RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552688.5

CS-233, Transcript of citrate synthase, human

TSL 4

Gene CS, Length 580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-233	ENST00000552688	MEGF10	Q96KG7	1140 aa		5.7	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	HRASLS5	Q96KN8	279 aa		5.7	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	CNN2	Q99439	309 aa	Known RBP	5.7	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	TEAD3	Q99594	435 aa		5.7	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	TMEM246	Q9BRR3	403 aa		5.7	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	ABHD6	Q9BV23	337 aa		5.7	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	ADI1	Q9BV57	179 aa		5.7	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	DPAGT1	Q9H3H5	408 aa		5.7	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	MARCH7	Q9H992	704 aa		5.7	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	ADGRL4	Q9HBW9	690 aa		5.7	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	TCF7L1	Q9HCS4	588 aa		5.7	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	IKZF2	Q9UKS7	526 aa		5.7	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	GTF2A1L	Q9UNN4	478 aa		5.7	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	STARD10	Q9Y365	291 aa		5.7	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	SOX21	Q9Y651	276 aa	Predicted RBP	5.7	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	WNK2	Q9Y3S1	2297 aa		5.7	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	IGHV3-64D	A0A0J9YX35	117 aa		5.69	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	ZNF879	B4DU55	563 aa		5.69	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688		M0R135	149 aa		5.69	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	PRODH	O43272	600 aa		5.69	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	RRP9	O43818	475 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	TOX4	O94842	621 aa		5.69	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	RPP14	O95059	124 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	ALX3	O95076	343 aa		5.69	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	CYB5R3	P00387	301 aa	Predicted RBP	5.69	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	LCAT	P04180	440 aa		5.69	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	LYN	P07948	512 aa		5.69	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	H2BFM	P0C1H6	154 aa		5.69	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	ACSM4	P0C7M7	580 aa		5.69	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	HSD11B1	P28845	292 aa		5.69	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	ATP6V1E1	P36543	226 aa		5.69	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	GATA4	P43694	442 aa		5.69	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	PROK1	P58294	105 aa		5.69	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	CXCR4	P61073	352 aa		5.69	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	HIST1H3A	P68431	136 aa		5.69	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	EFNB1	P98172	346 aa		5.69	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	ZNF91	Q05481	1191 aa		5.69	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	MFGE8	Q08431	387 aa	Predicted RBP	5.69	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	ODF4	Q2M2E3	257 aa		5.69	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	RSPO1	Q2MKA7	263 aa	Predicted RBP	5.69	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	C2orf68	Q2NKX9	166 aa		5.69	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	SLC35D3	Q5M8T2	416 aa		5.69	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	HIST2H3PS2	Q5TEC6	136 aa		5.69	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	ZNF691	Q5VV52	312 aa		5.69	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	WDR25	Q64LD2	544 aa	Predicted RBP	5.69	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	HIST2H2BD	Q6DRA6	164 aa		5.69	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	HIST2H3A	Q71DI3	136 aa		5.69	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	FAM57B	Q71RH2	274 aa		5.69	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	SLC16A9	Q7RTY1	509 aa		5.69	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	REC114	Q7Z4M0	266 aa		5.69	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	KRT77	Q7Z794	578 aa		5.69	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	GID4	Q8IVV7	300 aa		5.69	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	DHRSX	Q8N5I4	330 aa		5.69	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	PNLDC1	Q8NA58	520 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	BHLHE23	Q8NDY6	225 aa		5.69	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	OR8J1	Q8NGP2	316 aa		5.69	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	OR11L1	Q8NGX0	322 aa		5.69	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	OTOS	Q8NHW6	89 aa		5.69	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	PPP1R14A	Q96A00	147 aa		5.69	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	APOBEC3D	Q96AK3	386 aa	Predicted RBP	5.69	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	ZNF799	Q96GE5	643 aa		5.69	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	COQ7	Q99807	217 aa		5.69	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	APOL4	Q9BPW4	351 aa		5.69	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	HDHD2	Q9H0R4	259 aa		5.69	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	TNFRSF19	Q9NS68	423 aa		5.69	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	ACOXL	Q9NUZ1	547 aa		5.69	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	ERVK-18	Q9QC07	812 aa		5.69	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	ATPIF1	Q9UII2	106 aa		5.69	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	LAMP5	Q9UJQ1	280 aa		5.69	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	CENPVL3	A0A0U1RRI6	287 aa		5.68	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688		A0A1B0GWJ7	208 aa		5.68	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	ZNF878	C9JN71	531 aa		5.68	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688		E9PQ18	207 aa		5.68	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	ZNF670-ZNF695	F2Z2N8	137 aa		5.68	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	NDUFA2	O43678	99 aa		5.68	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	WBP4	O75554	376 aa	Known RBP	5.68	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	ZNF205	O95201	554 aa		5.68	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	CSF1	P09603	554 aa		5.68	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	DBT	P11182	482 aa	Known RBP	5.68	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	GABRB1	P18505	474 aa		5.68	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	HTR1F	P30939	366 aa		5.68	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	CFHR2	P36980	270 aa		5.68	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	CAPG	P40121	348 aa		5.68	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	PSMB10	P40306	273 aa		5.68	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	IER3	P46695	156 aa		5.68	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	ZNF121	P58317	390 aa	Predicted RBP	5.68	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	KRTAP10-3	P60369	221 aa		5.68	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	ADARB1	P78563	741 aa	Known RBP	5.68	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	TP53I3	Q53FA7	332 aa		5.68	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	GLYATL3	Q5SZD4	288 aa		5.68	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	METTL11B	Q5VVY1	283 aa		5.68	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	OR2T2	Q6IF00	324 aa		5.68	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	ZNF841	Q6ZN19	808 aa		5.68	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	LDLRAD3	Q86YD5	345 aa		5.68	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	HIST2H2AB	Q8IUE6	130 aa	Predicted RBP	5.68	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	PACRGL	Q8N7B6	248 aa		5.68	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	ZSCAN4	Q8NAM6	433 aa	Predicted RBP	5.68	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	OR10AD1	Q8NGE0	317 aa		5.68	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	ZNF420	Q8TAQ5	688 aa	Predicted RBP	5.68	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688		Q8TCH9	128 aa		5.68	□□□□□ -1.5

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52 ms