RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317623.8

PCNX4-201, Transcript of pecanex 4, humanhuman

APPRIS P3 TSL 5 BASIC

Gene PCNX4, Length 17,339 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX4-201ENST00000317623 BSGP35613 385 aa5.96□□□□□ -1.45
PCNX4-201ENST00000317623 IL24Q13007 206 aa5.96□□□□□ -1.45
PCNX4-201ENST00000317623 USP53Q70EK8 1073 aa5.96□□□□□ -1.45
PCNX4-201ENST00000317623 OR51E1Q8TCB6 317 aa5.96□□□□□ -1.45
PCNX4-201ENST00000317623 MOGAT1Q96PD6 335 aa5.96□□□□□ -1.45
PCNX4-201ENST00000317623 LRFN3Q9BTN0 628 aa5.96□□□□□ -1.45
PCNX4-201ENST00000317623 PECRQ9BY49 303 aa5.96□□□□□ -1.45
PCNX4-201ENST00000317623 B3GAT1Q9P2W7 334 aa5.96□□□□□ -1.45
PCNX4-201ENST00000317623 LIPGQ9Y5X9 500 aa5.96□□□□□ -1.45
PCNX4-201ENST00000317623 NMBP08949 121 aa5.96□□□□□ -1.46
PCNX4-201ENST00000317623 IL13RA2Q14627 380 aa5.96□□□□□ -1.46
PCNX4-201ENST00000317623 C1orf140Q5VVS0 124 aa5.96□□□□□ -1.46
PCNX4-201ENST00000317623 SLC17A4Q9Y2C5 497 aa5.96□□□□□ -1.46
PCNX4-201ENST00000317623 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
PCNX4-201ENST00000317623 C11orf94C9JXX5 98 aa5.96□□□□□ -1.46
PCNX4-201ENST00000317623 POU3F2P20265 443 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
PCNX4-201ENST00000317623 RPL27P61353 136 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
PCNX4-201ENST00000317623 PIK3IP1Q96FE7 263 aa5.96□□□□□ -1.46
PCNX4-201ENST00000317623 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
PCNX4-201ENST00000317623 S1PR5Q9H228 398 aa5.96□□□□□ -1.46
PCNX4-201ENST00000317623 NAA60Q9H7X0 242 aa5.96□□□□□ -1.46
PCNX4-201ENST00000317623 IL19Q9UHD0 177 aa5.96□□□□□ -1.46
PCNX4-201ENST00000317623 ZNF750Q32MQ0 723 aa5.96□□□□□ -1.46
PCNX4-201ENST00000317623 MS4A8Q9BY19 250 aa5.96□□□□□ -1.46
PCNX4-201ENST00000317623 CHST6Q9GZX3 395 aa5.96□□□□□ -1.46
PCNX4-201ENST00000317623 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa5.96□□□□□ -1.46
PCNX4-201ENST00000317623 KCNAB3O43448 404 aa5.96□□□□□ -1.46
PCNX4-201ENST00000317623 DUX1O43812 170 aa5.96□□□□□ -1.46
PCNX4-201ENST00000317623 ZFAND5O76080 213 aa5.96□□□□□ -1.46
PCNX4-201ENST00000317623 GYPAP02724 150 aa5.96□□□□□ -1.46
PCNX4-201ENST00000317623 SCGB1A1P11684 91 aa5.96□□□□□ -1.46
PCNX4-201ENST00000317623 ZNF345Q14585 488 aa5.96□□□□□ -1.46
PCNX4-201ENST00000317623 OR10G3Q8NGC4 313 aa5.96□□□□□ -1.46
PCNX4-201ENST00000317623 BCL2L2Q92843 193 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
PCNX4-201ENST00000317623 OR2A5Q96R48 311 aa5.96□□□□□ -1.46
PCNX4-201ENST00000317623 DDNO94850 711 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
PCNX4-201ENST00000317623 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
PCNX4-201ENST00000317623 MRPS2Q9Y399 296 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
PCNX4-201ENST00000317623 ZNF253O75346 499 aa5.96□□□□□ -1.46
PCNX4-201ENST00000317623 FAM87AP0C7U9 286 aa5.96□□□□□ -1.46
PCNX4-201ENST00000317623 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
PCNX4-201ENST00000317623 BPIFB3P59826 476 aa5.96□□□□□ -1.46
PCNX4-201ENST00000317623 INSL4Q14641 139 aa5.96□□□□□ -1.46
PCNX4-201ENST00000317623 OLIG3Q7RTU3 272 aa5.96□□□□□ -1.46
PCNX4-201ENST00000317623 MRGPRGQ86SM5 289 aa5.96□□□□□ -1.46
PCNX4-201ENST00000317623 MARCH3Q86UD3 253 aa5.96□□□□□ -1.46
PCNX4-201ENST00000317623 GOT1L1Q8NHS2 421 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
PCNX4-201ENST00000317623 TRMT61AQ96FX7 289 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
