RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602319.1

HCG18-242, Transcript of HLA complex group 18, humanhuman

BASIC

Gene HCG18, Length 3,342 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCG18-242ENST00000602319 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
HCG18-242ENST00000602319 TLCD2A6NGC4 264 aa8.72□□□□□ -1.01
HCG18-242ENST00000602319 C11orf98E9PRG8 122 aa8.72□□□□□ -1.01
HCG18-242ENST00000602319 HSD17B6O14756 317 aa8.72□□□□□ -1.01
HCG18-242ENST00000602319 TNFRSF10CO14798 259 aa8.72□□□□□ -1.01
HCG18-242ENST00000602319 HIST1H2BKO60814 126 aa8.72□□□□□ -1.01
HCG18-242ENST00000602319 HIST1H2BJP06899 126 aa8.72□□□□□ -1.01
HCG18-242ENST00000602319 BCKDHBP21953 392 aa8.72□□□□□ -1.01
HCG18-242ENST00000602319 HIST1H2BOP23527 126 aa8.72□□□□□ -1.01
HCG18-242ENST00000602319 HIST1H2BBP33778 126 aa8.72□□□□□ -1.01
HCG18-242ENST00000602319 HSD17B7P56937 341 aa8.72□□□□□ -1.01
HCG18-242ENST00000602319 HIST1H2BDP58876 126 aa8.72□□□□□ -1.01
HCG18-242ENST00000602319 HIST1H2BCP62807 126 aa8.72□□□□□ -1.01
HCG18-242ENST00000602319 HIST2H2BEQ16778 126 aa8.72□□□□□ -1.01
HCG18-242ENST00000602319 IAH1Q2TAA2 248 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
HCG18-242ENST00000602319 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
HCG18-242ENST00000602319 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
HCG18-242ENST00000602319 GPBAR1Q8TDU6 330 aa8.72□□□□□ -1.01
HCG18-242ENST00000602319 HIST1H2BHQ93079 126 aa8.72□□□□□ -1.01
HCG18-242ENST00000602319 HIST1H2BNQ99877 126 aa8.72□□□□□ -1.01
HCG18-242ENST00000602319 HIST1H2BMQ99879 126 aa8.72□□□□□ -1.01
HCG18-242ENST00000602319 CCDC3Q9BQI4 270 aa8.72□□□□□ -1.01
HCG18-242ENST00000602319 C20orf24Q9BUV8 137 aa8.72□□□□□ -1.01
HCG18-242ENST00000602319 TM2D1Q9BX74 207 aa8.72□□□□□ -1.01
HCG18-242ENST00000602319 FOXQ1Q9C009 403 aa8.72□□□□□ -1.01
HCG18-242ENST00000602319 MRPS28Q9Y2Q9 187 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
HCG18-242ENST00000602319 A0A1B0GV90 55 aa8.72□□□□□ -1.01
HCG18-242ENST00000602319 RNF224P0DH78 156 aa8.72□□□□□ -1.01
HCG18-242ENST00000602319 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
HCG18-242ENST00000602319 POLR2HP52434 150 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
HCG18-242ENST00000602319 AKIRIN2Q53H80 203 aa8.72□□□□□ -1.01
HCG18-242ENST00000602319 GGNBP1Q5YKI7 109 aa8.72□□□□□ -1.01
HCG18-242ENST00000602319 GLIPR1L1Q6UWM5 242 aa8.72□□□□□ -1.01
HCG18-242ENST00000602319 Q8WTZ3 238 aa8.72□□□□□ -1.01
HCG18-242ENST00000602319 CYYR1Q96J86 154 aa8.72□□□□□ -1.01
HCG18-242ENST00000602319 NEU1Q99519 415 aa8.72□□□□□ -1.01
HCG18-242ENST00000602319 FAM60AQ9NP50 221 aa8.72□□□□□ -1.01
HCG18-242ENST00000602319 C10orf142B7Z368 130 aa8.72□□□□□ -1.01
HCG18-242ENST00000602319 FKTNO75072 461 aa8.72□□□□□ -1.01
HCG18-242ENST00000602319 CXCL1P09341 107 aa8.72□□□□□ -1.01
HCG18-242ENST00000602319 PI3P19957 117 aa8.72□□□□□ -1.01
HCG18-242ENST00000602319 SPCS3P61009 180 aa8.72□□□□□ -1.01
HCG18-242ENST00000602319 LSM6P62312 80 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
