RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578454.5

NCOA4-201, Transcript of nuclear receptor coactivator 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NCOA4, Length 2,307 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA4-201ENST00000578454 FAM25AB3EWG3 89 aa7.31□□□□□ -1.24
NCOA4-201ENST00000578454 FAM25CB3EWG5 89 aa7.31□□□□□ -1.24
NCOA4-201ENST00000578454 FAM25GB3EWG6 89 aa7.31□□□□□ -1.24
NCOA4-201ENST00000578454 HPGDSO60760 199 aa7.31□□□□□ -1.24
NCOA4-201ENST00000578454 CELA3BP08861 270 aa7.31□□□□□ -1.24
NCOA4-201ENST00000578454 CALCBP10092 127 aa7.31□□□□□ -1.24
NCOA4-201ENST00000578454 FAHP16930 419 aa7.31□□□□□ -1.24
NCOA4-201ENST00000578454 ETV6P41212 452 aa7.31□□□□□ -1.24
NCOA4-201ENST00000578454 B2MP61769 119 aa7.31□□□□□ -1.24
NCOA4-201ENST00000578454 FAM3AP98173 230 aa7.31□□□□□ -1.24
NCOA4-201ENST00000578454 RAB11BQ15907 218 aa7.31□□□□□ -1.24
NCOA4-201ENST00000578454 ZNF529Q6P280 563 aa7.31□□□□□ -1.24
NCOA4-201ENST00000578454 UTS2BQ765I0 119 aa7.31□□□□□ -1.24
NCOA4-201ENST00000578454 MRPL21Q7Z2W9 205 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
NCOA4-201ENST00000578454 JAGN1Q8N5M9 183 aa7.31□□□□□ -1.24
NCOA4-201ENST00000578454 SAMD12Q8N8I0 201 aa7.31□□□□□ -1.24
NCOA4-201ENST00000578454 BORCS5Q969J3 196 aa7.31□□□□□ -1.24
NCOA4-201ENST00000578454 CMTM3Q96MX0 182 aa7.31□□□□□ -1.24
NCOA4-201ENST00000578454 ACTR6Q9GZN1 396 aa7.31□□□□□ -1.24
NCOA4-201ENST00000578454 MIXL1Q9H2W2 232 aa7.31□□□□□ -1.24
NCOA4-201ENST00000578454 NEK6Q9HC98 313 aa7.31□□□□□ -1.24
NCOA4-201ENST00000578454 SPATA2Q9UM82 520 aa7.31□□□□□ -1.24
NCOA4-201ENST00000578454 STARD10Q9Y365 291 aa7.31□□□□□ -1.24
NCOA4-201ENST00000578454 SLC25A15Q9Y619 301 aa7.31□□□□□ -1.24
NCOA4-201ENST00000578454 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
NCOA4-201ENST00000578454 hCG_38984A0A1B0GV85 526 aa7.3□□□□□ -1.24
NCOA4-201ENST00000578454 C16orf97H3BN30 126 aa7.3□□□□□ -1.24
NCOA4-201ENST00000578454 SLC17A2O00624 439 aa7.3□□□□□ -1.24
NCOA4-201ENST00000578454 ALX3O95076 343 aa7.3□□□□□ -1.24
NCOA4-201ENST00000578454 NGFP01138 241 aa7.3□□□□□ -1.24
NCOA4-201ENST00000578454 ALDOBP05062 364 aa7.3□□□□□ -1.24
NCOA4-201ENST00000578454 CD37P11049 281 aa7.3□□□□□ -1.24
NCOA4-201ENST00000578454 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
NCOA4-201ENST00000578454 CFPP27918 469 aa7.3□□□□□ -1.24
NCOA4-201ENST00000578454 HTR2CP28335 458 aa7.3□□□□□ -1.24
NCOA4-201ENST00000578454 WNT5AP41221 380 aa7.3□□□□□ -1.24
NCOA4-201ENST00000578454 CAPZA1P52907 286 aa7.3□□□□□ -1.24
NCOA4-201ENST00000578454 FAM27E3Q08E93 113 aa7.3□□□□□ -1.24
NCOA4-201ENST00000578454 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
NCOA4-201ENST00000578454 GK2Q14410 553 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
NCOA4-201ENST00000578454 OR8B8Q15620 311 aa7.3□□□□□ -1.24
NCOA4-201ENST00000578454 ZBTB37Q5TC79 503 aa7.3□□□□□ -1.24
NCOA4-201ENST00000578454 SSX8Q7RTT4 187 aa7.3□□□□□ -1.24
NCOA4-201ENST00000578454 LRRC28Q86X40 367 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
NCOA4-201ENST00000578454 CDH26Q8IXH8 852 aa7.3□□□□□ -1.24
NCOA4-201ENST00000578454 MFSD4AQ8N468 514 aa7.3□□□□□ -1.24
NCOA4-201ENST00000578454 PAQR4Q8N4S7 273 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
NCOA4-201ENST00000578454 RELL2Q8NC24 303 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
