RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588815.5

CAPNS1-206, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,471 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-206ENST00000588815 LHFPL2Q6ZUX7 228 aa26.65■■□□□ 1.86
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF843Q8N446 348 aa26.65■■□□□ 1.86
CAPNS1-206ENST00000588815 LGALS14Q8TCE9 139 aa26.65■■□□□ 1.86
CAPNS1-206ENST00000588815 PAPOLGQ9BWT3 736 aaKnown RBP26.65■■□□□ 1.86
CAPNS1-206ENST00000588815 HPGDSO60760 199 aa26.64■■□□□ 1.86
CAPNS1-206ENST00000588815 CLDN14O95500 239 aa26.64■■□□□ 1.86
CAPNS1-206ENST00000588815 APOA1P02647 267 aa26.64■■□□□ 1.86
CAPNS1-206ENST00000588815 BMP4P12644 408 aa26.64■■□□□ 1.86
CAPNS1-206ENST00000588815 GCH1P30793 250 aa26.64■■□□□ 1.86
CAPNS1-206ENST00000588815 FUT6P51993 359 aa26.64■■□□□ 1.86
CAPNS1-206ENST00000588815 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP26.64■■□□□ 1.86
CAPNS1-206ENST00000588815 KISS1Q15726 138 aa26.64■■□□□ 1.86
CAPNS1-206ENST00000588815 SAMD12Q8N8I0 201 aa26.64■■□□□ 1.86
CAPNS1-206ENST00000588815 SLC25A28Q96A46 364 aa26.64■■□□□ 1.86
CAPNS1-206ENST00000588815 FAM3DQ96BQ1 224 aa26.64■■□□□ 1.86
CAPNS1-206ENST00000588815 ZC3HAV1LQ96H79 300 aaKnown RBP26.64■■□□□ 1.86
CAPNS1-206ENST00000588815 KITLGP21583 273 aa26.63■■□□□ 1.85
CAPNS1-206ENST00000588815 ERVS71-1P61550 626 aa26.63■■□□□ 1.85
CAPNS1-206ENST00000588815 SNTB2Q13425 540 aaKnown RBP26.63■■□□□ 1.85
CAPNS1-206ENST00000588815 UBE2NLQ5JXB2 153 aa26.63■■□□□ 1.85
CAPNS1-206ENST00000588815 OR2T2Q6IF00 324 aa26.63■■□□□ 1.85
CAPNS1-206ENST00000588815 RGS7BPQ6MZT1 257 aaPredicted RBP26.63■■□□□ 1.85
CAPNS1-206ENST00000588815 METAP1DQ6UB28 335 aaPredicted RBP26.63■■□□□ 1.85
CAPNS1-206ENST00000588815 ZDHHC23Q8IYP9 409 aa26.63■■□□□ 1.85
CAPNS1-206ENST00000588815 BORCS8Q96FH0 119 aa26.63■■□□□ 1.85
CAPNS1-206ENST00000588815 GPER1Q99527 375 aa26.63■■□□□ 1.85
CAPNS1-206ENST00000588815 CNTD2Q9H8S5 307 aa26.63■■□□□ 1.85
CAPNS1-206ENST00000588815 OR5V1Q9UGF6 321 aa26.63■■□□□ 1.85
CAPNS1-206ENST00000588815 RBP2P50120 134 aa26.62■■□□□ 1.85
CAPNS1-206ENST00000588815 CLDN12P56749 244 aa26.62■■□□□ 1.85
CAPNS1-206ENST00000588815 TFF3Q07654 80 aa26.62■■□□□ 1.85
CAPNS1-206ENST00000588815 PRDX4Q13162 271 aa26.62■■□□□ 1.85
CAPNS1-206ENST00000588815 PLCXD3Q63HM9 321 aa26.62■■□□□ 1.85
CAPNS1-206ENST00000588815 MOB3CQ70IA8 216 aa26.62■■□□□ 1.85
CAPNS1-206ENST00000588815 MFSD4AQ8N468 514 aa26.62■■□□□ 1.85
CAPNS1-206ENST00000588815 NUP37Q8NFH4 326 aa26.62■■□□□ 1.85
CAPNS1-206ENST00000588815 DIRAS2Q96HU8 199 aa26.62■■□□□ 1.85
CAPNS1-206ENST00000588815 GHRLQ9UBU3 117 aa26.62■■□□□ 1.85
CAPNS1-206ENST00000588815 NOP16Q9Y3C1 178 aaKnown RBP26.62■■□□□ 1.85
CAPNS1-206ENST00000588815 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa26.62■■□□□ 1.85
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF850A8MQ14 1090 aa26.62■■□□□ 1.85
CAPNS1-206ENST00000588815 ARSBP15848 533 aa26.62■■□□□ 1.85
CAPNS1-206ENST00000588815 PEX19P40855 299 aa26.62■■□□□ 1.85
CAPNS1-206ENST00000588815 EVX1P49640 407 aa26.62■■□□□ 1.85
CAPNS1-206ENST00000588815 PSG7Q13046 419 aa26.62■■□□□ 1.85
CAPNS1-206ENST00000588815 OR5H6Q8NGV6 325 aa26.62■■□□□ 1.85
CAPNS1-206ENST00000588815 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP26.62■■□□□ 1.85
CAPNS1-206ENST00000588815 ESRP2Q9H6T0 727 aaKnown RBP26.62■■□□□ 1.85
