RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574205.5

CTDNEP1-209, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDNEP1, Length 1,506 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-209ENST00000574205 COMMD4Q9H0A8 199 aa27.99■■■□□ 2.07
CTDNEP1-209ENST00000574205 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa27.98■■■□□ 2.07
CTDNEP1-209ENST00000574205 H3BSH0 61 aa27.98■■■□□ 2.07
CTDNEP1-209ENST00000574205 RGS10O43665 173 aa27.98■■■□□ 2.07
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZFPL1O95159 310 aa27.98■■■□□ 2.07
CTDNEP1-209ENST00000574205 NR4A2P43354 598 aa27.98■■■□□ 2.07
CTDNEP1-209ENST00000574205 SLC3A1Q07837 685 aa27.98■■■□□ 2.07
CTDNEP1-209ENST00000574205 CDK5R1Q15078 307 aa27.98■■■□□ 2.07
CTDNEP1-209ENST00000574205 OR5AK2Q8NH90 309 aa27.98■■■□□ 2.07
CTDNEP1-209ENST00000574205 MND1Q9BWT6 205 aa27.98■■■□□ 2.07
CTDNEP1-209ENST00000574205 REG4Q9BYZ8 158 aa27.98■■■□□ 2.07
CTDNEP1-209ENST00000574205 ERVK-18Q9QC07 812 aa27.98■■■□□ 2.07
CTDNEP1-209ENST00000574205 HHLA2Q9UM44 414 aa27.98■■■□□ 2.07
CTDNEP1-209ENST00000574205 IGHV3-64DA0A0J9YX35 117 aa27.97■■■□□ 2.07
CTDNEP1-209ENST00000574205 CDH15P55291 814 aa27.97■■■□□ 2.07
CTDNEP1-209ENST00000574205 RPS4Y2Q8TD47 263 aa27.97■■■□□ 2.07
CTDNEP1-209ENST00000574205 C10orf35Q96D05 121 aa27.97■■■□□ 2.07
CTDNEP1-209ENST00000574205 MICU1Q9BPX6 476 aa27.97■■■□□ 2.07
CTDNEP1-209ENST00000574205 PDCD1LG2Q9BQ51 273 aa27.97■■■□□ 2.07
CTDNEP1-209ENST00000574205 HIVEP1P15822 2718 aa27.97■■■□□ 2.07
CTDNEP1-209ENST00000574205 CLDN25C9JDP6 229 aa27.97■■■□□ 2.07
CTDNEP1-209ENST00000574205 RNF223E7ERA6 249 aa27.97■■■□□ 2.07
CTDNEP1-209ENST00000574205 IFNL4K9M1U5 179 aa27.97■■■□□ 2.07
CTDNEP1-209ENST00000574205 LALBAP00709 142 aa27.97■■■□□ 2.07
CTDNEP1-209ENST00000574205 GPR6P46095 362 aaPredicted RBP27.97■■■□□ 2.07
CTDNEP1-209ENST00000574205 TMEM42Q69YG0 159 aa27.97■■■□□ 2.07
CTDNEP1-209ENST00000574205 OR5P3Q8WZ94 311 aa27.97■■■□□ 2.07
CTDNEP1-209ENST00000574205 HIST1H2AAQ96QV6 131 aa27.97■■■□□ 2.07
CTDNEP1-209ENST00000574205 TMEM106BQ9NUM4 274 aa27.97■■■□□ 2.07
CTDNEP1-209ENST00000574205 H7C1Q1 480 aa27.96■■■□□ 2.07
CTDNEP1-209ENST00000574205 PPIHO43447 177 aaKnown RBP27.96■■■□□ 2.07
CTDNEP1-209ENST00000574205 NRASP01111 189 aa27.96■■■□□ 2.07
CTDNEP1-209ENST00000574205 TAS2R43P59537 309 aa27.96■■■□□ 2.07
CTDNEP1-209ENST00000574205 CLVS2Q5SYC1 327 aa27.96■■■□□ 2.07
CTDNEP1-209ENST00000574205 PRAMEF6Q5VXH4 476 aa27.96■■■□□ 2.07
CTDNEP1-209ENST00000574205 PRSS48Q7RTY5 328 aa27.96■■■□□ 2.07
CTDNEP1-209ENST00000574205 MOGAT3Q86VF5 341 aa27.96■■■□□ 2.07
CTDNEP1-209ENST00000574205 HPSE2Q8WWQ2 592 aa27.96■■■□□ 2.07
CTDNEP1-209ENST00000574205 SMIM19Q96E16 107 aa27.96■■■□□ 2.07
CTDNEP1-209ENST00000574205 TMUB1Q9BVT8 246 aa27.96■■■□□ 2.07
CTDNEP1-209ENST00000574205 RTL8AQ9BWD3 113 aa27.96■■■□□ 2.07
CTDNEP1-209ENST00000574205 OGG1O15527 345 aa27.95■■■□□ 2.06
CTDNEP1-209ENST00000574205 MPPED2Q15777 294 aa27.95■■■□□ 2.06
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF181Q2M3W8 571 aa27.95■■■□□ 2.06
CTDNEP1-209ENST00000574205 CEACAM21Q3KPI0 293 aa27.95■■■□□ 2.06
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF420Q8TAQ5 688 aaPredicted RBP27.95■■■□□ 2.06
CTDNEP1-209ENST00000574205 ACANP16112 2415 aa27.95■■■□□ 2.06
CTDNEP1-209ENST00000574205 A6NIN4 97 aa27.94■■■□□ 2.06
CTDNEP1-209ENST00000574205 EEF1B2P24534 225 aaKnown RBP27.94■■■□□ 2.06
