RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000404525.5

LTBP1-202, Transcript of latent transforming growth factor beta binding protein 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene LTBP1, Length 5,092 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP1-202ENST00000404525 CYTIPO60759 359 aa7.25□□□□□ -1.25
LTBP1-202ENST00000404525 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
LTBP1-202ENST00000404525 AVPR2P30518 371 aa7.25□□□□□ -1.25
LTBP1-202ENST00000404525 GUCA2AQ02747 115 aa7.25□□□□□ -1.25
LTBP1-202ENST00000404525 SPEM2Q0P670 501 aa7.25□□□□□ -1.25
LTBP1-202ENST00000404525 ZNF239Q16600 458 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
LTBP1-202ENST00000404525 PCK2Q16822 640 aa7.25□□□□□ -1.25
LTBP1-202ENST00000404525 TMEM178AQ8NBL3 297 aa7.25□□□□□ -1.25
LTBP1-202ENST00000404525 OR5M8Q8NGP6 311 aa7.25□□□□□ -1.25
LTBP1-202ENST00000404525 OR10J5Q8NHC4 309 aa7.25□□□□□ -1.25
LTBP1-202ENST00000404525 GAB2Q9UQC2 676 aa7.25□□□□□ -1.25
LTBP1-202ENST00000404525 SLC5A6Q9Y289 635 aa7.25□□□□□ -1.25
LTBP1-202ENST00000404525 hCG_1809904A0A1W2PP81 198 aa7.25□□□□□ -1.25
LTBP1-202ENST00000404525 A0A1W2PPE2 198 aa7.25□□□□□ -1.25
LTBP1-202ENST00000404525 A0A1W2PR64 198 aa7.25□□□□□ -1.25
LTBP1-202ENST00000404525 A0A1W2PRV1 198 aa7.25□□□□□ -1.25
LTBP1-202ENST00000404525 OR6C76A6NM76 312 aa7.25□□□□□ -1.25
LTBP1-202ENST00000404525 MESP2Q0VG99 397 aa7.25□□□□□ -1.25
LTBP1-202ENST00000404525 INPP5JQ15735 1006 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
LTBP1-202ENST00000404525 CATSPERDQ86XM0 798 aa7.25□□□□□ -1.25
LTBP1-202ENST00000404525 GALNT16Q8N428 558 aa7.25□□□□□ -1.25
LTBP1-202ENST00000404525 OR2AE1Q8NHA4 323 aa7.25□□□□□ -1.25
LTBP1-202ENST00000404525 ZG16BQ96DA0 208 aa7.25□□□□□ -1.25
LTBP1-202ENST00000404525 VWCEQ96DN2 955 aa7.25□□□□□ -1.25
LTBP1-202ENST00000404525 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa7.25□□□□□ -1.25
LTBP1-202ENST00000404525 ZNF346Q9UL40 294 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
LTBP1-202ENST00000404525 FAM96BQ9Y3D0 163 aa7.25□□□□□ -1.25
LTBP1-202ENST00000404525 ATG2BQ96BY7 2078 aa7.25□□□□□ -1.25
LTBP1-202ENST00000404525 G3V3Q6 166 aa7.25□□□□□ -1.25
LTBP1-202ENST00000404525 H0YIG0 161 aa7.25□□□□□ -1.25
LTBP1-202ENST00000404525 KLRC4-KLRK1H3BQV0 150 aa7.25□□□□□ -1.25
LTBP1-202ENST00000404525 LINC01387J3KSC0 135 aa7.25□□□□□ -1.25
LTBP1-202ENST00000404525 OR2C1O95371 312 aa7.25□□□□□ -1.25
LTBP1-202ENST00000404525 OR13C7P0DN81 318 aa7.25□□□□□ -1.25
LTBP1-202ENST00000404525 IL3RAP26951 378 aa7.25□□□□□ -1.25
LTBP1-202ENST00000404525 FCGR2CP31995 323 aa7.25□□□□□ -1.25
LTBP1-202ENST00000404525 AKR1C3P42330 323 aa7.25□□□□□ -1.25
LTBP1-202ENST00000404525 RPL18Q07020 188 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
LTBP1-202ENST00000404525 PRTGQ2VWP7 1150 aa7.25□□□□□ -1.25
LTBP1-202ENST00000404525 ZNF528Q3MIS6 628 aa7.25□□□□□ -1.25
LTBP1-202ENST00000404525 SLC35G3Q8N808 338 aa7.25□□□□□ -1.25
LTBP1-202ENST00000404525 EMC6Q9BV81 110 aa7.25□□□□□ -1.25
LTBP1-202ENST00000404525 TXNIPQ9H3M7 391 aa7.25□□□□□ -1.25
LTBP1-202ENST00000404525 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa7.25□□□□□ -1.25
LTBP1-202ENST00000404525 SLCO1B1Q9Y6L6 691 aa7.25□□□□□ -1.25
LTBP1-202ENST00000404525 TRPM6Q9BX84 2022 aa7.24□□□□□ -1.25
LTBP1-202ENST00000404525 SSX7Q7RTT5 188 aa7.24□□□□□ -1.25
LTBP1-202ENST00000404525 HPSE2Q8WWQ2 592 aa7.24□□□□□ -1.25
LTBP1-202ENST00000404525 C2orf50Q96LR7 162 aa7.24□□□□□ -1.25
