RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293826.4

TNFSF12-TNFSF13-201, Transcript of TNFSF12-TNFSF13 readthrough, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TNFSF12-TNFSF13, Length 1,816 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 UCP2P55851 309 aa20.52■□□□□ 0.88
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 OR5AS1Q8N127 324 aa20.52■□□□□ 0.88
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SPSB4Q96A44 273 aa20.52■□□□□ 0.88
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CNTD2Q9H8S5 307 aa20.52■□□□□ 0.88
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 DIABLOQ9NR28 239 aa20.52■□□□□ 0.88
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CADP27708 2225 aa20.51■□□□□ 0.87
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CHD6Q8TD26 2715 aa20.51■□□□□ 0.87
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 LDLRAD4O15165 306 aa20.51■□□□□ 0.87
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 XRCC2O43543 280 aa20.51■□□□□ 0.87
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CTAG2O75638 210 aa20.51■□□□□ 0.87
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ALDOBP05062 364 aa20.51■□□□□ 0.87
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CD3GP09693 182 aa20.51■□□□□ 0.87
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 GSK3AP49840 483 aa20.51■□□□□ 0.87
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TAS2R20P59543 309 aa20.51■□□□□ 0.87
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 OR4D6Q8NGJ1 314 aa20.51■□□□□ 0.87
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ENKURQ8TC29 256 aa20.51■□□□□ 0.87
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 OR10A4Q9H209 315 aa20.51■□□□□ 0.87
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 EIF3KQ9UBQ5 218 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PIGLQ9Y2B2 252 aa20.51■□□□□ 0.87
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 GABARAPH6UMI1 98 aa20.5■□□□□ 0.87
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 RNF224P0DH78 156 aa20.5■□□□□ 0.87
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 KIR2DL3P43628 341 aa20.5■□□□□ 0.87
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TMEM255AQ5JRV8 349 aa20.5■□□□□ 0.87
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 OR1J1Q8NGS3 322 aa20.5■□□□□ 0.87
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PTX4Q96A99 478 aa20.5■□□□□ 0.87
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 OR2J1Q9GZK6 312 aa20.5■□□□□ 0.87
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 KCNK15Q9H427 330 aa20.5■□□□□ 0.87
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 DPRXA6NFQ7 191 aa20.5■□□□□ 0.87
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PPP1CBP62140 327 aa20.5■□□□□ 0.87
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PP6455Q8WZ26 134 aa20.5■□□□□ 0.87
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ZNF391Q9UJN7 358 aa20.5■□□□□ 0.87
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 DHRS7CA6NNS2 312 aa20.49■□□□□ 0.87
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ATP6V1G2-DDX39BF2Z307 99 aa20.49■□□□□ 0.87
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ICMTO60725 284 aa20.49■□□□□ 0.87
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ALX3O95076 343 aa20.49■□□□□ 0.87
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CLDN14O95500 239 aa20.49■□□□□ 0.87
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CD40P25942 277 aa20.49■□□□□ 0.87
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ZNF93P35789 620 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 UTS2BQ765I0 119 aa20.49■□□□□ 0.87
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 DUSP18Q8NEJ0 188 aa20.49■□□□□ 0.87
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SLC25A40Q8TBP6 338 aa20.49■□□□□ 0.87
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 FCAMRQ8WWV6 532 aa20.49■□□□□ 0.87
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP20.49■□□□□ 0.87
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PHF21AQ96BD5 680 aa20.49■□□□□ 0.87
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ATG5Q9H1Y0 275 aa20.49■□□□□ 0.87
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 FZR1Q9UM11 496 aa20.49■□□□□ 0.87
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 GGT3PA6NGU5 568 aa20.48■□□□□ 0.87
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 LILRA1O75019 489 aa20.48■□□□□ 0.87
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 RAB6AP20340 208 aa20.48■□□□□ 0.87
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 MALLQ13021 153 aa20.48■□□□□ 0.87
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 GPR176Q14439 515 aa20.48■□□□□ 0.87
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 KRT74Q7RTS7 529 aa20.48■□□□□ 0.87
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 MRPL21Q7Z2W9 205 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 RNF144BQ7Z419 303 aa20.48■□□□□ 0.87
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 BIVMQ86UB2 503 aa20.48■□□□□ 0.87
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TOMM5Q8N4H5 51 aa20.48■□□□□ 0.87
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SEMA6DQ8NFY4 1073 aa20.48■□□□□ 0.87
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 RGCCQ9H4X1 137 aa20.48■□□□□ 0.87
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 FAM240BA0A1B0GVZ2 78 aa20.48■□□□□ 0.87
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 BPNT1O95861 308 aa20.48■□□□□ 0.87
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 MSMPQ1L6U9 139 aa20.48■□□□□ 0.87
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 C3orf36Q3SXR2 165 aa20.48■□□□□ 0.87
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ZNF808Q8N4W9 903 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 BHLHE23Q8NDY6 225 aa20.48■□□□□ 0.87
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 OR56B2PQ8NGI1 322 aa20.48■□□□□ 0.87
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 OR52I2Q8NH67 350 aa20.48■□□□□ 0.87
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 MMP28Q9H239 520 aa20.48■□□□□ 0.87
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 AUNIPQ9H7T9 357 aa20.48■□□□□ 0.87
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 MOV10Q9HCE1 1003 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CACNG2Q9Y698 323 aa20.48■□□□□ 0.87
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 IGKV1-9A0A0C4DH69 117 aa20.47■□□□□ 0.87
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 MEIOCA2RUB1 952 aa20.47■□□□□ 0.87
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ORC5O43913 435 aa20.47■□□□□ 0.87
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CCNKO75909 580 aa20.47■□□□□ 0.87
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PRF1P14222 555 aa20.47■□□□□ 0.87
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 MPV17P39210 176 aa20.47■□□□□ 0.87
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SRP9P49458 86 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 BSPH1Q075Z2 132 aa20.47■□□□□ 0.87
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 OR8B8Q15620 311 aa20.47■□□□□ 0.87
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ALKBH6Q3KRA9 238 aa20.47■□□□□ 0.87
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 RADILQ96JH8 1075 aa20.47■□□□□ 0.87
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CHST5Q9GZS9 411 aa20.47■□□□□ 0.87
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 RAB22AQ9UL26 194 aa20.47■□□□□ 0.87
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CRYAAP02489 173 aa20.46■□□□□ 0.87
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 HCKP08631 526 aa20.46■□□□□ 0.87
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PPP3CBP16298 524 aa20.46■□□□□ 0.87
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 GDNFP39905 211 aa20.46■□□□□ 0.87
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 OR2T2Q6IF00 324 aa20.46■□□□□ 0.87
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PLET1Q6UQ28 207 aa20.46■□□□□ 0.87
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 DNM1P46Q6ZS02 220 aa20.46■□□□□ 0.87
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SSC4DQ8WTU2 575 aa20.46■□□□□ 0.87
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 A0A0A6YYH2 397 aa20.46■□□□□ 0.87
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 A6NJ64 397 aa20.46■□□□□ 0.87
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