96KK4 312 aa14.81□□□□□ -0.04
HCLS1-202ENST00000428394 EMC6Q9BV81 110 aa14.81□□□□□ -0.04
HCLS1-202ENST00000428394 SMDT1Q9H4I9 107 aa14.81□□□□□ -0.04
HCLS1-202ENST00000428394 IFT22Q9H7X7 185 aa14.81□□□□□ -0.04
HCLS1-202ENST00000428394 METTL7AQ9H8H3 244 aa14.81□□□□□ -0.04
HCLS1-202ENST00000428394 FAM212BQ9NTI7 297 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
HCLS1-202ENST00000428394 IGKV1-9A0A0C4DH69 117 aa14.81□□□□□ -0.04
HCLS1-202ENST00000428394 TRBV11-1A0A0K0K1C0 115 aa14.81□□□□□ -0.04
HCLS1-202ENST00000428394 C2CD4DB7Z1M9 353 aa14.81□□□□□ -0.04
HCLS1-202ENST00000428394 H3BML4 177 aa14.81□□□□□ -0.04
HCLS1-202ENST00000428394 EIF1BO60739 113 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
HCLS1-202ENST00000428394 MED6O75586 246 aa14.81□□□□□ -0.04
HCLS1-202ENST00000428394 S100A8P05109 93 aa14.81□□□□□ -0.04
HCLS1-202ENST00000428394 HPNP05981 417 aa14.81□□□□□ -0.04
HCLS1-202ENST00000428394 QDPRP09417 244 aa14.81□□□□□ -0.04
HCLS1-202ENST00000428394 MUC1P15941 1255 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
HCLS1-202ENST00000428394 ZNF708P17019 499 aa14.81□□□□□ -0.04
HCLS1-202ENST00000428394 BLVRBP30043 206 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
HCLS1-202ENST00000428394 DHPSP49366 369 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
HCLS1-202ENST00000428394 B2MP61769 119 aa14.81□□□□□ -0.04
HCLS1-202ENST00000428394 RBM39Q14498 530 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
HCLS1-202ENST00000428394 NKAIN1Q4KMZ8 207 aa14.81□□□□□ -0.04
HCLS1-202ENST00000428394 FAM76BQ5HYJ3 339 aa14.81□□□□□ -0.04
HCLS1-202ENST00000428394 FAM57BQ71RH2 274 aa14.81□□□□□ -0.04
HCLS1-202ENST00000428394 TMEM54Q969K7 222 aa14.81□□□□□ -0.04
HCLS1-202ENST00000428394 GALNT14Q96FL9 552 aa14.81□□□□□ -0.04
HCLS1-202ENST00000428394 PRRX2Q99811 253 aa14.81□□□□□ -0.04
HCLS1-202ENST00000428394 SUCNR1Q9BXA5 334 aa14.81□□□□□ -0.04
HCLS1-202ENST00000428394 NELFAQ9H3P2 528 aa14.81□□□□□ -0.04
HCLS1-202ENST00000428394 BANF2Q9H503 90 aa14.81□□□□□ -0.04
HCLS1-202ENST00000428394 COA4Q9NYJ1 87 aa14.81□□□□□ -0.04
HCLS1-202ENST00000428394 ZNF391Q9UJN7 358 aa14.81□□□□□ -0.04
HCLS1-202ENST00000428394 STRAPQ9Y3F4 350 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
HCLS1-202ENST00000428394 PCDH15Q96QU1 1955 aa14.81□□□□□ -0.04
HCLS1-202ENST00000428394 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa14.8□□□□□ -0.04
HCLS1-202ENST00000428394 E5RGE8 158 aa14.8□□□□□ -0.04
HCLS1-202ENST00000428394 TP53I11O14683 189 aa14.8□□□□□ -0.04
HCLS1-202ENST00000428394 SRFP11831 508 aa14.8□□□□□ -0.04
HCLS1-202ENST00000428394 PDZK1IP1Q13113 114 aa14.8□□□□□ -0.04
HCLS1-202ENST00000428394 SWI5Q1ZZU3 235 aa14.8□□□□□ -0.04
HCLS1-202ENST00000428394 PLXDC2Q6UX71 529 aa14.8□□□□□ -0.04
HCLS1-202ENST00000428394 SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa14.8□□□□□ -0.04
HCLS1-202ENST00000428394 MYOTQ9UBF9 498 aa14.8□□□□□ -0.04
HCLS1-202ENST00000428394 KCNIP3Q9Y2W7 256 aa14.8□□□□□ -0.04
HCLS1-202ENST00000428394 NSG2Q9Y328 171 aa14.8□□□□□ -0.04
HCLS1-202ENST00000428394 TIMM10BQ9Y5J6 103 aa14.8□□□□□ -0.04
HCLS1-202ENST00000428394 PIEZO1Q92508 2521 aa14.8□□□□□ -0.04
HCLS1-202ENST00000428394 ALPK2Q86TB3 2170 aa14.8□□□□□ -0.04
HCLS1-202ENST00000428394 FER1L5A0AVI2 2057 aa14.79□□□□□ -0.04
HCLS1-202ENST00000428394 C5orf42Q9H799 3197 aa14.79□□□□□ -0.04
HCLS1-202ENST00000428394 A0A1B0GW64 132 aa14.79□□□□□ -0.04
HCLS1-202ENST00000428394 PMS2P1A4D2B8 440 aa14.79□□□□□ -0.04
HCLS1-202ENST00000428394 DNPH1O43598 174 aa14.79□□□□□ -0.04
HCLS1-202ENST00000428394 LRP3O75074 770 aa14.79□□□□□ -0.04
HCLS1-202ENST00000428394 DKK1O94907 266 aa14.79□□□□□ -0.04
HCLS1-202ENST00000428394 SFTA3P0C7M3 94 aa14.79□□□□□ -0.04
HCLS1-202ENST00000428394 PTGER4P35408 488 aa14.79□□□□□ -0.04
HCLS1-202ENST00000428394 NPBWR1P48145 328 aa14.79□□□□□ -0.04
HCLS1-202ENST00000428394 IAH1Q2TAA2 248 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 180.6 ms