RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000582376.1

GGA3-212, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 4

Gene GGA3, Length 551 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-212ENST00000582376 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
GGA3-212ENST00000582376 IGKV1D-17A0A075B6S4 117 aa7.24□□□□□ -1.25
GGA3-212ENST00000582376 HTR3EA5X5Y0 456 aa7.24□□□□□ -1.25
GGA3-212ENST00000582376 TRIM64CA6NLI5 447 aa7.24□□□□□ -1.25
GGA3-212ENST00000582376 M0QZK8 103 aa7.24□□□□□ -1.25
GGA3-212ENST00000582376 CD14P08571 375 aa7.24□□□□□ -1.25
GGA3-212ENST00000582376 IGHV1-8P0DP01 117 aa7.24□□□□□ -1.25
GGA3-212ENST00000582376 GP9P14770 177 aa7.24□□□□□ -1.25
GGA3-212ENST00000582376 CD24P25063 80 aa7.24□□□□□ -1.25
GGA3-212ENST00000582376 DDOSTP39656 456 aa7.24□□□□□ -1.25
GGA3-212ENST00000582376 MDH1P40925 334 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
GGA3-212ENST00000582376 SLC1A6P48664 564 aa7.24□□□□□ -1.25
GGA3-212ENST00000582376 SLC35B1P78383 322 aa7.24□□□□□ -1.25
GGA3-212ENST00000582376 IL18R1Q13478 541 aa7.24□□□□□ -1.25
GGA3-212ENST00000582376 KRR1Q13601 381 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
GGA3-212ENST00000582376 ZNF273Q14593 569 aa7.24□□□□□ -1.25
GGA3-212ENST00000582376 KIR2DS1Q14954 304 aa7.24□□□□□ -1.25
GGA3-212ENST00000582376 RFX4Q33E94 735 aa7.24□□□□□ -1.25
GGA3-212ENST00000582376 LRIF1Q5T3J3 769 aa7.24□□□□□ -1.25
GGA3-212ENST00000582376 SLC18B1Q6NT16 456 aa7.24□□□□□ -1.25
GGA3-212ENST00000582376 TMPRSS11FQ6ZWK6 438 aa7.24□□□□□ -1.25
GGA3-212ENST00000582376 CALHM1Q8IU99 346 aa7.24□□□□□ -1.25
GGA3-212ENST00000582376 LINC00346Q8IVM7 164 aa7.24□□□□□ -1.25
GGA3-212ENST00000582376 DPP10Q8N608 796 aa7.24□□□□□ -1.25
GGA3-212ENST00000582376 C11orf65Q8NCR3 313 aa7.24□□□□□ -1.25
GGA3-212ENST00000582376 OR4M1Q8NGD0 313 aa7.24□□□□□ -1.25
GGA3-212ENST00000582376 OR9I1Q8NGQ6 314 aa7.24□□□□□ -1.25
GGA3-212ENST00000582376 OR2T27Q8NH04 317 aa7.24□□□□□ -1.25
GGA3-212ENST00000582376 SLC26A7Q8TE54 656 aa7.24□□□□□ -1.25
GGA3-212ENST00000582376 STMN2Q93045 179 aa7.24□□□□□ -1.25
GGA3-212ENST00000582376 SPTSSAQ969W0 71 aa7.24□□□□□ -1.25
GGA3-212ENST00000582376 PKNOX2Q96KN3 472 aa7.24□□□□□ -1.25
GGA3-212ENST00000582376 NOL4LQ96MY1 436 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
GGA3-212ENST00000582376 POLR2J2Q9GZM3 115 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
GGA3-212ENST00000582376 NUAK2Q9H093 628 aa7.24□□□□□ -1.25
GGA3-212ENST00000582376 POLR2J3Q9H1A7 115 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
GGA3-212ENST00000582376 DCLRE1BQ9H816 532 aa7.24□□□□□ -1.25
GGA3-212ENST00000582376 PNPOQ9NVS9 261 aa7.24□□□□□ -1.25
GGA3-212ENST00000582376 SLAMF8Q9P0V8 285 aa7.24□□□□□ -1.25
GGA3-212ENST00000582376 HAO1Q9UJM8 370 aa7.24□□□□□ -1.25
GGA3-212ENST00000582376 ZNF222Q9UK12 451 aa7.24□□□□□ -1.25
GGA3-212ENST00000582376 ALMS1Q8TCU4 4167 aa7.24□□□□□ -1.25
GGA3-212ENST00000582376 C17orf98A8MV24 154 aa7.23□□□□□ -1.25
GGA3-212ENST00000582376 EVPLLA8MZ36 301 aa7.23□□□□□ -1.25
GGA3-212ENST00000582376 IMPA2O14732 288 aa7.23□□□□□ -1.25
GGA3-212ENST00000582376 PTP4A3O75365 173 aa7.23□□□□□ -1.25
GGA3-212ENST00000582376 PSG2P11465 335 aa7.23□□□□□ -1.25
GGA3-212ENST00000582376 SPNP16150 400 aa7.23□□□□□ -1.25
GGA3-212ENST00000582376 GPX2P18283 190 aa7.23□□□□□ -1.25
