RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000621029.4

SEMA3B-215, Transcript of semaphorin 3B, humanhuman

TSL 5

Gene SEMA3B, Length 934 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3B-215ENST00000621029 TEX36Q5VZQ5 186 aa24.09■■□□□ 1.45
SEMA3B-215ENST00000621029 ZDHHC23Q8IYP9 409 aa24.09■■□□□ 1.45
SEMA3B-215ENST00000621029 ZNF679Q8IYX0 411 aa24.09■■□□□ 1.45
SEMA3B-215ENST00000621029 OR5P3Q8WZ94 311 aa24.09■■□□□ 1.45
SEMA3B-215ENST00000621029 ST8SIA4Q92187 359 aa24.09■■□□□ 1.45
SEMA3B-215ENST00000621029 DUS3LQ96G46 650 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
SEMA3B-215ENST00000621029 OR8B4Q96RC9 309 aa24.09■■□□□ 1.45
SEMA3B-215ENST00000621029 PBOV1Q9GZY1 135 aa24.09■■□□□ 1.45
SEMA3B-215ENST00000621029 FAM206AQ9NX38 181 aa24.09■■□□□ 1.45
SEMA3B-215ENST00000621029 DVL1O14640 695 aa24.08■■□□□ 1.45
SEMA3B-215ENST00000621029 TNFRSF13BO14836 293 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.45
SEMA3B-215ENST00000621029 MUC1P15941 1255 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.45
SEMA3B-215ENST00000621029 ROM1Q03395 351 aa24.08■■□□□ 1.45
SEMA3B-215ENST00000621029 NXNL2Q5VZ03 156 aa24.08■■□□□ 1.45
SEMA3B-215ENST00000621029 C12orf73Q69YU5 71 aa24.08■■□□□ 1.45
SEMA3B-215ENST00000621029 THAP5Q7Z6K1 395 aa24.08■■□□□ 1.45
SEMA3B-215ENST00000621029 SLC35F2Q8IXU6 374 aa24.08■■□□□ 1.45
SEMA3B-215ENST00000621029 RPL3LQ92901 407 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.45
SEMA3B-215ENST00000621029 FAM71F1Q96KD3 344 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.45
SEMA3B-215ENST00000621029 CCL13Q99616 98 aa24.08■■□□□ 1.45
SEMA3B-215ENST00000621029 CIB1Q99828 191 aa24.08■■□□□ 1.45
SEMA3B-215ENST00000621029 DNAJB11Q9UBS4 358 aa24.08■■□□□ 1.45
SEMA3B-215ENST00000621029 ZNF816-ZNF321PA0A0X1KG74 233 aa24.07■■□□□ 1.44
SEMA3B-215ENST00000621029 TMEM210A6NLX4 147 aa24.07■■□□□ 1.44
SEMA3B-215ENST00000621029 LIPFP07098 398 aa24.07■■□□□ 1.44
SEMA3B-215ENST00000621029 CXCR4P61073 352 aa24.07■■□□□ 1.44
SEMA3B-215ENST00000621029 GPR157Q5UAW9 335 aa24.07■■□□□ 1.44
SEMA3B-215ENST00000621029 AADACL4Q5VUY2 407 aa24.07■■□□□ 1.44
SEMA3B-215ENST00000621029 ZNF322Q6U7Q0 402 aaPredicted RBP24.07■■□□□ 1.44
SEMA3B-215ENST00000621029 PNLDC1Q8NA58 520 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
SEMA3B-215ENST00000621029 RIBC2Q9H4K1 309 aa24.07■■□□□ 1.44
SEMA3B-215ENST00000621029 A0A0U1RQV5 110 aa24.06■■□□□ 1.44
SEMA3B-215ENST00000621029 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa24.06■■□□□ 1.44
SEMA3B-215ENST00000621029 PRR32B1ATL7 298 aa24.06■■□□□ 1.44
SEMA3B-215ENST00000621029 ZNF670-ZNF695F2Z2N8 137 aa24.06■■□□□ 1.44
SEMA3B-215ENST00000621029 ACTR3P61158 418 aa24.06■■□□□ 1.44
SEMA3B-215ENST00000621029 WDR38Q5JTN6 314 aa24.06■■□□□ 1.44
SEMA3B-215ENST00000621029 BTN2A1Q7KYR7 527 aa24.06■■□□□ 1.44
SEMA3B-215ENST00000621029 GID4Q8IVV7 300 aa24.06■■□□□ 1.44
SEMA3B-215ENST00000621029 C3orf56Q8N813 242 aa24.06■■□□□ 1.44
SEMA3B-215ENST00000621029 OR51E1Q8TCB6 317 aa24.06■■□□□ 1.44
SEMA3B-215ENST00000621029 SEH1LQ96EE3 360 aa24.06■■□□□ 1.44
SEMA3B-215ENST00000621029 CENPNQ96H22 339 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
SEMA3B-215ENST00000621029 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
SEMA3B-215ENST00000621029 APOL4Q9BPW4 351 aa24.06■■□□□ 1.44
SEMA3B-215ENST00000621029 TLNRD1Q9H1K6 362 aa24.06■■□□□ 1.44
SEMA3B-215ENST00000621029 GPR84Q9NQS5 396 aa24.06■■□□□ 1.44
