RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586900.1

PKN1-208, Transcript of protein kinase N1, human

TSL 3

Gene PKN1, Length 550 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PKN1-208	ENST00000586900	PLPP2	O43688	288 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PKN1-208	ENST00000586900	RP2	O75695	350 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PKN1-208	ENST00000586900	NRAS	P01111	189 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PKN1-208	ENST00000586900	SLC25A16	P16260	332 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PKN1-208	ENST00000586900	FAH	P16930	419 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PKN1-208	ENST00000586900	SLC3A1	Q07837	685 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PKN1-208	ENST00000586900	GPR50	Q13585	617 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PKN1-208	ENST00000586900	RIN1	Q13671	783 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PKN1-208	ENST00000586900	TBCE	Q15813	527 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
PKN1-208	ENST00000586900	ZNF181	Q2M3W8	571 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PKN1-208	ENST00000586900	HFE	Q30201	348 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PKN1-208	ENST00000586900	SPRN	Q5BIV9	151 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PKN1-208	ENST00000586900	FAM76B	Q5HYJ3	339 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PKN1-208	ENST00000586900	ZDHHC23	Q8IYP9	409 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PKN1-208	ENST00000586900	WFDC11	Q8NEX6	87 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PKN1-208	ENST00000586900	OR5A2	Q8NGI9	324 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PKN1-208	ENST00000586900	OR8S1	Q8NH09	359 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PKN1-208	ENST00000586900	PP6455	Q8WZ26	134 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PKN1-208	ENST00000586900	OR5P3	Q8WZ94	311 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PKN1-208	ENST00000586900	YIPF5	Q969M3	257 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PKN1-208	ENST00000586900	TECTB	Q96PL2	329 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PKN1-208	ENST00000586900	PDCD1LG2	Q9BQ51	273 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PKN1-208	ENST00000586900	CCDC90B	Q9GZT6	254 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PKN1-208	ENST00000586900	PLEKHA1	Q9HB21	404 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PKN1-208	ENST00000586900	GCM1	Q9NP62	436 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PKN1-208	ENST00000586900	ZNF275	Q9NSD4	429 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
PKN1-208	ENST00000586900	PPP1R3C	Q9UQK1	317 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PKN1-208	ENST00000586900	ZNF281	Q9Y2X9	895 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PKN1-208	ENST00000586900	SIRT4	Q9Y6E7	314 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
PKN1-208	ENST00000586900	ITPR3	Q14573	2671 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PKN1-208	ENST00000586900	LOC100289279	A0A1B0GTE1	492 aa		10.42	□□□□□ -0.74
PKN1-208	ENST00000586900	OR5B21	A6NL26	309 aa		10.42	□□□□□ -0.74
PKN1-208	ENST00000586900	TMEM210	A6NLX4	147 aa		10.42	□□□□□ -0.74
PKN1-208	ENST00000586900	LYNX1	G3V0Z9	82 aa		10.42	□□□□□ -0.74
PKN1-208	ENST00000586900	GATB	O75879	557 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
PKN1-208	ENST00000586900	SERPINA3	P01011	423 aa		10.42	□□□□□ -0.74
PKN1-208	ENST00000586900	LYNX1	P0DP58	116 aa		10.42	□□□□□ -0.74
PKN1-208	ENST00000586900	MED22	Q15528	200 aa		10.42	□□□□□ -0.74
PKN1-208	ENST00000586900	CEACAM21	Q3KPI0	293 aa		10.42	□□□□□ -0.74
PKN1-208	ENST00000586900	KCTD21	Q4G0X4	260 aa		10.42	□□□□□ -0.74
PKN1-208	ENST00000586900	UTS2B	Q765I0	119 aa		10.42	□□□□□ -0.74
PKN1-208	ENST00000586900	TGIF2LY	Q8IUE0	185 aa		10.42	□□□□□ -0.74
