RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348564.10

PTPRC-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 4,626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-201ENST00000348564 ERVK-16P61578 105 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRC-201ENST00000348564 SLC35B1P78383 322 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRC-201ENST00000348564 PRKCDQ05655 676 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRC-201ENST00000348564 GPR50Q13585 617 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRC-201ENST00000348564 PDCD1Q15116 288 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRC-201ENST00000348564 IDNKQ5T6J7 187 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRC-201ENST00000348564 C20orf196Q8IYI0 205 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRC-201ENST00000348564 OR5D13Q8NGL4 314 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRC-201ENST00000348564 LRRC20Q8TCA0 184 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRC-201ENST00000348564 ASB10Q8WXI3 467 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRC-201ENST00000348564 TFAP2CQ92754 450 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRC-201ENST00000348564 RPL3LQ92901 407 aaKnown RBP3.83□□□□□ -1.8
PTPRC-201ENST00000348564 ARL11Q969Q4 196 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRC-201ENST00000348564 NPAS1Q99742 590 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRC-201ENST00000348564 SELENOIQ9C0D9 397 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRC-201ENST00000348564 SLC5A7Q9GZV3 580 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRC-201ENST00000348564 MYRFQ9Y2G1 1151 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRC-201ENST00000348564 NDUFS8O00217 210 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRC-201ENST00000348564 MSMBP08118 114 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRC-201ENST00000348564 RPS4Y1P22090 263 aaKnown RBP3.83□□□□□ -1.8
PTPRC-201ENST00000348564 ERVFRD-1P60508 538 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRC-201ENST00000348564 GK3PQ14409 553 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRC-201ENST00000348564 GPR176Q14439 515 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRC-201ENST00000348564 EXOSC6Q5RKV6 272 aaKnown RBP3.83□□□□□ -1.8
PTPRC-201ENST00000348564 CLVS2Q5SYC1 327 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRC-201ENST00000348564 KDM4DQ6B0I6 523 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRC-201ENST00000348564 MZT2AQ6P582 158 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRC-201ENST00000348564 BRD3OSQ6XYD6 125 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRC-201ENST00000348564 RFPL4BQ6ZWI9 263 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRC-201ENST00000348564 LSMEM1Q8N8F7 131 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRC-201ENST00000348564 MRPS24Q96EL2 167 aaKnown RBP3.83□□□□□ -1.8
PTPRC-201ENST00000348564 TMEM80Q96HE8 168 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRC-201ENST00000348564 C4orf36Q96KX1 117 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRC-201ENST00000348564 OPALINQ96PE5 141 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRC-201ENST00000348564 SORCS2Q96PQ0 1159 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRC-201ENST00000348564 TSPAN32Q96QS1 320 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRC-201ENST00000348564 RASL11BQ9BPW5 248 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRC-201ENST00000348564 ATG5Q9H1Y0 275 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRC-201ENST00000348564 RGCCQ9H4X1 137 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRC-201ENST00000348564 HRASLSQ9HDD0 168 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRC-201ENST00000348564 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP3.83□□□□□ -1.8
