RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392539.3

HOXD13-201, Transcript of homeobox D13, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD13, Length 2,240 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13-201ENST00000392539 RRNAD1Q96FB5 475 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.3
HOXD13-201ENST00000392539 RBM24Q9BX46 236 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.3
HOXD13-201ENST00000392539 IGHV3-15A0A0B4J1V0 119 aa23.14■■□□□ 1.29
HOXD13-201ENST00000392539 SDCBPO00560 298 aaPredicted RBP23.14■■□□□ 1.29
HOXD13-201ENST00000392539 NUPL2O15504 423 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.29
HOXD13-201ENST00000392539 CCL3P10147 92 aa23.14■■□□□ 1.29
HOXD13-201ENST00000392539 RSPO1Q2MKA7 263 aaPredicted RBP23.14■■□□□ 1.29
HOXD13-201ENST00000392539 HLA-BQ31612 363 aa23.14■■□□□ 1.29
HOXD13-201ENST00000392539 PLEKHN1Q494U1 663 aaPredicted RBP23.14■■□□□ 1.29
HOXD13-201ENST00000392539 NARS2Q96I59 477 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.29
HOXD13-201ENST00000392539 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP23.14■■□□□ 1.29
HOXD13-201ENST00000392539 GNRHR2Q96P88 292 aa23.14■■□□□ 1.29
HOXD13-201ENST00000392539 METTL8Q9H825 291 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.29
HOXD13-201ENST00000392539 CYTL1Q9NRR1 136 aa23.14■■□□□ 1.29
HOXD13-201ENST00000392539 DKKL1Q9UK85 242 aa23.14■■□□□ 1.29
HOXD13-201ENST00000392539 PCDHGA1Q9Y5H4 931 aa23.14■■□□□ 1.29
HOXD13-201ENST00000392539 CD63P08962 238 aa23.13■■□□□ 1.29
HOXD13-201ENST00000392539 ZNF84P51523 738 aa23.13■■□□□ 1.29
HOXD13-201ENST00000392539 AIMP2Q13155 320 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
HOXD13-201ENST00000392539 CHRFAM7AQ494W8 412 aa23.13■■□□□ 1.29
HOXD13-201ENST00000392539 M1APQ8TC57 530 aa23.13■■□□□ 1.29
HOXD13-201ENST00000392539 ROBO4Q8WZ75 1007 aa23.13■■□□□ 1.29
HOXD13-201ENST00000392539 C2orf50Q96LR7 162 aa23.13■■□□□ 1.29
HOXD13-201ENST00000392539 FSCN3Q9NQT6 498 aa23.13■■□□□ 1.29
HOXD13-201ENST00000392539 TMEM100Q9NV29 134 aa23.13■■□□□ 1.29
HOXD13-201ENST00000392539 FIGNL2A6NMB9 653 aa23.13■■□□□ 1.29
HOXD13-201ENST00000392539 MPTX1A8MV57 137 aa23.13■■□□□ 1.29
HOXD13-201ENST00000392539 M0R135 149 aa23.13■■□□□ 1.29
HOXD13-201ENST00000392539 DNASE2O00115 360 aaPredicted RBP23.13■■□□□ 1.29
HOXD13-201ENST00000392539 ZIC3O60481 467 aa23.13■■□□□ 1.29
HOXD13-201ENST00000392539 KLK3P07288 261 aaPredicted RBP23.13■■□□□ 1.29
HOXD13-201ENST00000392539 SSR4P51571 173 aa23.13■■□□□ 1.29
HOXD13-201ENST00000392539 SPTSSAQ969W0 71 aa23.13■■□□□ 1.29
HOXD13-201ENST00000392539 ZNF799Q96GE5 643 aa23.13■■□□□ 1.29
HOXD13-201ENST00000392539 UCN2Q96RP3 112 aa23.13■■□□□ 1.29
HOXD13-201ENST00000392539 PROK2Q9HC23 129 aa23.13■■□□□ 1.29
HOXD13-201ENST00000392539 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
HOXD13-201ENST00000392539 UMODP07911 640 aa23.12■■□□□ 1.29
HOXD13-201ENST00000392539 COX6A1P12074 109 aa23.12■■□□□ 1.29
HOXD13-201ENST00000392539 GLRA1P23415 457 aa23.12■■□□□ 1.29
HOXD13-201ENST00000392539 SUCLG1P53597 346 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
HOXD13-201ENST00000392539 IFI44Q8TCB0 444 aa23.12■■□□□ 1.29
HOXD13-201ENST00000392539 RNF141Q8WVD5 230 aa23.12■■□□□ 1.29
HOXD13-201ENST00000392539 PRR13Q9NZ81 148 aa23.12■■□□□ 1.29
HOXD13-201ENST00000392539 PTRH2Q9Y3E5 179 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
HOXD13-201ENST00000392539 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP23.12■■□□□ 1.29
HOXD13-201ENST00000392539 PAQR8Q8TEZ7 354 aa23.12■■□□□ 1.29