NCOA4-201ENST00000578454 OR51A2Q8NGJ7 313 aa7.3□□□□□ -1.24
NCOA4-201ENST00000578454 OR6M1Q8NGM8 313 aa7.3□□□□□ -1.24
NCOA4-201ENST00000578454 ST8SIA4Q92187 359 aa7.3□□□□□ -1.24
NCOA4-201ENST00000578454 SORCS2Q96PQ0 1159 aa7.3□□□□□ -1.24
NCOA4-201ENST00000578454 CHST5Q9GZS9 411 aa7.3□□□□□ -1.24
NCOA4-201ENST00000578454 TMEM160Q9NX00 188 aa7.3□□□□□ -1.24
NCOA4-201ENST00000578454 PTTG3PQ9NZH4 202 aa7.3□□□□□ -1.24
NCOA4-201ENST00000578454 FABP12A6NFH5 140 aa7.3□□□□□ -1.24
NCOA4-201ENST00000578454 GGT3PA6NGU5 568 aa7.3□□□□□ -1.24
NCOA4-201ENST00000578454 IGLV1-44P01699 117 aa7.3□□□□□ -1.24
NCOA4-201ENST00000578454 HCKP08631 526 aa7.3□□□□□ -1.24
NCOA4-201ENST00000578454 CD40LGP29965 261 aa7.3□□□□□ -1.24
NCOA4-201ENST00000578454 TALDO1P37837 337 aa7.3□□□□□ -1.24
NCOA4-201ENST00000578454 ST3GAL2Q16842 350 aa7.3□□□□□ -1.24
NCOA4-201ENST00000578454 C3orf36Q3SXR2 165 aa7.3□□□□□ -1.24
NCOA4-201ENST00000578454 CLVS2Q5SYC1 327 aa7.3□□□□□ -1.24
NCOA4-201ENST00000578454 METAP1DQ6UB28 335 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
NCOA4-201ENST00000578454 ZNF101Q8IZC7 436 aa7.3□□□□□ -1.24
NCOA4-201ENST00000578454 FTMTQ8N4E7 242 aa7.3□□□□□ -1.24
NCOA4-201ENST00000578454 METRNQ9UJH8 293 aa7.3□□□□□ -1.24
NCOA4-201ENST00000578454 ETV7Q9Y603 341 aa7.3□□□□□ -1.24
NCOA4-201ENST00000578454 PKD1L2Q7Z442 2459 aa7.29□□□□□ -1.24
NCOA4-201ENST00000578454 ZNF816-ZNF321PA0A0X1KG74 233 aa7.29□□□□□ -1.24
NCOA4-201ENST00000578454 UBE2CO00762 179 aa7.29□□□□□ -1.24
NCOA4-201ENST00000578454 APOA1P02647 267 aa7.29□□□□□ -1.24
NCOA4-201ENST00000578454 CECR9P0C854 216 aa7.29□□□□□ -1.24
NCOA4-201ENST00000578454 ELK1P19419 428 aa7.29□□□□□ -1.24
NCOA4-201ENST00000578454 TUBG1P23258 451 aa7.29□□□□□ -1.24
NCOA4-201ENST00000578454 ACKR3P25106 362 aa7.29□□□□□ -1.24
NCOA4-201ENST00000578454 CHRNB4P30926 498 aa7.29□□□□□ -1.24
NCOA4-201ENST00000578454 ZNF93P35789 620 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
NCOA4-201ENST00000578454 EVX1P49640 407 aa7.29□□□□□ -1.24
NCOA4-201ENST00000578454 UCP2P55851 309 aa7.29□□□□□ -1.24
NCOA4-201ENST00000578454 CLDN12P56749 244 aa7.29□□□□□ -1.24
NCOA4-201ENST00000578454 UBE2NLQ5JXB2 153 aa7.29□□□□□ -1.24
NCOA4-201ENST00000578454 C1orf100Q5SVJ3 147 aa7.29□□□□□ -1.24
NCOA4-201ENST00000578454 CNIH2Q6PI25 160 aa7.29□□□□□ -1.24
NCOA4-201ENST00000578454 FAM131AQ6UXB0 335 aa7.29□□□□□ -1.24
NCOA4-201ENST00000578454 MYPOPQ86VE0 399 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
NCOA4-201ENST00000578454 C1orf174Q8IYL3 243 aa7.29□□□□□ -1.24
NCOA4-201ENST00000578454 OR5AS1Q8N127 324 aa7.29□□□□□ -1.24
NCOA4-201ENST00000578454 CSNK2A3Q8NEV1 391 aa7.29□□□□□ -1.24
NCOA4-201ENST00000578454 OR52N4Q8NGI2 321 aa7.29□□□□□ -1.24
NCOA4-201ENST00000578454 OR5H6Q8NGV6 325 aa7.29□□□□□ -1.24
NCOA4-201ENST00000578454 LGALS14Q8TCE9 139 aa7.29□□□□□ -1.24
NCOA4-201ENST00000578454 TECTBQ96PL2 329 aa7.29□□□□□ -1.24
NCOA4-201ENST00000578454 OR51B6Q9H340 312 aa7.29□□□□□ -1.24
NCOA4-201ENST00000578454 METTL17Q9H7H0 456 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
NCOA4-201ENST00000578454 TUBG2Q9NRH3 451 aa7.29□□□□□ -1.24
NCOA4-201ENST00000578454 CGGBP1Q9UFW8 167 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
NCOA4-201ENST00000578454 KCNN3Q9UGI6 736 aa7.29□□□□□ -1.24
NCOA4-201ENST00000578454 SPTA1P02549 2419 aa7.29□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.8 ms