SEMA3B-215ENST00000621029 OAZ3Q9UMX2 235 aa24.06■■□□□ 1.44
SEMA3B-215ENST00000621029 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
SEMA3B-215ENST00000621029 TMEM89A2RUT3 159 aa24.05■■□□□ 1.44
SEMA3B-215ENST00000621029 SAC3D1A6NKF1 404 aa24.05■■□□□ 1.44
SEMA3B-215ENST00000621029 ZNF879B4DU55 563 aa24.05■■□□□ 1.44
SEMA3B-215ENST00000621029 TOX4O94842 621 aa24.05■■□□□ 1.44
SEMA3B-215ENST00000621029 PRTN3P24158 256 aa24.05■■□□□ 1.44
SEMA3B-215ENST00000621029 DCTDP32321 178 aa24.05■■□□□ 1.44
SEMA3B-215ENST00000621029 GPM6AP51674 278 aa24.05■■□□□ 1.44
SEMA3B-215ENST00000621029 BRD3OSQ6XYD6 125 aa24.05■■□□□ 1.44
SEMA3B-215ENST00000621029 SLC36A1Q7Z2H8 476 aa24.05■■□□□ 1.44
SEMA3B-215ENST00000621029 SCCPDHQ8NBX0 429 aa24.05■■□□□ 1.44
SEMA3B-215ENST00000621029 OR5T2Q8NGG2 359 aa24.05■■□□□ 1.44
SEMA3B-215ENST00000621029 MNTQ99583 582 aa24.05■■□□□ 1.44
SEMA3B-215ENST00000621029 ADGRL4Q9HBW9 690 aa24.05■■□□□ 1.44
SEMA3B-215ENST00000621029 KAAG1Q9UBP8 84 aa24.05■■□□□ 1.44
SEMA3B-215ENST00000621029 MAGEB4O15481 346 aaPredicted RBP24.04■■□□□ 1.44
SEMA3B-215ENST00000621029 PLATP00750 562 aa24.04■■□□□ 1.44
SEMA3B-215ENST00000621029 SFTPBP07988 381 aa24.04■■□□□ 1.44
SEMA3B-215ENST00000621029 CFHR2P36980 270 aa24.04■■□□□ 1.44
SEMA3B-215ENST00000621029 ELF3P78545 371 aaPredicted RBP24.04■■□□□ 1.44
SEMA3B-215ENST00000621029 EFNB1P98172 346 aa24.04■■□□□ 1.44
SEMA3B-215ENST00000621029 MFGE8Q08431 387 aaPredicted RBP24.04■■□□□ 1.44
SEMA3B-215ENST00000621029 RIPPLY1Q0D2K3 151 aa24.04■■□□□ 1.44
SEMA3B-215ENST00000621029 CEP78Q5JTW2 689 aa24.04■■□□□ 1.44
SEMA3B-215ENST00000621029 METTL11BQ5VVY1 283 aa24.04■■□□□ 1.44
SEMA3B-215ENST00000621029 OR51G2Q8NGK0 314 aa24.04■■□□□ 1.44
SEMA3B-215ENST00000621029 PPP1R14AQ96A00 147 aa24.04■■□□□ 1.44
SEMA3B-215ENST00000621029 SNTG1Q9NSN8 517 aa24.04■■□□□ 1.44
SEMA3B-215ENST00000621029 CLN6Q9NWW5 311 aa24.04■■□□□ 1.44
SEMA3B-215ENST00000621029 DOCK11Q5JSL3 2073 aa24.04■■□□□ 1.44
SEMA3B-215ENST00000621029 SRRM5B3KS81 715 aa24.03■■□□□ 1.44
SEMA3B-215ENST00000621029 LOC110117498-PIK3R3F6TDL0 507 aa24.03■■□□□ 1.44
SEMA3B-215ENST00000621029 ECDO95905 644 aaPredicted RBP24.03■■□□□ 1.44
SEMA3B-215ENST00000621029 POLR2IP36954 125 aaKnown RBP24.03■■□□□ 1.44
SEMA3B-215ENST00000621029 IKZF1Q13422 519 aa24.03■■□□□ 1.44
SEMA3B-215ENST00000621029 BCL2L15Q5TBC7 163 aa24.03■■□□□ 1.44
SEMA3B-215ENST00000621029 C9orf139Q6ZV77 190 aa24.03■■□□□ 1.44
SEMA3B-215ENST00000621029 MOB3CQ70IA8 216 aa24.03■■□□□ 1.44
SEMA3B-215ENST00000621029 FAM216BQ8N7L0 139 aa24.03■■□□□ 1.44
SEMA3B-215ENST00000621029 OR10Z1Q8NGY1 313 aa24.03■■□□□ 1.44
SEMA3B-215ENST00000621029 HPSE2Q8WWQ2 592 aa24.03■■□□□ 1.44
SEMA3B-215ENST00000621029 PYDC1Q8WXC3 89 aa24.03■■□□□ 1.44
SEMA3B-215ENST00000621029 ZDHHC16Q969W1 377 aa24.03■■□□□ 1.44
SEMA3B-215ENST00000621029 C12orf43Q96C57 262 aaKnown RBP24.03■■□□□ 1.44
SEMA3B-215ENST00000621029 TBX5Q99593 518 aa24.03■■□□□ 1.44
SEMA3B-215ENST00000621029 HAO2Q9NYQ3 351 aa24.03■■□□□ 1.44
SEMA3B-215ENST00000621029 NUFIP1Q9UHK0 495 aaKnown RBP24.03■■□□□ 1.44
SEMA3B-215ENST00000621029 PIGLQ9Y2B2 252 aa24.03■■□□□ 1.44
SEMA3B-215ENST00000621029 ANK2Q01484 3957 aa24.03■■□□□ 1.44
SEMA3B-215ENST00000621029 A0A1B0GW55 424 aa24.02■■□□□ 1.44
SEMA3B-215ENST00000621029 ZNF732B4DXR9 585 aa24.02■■□□□ 1.44
SEMA3B-215ENST00000621029 ANKHD1-EIF4EBP3H7C0V5 636 aaPredicted RBP24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.1 ms