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HCG18-242ENST00000602319 DNM1P34Q6PK57 102 aa8.72□□□□□ -1.01
HCG18-242ENST00000602319 SPNS3Q6ZMD2 512 aa8.72□□□□□ -1.01
HCG18-242ENST00000602319 COX15Q7KZN9 410 aa8.72□□□□□ -1.01
HCG18-242ENST00000602319 OR10G6Q8NH81 332 aa8.72□□□□□ -1.01
HCG18-242ENST00000602319 FNDC9Q8TBE3 224 aa8.72□□□□□ -1.01
HCG18-242ENST00000602319 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa8.72□□□□□ -1.01
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HCG18-242ENST00000602319 KCNJ16Q9NPI9 418 aa8.72□□□□□ -1.01
HCG18-242ENST00000602319 HSF4Q9ULV5 492 aa8.72□□□□□ -1.01
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HCG18-242ENST00000602319 H7C1Q1 480 aa8.71□□□□□ -1.01
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HCG18-242ENST00000602319 ZNF17P17021 662 aa8.71□□□□□ -1.01
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HCG18-242ENST00000602319 HOXA6P31267 233 aa8.71□□□□□ -1.01
HCG18-242ENST00000602319 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.01
HCG18-242ENST00000602319 MS4A18Q3C1V0 323 aa8.71□□□□□ -1.01
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HCG18-242ENST00000602319 SPTBP11277 2137 aa8.71□□□□□ -1.02
HCG18-242ENST00000602319 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa8.71□□□□□ -1.02
HCG18-242ENST00000602319 IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 117 aa8.71□□□□□ -1.02
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HCG18-242ENST00000602319 MSTNO14793 375 aa8.71□□□□□ -1.02
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HCG18-242ENST00000602319 IGKV3-11P04433 115 aa8.71□□□□□ -1.02
HCG18-242ENST00000602319 HPNP05981 417 aa8.71□□□□□ -1.02
HCG18-242ENST00000602319 SOD3P08294 240 aa8.71□□□□□ -1.02
HCG18-242ENST00000602319 AMY2BP19961 511 aa8.71□□□□□ -1.02
HCG18-242ENST00000602319 GJA4P35212 333 aa8.71□□□□□ -1.02
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HCG18-242ENST00000602319 CAMLGP49069 296 aa8.71□□□□□ -1.02
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HCG18-242ENST00000602319 ACY1Q03154 408 aa8.71□□□□□ -1.02
HCG18-242ENST00000602319 IL13RA2Q14627 380 aa8.71□□□□□ -1.02
HCG18-242ENST00000602319 SLC16A14Q7RTX9 510 aa8.71□□□□□ -1.02
HCG18-242ENST00000602319 OR5L2Q8NGL0 311 aa8.71□□□□□ -1.02
HCG18-242ENST00000602319 TMEM59Q9BXS4 323 aa8.71□□□□□ -1.02
HCG18-242ENST00000602319 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
HCG18-242ENST00000602319 TP53TG5Q9Y2B4 290 aa8.71□□□□□ -1.02
HCG18-242ENST00000602319 TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 188 aa8.7□□□□□ -1.02
HCG18-242ENST00000602319 SRP19P09132 144 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
HCG18-242ENST00000602319 H2BFMP0C1H6 154 aa8.7□□□□□ -1.02
HCG18-242ENST00000602319 RAB4BP61018 213 aa8.7□□□□□ -1.02
HCG18-242ENST00000602319 SQSTM1Q13501 440 aa8.7□□□□□ -1.02
HCG18-242ENST00000602319 TMEM187Q14656 261 aa8.7□□□□□ -1.02
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