RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000413409.6

PTPRC-206, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 1,338 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-206ENST00000413409 ZNF107Q9UII5 783 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
PTPRC-206ENST00000413409 V9GYS6 101 aa14.85□□□□□ -0.03
PTPRC-206ENST00000413409 ANK2Q01484 3957 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRC-206ENST00000413409 SONP18583 2426 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
PTPRC-206ENST00000413409 TRAV18A0A075B6X5 111 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRC-206ENST00000413409 OR6C6A6NF89 314 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRC-206ENST00000413409 ZNF724A8MTY0 619 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRC-206ENST00000413409 H7C1Q1 480 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRC-206ENST00000413409 SYNGR3O43761 229 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRC-206ENST00000413409 RBBP9O75884 186 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRC-206ENST00000413409 DHRS3O75911 302 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRC-206ENST00000413409 H2AFB2P0C5Z0 115 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRC-206ENST00000413409 PRSS3P35030 304 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRC-206ENST00000413409 ACTBP60709 375 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRC-206ENST00000413409 ACTG1P63261 375 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRC-206ENST00000413409 ZFP69Q49AA0 526 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRC-206ENST00000413409 LRRC18Q8N456 261 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRC-206ENST00000413409 OR52N4Q8NGI2 321 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRC-206ENST00000413409 OR52H1Q8NGJ2 320 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRC-206ENST00000413409 GPX8Q8TED1 209 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRC-206ENST00000413409 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
PTPRC-206ENST00000413409 C20orf85Q9H1P6 137 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRC-206ENST00000413409 OR10A2Q9H208 303 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRC-206ENST00000413409 BCO1Q9HAY6 547 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRC-206ENST00000413409 PARPBPQ9NWS1 579 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRC-206ENST00000413409 KLK11Q9UBX7 282 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRC-206ENST00000413409 A0A0G2JNJ9 132 aa14.83□□□□□ -0.04
PTPRC-206ENST00000413409 RNF212BA8MTL3 300 aa14.83□□□□□ -0.04
PTPRC-206ENST00000413409 PRAF2O60831 178 aa14.83□□□□□ -0.04
PTPRC-206ENST00000413409 LPLP06858 475 aa14.83□□□□□ -0.04
PTPRC-206ENST00000413409 UBBP0CG47 229 aa14.83□□□□□ -0.04
PTPRC-206ENST00000413409 GSK3AP49840 483 aa14.83□□□□□ -0.04
PTPRC-206ENST00000413409 CCR6P51684 374 aa14.83□□□□□ -0.04
PTPRC-206ENST00000413409 PPIAP62937 165 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
PTPRC-206ENST00000413409 QRFPP83859 136 aa14.83□□□□□ -0.04
PTPRC-206ENST00000413409 GALK2Q01415 458 aa14.83□□□□□ -0.04
PTPRC-206ENST00000413409 RSPO1Q2MKA7 263 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
PTPRC-206ENST00000413409 CEACAM16Q2WEN9 425 aa14.83□□□□□ -0.04
PTPRC-206ENST00000413409 UTS2BQ765I0 119 aa14.83□□□□□ -0.04
PTPRC-206ENST00000413409 OR1F12Q8NHA8 337 aa14.83□□□□□ -0.04
PTPRC-206ENST00000413409 PP6455Q8WZ26 134 aa14.83□□□□□ -0.04
PTPRC-206ENST00000413409 FAM46BQ96A09 425 aa14.83□□□□□ -0.04
PTPRC-206ENST00000413409 LYZL4Q96KX0 146 aa14.83□□□□□ -0.04
PTPRC-206ENST00000413409 GHITMQ9H3K2 345 aa14.83□□□□□ -0.04
PTPRC-206ENST00000413409 EXO5Q9H790 373 aa14.83□□□□□ -0.04
PTPRC-206ENST00000413409 PLEKHF2Q9H8W4 249 aa14.83□□□□□ -0.04