LTBP1-202ENST00000404525 ASH2LQ9UBL3 628 aa7.24□□□□□ -1.25
LTBP1-202ENST00000404525 SSUH2Q9Y2M2 353 aa7.24□□□□□ -1.25
LTBP1-202ENST00000404525 UMAD1C9J7I0 102 aa7.24□□□□□ -1.25
LTBP1-202ENST00000404525 DEGS1O15121 323 aa7.24□□□□□ -1.25
LTBP1-202ENST00000404525 METTL15P1P0C7V9 234 aa7.24□□□□□ -1.25
LTBP1-202ENST00000404525 RPL12P30050 165 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
LTBP1-202ENST00000404525 CYB561P49447 251 aa7.24□□□□□ -1.25
LTBP1-202ENST00000404525 DHRS2Q13268 280 aa7.24□□□□□ -1.25
LTBP1-202ENST00000404525 ENDOGQ14249 297 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
LTBP1-202ENST00000404525 SLC17A1Q14916 467 aa7.24□□□□□ -1.25
LTBP1-202ENST00000404525 JMJD6Q6NYC1 403 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
LTBP1-202ENST00000404525 Q6ZRG5 221 aa7.24□□□□□ -1.25
LTBP1-202ENST00000404525 ARHGEF39Q8N4T4 335 aa7.24□□□□□ -1.25
LTBP1-202ENST00000404525 OR2G2Q8NGZ5 317 aa7.24□□□□□ -1.25
LTBP1-202ENST00000404525 APH1AQ96BI3 265 aa7.24□□□□□ -1.25
LTBP1-202ENST00000404525 SLC25A38Q96DW6 304 aa7.24□□□□□ -1.25
LTBP1-202ENST00000404525 ZNF2Q9BSG1 426 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
LTBP1-202ENST00000404525 AK3Q9UIJ7 227 aa7.24□□□□□ -1.25
LTBP1-202ENST00000404525 IGHV3-20A0A0C4DH32 117 aa7.24□□□□□ -1.25
LTBP1-202ENST00000404525 PRSS37A4D1T9 235 aa7.24□□□□□ -1.25
LTBP1-202ENST00000404525 AP4M1O00189 453 aa7.24□□□□□ -1.25
LTBP1-202ENST00000404525 CD37P11049 281 aa7.24□□□□□ -1.25
LTBP1-202ENST00000404525 SLC25A4P12235 298 aa7.24□□□□□ -1.25
LTBP1-202ENST00000404525 ST6GAL1P15907 406 aa7.24□□□□□ -1.25
LTBP1-202ENST00000404525 TCN2P20062 427 aa7.24□□□□□ -1.25
LTBP1-202ENST00000404525 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP7.24□□□□□ -1.25
LTBP1-202ENST00000404525 SLC10A1Q14973 349 aa7.24□□□□□ -1.25
LTBP1-202ENST00000404525 H2BFWTQ7Z2G1 175 aa7.24□□□□□ -1.25
LTBP1-202ENST00000404525 CPEB2Q7Z5Q1 589 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
LTBP1-202ENST00000404525 CA13Q8N1Q1 262 aa7.24□□□□□ -1.25
LTBP1-202ENST00000404525 EXD3Q8N9H8 876 aa7.24□□□□□ -1.25
LTBP1-202ENST00000404525 OR52N5Q8NH56 324 aa7.24□□□□□ -1.25
LTBP1-202ENST00000404525 OR51E1Q8TCB6 317 aa7.24□□□□□ -1.25
LTBP1-202ENST00000404525 CORO2AQ92828 525 aa7.24□□□□□ -1.25
LTBP1-202ENST00000404525 HIF1ANQ9NWT6 349 aa7.24□□□□□ -1.25
LTBP1-202ENST00000404525 CACFD1Q9UGQ2 172 aa7.24□□□□□ -1.25
LTBP1-202ENST00000404525 TIMM10BQ9Y5J6 103 aa7.24□□□□□ -1.25
LTBP1-202ENST00000404525 R4GMQ9 66 aa7.24□□□□□ -1.25
LTBP1-202ENST00000404525 ZNF891A8MT65 544 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
LTBP1-202ENST00000404525 K7EQM0 130 aa7.24□□□□□ -1.25
LTBP1-202ENST00000404525 ZNF354AO60765 605 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
LTBP1-202ENST00000404525 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
LTBP1-202ENST00000404525 OR8U8P0C7N1 319 aa7.24□□□□□ -1.25
LTBP1-202ENST00000404525 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
LTBP1-202ENST00000404525 TBC1D28Q2M2D7 210 aa7.24□□□□□ -1.25
LTBP1-202ENST00000404525 C2orf68Q2NKX9 166 aa7.24□□□□□ -1.25
LTBP1-202ENST00000404525 PHYHD1Q5SRE7 291 aa7.24□□□□□ -1.25
LTBP1-202ENST00000404525 LYG2Q86SG7 212 aa7.24□□□□□ -1.25
LTBP1-202ENST00000404525 CMTM2Q8TAZ6 248 aa7.24□□□□□ -1.25
LTBP1-202ENST00000404525 GPX8Q8TED1 209 aa7.24□□□□□ -1.25
LTBP1-202ENST00000404525 SLC39A7Q92504 469 aa7.24□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.4 ms