GGA3-212ENST00000582376 ANOS1P23352 680 aa7.23□□□□□ -1.25
GGA3-212ENST00000582376 GLRA1P23415 457 aa7.23□□□□□ -1.25
GGA3-212ENST00000582376 BRS3P32247 399 aa7.23□□□□□ -1.25
GGA3-212ENST00000582376 SLC9A3P48764 834 aa7.23□□□□□ -1.25
GGA3-212ENST00000582376 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
GGA3-212ENST00000582376 FHL1Q13642 323 aa7.23□□□□□ -1.25
GGA3-212ENST00000582376 FAM122BQ7Z309 247 aa7.23□□□□□ -1.25
GGA3-212ENST00000582376 OAFQ86UD1 273 aa7.23□□□□□ -1.25
GGA3-212ENST00000582376 ZNF429Q86V71 674 aa7.23□□□□□ -1.25
GGA3-212ENST00000582376 OR6V1Q8N148 313 aa7.23□□□□□ -1.25
GGA3-212ENST00000582376 OR13C2Q8NGS9 318 aa7.23□□□□□ -1.25
GGA3-212ENST00000582376 OR2AJ1Q8NGZ0 328 aa7.23□□□□□ -1.25
GGA3-212ENST00000582376 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
GGA3-212ENST00000582376 RPL3LQ92901 407 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
GGA3-212ENST00000582376 SDSLQ96GA7 329 aa7.23□□□□□ -1.25
GGA3-212ENST00000582376 MICU1Q9BPX6 476 aa7.23□□□□□ -1.25
GGA3-212ENST00000582376 C1orf21Q9H246 121 aa7.23□□□□□ -1.25
GGA3-212ENST00000582376 IKZF5Q9H5V7 419 aa7.23□□□□□ -1.25
GGA3-212ENST00000582376 NMNAT1Q9HAN9 279 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
GGA3-212ENST00000582376 PNRC2Q9NPJ4 139 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
GGA3-212ENST00000582376 SDR39U1Q9NRG7 319 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
GGA3-212ENST00000582376 VAPAQ9P0L0 249 aa7.23□□□□□ -1.25
GGA3-212ENST00000582376 A4GNTQ9UNA3 340 aa7.23□□□□□ -1.25
GGA3-212ENST00000582376 GMEB1Q9Y692 573 aa7.23□□□□□ -1.25
GGA3-212ENST00000582376 TLDC2A0PJX2 215 aa7.22□□□□□ -1.25
GGA3-212ENST00000582376 ANXA2P2A6NMY6 339 aa7.22□□□□□ -1.25
GGA3-212ENST00000582376 SERPINE3A8MV23 424 aa7.22□□□□□ -1.25
GGA3-212ENST00000582376 EFCAB9A8MZ26 197 aa7.22□□□□□ -1.25
GGA3-212ENST00000582376 XRCC2O43543 280 aa7.22□□□□□ -1.25
GGA3-212ENST00000582376 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa7.22□□□□□ -1.25
GGA3-212ENST00000582376 MTNR1BP49286 362 aa7.22□□□□□ -1.25
GGA3-212ENST00000582376 SLC7A2P52569 658 aa7.22□□□□□ -1.25
GGA3-212ENST00000582376 DLX6P56179 175 aa7.22□□□□□ -1.25
GGA3-212ENST00000582376 KRT72Q14CN4 511 aa7.22□□□□□ -1.25
GGA3-212ENST00000582376 SNAPC1Q16533 368 aa7.22□□□□□ -1.25
GGA3-212ENST00000582376 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP7.22□□□□□ -1.25
GGA3-212ENST00000582376 AGBL2Q5U5Z8 902 aa7.22□□□□□ -1.25
GGA3-212ENST00000582376 LCN8Q6JVE9 175 aa7.22□□□□□ -1.25
GGA3-212ENST00000582376 DNM1P34Q6PK57 102 aa7.22□□□□□ -1.25
GGA3-212ENST00000582376 THAP5Q7Z6K1 395 aa7.22□□□□□ -1.25
GGA3-212ENST00000582376 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
GGA3-212ENST00000582376 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
GGA3-212ENST00000582376 FAM156AQ8NDB6 213 aa7.22□□□□□ -1.25
GGA3-212ENST00000582376 RASSF5Q8WWW0 418 aa7.22□□□□□ -1.25
GGA3-212ENST00000582376 TAMM41Q96BW9 452 aa7.22□□□□□ -1.25
GGA3-212ENST00000582376 RTL8AQ9BWD3 113 aa7.22□□□□□ -1.25
GGA3-212ENST00000582376 NDEL1Q9GZM8 345 aa7.22□□□□□ -1.25
GGA3-212ENST00000582376 YY1AP1Q9H869 796 aa7.22□□□□□ -1.25
GGA3-212ENST00000582376 ISYNA1Q9NPH2 558 aa7.22□□□□□ -1.25
GGA3-212ENST00000582376 TBC1D23Q9NUY8 699 aa7.22□□□□□ -1.25
GGA3-212ENST00000582376 KCNG2Q9UJ96 466 aa7.22□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.5 ms