PKN1-208	ENST00000586900	SVOP	Q8N4V2	548 aa		10.42	□□□□□ -0.74
PKN1-208	ENST00000586900	OR10AC1	Q8NH08	325 aa		10.42	□□□□□ -0.74
PKN1-208	ENST00000586900		Q8TCH9	128 aa		10.42	□□□□□ -0.74
PKN1-208	ENST00000586900	GPR148	Q8TDV2	347 aa		10.42	□□□□□ -0.74
PKN1-208	ENST00000586900	GHSR	Q92847	366 aa		10.42	□□□□□ -0.74
PKN1-208	ENST00000586900	PGLYRP3	Q96LB9	341 aa		10.42	□□□□□ -0.74
PKN1-208	ENST00000586900		Q96MF0	132 aa		10.42	□□□□□ -0.74
PKN1-208	ENST00000586900	OR5M11	Q96RB7	305 aa		10.42	□□□□□ -0.74
PKN1-208	ENST00000586900	PIMREG	Q9BSJ6	248 aa		10.42	□□□□□ -0.74
PKN1-208	ENST00000586900	RTL8A	Q9BWD3	113 aa		10.42	□□□□□ -0.74
PKN1-208	ENST00000586900	CHST5	Q9GZS9	411 aa		10.42	□□□□□ -0.74
PKN1-208	ENST00000586900	PPP1R3E	Q9H7J1	279 aa		10.42	□□□□□ -0.74
PKN1-208	ENST00000586900	LRCH1	Q9Y2L9	728 aa		10.42	□□□□□ -0.74
PKN1-208	ENST00000586900	OTOG	Q6ZRI0	2925 aa		10.41	□□□□□ -0.74
PKN1-208	ENST00000586900	IGHV4-30-2	A0A087WSY4	118 aa		10.41	□□□□□ -0.74
PKN1-208	ENST00000586900	ANKRD61	A6NGH8	418 aa		10.41	□□□□□ -0.74
PKN1-208	ENST00000586900	LRRC30	A6NM36	301 aa		10.41	□□□□□ -0.74
PKN1-208	ENST00000586900	CDC14B	O60729	498 aa		10.41	□□□□□ -0.74
PKN1-208	ENST00000586900	CEL	P19835	753 aa		10.41	□□□□□ -0.74
PKN1-208	ENST00000586900	GNG3	P63215	75 aa		10.41	□□□□□ -0.74
PKN1-208	ENST00000586900	YIF1B	Q5BJH7	314 aa		10.41	□□□□□ -0.74
PKN1-208	ENST00000586900	PLCXD3	Q63HM9	321 aa		10.41	□□□□□ -0.74
PKN1-208	ENST00000586900	MOB3C	Q70IA8	216 aa		10.41	□□□□□ -0.74
PKN1-208	ENST00000586900	PARP16	Q8N5Y8	322 aa		10.41	□□□□□ -0.74
PKN1-208	ENST00000586900	OR1M1	Q8NGA1	313 aa		10.41	□□□□□ -0.74
PKN1-208	ENST00000586900	OR51A4	Q8NGJ6	313 aa		10.41	□□□□□ -0.74
PKN1-208	ENST00000586900	OR13C3	Q8NGS6	347 aa		10.41	□□□□□ -0.74
PKN1-208	ENST00000586900	HPSE2	Q8WWQ2	592 aa		10.41	□□□□□ -0.74
PKN1-208	ENST00000586900	RGP1	Q92546	391 aa	Predicted RBP	10.41	□□□□□ -0.74
PKN1-208	ENST00000586900	CCL17	Q92583	94 aa		10.41	□□□□□ -0.74
PKN1-208	ENST00000586900	HPS1	Q92902	700 aa		10.41	□□□□□ -0.74
PKN1-208	ENST00000586900	DVL3	Q92997	716 aa	Predicted RBP	10.41	□□□□□ -0.74
PKN1-208	ENST00000586900	ADAT3	Q96EY9	351 aa	Predicted RBP	10.41	□□□□□ -0.74
PKN1-208	ENST00000586900	RNF170	Q96K19	258 aa		10.41	□□□□□ -0.74
PKN1-208	ENST00000586900	TLNRD1	Q9H1K6	362 aa		10.41	□□□□□ -0.74
PKN1-208	ENST00000586900	FN3KRP	Q9HA64	309 aa		10.41	□□□□□ -0.74
PKN1-208	ENST00000586900	TMEM106B	Q9NUM4	274 aa		10.41	□□□□□ -0.74
PKN1-208	ENST00000586900	DHDH	Q9UQ10	334 aa		10.41	□□□□□ -0.74
PKN1-208	ENST00000586900	MAP1A	P78559	2803 aa	Predicted RBP	10.4	□□□□□ -0.74
PKN1-208	ENST00000586900	CLDN25	C9JDP6	229 aa		10.4	□□□□□ -0.74
PKN1-208	ENST00000586900		H3BSH0	61 aa		10.4	□□□□□ -0.74
PKN1-208	ENST00000586900	LMX1B	O60663	402 aa		10.4	□□□□□ -0.74
PKN1-208	ENST00000586900	ALX3	O95076	343 aa		10.4	□□□□□ -0.74
PKN1-208	ENST00000586900	FSTL3	O95633	263 aa		10.4	□□□□□ -0.74
PKN1-208	ENST00000586900	CD2	P06729	351 aa		10.4	□□□□□ -0.74
PKN1-208	ENST00000586900	ZNF20	P17024	532 aa		10.4	□□□□□ -0.74
PKN1-208	ENST00000586900	CFHR2	P36980	270 aa		10.4	□□□□□ -0.74
PKN1-208	ENST00000586900	NR4A2	P43354	598 aa		10.4	□□□□□ -0.74
PKN1-208	ENST00000586900	GPR6	P46095	362 aa	Predicted RBP	10.4	□□□□□ -0.74
PKN1-208	ENST00000586900	CHN2	P52757	468 aa		10.4	□□□□□ -0.74
PKN1-208	ENST00000586900	EMX1	Q04741	257 aa	Predicted RBP	10.4	□□□□□ -0.74
PKN1-208	ENST00000586900	MLLT11	Q13015	90 aa	Predicted RBP	10.4	□□□□□ -0.74
PKN1-208	ENST00000586900	ZNF154	Q13106	437 aa		10.4	□□□□□ -0.74
PKN1-208	ENST00000586900	TPBG	Q13641	420 aa		10.4	□□□□□ -0.74
PKN1-208	ENST00000586900	DOC2B	Q14184	412 aa		10.4	□□□□□ -0.74
PKN1-208	ENST00000586900	CNN3	Q15417	329 aa	Known RBP	10.4	□□□□□ -0.74
PKN1-208	ENST00000586900	MPPED2	Q15777	294 aa		10.4	□□□□□ -0.74
PKN1-208	ENST00000586900	CARTPT	Q16568	116 aa		10.4	□□□□□ -0.74

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