RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331222.5

CLN8-201, Transcript of CLN8, transmembrane ER and ERGIC protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLN8, Length 7,169 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8-201ENST00000331222 SAGE1Q9NXZ1 904 aa9.51□□□□□ -0.89
CLN8-201ENST00000331222 LSM2Q9Y333 95 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
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CLN8-201ENST00000331222 METTL12A8MUP2 240 aa9.5□□□□□ -0.89
CLN8-201ENST00000331222 XKR7Q5GH72 579 aa9.5□□□□□ -0.89
CLN8-201ENST00000331222 C1orf210Q8IVY1 113 aa9.5□□□□□ -0.89
CLN8-201ENST00000331222 MORN4Q8NDC4 146 aa9.5□□□□□ -0.89
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CLN8-201ENST00000331222 PSD2Q9BQI7 771 aa9.5□□□□□ -0.89
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CLN8-201ENST00000331222 HEATR5BQ9P2D3 2071 aa9.49□□□□□ -0.89
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CLN8-201ENST00000331222 PAX5Q02548 391 aa9.49□□□□□ -0.89
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CLN8-201ENST00000331222 USP54Q70EL1 1684 aa9.49□□□□□ -0.89
CLN8-201ENST00000331222 CGB1A6NKQ9 187 aa9.49□□□□□ -0.89
CLN8-201ENST00000331222 K7ESF4 209 aa9.49□□□□□ -0.89
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CLN8-201ENST00000331222 BMI1P35226 326 aa9.49□□□□□ -0.89
CLN8-201ENST00000331222 CAPZBP47756 277 aa9.49□□□□□ -0.89
CLN8-201ENST00000331222 MAMSTRQ6ZN01 415 aa9.49□□□□□ -0.89
CLN8-201ENST00000331222 PRSS41Q7RTY9 318 aa9.49□□□□□ -0.89
CLN8-201ENST00000331222 FLYWCH2Q96CP2 140 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
CLN8-201ENST00000331222 PELI1Q96FA3 418 aa9.49□□□□□ -0.89
CLN8-201ENST00000331222 ZNF764Q96H86 408 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
CLN8-201ENST00000331222 ACER3Q9NUN7 267 aa9.49□□□□□ -0.89
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