RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551984.5

FGD4-215, Transcript of FYVE, RhoGEF and PH domain containing 4, human

TSL 5

Gene FGD4, Length 2,435 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FGD4-215	ENST00000551984	FMO6P	O60774	539 aa		5.69	□□□□□ -1.5
FGD4-215	ENST00000551984	C6orf47	O95873	294 aa		5.69	□□□□□ -1.5
FGD4-215	ENST00000551984	GKN3P	P0CG01	181 aa		5.69	□□□□□ -1.5
FGD4-215	ENST00000551984	DCTD	P32321	178 aa		5.69	□□□□□ -1.5
FGD4-215	ENST00000551984	AP3S2	P59780	193 aa		5.69	□□□□□ -1.5
FGD4-215	ENST00000551984	RAB4B	P61018	213 aa		5.69	□□□□□ -1.5
FGD4-215	ENST00000551984	MPPED2	Q15777	294 aa		5.69	□□□□□ -1.5
FGD4-215	ENST00000551984	DUSP5	Q16690	384 aa		5.69	□□□□□ -1.5
FGD4-215	ENST00000551984	RPS26P11	Q5JNZ5	115 aa	Predicted RBP	5.69	□□□□□ -1.5
FGD4-215	ENST00000551984	NCMAP	Q5T1S8	102 aa		5.69	□□□□□ -1.5
FGD4-215	ENST00000551984	PODNL1	Q6PEZ8	512 aa		5.69	□□□□□ -1.5
FGD4-215	ENST00000551984	ZNF474	Q6S9Z5	364 aa	Predicted RBP	5.69	□□□□□ -1.5
FGD4-215	ENST00000551984	ETV3L	Q6ZN32	361 aa		5.69	□□□□□ -1.5
FGD4-215	ENST00000551984	SSX6	Q7RTT6	188 aa		5.69	□□□□□ -1.5
FGD4-215	ENST00000551984	CEACAM19	Q7Z692	300 aa		5.69	□□□□□ -1.5
FGD4-215	ENST00000551984	PXK	Q7Z7A4	578 aa		5.69	□□□□□ -1.5
FGD4-215	ENST00000551984	DPPA2	Q7Z7J5	298 aa		5.69	□□□□□ -1.5
FGD4-215	ENST00000551984	ZAR1	Q86SH2	424 aa		5.69	□□□□□ -1.5
FGD4-215	ENST00000551984	SYT9	Q86SS6	491 aa		5.69	□□□□□ -1.5
FGD4-215	ENST00000551984	MEX3D	Q86XN8	651 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
FGD4-215	ENST00000551984	MUC20	Q8N307	709 aa	Predicted RBP	5.69	□□□□□ -1.5
FGD4-215	ENST00000551984	GTPBP8	Q8N3Z3	284 aa	Predicted RBP	5.69	□□□□□ -1.5
FGD4-215	ENST00000551984	SLC16A11	Q8NCK7	471 aa		5.69	□□□□□ -1.5
FGD4-215	ENST00000551984	OR4K5	Q8NGD3	323 aa		5.69	□□□□□ -1.5
FGD4-215	ENST00000551984	OR4C3	Q8NH37	302 aa		5.69	□□□□□ -1.5
FGD4-215	ENST00000551984	OSTF1	Q92882	214 aa		5.69	□□□□□ -1.5
FGD4-215	ENST00000551984	MISP3	Q96FF7	219 aa		5.69	□□□□□ -1.5
FGD4-215	ENST00000551984	ADGRG7	Q96K78	797 aa		5.69	□□□□□ -1.5
FGD4-215	ENST00000551984	STAC	Q99469	402 aa		5.69	□□□□□ -1.5
FGD4-215	ENST00000551984	C2orf88	Q9BSF0	95 aa		5.69	□□□□□ -1.5
FGD4-215	ENST00000551984	ZNF471	Q9BX82	626 aa	Predicted RBP	5.69	□□□□□ -1.5
FGD4-215	ENST00000551984	TREM1	Q9NP99	234 aa		5.69	□□□□□ -1.5
FGD4-215	ENST00000551984	DUSP22	Q9NRW4	184 aa		5.69	□□□□□ -1.5
FGD4-215	ENST00000551984	EXOG	Q9Y2C4	368 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
FGD4-215	ENST00000551984	HEATR5A	Q86XA9	2040 aa		5.69	□□□□□ -1.5
FGD4-215	ENST00000551984		H3BML4	177 aa		5.69	□□□□□ -1.5
FGD4-215	ENST00000551984	GABARAP	H6UMI1	98 aa		5.69	□□□□□ -1.5
FGD4-215	ENST00000551984	FARS2	O95363	451 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
FGD4-215	ENST00000551984	CD99	P14209	185 aa		5.69	□□□□□ -1.5
FGD4-215	ENST00000551984	CCKAR	P32238	428 aa		5.69	□□□□□ -1.5
FGD4-215	ENST00000551984	PRKAG1	P54619	331 aa		5.69	□□□□□ -1.5