PTPRC-201ENST00000348564 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRC-201ENST00000348564 C1RLQ9NZP8 487 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRC-201ENST00000348564 SLC22A13Q9Y226 551 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRC-201ENST00000348564 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP3.83□□□□□ -1.8
PTPRC-201ENST00000348564 CHST2Q9Y4C5 530 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRC-201ENST00000348564 WIPI2Q9Y4P8 454 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRC-201ENST00000348564 MYO15AQ9UKN7 3530 aa3.82□□□□□ -1.8
PTPRC-201ENST00000348564 IGHV1-18A0A0C4DH31 117 aa3.82□□□□□ -1.8
PTPRC-201ENST00000348564 A0A1B0GVC2 190 aa3.82□□□□□ -1.8
PTPRC-201ENST00000348564 RFPL4AA6NLU0 287 aa3.82□□□□□ -1.8
PTPRC-201ENST00000348564 RFPL4AL1F8VTS6 287 aa3.82□□□□□ -1.8
PTPRC-201ENST00000348564 WBP4O75554 376 aaKnown RBP3.82□□□□□ -1.8
PTPRC-201ENST00000348564 SNAPC5O75971 98 aa3.82□□□□□ -1.8
PTPRC-201ENST00000348564 BGLAPP02818 100 aa3.82□□□□□ -1.8
PTPRC-201ENST00000348564 LIPFP07098 398 aa3.82□□□□□ -1.8
PTPRC-201ENST00000348564 GTF2F2P13984 249 aa3.82□□□□□ -1.8
PTPRC-201ENST00000348564 HMGA2P52926 109 aa3.82□□□□□ -1.8
PTPRC-201ENST00000348564 LSM6P62312 80 aaKnown RBP3.82□□□□□ -1.8
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PTPRC-201ENST00000348564 ZNF620Q6ZNG0 422 aa3.82□□□□□ -1.8
PTPRC-201ENST00000348564 RDH10Q8IZV5 341 aa3.82□□□□□ -1.8
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PTPRC-201ENST00000348564 SLC35B4Q969S0 331 aa3.82□□□□□ -1.8
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP3.82□□□□□ -1.8
PTPRC-201ENST00000348564 OR4C12Q96R67 309 aa3.82□□□□□ -1.8
PTPRC-201ENST00000348564 TMUB1Q9BVT8 246 aa3.82□□□□□ -1.8
PTPRC-201ENST00000348564 YIPF3Q9GZM5 350 aa3.82□□□□□ -1.8
PTPRC-201ENST00000348564 GAL3ST2Q9H3Q3 398 aa3.82□□□□□ -1.8
PTPRC-201ENST00000348564 BEX1Q9HBH7 125 aa3.82□□□□□ -1.8
PTPRC-201ENST00000348564 OR2S2Q9NQN1 319 aa3.82□□□□□ -1.8
PTPRC-201ENST00000348564 DAPK2Q9UIK4 370 aa3.82□□□□□ -1.8
PTPRC-201ENST00000348564 MPC1Q9Y5U8 109 aa3.82□□□□□ -1.8
PTPRC-201ENST00000348564 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP3.82□□□□□ -1.8
PTPRC-201ENST00000348564 UBE2QL1A1L167 161 aa3.82□□□□□ -1.8
PTPRC-201ENST00000348564 DENRO43583 198 aaKnown RBP3.82□□□□□ -1.8
PTPRC-201ENST00000348564 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP3.82□□□□□ -1.8
PTPRC-201ENST00000348564 LY6G6DO95868 133 aa3.82□□□□□ -1.8
PTPRC-201ENST00000348564 F12P00748 615 aaPredicted RBP3.82□□□□□ -1.8
PTPRC-201ENST00000348564 ARG1P05089 322 aa3.82□□□□□ -1.8
PTPRC-201ENST00000348564 CDKN2AP42771 156 aaKnown RBP3.82□□□□□ -1.8
PTPRC-201ENST00000348564 FXYD4P59646 89 aa3.82□□□□□ -1.8
PTPRC-201ENST00000348564 BTG1P62324 171 aa3.82□□□□□ -1.8
PTPRC-201ENST00000348564 PRB3Q04118 309 aaPredicted RBP3.82□□□□□ -1.8
PTPRC-201ENST00000348564 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP3.82□□□□□ -1.8
PTPRC-201ENST00000348564 FNDC7Q5VTL7 733 aa3.82□□□□□ -1.8
PTPRC-201ENST00000348564 TMEM17Q86X19 198 aa3.82□□□□□ -1.8
PTPRC-201ENST00000348564 OR8G5Q8NG78 346 aa3.82□□□□□ -1.8
PTPRC-201ENST00000348564 CNIH3Q8TBE1 160 aa3.82□□□□□ -1.8
PTPRC-201ENST00000348564 TOMM40LQ969M1 308 aa3.82□□□□□ -1.8
PTPRC-201ENST00000348564 SLAMF9Q96A28 289 aa3.82□□□□□ -1.8
PTPRC-201ENST00000348564 NARS2Q96I59 477 aaKnown RBP3.82□□□□□ -1.8
PTPRC-201ENST00000348564 HS3ST6Q96QI5 342 aa3.82□□□□□ -1.8
PTPRC-201ENST00000348564 NPFFR1Q9GZQ6 430 aa3.82□□□□□ -1.8
PTPRC-201ENST00000348564 C6orf62Q9GZU0 229 aaPredicted RBP3.82□□□□□ -1.8
PTPRC-201ENST00000348564 PBOV1Q9GZY1 135 aa3.82□□□□□ -1.8
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF275Q9NSD4 429 aaPredicted RBP3.82□□□□□ -1.8
PTPRC-201ENST00000348564 AASSQ9UDR5 926 aa3.82□□□□□ -1.8
PTPRC-201ENST00000348564 SLC25A15Q9Y619 301 aa3.82□□□□□ -1.8
PTPRC-201ENST00000348564 FRYLO94915 3013 aa3.82□□□□□ -1.8
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