RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616395.4

TRAPPC3-209, Transcript of trafficking protein particle complex 3, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene TRAPPC3, Length 1,336 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3-209ENST00000616395 ZFP41Q8N8Y5 198 aa14.88□□□□□ -0.03
TRAPPC3-209ENST00000616395 MCFD2Q8NI22 146 aa14.88□□□□□ -0.03
TRAPPC3-209ENST00000616395 MS4A3Q96HJ5 214 aa14.88□□□□□ -0.03
TRAPPC3-209ENST00000616395 WACQ9BTA9 647 aa14.88□□□□□ -0.03
TRAPPC3-209ENST00000616395 CENPOQ9BU64 300 aa14.88□□□□□ -0.03
TRAPPC3-209ENST00000616395 DUSP13Q9UII6 198 aa14.88□□□□□ -0.03
TRAPPC3-209ENST00000616395 SF3B6Q9Y3B4 125 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
TRAPPC3-209ENST00000616395 TMEM212A6NML5 194 aa14.87□□□□□ -0.03
TRAPPC3-209ENST00000616395 GABRPO00591 440 aa14.87□□□□□ -0.03
TRAPPC3-209ENST00000616395 DHHO43323 396 aa14.87□□□□□ -0.03
TRAPPC3-209ENST00000616395 APOC1P02654 83 aa14.87□□□□□ -0.03
TRAPPC3-209ENST00000616395 OR8G3PP0DMU2 310 aa14.87□□□□□ -0.03
TRAPPC3-209ENST00000616395 B4GALT1P15291 398 aa14.87□□□□□ -0.03
TRAPPC3-209ENST00000616395 GLRXP35754 106 aa14.87□□□□□ -0.03
TRAPPC3-209ENST00000616395 LCN2P80188 198 aa14.87□□□□□ -0.03
TRAPPC3-209ENST00000616395 ALKBH1Q13686 389 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
TRAPPC3-209ENST00000616395 MOGQ16653 247 aa14.87□□□□□ -0.03
TRAPPC3-209ENST00000616395 MEP1BQ16820 701 aa14.87□□□□□ -0.03
TRAPPC3-209ENST00000616395 PCK2Q16822 640 aa14.87□□□□□ -0.03
TRAPPC3-209ENST00000616395 ALKBH6Q3KRA9 238 aa14.87□□□□□ -0.03
TRAPPC3-209ENST00000616395 YIF1BQ5BJH7 314 aa14.87□□□□□ -0.03
TRAPPC3-209ENST00000616395 C22orf42Q6IC83 251 aa14.87□□□□□ -0.03
TRAPPC3-209ENST00000616395 SSX6Q7RTT6 188 aa14.87□□□□□ -0.03
TRAPPC3-209ENST00000616395 TPRA1Q86W33 373 aa14.87□□□□□ -0.03
TRAPPC3-209ENST00000616395 OR5AK2Q8NH90 309 aa14.87□□□□□ -0.03
TRAPPC3-209ENST00000616395 WFDC12Q8WWY7 111 aa14.87□□□□□ -0.03
TRAPPC3-209ENST00000616395 C11orf40Q8WZ69 217 aa14.87□□□□□ -0.03
TRAPPC3-209ENST00000616395 ABHD6Q9BV23 337 aa14.87□□□□□ -0.03
TRAPPC3-209ENST00000616395 TTTY10Q9BZA0 68 aa14.87□□□□□ -0.03
TRAPPC3-209ENST00000616395 HMG20AQ9NP66 347 aa14.87□□□□□ -0.03
TRAPPC3-209ENST00000616395 ACOXLQ9NUZ1 547 aa14.87□□□□□ -0.03
TRAPPC3-209ENST00000616395 NUP50Q9UKX7 468 aa14.87□□□□□ -0.03
TRAPPC3-209ENST00000616395 LALBAP00709 142 aa14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC3-209ENST00000616395 ZNF35P13682 527 aa14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC3-209ENST00000616395 DCTDP32321 178 aa14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC3-209ENST00000616395 RAD52P43351 418 aa14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC3-209ENST00000616395 CCR9P51686 369 aa14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC3-209ENST00000616395 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC3-209ENST00000616395 CCL8P80075 99 aa14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC3-209ENST00000616395 FABP5Q01469 135 aa14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC3-209ENST00000616395 SLC9A3R2Q15599 337 aa14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC3-209ENST00000616395 SGCAQ16586 387 aa14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC3-209ENST00000616395 LYPD4Q6UWN0 246 aa14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC3-209ENST00000616395 DCXRQ7Z4W1 244 aa14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC3-209ENST00000616395 ZNF676Q8N7Q3 588 aa14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC3-209ENST00000616395 ABHD4Q8TB40 342 aa14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC3-209ENST00000616395 GHSRQ92847 366 aa14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC3-209ENST00000616395 MRPL22Q9NWU5 206 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC3-209ENST00000616395 WIPI2Q9Y4P8 454 aa14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC3-209ENST00000616395 PEX16Q9Y5Y5 336 aa14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC3-209ENST00000616395 ZNF878C9JN71 531 aa14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC3-209ENST00000616395 CLDN34H7C241 214 aa14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC3-209ENST00000616395 RPP14O95059 124 