RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000598256.1

LTBP4-222, Transcript of latent transforming growth factor beta binding protein 4, human

TSL 2

Gene LTBP4, Length 752 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LTBP4-222	ENST00000598256	C22orf42	Q6IC83	251 aa		13.58	□□□□□ -0.24
LTBP4-222	ENST00000598256	TMEM91	Q6ZNR0	172 aa		13.58	□□□□□ -0.24
LTBP4-222	ENST00000598256	MOB3C	Q70IA8	216 aa		13.58	□□□□□ -0.24
LTBP4-222	ENST00000598256	ZDHHC23	Q8IYP9	409 aa		13.58	□□□□□ -0.24
LTBP4-222	ENST00000598256	OR5D14	Q8NGL3	314 aa		13.58	□□□□□ -0.24
LTBP4-222	ENST00000598256	OR13C9	Q8NGT0	318 aa		13.58	□□□□□ -0.24
LTBP4-222	ENST00000598256	OR8S1	Q8NH09	359 aa		13.58	□□□□□ -0.24
LTBP4-222	ENST00000598256	UBASH3B	Q8TF42	649 aa		13.58	□□□□□ -0.24
LTBP4-222	ENST00000598256	PHYHIP	Q92561	330 aa		13.58	□□□□□ -0.24
LTBP4-222	ENST00000598256	ORAI1	Q96D31	301 aa		13.58	□□□□□ -0.24
LTBP4-222	ENST00000598256	SLC30A2	Q9BRI3	323 aa		13.58	□□□□□ -0.24
LTBP4-222	ENST00000598256	SLC22A4	Q9H015	551 aa		13.58	□□□□□ -0.24
LTBP4-222	ENST00000598256	TMEM100	Q9NV29	134 aa		13.58	□□□□□ -0.24
LTBP4-222	ENST00000598256	GSTK1	Q9Y2Q3	226 aa		13.58	□□□□□ -0.24
LTBP4-222	ENST00000598256	NOP16	Q9Y3C1	178 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
LTBP4-222	ENST00000598256	MPC1	Q9Y5U8	109 aa		13.58	□□□□□ -0.24
LTBP4-222	ENST00000598256	TRBV5-7	A0A0A0MS05	114 aa		13.57	□□□□□ -0.24
LTBP4-222	ENST00000598256	KIR2DP1	A0A0G2JNF4	349 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
LTBP4-222	ENST00000598256	ZSCAN5B	A6NJL1	495 aa		13.57	□□□□□ -0.24
LTBP4-222	ENST00000598256	NOL3	O60936	208 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
LTBP4-222	ENST00000598256	GPX5	O75715	221 aa		13.57	□□□□□ -0.24
LTBP4-222	ENST00000598256	RAF1	P04049	648 aa		13.57	□□□□□ -0.24
LTBP4-222	ENST00000598256	DANCR	P0C864	163 aa		13.57	□□□□□ -0.24
LTBP4-222	ENST00000598256	NAT2	P11245	290 aa		13.57	□□□□□ -0.24
LTBP4-222	ENST00000598256	FST	P19883	344 aa		13.57	□□□□□ -0.24
LTBP4-222	ENST00000598256	CRYBB2	P43320	205 aa		13.57	□□□□□ -0.24
LTBP4-222	ENST00000598256	MMP15	P51511	669 aa		13.57	□□□□□ -0.24
LTBP4-222	ENST00000598256	TMEM42	Q69YG0	159 aa		13.57	□□□□□ -0.24
LTBP4-222	ENST00000598256	UNQ9370/PRO34162	Q6UXP9	181 aa		13.57	□□□□□ -0.24
LTBP4-222	ENST00000598256	C20orf204	Q6ZNR8	217 aa		13.57	□□□□□ -0.24
LTBP4-222	ENST00000598256		Q6ZR03	302 aa		13.57	□□□□□ -0.24
LTBP4-222	ENST00000598256	DTX2	Q86UW9	622 aa		13.57	□□□□□ -0.24
