RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000415172.1

VPS13A-AS1-201, VPS13A antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene VPS13A-AS1, Length 519 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 LPAR3Q9UBY5 353 aa14.56□□□□□ -0.08
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 DIMT1Q9UNQ2 313 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 H3BSH0 61 aa14.55□□□□□ -0.08
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 LGALS8O00214 317 aa14.55□□□□□ -0.08
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 FOXH1O75593 365 aa14.55□□□□□ -0.08
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CD80P33681 288 aa14.55□□□□□ -0.08
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 GBX2P52951 348 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 NANOS3P60323 173 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 RIPK1Q13546 671 aa14.55□□□□□ -0.08
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CHRFAM7AQ494W8 412 aa14.55□□□□□ -0.08
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ESCO2Q56NI9 601 aa14.55□□□□□ -0.08
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TMEM42Q69YG0 159 aa14.55□□□□□ -0.08
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 WDR82Q6UXN9 313 aa14.55□□□□□ -0.08
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TMPRSS11AQ6ZMR5 421 aa14.55□□□□□ -0.08
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 DCDC5Q6ZRR9 648 aa14.55□□□□□ -0.08
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 NLRC3Q7RTR2 1065 aa14.55□□□□□ -0.08
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 C11orf53Q8IXP5 236 aa14.55□□□□□ -0.08
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 GCSAMQ8N6F7 178 aa14.55□□□□□ -0.08
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 OR5A2Q8NGI9 324 aa14.55□□□□□ -0.08
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ZNF649Q9BS31 505 aa14.55□□□□□ -0.08
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 FGF23Q9GZV9 251 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SHARPINQ9H0F6 387 aa14.55□□□□□ -0.08
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MIOXQ9UGB7 285 aa14.55□□□□□ -0.08
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ABCA1O95477 2261 aa14.54□□□□□ -0.08
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TRAV38-1A0A0B4J264 116 aa14.54□□□□□ -0.08
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 EFCAB10A6NFE3 127 aa14.54□□□□□ -0.08
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ANKRD61A6NGH8 418 aa14.54□□□□□ -0.08
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 OOEPA6NGQ2 149 aa14.54□□□□□ -0.08
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ZNF732B4DXR9 585 aa14.54□□□□□ -0.08
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 F5H0A9 414 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 C3orf80F5H4A9 247 aa14.54□□□□□ -0.08
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PLPP2O43688 288 aa14.54□□□□□ -0.08
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ATP6V1G2O95670 118 aa14.54□□□□□ -0.08
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ISG15P05161 165 aa14.54□□□□□ -0.08
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 LIMS3P0CW19 117 aa14.54□□□□□ -0.08
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 LIMS4P0CW20 117 aa14.54□□□□□ -0.08
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PIPP12273 146 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ALKBH1Q13686 389 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CR1LQ2VPA4 569 aa14.54□□□□□ -0.08
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 FAM76BQ5HYJ3 339 aa14.54□□□□□ -0.08
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SFRP4Q6FHJ7 346 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 RDH10Q8IZV5 341 aa14.54□□□□□ -0.08
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 C19orf18Q8NEA5 215 aa14.54□□□□□ -0.08
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 DEFB108BQ8NET1 73 aa14.54□□□□□ -0.08
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 OR8B3Q8NGG8 313 aa14.54□□□□□ -0.08
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 FBLIM1Q8WUP2 373 aa14.54□□□□□ -0.08
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 RPL3LQ92901 407 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 C10orf35Q96D05 121 aa14.54□□□□□ -0.08
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TMEM80Q96HE8 168 aa14.54□□□□□ -0.08
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 OR8B2Q96RD0 313 aa14.54□□□□□ -0.08
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MDFIQ99750 246 aa14.54□□□□□ -0.08
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 BEX2Q9BXY8 128 aa14.54□□□□□ -0.08
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 METTL17Q9H7H0 456 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 GPR173Q9NS66 373 aa14.54□□□□□ -0.08
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CNOT2Q9NZN8 540 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 LRCH1Q9Y2L9 728 aa14.54□□□□□ -0.08
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CAB39Q9Y376 341 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 DYSFO75923 2080 aa14.54□□□□□ -0.08
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 A6NIN4 97 aa14.53□□□□□ -0.08
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 GATBO75879 557 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SERPINA3P01011 423 aa14.53□□□□□ -0.08
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 LHBP01229 141 aa14.53□□□□□ -0.08
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 RPSAP08865 295 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CCDC159P0C7I6 412 aa14.53□□□□□ -0.08
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CFHR2P36980 270 aa14.53□□□□□ -0.08
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 HSPA13P48723 471 aa14.53□□□□□ -0.08
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ETV1P50549 477 aa14.53□□□□□ -0.08
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 LCN2P80188 198 aa14.53□□□□□ -0.08
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 DMRTC1Q5HYR2 192 aa14.53□□□□□ -0.08
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 FAM120AOSQ5T036 256 aa14.53□□□□□ -0.08
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ZNF676Q8N7Q3 588 aa14.53□□□□□ -0.08
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SCCPDHQ8NBX0 429 aa14.53□□□□□ -0.08
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 OR10Z1Q8NGY1 313 aa14.53□□□□□ -0.08
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TECTBQ96PL2 329 aa14.53□□□□□ -0.08
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 OR51I2Q9H344 312 aa14.53□□□□□ -0.08
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 HHLA2Q9UM44 414 aa14.53□□□□□ -0.08
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 A0A0G2JMP0 313 aa14.52□□□□□ -0.09
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 A0A0X1KG70 313 aa14.52□□□□□ -0.09
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TMEM212A6NML5 194 aa14.52□□□□□ -0.09
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 OR4C45A6NMZ5 311 aa14.52□□□□□ -0.09
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 KIAA1324LA8MWY0 1029 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 A8MXK9 166 aa14.52□□□□□ -0.09
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 NDUFA2O43678 99 aa14.52□□□□□ -0.09
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 XPNPEP2O43895 674 aa14.52□□□□□ -0.09
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 WNT2P09544 360 aa14.52□□□□□ -0.09
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ZNF20P17024 532 aa14.52□□□□□ -0.09
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 EGR1P18146 543 aa14.52□□□□□ -0.09
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TGM4P49221 684 aa14.52□□□□□ -0.09
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SEC61A1P61619 476 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 GNB2P62879 340 aa14.52□□□□□ -0.09
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ST3GAL4Q11206 333 aa14.52□□□□□ -0.09
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MICBQ29980 383 aa14.52□□□□□ -0.09
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TEX36Q5VZQ5 186 aa14.52□□□□□ -0.09
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 LAIR2Q6ISS4 152 aa14.52□□□□□ -0.09
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 IZUMO2Q6UXV1 221 aa14.52□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44 ms