PCNX4-201ENST00000317623 SH2D2AQ9NP31 389 aa5.96□□□□□ -1.46
PCNX4-201ENST00000317623 CSNK1DP48730 415 aa5.96□□□□□ -1.46
PCNX4-201ENST00000317623 CLDN17P56750 224 aa5.96□□□□□ -1.46
PCNX4-201ENST00000317623 ZNF880Q6PDB4 577 aa5.96□□□□□ -1.46
PCNX4-201ENST00000317623 PLXDC1Q8IUK5 500 aa5.96□□□□□ -1.46
PCNX4-201ENST00000317623 PUSL1Q8N0Z8 303 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
PCNX4-201ENST00000317623 SDK2Q58EX2 2172 aa5.96□□□□□ -1.46
PCNX4-201ENST00000317623 TRBV11-1A0A0K0K1C0 115 aa5.96□□□□□ -1.46
PCNX4-201ENST00000317623 C4orf47A7E2U8 309 aa5.96□□□□□ -1.46
PCNX4-201ENST00000317623 WNT11O96014 354 aa5.96□□□□□ -1.46
PCNX4-201ENST00000317623 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
PCNX4-201ENST00000317623 TRMT12Q53H54 448 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
PCNX4-201ENST00000317623 MED25Q71SY5 747 aa5.96□□□□□ -1.46
PCNX4-201ENST00000317623 VN1R1Q9GZP7 353 aa5.96□□□□□ -1.46
PCNX4-201ENST00000317623 CBLN4Q9NTU7 201 aa5.96□□□□□ -1.46
PCNX4-201ENST00000317623 NACAE9PAV3 2078 aa5.96□□□□□ -1.46
PCNX4-201ENST00000317623 NCBP2LA6PVI3 153 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
PCNX4-201ENST00000317623 CTAG2O75638 210 aa5.96□□□□□ -1.46
PCNX4-201ENST00000317623 PGA4P0DJD7 388 aa5.96□□□□□ -1.46
PCNX4-201ENST00000317623 PGA5P0DJD9 388 aa5.96□□□□□ -1.46
PCNX4-201ENST00000317623 WDFY1Q8IWB7 410 aa5.96□□□□□ -1.46
PCNX4-201ENST00000317623 PRSS1P07477 247 aa5.96□□□□□ -1.46
PCNX4-201ENST00000317623 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP5.96□□□□□ -1.46
PCNX4-201ENST00000317623 NOSIPQ9Y314 301 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
PCNX4-201ENST00000317623 CLDN16Q9Y5I7 305 aa5.96□□□□□ -1.46
PCNX4-201ENST00000317623 A0A0A6YYC8 382 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
PCNX4-201ENST00000317623 I3L1I5 382 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
PCNX4-201ENST00000317623 TMEM25Q86YD3 366 aa5.95□□□□□ -1.46
PCNX4-201ENST00000317623 SIRT6Q8N6T7 355 aa5.95□□□□□ -1.46
PCNX4-201ENST00000317623 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa5.95□□□□□ -1.46
PCNX4-201ENST00000317623 HPP00738 406 aa5.95□□□□□ -1.46
PCNX4-201ENST00000317623 CA2P00918 260 aa5.95□□□□□ -1.46
PCNX4-201ENST00000317623 SMIM17P0DL12 118 aa5.95□□□□□ -1.46
PCNX4-201ENST00000317623 G6PCP35575 357 aa5.95□□□□□ -1.46
PCNX4-201ENST00000317623 BSXQ3C1V8 233 aa5.95□□□□□ -1.46
PCNX4-201ENST00000317623 SAMD13Q5VXD3 122 aa5.95□□□□□ -1.46
PCNX4-201ENST00000317623 TMEM64Q6YI46 380 aa5.95□□□□□ -1.46
PCNX4-201ENST00000317623 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
PCNX4-201ENST00000317623 SPACA5Q96QH8 159 aa5.95□□□□□ -1.46
PCNX4-201ENST00000317623 STRADBQ9C0K7 418 aa5.95□□□□□ -1.46
PCNX4-201ENST00000317623 TBX21Q9UL17 535 aa5.95□□□□□ -1.46
PCNX4-201ENST00000317623 TAS1R1Q7RTX1 841 aa5.95□□□□□ -1.46
PCNX4-201ENST00000317623 OR8A1Q8NGG7 326 aa5.95□□□□□ -1.46
PCNX4-201ENST00000317623 RPS4Y2Q8TD47 263 aa5.95□□□□□ -1.46
PCNX4-201ENST00000317623 EID2BQ96D98 161 aa5.95□□□□□ -1.46
PCNX4-201ENST00000317623 SLAMF6Q96DU3 332 aa5.95□□□□□ -1.46
PCNX4-201ENST00000317623 SNED1Q8TER0 1413 aa5.95□□□□□ -1.46
PCNX4-201ENST00000317623 A0A1W2PN81 502 aa5.95□□□□□ -1.46
PCNX4-201ENST00000317623 CORTO00230 105 aa5.95□□□□□ -1.46
PCNX4-201ENST00000317623 DYNLT3P51808 116 aa5.95□□□□□ -1.46
PCNX4-201ENST00000317623 C17orf67Q0P5P2 114 aa5.95□□□□□ -1.46
PCNX4-201ENST00000317623 FAM110CQ1W6H9 321 aa5.95□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.8 ms