LTBP4-222	ENST00000598256	CLVS1	Q8IUQ0	354 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
LTBP4-222	ENST00000598256	OR10AD1	Q8NGE0	317 aa		13.57	□□□□□ -0.24
LTBP4-222	ENST00000598256	OR13G1	Q8NGZ3	307 aa		13.57	□□□□□ -0.24
LTBP4-222	ENST00000598256	NPRL2	Q8WTW4	380 aa		13.57	□□□□□ -0.24
LTBP4-222	ENST00000598256	GTF3A	Q92664	365 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
LTBP4-222	ENST00000598256	RPL3L	Q92901	407 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
LTBP4-222	ENST00000598256	TRMT61A	Q96FX7	289 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
LTBP4-222	ENST00000598256	TECTB	Q96PL2	329 aa		13.57	□□□□□ -0.24
LTBP4-222	ENST00000598256	HIST1H2AA	Q96QV6	131 aa		13.57	□□□□□ -0.24
LTBP4-222	ENST00000598256	SLITRK2	Q9H156	845 aa		13.57	□□□□□ -0.24
LTBP4-222	ENST00000598256	ZCCHC4	Q9H5U6	513 aa		13.57	□□□□□ -0.24
LTBP4-222	ENST00000598256	PLEKHF2	Q9H8W4	249 aa		13.57	□□□□□ -0.24
LTBP4-222	ENST00000598256	TCF7L1	Q9HCS4	588 aa		13.57	□□□□□ -0.24
LTBP4-222	ENST00000598256	ABCB9	Q9NP78	766 aa		13.57	□□□□□ -0.24
LTBP4-222	ENST00000598256	TXNL4B	Q9NX01	149 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
LTBP4-222	ENST00000598256	LAMP3	Q9UQV4	416 aa		13.57	□□□□□ -0.24
LTBP4-222	ENST00000598256	ABCA4	P78363	2273 aa		13.57	□□□□□ -0.24
LTBP4-222	ENST00000598256	MTOR	P42345	2549 aa		13.57	□□□□□ -0.24
LTBP4-222	ENST00000598256	PIN1P1	O15428	100 aa		13.56	□□□□□ -0.24
LTBP4-222	ENST00000598256	SPRY3	O43610	288 aa		13.56	□□□□□ -0.24
LTBP4-222	ENST00000598256	SULT1B1	O43704	296 aa		13.56	□□□□□ -0.24
LTBP4-222	ENST00000598256	GMDS	O60547	372 aa		13.56	□□□□□ -0.24
LTBP4-222	ENST00000598256	SOD3	P08294	240 aa		13.56	□□□□□ -0.24
LTBP4-222	ENST00000598256	UCHL1	P09936	223 aa		13.56	□□□□□ -0.24
LTBP4-222	ENST00000598256	BMP4	P12644	408 aa		13.56	□□□□□ -0.24
LTBP4-222	ENST00000598256	RAB3A	P20336	220 aa		13.56	□□□□□ -0.24
LTBP4-222	ENST00000598256	MYL9	P24844	172 aa		13.56	□□□□□ -0.24
LTBP4-222	ENST00000598256	CALR	P27797	417 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
LTBP4-222	ENST00000598256	FGF9	P31371	208 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
LTBP4-222	ENST00000598256	LSM3	P62310	102 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
LTBP4-222	ENST00000598256	SWI5	Q1ZZU3	235 aa		13.56	□□□□□ -0.24
LTBP4-222	ENST00000598256	MST1L	Q2TV78	715 aa		13.56	□□□□□ -0.24
LTBP4-222	ENST00000598256	DMRTC1	Q5HYR2	192 aa		13.56	□□□□□ -0.24
LTBP4-222	ENST00000598256	GDPGP1	Q6ZNW5	385 aa		13.56	□□□□□ -0.24