PTPRC-206ENST00000413409 NEK6Q9HC98 313 aa14.83□□□□□ -0.04
PTPRC-206ENST00000413409 Q9UFV3 132 aa14.83□□□□□ -0.04
PTPRC-206ENST00000413409 ZNF391Q9UJN7 358 aa14.83□□□□□ -0.04
PTPRC-206ENST00000413409 NOSIPQ9Y314 301 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
PTPRC-206ENST00000413409 TRAV6A0A075B6T7 132 aa14.82□□□□□ -0.04
PTPRC-206ENST00000413409 METTL21EPA6NDL7 271 aa14.82□□□□□ -0.04
PTPRC-206ENST00000413409 TMEM14DPA8MWL7 114 aa14.82□□□□□ -0.04
PTPRC-206ENST00000413409 F5H5K5 113 aa14.82□□□□□ -0.04
PTPRC-206ENST00000413409 RPL36A-HNRNPH2H7BZ11 118 aa14.82□□□□□ -0.04
PTPRC-206ENST00000413409 GMDSO60547 372 aa14.82□□□□□ -0.04
PTPRC-206ENST00000413409 MRPL33O75394 65 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
PTPRC-206ENST00000413409 MTRF1O75570 445 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
PTPRC-206ENST00000413409 GLI4P10075 376 aa14.82□□□□□ -0.04
PTPRC-206ENST00000413409 PSMB1P20618 241 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
PTPRC-206ENST00000413409 ZNF93P35789 620 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
PTPRC-206ENST00000413409 SLC6A9P48067 706 aa14.82□□□□□ -0.04
PTPRC-206ENST00000413409 RNPS1Q15287 305 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
PTPRC-206ENST00000413409 KCNJ8Q15842 424 aa14.82□□□□□ -0.04
PTPRC-206ENST00000413409 FAM189A2Q15884 450 aa14.82□□□□□ -0.04
PTPRC-206ENST00000413409 SHEQ5VZ18 495 aa14.82□□□□□ -0.04
PTPRC-206ENST00000413409 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
PTPRC-206ENST00000413409 ING3Q9NXR8 418 aa14.82□□□□□ -0.04
PTPRC-206ENST00000413409 TIMM10BQ9Y5J6 103 aa14.82□□□□□ -0.04
PTPRC-206ENST00000413409 A0A0A6YYJ9 748 aa14.81□□□□□ -0.04
PTPRC-206ENST00000413409 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
PTPRC-206ENST00000413409 PEX14O75381 377 aa14.81□□□□□ -0.04
PTPRC-206ENST00000413409 FARS2O95363 451 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
PTPRC-206ENST00000413409 PTHLHP12272 177 aa14.81□□□□□ -0.04
PTPRC-206ENST00000413409 B4GALT1P15291 398 aa14.81□□□□□ -0.04
PTPRC-206ENST00000413409 ZNF32P17041 273 aa14.81□□□□□ -0.04
PTPRC-206ENST00000413409 ANOS1P23352 680 aa14.81□□□□□ -0.04
PTPRC-206ENST00000413409 STOMP27105 288 aa14.81□□□□□ -0.04
PTPRC-206ENST00000413409 MECP2P51608 486 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
PTPRC-206ENST00000413409 SLC10A1Q14973 349 aa14.81□□□□□ -0.04
PTPRC-206ENST00000413409 GSG1Q2KHT4 349 aa14.81□□□□□ -0.04
PTPRC-206ENST00000413409 PCGF3Q3KNV8 242 aa14.81□□□□□ -0.04
PTPRC-206ENST00000413409 CD276Q5ZPR3 534 aa14.81□□□□□ -0.04
PTPRC-206ENST00000413409 AWAT2Q6E213 333 aa14.81□□□□□ -0.04
PTPRC-206ENST00000413409 RTL6Q6ICC9 239 aa14.81□□□□□ -0.04
PTPRC-206ENST00000413409 ZNF627Q7L945 461 aa14.81□□□□□ -0.04
PTPRC-206ENST00000413409 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
PTPRC-206ENST00000413409 SOX7Q9BT81 388 aa14.81□□□□□ -0.04
PTPRC-206ENST00000413409 OR2H1Q9GZK4 316 aa14.81□□□□□ -0.04
PTPRC-206ENST00000413409 CHST5Q9GZS9 411 aa14.81□□□□□ -0.04
PTPRC-206ENST00000413409 ZDHHC11Q9H8X9 412 aa14.81□□□□□ -0.04
PTPRC-206ENST00000413409 RANGRFQ9HD47 186 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
PTPRC-206ENST00000413409 MCUBQ9NWR8 336 aa14.81□□□□□ -0.04
PTPRC-206ENST00000413409 MRPL15Q9P015 296 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
PTPRC-206ENST00000413409 FAM215AQ9Y5M1 114 aa14.81□□□□□ -0.04
PTPRC-206ENST00000413409 N6AMT1Q9Y5N5 214 aa14.81□□□□□ -0.04
PTPRC-206ENST00000413409 A8MV72 311 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
PTPRC-206ENST00000413409 NDUFB6O95139 128 aa14.8□□□□□ -0.04
PTPRC-206ENST00000413409 AKAIN1P0CW23 69 aa14.8□□□□□ -0.04
PTPRC-206ENST00000413409 VSIG8P0DPA2 414 aa14.8□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.4 ms