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC3-209ENST00000616395 CDRT1O95170 752 aa14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC3-209ENST00000616395 FARS2O95363 451 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC3-209ENST00000616395 KNG1P01042 644 aa14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC3-209ENST00000616395 HLA-HP01893 362 aa14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC3-209ENST00000616395 HSD11B1P28845 292 aa14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC3-209ENST00000616395 MTNR1BP49286 362 aa14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC3-209ENST00000616395 KLF17Q5JT82 389 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC3-209ENST00000616395 ZNF684Q5T5D7 378 aa14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC3-209ENST00000616395 FDX2Q6P4F2 183 aa14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC3-209ENST00000616395 ZNF813Q6ZN06 617 aa14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC3-209ENST00000616395 CEACAM19Q7Z692 300 aa14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC3-209ENST00000616395 GJC3Q8NFK1 279 aa14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC3-209ENST00000616395 CEP19Q96LK0 163 aa14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC3-209ENST00000616395 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC3-209ENST00000616395 MOB1AQ9H8S9 216 aa14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC3-209ENST00000616395 ELOVL3Q9HB03 270 aa14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC3-209ENST00000616395 POLE4Q9NR33 117 aa14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC3-209ENST00000616395 B3GNT2Q9NY97 397 aa14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC3-209ENST00000616395 PLEK2Q9NYT0 353 aa14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC3-209ENST00000616395 MRM2Q9UI43 246 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC3-209ENST00000616395 MMP24Q9Y5R2 645 aa14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC3-209ENST00000616395 M0QZ24 198 aa14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC3-209ENST00000616395 PDCD5O14737 125 aa14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC3-209ENST00000616395 RANBP1P43487 201 aa14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC3-209ENST00000616395 PCBD1P61457 104 aa14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC3-209ENST00000616395 GRB2P62993 217 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC3-209ENST00000616395 MRPS34P82930 218 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC3-209ENST00000616395 ACSM3Q53FZ2 586 aa14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC3-209ENST00000616395 MZT2AQ6P582 158 aa14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC3-209ENST00000616395 C17orf107Q6ZR85 190 aa14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC3-209ENST00000616395 SPATC1Q76KD6 591 aa14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC3-209ENST00000616395 CCDC36Q8IYA8 594 aa14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC3-209ENST00000616395 SP140LQ9H930 580 aa14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC3-209ENST00000616395 SNTG1Q9NSN8 517 aa14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC3-209ENST00000616395 CENPMQ9NSP4 180 aa14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC3-209ENST00000616395 SLCO1C1Q9NYB5 712 aa14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC3-209ENST00000616395 CYB5R1Q9UHQ9 305 aa14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC3-209ENST00000616395 GTF2A1LQ9UNN4 478 aa14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC3-209ENST00000616395 E9PI62 339 aa14.83□□□□□ -0.04
TRAPPC3-209ENST00000616395 LOC110117498-PIK3R3F6TDL0 507 aa14.83□□□□□ -0.04
TRAPPC3-209ENST00000616395 TMEM127O75204 238 aa14.83□□□□□ -0.04
TRAPPC3-209ENST00000616395 CD2P06729 351 aa14.83□□□□□ -0.04
TRAPPC3-209ENST00000616395 PATE4P0C8F1 98 aa14.83□□□□□ -0.04
TRAPPC3-209ENST00000616395 CD79AP11912 226 aa14.83□□□□□ -0.04
TRAPPC3-209ENST00000616395 ZNF14P17017 642 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
TRAPPC3-209ENST00000616395 PSMB10P40306 273 aa14.83□□□□□ -0.04
TRAPPC3-209ENST00000616395 ZNF846Q147U1 533 aa14.83□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.4 ms