CAPNS1-206ENST00000588815 A0A0B4J203 849 aa26.61■■□□□ 1.85
CAPNS1-206ENST00000588815 BPNT1O95861 308 aa26.61■■□□□ 1.85
CAPNS1-206ENST00000588815 UBBP0CG47 229 aa26.61■■□□□ 1.85
CAPNS1-206ENST00000588815 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP26.61■■□□□ 1.85
CAPNS1-206ENST00000588815 ALDH3B1P43353 468 aa26.61■■□□□ 1.85
CAPNS1-206ENST00000588815 POU3F4P49335 361 aa26.61■■□□□ 1.85
CAPNS1-206ENST00000588815 ATP1B3P54709 279 aa26.61■■□□□ 1.85
CAPNS1-206ENST00000588815 CDSNQ15517 529 aa26.61■■□□□ 1.85
CAPNS1-206ENST00000588815 CEACAM21Q3KPI0 293 aa26.61■■□□□ 1.85
CAPNS1-206ENST00000588815 OR51D1Q8NGF3 324 aa26.61■■□□□ 1.85
CAPNS1-206ENST00000588815 OR4D6Q8NGJ1 314 aa26.61■■□□□ 1.85
CAPNS1-206ENST00000588815 RAB40AQ8WXH6 277 aa26.61■■□□□ 1.85
CAPNS1-206ENST00000588815 PTX4Q96A99 478 aa26.61■■□□□ 1.85
CAPNS1-206ENST00000588815 HIST1H2AAQ96QV6 131 aa26.61■■□□□ 1.85
CAPNS1-206ENST00000588815 SLC22A4Q9H015 551 aa26.61■■□□□ 1.85
CAPNS1-206ENST00000588815 CYSLTR2Q9NS75 346 aa26.61■■□□□ 1.85
CAPNS1-206ENST00000588815 DPRXA6NFQ7 191 aa26.6■■□□□ 1.85
CAPNS1-206ENST00000588815 PRB1P04280 392 aa26.6■■□□□ 1.85
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF250P15622 560 aa26.6■■□□□ 1.85
CAPNS1-206ENST00000588815 CD40LGP29965 261 aa26.6■■□□□ 1.85
CAPNS1-206ENST00000588815 TALDO1P37837 337 aa26.6■■□□□ 1.85
CAPNS1-206ENST00000588815 MTCP1P56278 107 aa26.6■■□□□ 1.85
CAPNS1-206ENST00000588815 C2orf76Q3KRA6 126 aa26.6■■□□□ 1.85
CAPNS1-206ENST00000588815 OR5A2Q8NGI9 324 aa26.6■■□□□ 1.85
CAPNS1-206ENST00000588815 ZFAND2BQ8WV99 257 aa26.6■■□□□ 1.85
CAPNS1-206ENST00000588815 ABCG5Q9H222 651 aa26.6■■□□□ 1.85
CAPNS1-206ENST00000588815 RABL2AQ9UBK7 228 aaPredicted RBP26.6■■□□□ 1.85
CAPNS1-206ENST00000588815 PURGQ9UJV8 347 aaKnown RBP26.6■■□□□ 1.85
CAPNS1-206ENST00000588815 RABL2BQ9UNT1 228 aa26.6■■□□□ 1.85
CAPNS1-206ENST00000588815 FAM25AB3EWG3 89 aa26.59■■□□□ 1.85
CAPNS1-206ENST00000588815 FAM25CB3EWG5 89 aa26.59■■□□□ 1.85
CAPNS1-206ENST00000588815 FAM25GB3EWG6 89 aa26.59■■□□□ 1.85
CAPNS1-206ENST00000588815 ATP6V1G2-DDX39BF2Z307 99 aa26.59■■□□□ 1.85
CAPNS1-206ENST00000588815 ZG16O60844 167 aa26.59■■□□□ 1.85
CAPNS1-206ENST00000588815 ELK1P19419 428 aa26.59■■□□□ 1.85
CAPNS1-206ENST00000588815 P2RY14Q15391 338 aa26.59■■□□□ 1.85
CAPNS1-206ENST00000588815 ANGPTL5Q86XS5 388 aa26.59■■□□□ 1.85
CAPNS1-206ENST00000588815 NPRL2Q8WTW4 380 aa26.59■■□□□ 1.85
CAPNS1-206ENST00000588815 FBLN5Q9UBX5 448 aa26.59■■□□□ 1.85
CAPNS1-206ENST00000588815 GPR160Q9UJ42 338 aa26.59■■□□□ 1.85
CAPNS1-206ENST00000588815 MPV17P39210 176 aa26.58■■□□□ 1.85
CAPNS1-206ENST00000588815 ART1P52961 327 aa26.58■■□□□ 1.85
CAPNS1-206ENST00000588815 BSPH1Q075Z2 132 aa26.58■■□□□ 1.85
CAPNS1-206ENST00000588815 AWAT2Q6E213 333 aa26.58■■□□□ 1.85
CAPNS1-206ENST00000588815 BHLHE23Q8NDY6 225 aa26.58■■□□□ 1.85
CAPNS1-206ENST00000588815 RADILQ96JH8 1075 aa26.58■■□□□ 1.85
CAPNS1-206ENST00000588815 SPACA5Q96QH8 159 aa26.58■■□□□ 1.85
CAPNS1-206ENST00000588815 MRPS28Q9Y2Q9 187 aaKnown RBP26.58■■□□□ 1.85
CAPNS1-206ENST00000588815 CFAP46Q8IYW2 2715 aa26.57■■□□□ 1.84
CAPNS1-206ENST00000588815 TUBAL3A6NHL2 446 aa26.57■■□□□ 1.84
CAPNS1-206ENST00000588815 OR5B21A6NL26 309 aa26.57■■□□□ 1.84
CAPNS1-206ENST00000588815 ABCD4O14678 606 aa26.57■■□□□ 1.84
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