RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262539.7

PTPN3-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPN3, Length 6,832 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN3-201ENST00000262539 J3QRE1 110 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 CTLA4P16410 223 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 VEGFCP49767 419 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 LIMK1P53667 647 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 CAMK2BQ13554 666 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 TMEM65Q6PI78 240 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 SFTPA2Q8IWL1 248 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 LAX1Q8IWV1 398 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 OR5D18Q8NGL1 313 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 APOBEC3DQ96AK3 386 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 CYB5R1Q9UHQ9 305 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 MEIOCA2RUB1 952 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 AKR7A3O95154 331 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 SLC2A10O95528 541 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 GLAP06280 429 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 GABRA1P14867 456 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 TAS2R30P59541 319 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 RPS16P62249 146 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 TMEM91Q6ZNR0 172 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 LGALS14Q8TCE9 139 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 HPSE2Q8WWQ2 592 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 ST8SIA4Q92187 359 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 NMES1Q9C002 83 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 SLC39A9Q9NUM3 307 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP7.31□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 M0R135 149 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 MED6O75586 246 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 GAS1P54826 345 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 CLDN6P56747 220 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 GK2Q14410 553 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 RTL8BQ17RB0 113 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 B3GLCTQ6Y288 498 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 FCRLAQ7L513 359 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 ZNF799Q96GE5 643 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 SAMD10Q9BYL1 202 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 SELENOIQ9C0D9 397 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 EMC7Q9NPA0 242 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 TAS2R5Q9NYW4 299 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 CACFD1Q9UGQ2 172 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 KIR2DS1A0A191URI9 304 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 A0A1B0GUH1 482 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 OIP5O43482 229 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 KLF7O75840 302 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 CCL4P13236 92 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 KIR2DS4P43632 304 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 KIR2DS1Q14954 304 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 SLC25A47Q6Q0C1 308 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 NRARPQ7Z6K4 114 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 C8orf44Q96CB5 159 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 RNF170Q96K19 258 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 MED20Q9H944 212 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 A0A096LPE4 126 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 A0A1W2PPZ6 126 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 F5H5P2 479 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 HRKO00198 91 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 QDPRP09417 244 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 GLRA1P23415 457 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 GDNFP39905 211 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 PMELP40967 661 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 EGR4Q05215 589 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 TNK1Q13470 666 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 PINX1Q96BK5 328 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 S1PR3Q99500 378 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 GDF2Q9UK05 429 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 SLC22A20A6NK97 555 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 HAX1O00165 279 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 SELENOFO60613 162 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 HOXB5P09067 269 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 TLE1Q04724 770 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 APOOLQ6UXV4 268 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 Q8IYB0 196 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 FOXB1Q99853 325 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 MARVELD1Q9BSK0 173 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 MSTNO14793 375 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 AGPAT2O15120 278 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 CXCL13O43927 109 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 MYF5P13349 255 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 ZNF93P35789 620 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 PLA2G2CQ5R387 149 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 MOB3BQ86TA1 216 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 PIGTQ969N2 578 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 PTDSS2Q9BVG9 487 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 MRPL13Q9BYD1 178 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 BCO1Q9HAY6 547 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 NLKQ9UBE8 527 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 ASH2LQ9UBL3 628 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 PRR33A8MZF0 331 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 HES3Q5TGS1 186 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 H3F3CQ6NXT2 135 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 MOB1BQ7L9L4 216 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 ZNF321PQ8N8H1 164 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 PGLYRP3Q96LB9 341 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 MTFP1Q9UDX5 166 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 CHCHD2Q9Y6H1 151 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 MYOFQ9NZM1 2061 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 C5orf49A4QMS7 147 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 CLEC2LP0C7M8 214 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 ATF1P18846 271 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 FABP6P51161 128 aa7.3□□□□□ -1.24
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