RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577468.2

PTPRM-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-204ENST00000577468 OR9I1Q8NGQ6 314 aa2.65□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 LRRC15Q8TF66 581 aa2.65□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 OR8D1Q8WZ84 308 aa2.65□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 OR5P2Q8WZ92 322 aa2.65□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 HIST1H2ACQ93077 130 aa2.65□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 ARL11Q969Q4 196 aa2.65□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 HIST1H2BAQ96A08 127 aa2.65□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 TMEM159Q96B96 161 aa2.65□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 NUS1Q96E22 293 aa2.65□□□□□ -1.99
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PTPRM-204ENST00000577468 NMRAL1Q9HBL8 299 aa2.65□□□□□ -1.99
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PTPRM-204ENST00000577468 SCN3BQ9NY72 215 aa2.65□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 IL17CQ9P0M4 197 aa2.65□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 OPTCQ9UBM4 332 aa2.65□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 LHX3Q9UBR4 397 aa2.65□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 HSPB8Q9UJY1 196 aa2.65□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 FBXL2Q9UKC9 423 aa2.65□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 PILRBQ9UKJ0 227 aa2.65□□□□□ -1.99
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PTPRM-204ENST00000577468 MST1RQ04912 1400 aa2.65□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa2.65□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 NSD3Q9BZ95 1437 aa2.65□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP2.65□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa2.65□□□□□ -1.99
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PTPRM-204ENST00000577468 IGHV2-70DA0A0C4DH43 119 aa2.64□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 A0A0G2JN53 185 aa2.64□□□□□ -1.99
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PTPRM-204ENST00000577468 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa2.64□□□□□ -1.99
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PTPRM-204ENST00000577468 E5RGE8 158 aa2.64□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 K7ERI5 159 aa2.64□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 PLPP1O14494 284 aa2.64□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 TNFRSF13BO14836 293 aaPredicted RBP2.64□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 MFSD11O43934 449 aa2.64□□□□□ -1.99
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PTPRM-204ENST00000577468 ALOX12BO75342 701 aa2.64□□□□□ -1.99
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PTPRM-204ENST00000577468 JTBO76095 146 aa2.64□□□□□ -1.99
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PTPRM-204ENST00000577468 CD2P06729 351 aa2.64□□□□□ -1.99
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PTPRM-204ENST00000577468 SULT1A4P0DMN0 295 aa2.64□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 OR5H8P0DN80 308 aa2.64□□□□□ -1.99
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PTPRM-204ENST00000577468 KDELR1P24390 212 aa2.64□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 HTR1DP28221 377 aa2.64□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 RPL12P30050 165 aaKnown RBP2.64□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 CMPK1P30085 196 aa2.64□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP2.64□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 NBL1P41271 181 aa2.64□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 TNFSF9P41273 254 aa2.64□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 CTSCP53634 463 aa2.64□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 CLDN6P56747 220 aa2.64□□□□□ -1.99
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