LTBP4-222	ENST00000598256	UTS2B	Q765I0	119 aa		13.56	□□□□□ -0.24
LTBP4-222	ENST00000598256	ANKRD13B	Q86YJ7	626 aa		13.56	□□□□□ -0.24
LTBP4-222	ENST00000598256	OR2Z1	Q8NG97	314 aa		13.56	□□□□□ -0.24
LTBP4-222	ENST00000598256	TRMT10A	Q8TBZ6	339 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
LTBP4-222	ENST00000598256	ELMOD3	Q96FG2	381 aa		13.56	□□□□□ -0.24
LTBP4-222	ENST00000598256	TRAF4	Q9BUZ4	470 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
LTBP4-222	ENST00000598256	MS4A5	Q9H3V2	200 aa		13.56	□□□□□ -0.24
LTBP4-222	ENST00000598256	PPP1R3E	Q9H7J1	279 aa		13.56	□□□□□ -0.24
LTBP4-222	ENST00000598256	NEK6	Q9HC98	313 aa		13.56	□□□□□ -0.24
LTBP4-222	ENST00000598256	NKIRAS2	Q9NYR9	191 aa		13.56	□□□□□ -0.24
LTBP4-222	ENST00000598256	FBXO9	Q9UK97	447 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
LTBP4-222	ENST00000598256	ZDHHC8	Q9ULC8	765 aa		13.56	□□□□□ -0.24
LTBP4-222	ENST00000598256	TRAV8-7	A0A075B6U6	113 aa		13.55	□□□□□ -0.24
LTBP4-222	ENST00000598256	CCDC160	A6NGH7	325 aa		13.55	□□□□□ -0.24
LTBP4-222	ENST00000598256	C17orf100	A8MU93	164 aa		13.55	□□□□□ -0.24
LTBP4-222	ENST00000598256		H0YL77	283 aa		13.55	□□□□□ -0.24
LTBP4-222	ENST00000598256	MLNR	O43193	412 aa		13.55	□□□□□ -0.24
LTBP4-222	ENST00000598256	GABARAP	O95166	117 aa		13.55	□□□□□ -0.24
LTBP4-222	ENST00000598256	HCK	P08631	526 aa		13.55	□□□□□ -0.24
LTBP4-222	ENST00000598256	ATF1	P18846	271 aa		13.55	□□□□□ -0.24
LTBP4-222	ENST00000598256	TNFSF4	P23510	183 aa		13.55	□□□□□ -0.24
LTBP4-222	ENST00000598256	AZGP1	P25311	298 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
LTBP4-222	ENST00000598256	PPOX	P50336	477 aa		13.55	□□□□□ -0.24
LTBP4-222	ENST00000598256	UBE2V2	Q15819	145 aa		13.55	□□□□□ -0.24
LTBP4-222	ENST00000598256	C11orf71	Q6IPW1	123 aa		13.55	□□□□□ -0.24
LTBP4-222	ENST00000598256	OR1M1	Q8NGA1	313 aa		13.55	□□□□□ -0.24
LTBP4-222	ENST00000598256	DIRC2	Q96SL1	478 aa		13.55	□□□□□ -0.24
LTBP4-222	ENST00000598256	MICU1	Q9BPX6	476 aa		13.55	□□□□□ -0.24
LTBP4-222	ENST00000598256	CENPO	Q9BU64	300 aa		13.55	□□□□□ -0.24
LTBP4-222	ENST00000598256	RTL8A	Q9BWD3	113 aa		13.55	□□□□□ -0.24
LTBP4-222	ENST00000598256	NAA50	Q9GZZ1	169 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
LTBP4-222	ENST00000598256	TPK1	Q9H3S4	243 aa		13.55	□□□□□ -0.24
LTBP4-222	ENST00000598256	FOXJ3	Q9UPW0	622 aa		13.55	□□□□□ -0.24
LTBP4-222	ENST00000598256	SLC7A11	Q9UPY5	501 aa		13.55	□□□□□ -0.24

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62.4 ms