HOXD13-201ENST00000392539 MR1Q95460 341 aa23.12■■□□□ 1.29
HOXD13-201ENST00000392539 ULBP2Q9BZM5 246 aa23.12■■□□□ 1.29
HOXD13-201ENST00000392539 SLC6A15Q9H2J7 730 aa23.12■■□□□ 1.29
HOXD13-201ENST00000392539 ELL3Q9HB65 397 aaPredicted RBP23.12■■□□□ 1.29
HOXD13-201ENST00000392539 PLEK2Q9NYT0 353 aa23.12■■□□□ 1.29
HOXD13-201ENST00000392539 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP23.12■■□□□ 1.29
HOXD13-201ENST00000392539 PET100P0DJ07 73 aa23.11■■□□□ 1.29
HOXD13-201ENST00000392539 CD79AP11912 226 aa23.11■■□□□ 1.29
HOXD13-201ENST00000392539 RPS2P15880 293 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
HOXD13-201ENST00000392539 CCDC157Q569K6 752 aa23.11■■□□□ 1.29
HOXD13-201ENST00000392539 MAFIPQ8WZ33 124 aa23.11■■□□□ 1.29
HOXD13-201ENST00000392539 PIGTQ969N2 578 aa23.11■■□□□ 1.29
HOXD13-201ENST00000392539 NTNG2Q96CW9 530 aa23.11■■□□□ 1.29
HOXD13-201ENST00000392539 AQP10Q96PS8 301 aa23.11■■□□□ 1.29
HOXD13-201ENST00000392539 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
HOXD13-201ENST00000392539 C14orf166Q9Y224 244 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
HOXD13-201ENST00000392539 SIGLEC5O15389 551 aa23.1■■□□□ 1.29
HOXD13-201ENST00000392539 ECI1P42126 302 aa23.1■■□□□ 1.29
HOXD13-201ENST00000392539 SIGLEC14Q08ET2 396 aa23.1■■□□□ 1.29
HOXD13-201ENST00000392539 POC1AQ8NBT0 407 aa23.1■■□□□ 1.29
HOXD13-201ENST00000392539 OR10C1Q96KK4 312 aa23.1■■□□□ 1.29
HOXD13-201ENST00000392539 PIGQQ9BRB3 760 aa23.1■■□□□ 1.29
HOXD13-201ENST00000392539 OR5AC2Q9NZP5 309 aa23.1■■□□□ 1.29
HOXD13-201ENST00000392539 SIT1Q9Y3P8 196 aa23.1■■□□□ 1.29
HOXD13-201ENST00000392539 NUDT19A8MXV4 375 aa23.1■■□□□ 1.29
HOXD13-201ENST00000392539 GDF9O60383 454 aa23.1■■□□□ 1.29
HOXD13-201ENST00000392539 STK11Q15831 433 aa23.1■■□□□ 1.29
HOXD13-201ENST00000392539 NKAPLQ5M9Q1 402 aa23.1■■□□□ 1.29
HOXD13-201ENST00000392539 DTX1Q86Y01 620 aa23.1■■□□□ 1.29
HOXD13-201ENST00000392539 BOLLQ8N9W6 283 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
HOXD13-201ENST00000392539 JSRP1Q96MG2 331 aaPredicted RBP23.1■■□□□ 1.29
HOXD13-201ENST00000392539 SH2D2AQ9NP31 389 aa23.1■■□□□ 1.29
HOXD13-201ENST00000392539 DNAJB11Q9UBS4 358 aa23.1■■□□□ 1.29
HOXD13-201ENST00000392539 VCANP13611 3396 aa23.1■■□□□ 1.29
HOXD13-201ENST00000392539 RAC1P63000 192 aa23.09■■□□□ 1.29
HOXD13-201ENST00000392539 C20orf196Q8IYI0 205 aa23.09■■□□□ 1.29
HOXD13-201ENST00000392539 ZIC4Q8N9L1 334 aa23.09■■□□□ 1.29
HOXD13-201ENST00000392539 ARL11Q969Q4 196 aa23.09■■□□□ 1.29
HOXD13-201ENST00000392539 MEMO1Q9Y316 297 aa23.09■■□□□ 1.29
HOXD13-201ENST00000392539 TMEM218A2RU14 115 aa23.09■■□□□ 1.29
HOXD13-201ENST00000392539 C9J4A7 227 aa23.09■■□□□ 1.29
HOXD13-201ENST00000392539 DBHP09172 617 aa23.09■■□□□ 1.29
HOXD13-201ENST00000392539 MRPS34P82930 218 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
HOXD13-201ENST00000392539 SPEGQ15772 3267 aa23.09■■□□□ 1.29
HOXD13-201ENST00000392539 FAM27BQ5VT28 67 aa23.09■■□□□ 1.29
HOXD13-201ENST00000392539 HLA-CQ95604 372 aa23.09■■□□□ 1.29
HOXD13-201ENST00000392539 ZNF701Q9NV72 531 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
HOXD13-201ENST00000392539 PILRBQ9UKJ0 227 aa23.09■■□□□ 1.29
HOXD13-201ENST00000392539 MSGN1A6NI15 193 aa23.08■■□□□ 1.29
HOXD13-201ENST00000392539 RRP8O43159 456 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.29
HOXD13-201ENST00000392539 ATG12O94817 140 aa23.08■■□□□ 1.29
HOXD13-201ENST00000392539 TMEM156Q8N614 296 aa23.08■■□□□ 1.29
HOXD13-201ENST00000392539 FBXO17Q96EF6 278 aa23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.2 ms