CTDNEP1-209ENST00000574205 IRF3Q14653 427 aa27.94■■■□□ 2.06
CTDNEP1-209ENST00000574205 CEP78Q5JTW2 689 aa27.94■■■□□ 2.06
CTDNEP1-209ENST00000574205 CIARTQ8N365 385 aaPredicted RBP27.94■■■□□ 2.06
CTDNEP1-209ENST00000574205 OR51A4Q8NGJ6 313 aa27.94■■■□□ 2.06
CTDNEP1-209ENST00000574205 OR10AC1Q8NH08 325 aa27.94■■■□□ 2.06
CTDNEP1-209ENST00000574205 Q8TCH9 128 aa27.94■■■□□ 2.06
CTDNEP1-209ENST00000574205 FN3KRPQ9HA64 309 aa27.94■■■□□ 2.06
CTDNEP1-209ENST00000574205 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP27.94■■■□□ 2.06
CTDNEP1-209ENST00000574205 F8P00451 2351 aa27.94■■■□□ 2.06
CTDNEP1-209ENST00000574205 A0A096LNT2 108 aa27.93■■■□□ 2.06
CTDNEP1-209ENST00000574205 LMX1BO60663 402 aa27.93■■■□□ 2.06
CTDNEP1-209ENST00000574205 GRPP07492 148 aa27.93■■■□□ 2.06
CTDNEP1-209ENST00000574205 CD99P14209 185 aa27.93■■■□□ 2.06
CTDNEP1-209ENST00000574205 PLCXD3Q63HM9 321 aa27.93■■■□□ 2.06
CTDNEP1-209ENST00000574205 TIMD4Q96H15 378 aa27.93■■■□□ 2.06
CTDNEP1-209ENST00000574205 YTHDF1Q9BYJ9 559 aaKnown RBP27.93■■■□□ 2.06
CTDNEP1-209ENST00000574205 CCDC90BQ9GZT6 254 aa27.93■■■□□ 2.06
CTDNEP1-209ENST00000574205 UFSP2Q9NUQ7 469 aa27.93■■■□□ 2.06
CTDNEP1-209ENST00000574205 LRRC30A6NM36 301 aa27.92■■■□□ 2.06
CTDNEP1-209ENST00000574205 MT-ND2P03891 347 aa27.92■■■□□ 2.06
CTDNEP1-209ENST00000574205 GABARAPL2P60520 117 aa27.92■■■□□ 2.06
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF154Q13106 437 aa27.92■■■□□ 2.06
CTDNEP1-209ENST00000574205 DMKNQ6E0U4 476 aaPredicted RBP27.92■■■□□ 2.06
CTDNEP1-209ENST00000574205 MOB3CQ70IA8 216 aa27.92■■■□□ 2.06
CTDNEP1-209ENST00000574205 PEG10Q86TG7 708 aaKnown RBP27.92■■■□□ 2.06
CTDNEP1-209ENST00000574205 WDR86Q86TI4 376 aa27.92■■■□□ 2.06
CTDNEP1-209ENST00000574205 PP6455Q8WZ26 134 aa27.92■■■□□ 2.06
CTDNEP1-209ENST00000574205 HPS1Q92902 700 aa27.92■■■□□ 2.06
CTDNEP1-209ENST00000574205 RNF170Q96K19 258 aa27.92■■■□□ 2.06
CTDNEP1-209ENST00000574205 COX4I2Q96KJ9 171 aa27.92■■■□□ 2.06
CTDNEP1-209ENST00000574205 DCAF16Q9NXF7 216 aa27.92■■■□□ 2.06
CTDNEP1-209ENST00000574205 ANKRD61A6NGH8 418 aa27.92■■■□□ 2.06
CTDNEP1-209ENST00000574205 TMEM210A6NLX4 147 aa27.92■■■□□ 2.06
CTDNEP1-209ENST00000574205 USF1P22415 310 aaPredicted RBP27.92■■■□□ 2.06
CTDNEP1-209ENST00000574205 THBS2P35442 1172 aa27.92■■■□□ 2.06
CTDNEP1-209ENST00000574205 BDH1Q02338 343 aa27.92■■■□□ 2.06
CTDNEP1-209ENST00000574205 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP27.92■■■□□ 2.06
CTDNEP1-209ENST00000574205 FAM76BQ5HYJ3 339 aa27.92■■■□□ 2.06
CTDNEP1-209ENST00000574205 OR1M1Q8NGA1 313 aa27.92■■■□□ 2.06
CTDNEP1-209ENST00000574205 OR5A2Q8NGI9 324 aa27.92■■■□□ 2.06
CTDNEP1-209ENST00000574205 OR13C3Q8NGS6 347 aa27.92■■■□□ 2.06
CTDNEP1-209ENST00000574205 RAB1CQ92928 201 aa27.92■■■□□ 2.06
CTDNEP1-209ENST00000574205 C18orf12Q96KH6 178 aa27.92■■■□□ 2.06
CTDNEP1-209ENST00000574205 CHST5Q9GZS9 411 aa27.92■■■□□ 2.06
CTDNEP1-209ENST00000574205 CR1P17927 2039 aa27.92■■■□□ 2.06
CTDNEP1-209ENST00000574205 OR5B21A6NL26 309 aa27.91■■■□□ 2.06
CTDNEP1-209ENST00000574205 TMEM178BH3BS89 294 aa27.91■■■□□ 2.06
CTDNEP1-209ENST00000574205 PMELP40967 661 aa27.91■■■□□ 2.06
CTDNEP1-209ENST00000574205 ACSM1Q08AH1 577 aa27.91■■■□□ 2.06
CTDNEP1-209ENST00000574205 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP27.91■■■□□ 2.06
CTDNEP1-209ENST00000574205 SPHARQ15513 63 aa27.91■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.7 ms