FGD4-215	ENST00000551984	F2RL1	P55085	397 aa		5.69	□□□□□ -1.5
FGD4-215	ENST00000551984	HGFAC	Q04756	655 aa		5.69	□□□□□ -1.5
FGD4-215	ENST00000551984	PIN1	Q13526	163 aa	Predicted RBP	5.69	□□□□□ -1.5
FGD4-215	ENST00000551984	CLINT1	Q14677	625 aa		5.69	□□□□□ -1.5
FGD4-215	ENST00000551984	PLPPR5	Q32ZL2	321 aa		5.69	□□□□□ -1.5
FGD4-215	ENST00000551984	ENTPD8	Q5MY95	495 aa		5.69	□□□□□ -1.5
FGD4-215	ENST00000551984	AADACL4	Q5VUY2	407 aa		5.69	□□□□□ -1.5
FGD4-215	ENST00000551984	ARL9	Q6T311	187 aa		5.69	□□□□□ -1.5
FGD4-215	ENST00000551984	C6orf120	Q7Z4R8	191 aa		5.69	□□□□□ -1.5
FGD4-215	ENST00000551984	TGIF2LX	Q8IUE1	241 aa		5.69	□□□□□ -1.5
FGD4-215	ENST00000551984	CMTM4	Q8IZR5	234 aa		5.69	□□□□□ -1.5
FGD4-215	ENST00000551984	OR5D16	Q8NGK9	328 aa		5.69	□□□□□ -1.5
FGD4-215	ENST00000551984	OR5J2	Q8NH18	312 aa		5.69	□□□□□ -1.5
FGD4-215	ENST00000551984	FNDC9	Q8TBE3	224 aa		5.69	□□□□□ -1.5
FGD4-215	ENST00000551984	LGALS14	Q8TCE9	139 aa		5.69	□□□□□ -1.5
FGD4-215	ENST00000551984	ARL11	Q969Q4	196 aa		5.69	□□□□□ -1.5
FGD4-215	ENST00000551984	C16orf58	Q96GQ5	468 aa		5.69	□□□□□ -1.5
FGD4-215	ENST00000551984	ZNF845	Q96IR2	970 aa	Predicted RBP	5.69	□□□□□ -1.5
FGD4-215	ENST00000551984	NRIP2	Q9BQI9	281 aa		5.69	□□□□□ -1.5
FGD4-215	ENST00000551984	LAT2	Q9GZY6	243 aa		5.69	□□□□□ -1.5
FGD4-215	ENST00000551984	FBXO34	Q9NWN3	711 aa		5.69	□□□□□ -1.5
FGD4-215	ENST00000551984	ELOVL5	Q9NYP7	299 aa		5.69	□□□□□ -1.5
FGD4-215	ENST00000551984	ABRACL	Q9P1F3	81 aa		5.69	□□□□□ -1.5
FGD4-215	ENST00000551984	RCC2	Q9P258	522 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
FGD4-215	ENST00000551984	CBY1	Q9Y3M2	126 aa		5.69	□□□□□ -1.5
FGD4-215	ENST00000551984	BTBD17	A6NE02	478 aa		5.68	□□□□□ -1.5
FGD4-215	ENST00000551984	ZNF705E	A8MWA4	302 aa	Predicted RBP	5.68	□□□□□ -1.5
FGD4-215	ENST00000551984	DEFB108A	A8MXU0	73 aa		5.68	□□□□□ -1.5
FGD4-215	ENST00000551984	BLOC1S5-TXNDC5	H3BN57	136 aa		5.68	□□□□□ -1.5
FGD4-215	ENST00000551984	MT-ND4L	P03901	98 aa		5.68	□□□□□ -1.5
FGD4-215	ENST00000551984	CD2	P06729	351 aa		5.68	□□□□□ -1.5
FGD4-215	ENST00000551984	FCGR2A	P12318	317 aa		5.68	□□□□□ -1.5
FGD4-215	ENST00000551984	CD53	P19397	219 aa		5.68	□□□□□ -1.5
FGD4-215	ENST00000551984	CPT2	P23786	658 aa		5.68	□□□□□ -1.5
FGD4-215	ENST00000551984	AGTR1	P30556	359 aa		5.68	□□□□□ -1.5
FGD4-215	ENST00000551984	PMEL	P40967	661 aa		5.68	□□□□□ -1.5
FGD4-215	ENST00000551984	FAM27E3	Q08E93	113 aa		5.68	□□□□□ -1.5
FGD4-215	ENST00000551984	ZNF345	Q14585	488 aa		5.68	□□□□□ -1.5
FGD4-215	ENST00000551984	MAPK14	Q16539	360 aa		5.68	□□□□□ -1.5
FGD4-215	ENST00000551984	DEFB113	Q30KQ7	82 aa		5.68	□□□□□ -1.5
FGD4-215	ENST00000551984	GFOD2	Q3B7J2	385 aa		5.68	□□□□□ -1.5
FGD4-215	ENST00000551984	BEX5	Q5H9J7	111 aa		5.68	□□□□□ -1.5
FGD4-215	ENST00000551984	NKAPL	Q5M9Q1	402 aa		5.68	□□□□□ -1.5
FGD4-215	ENST00000551984	LIN54	Q6MZP7	749 aa		5.68	□□□□□ -1.5
FGD4-215	ENST00000551984	REEP3	Q6NUK4	255 aa		5.68	□□□□□ -1.5
FGD4-215	ENST00000551984	CDC73	Q6P1J9	531 aa		5.68	□□□□□ -1.5
FGD4-215	ENST00000551984	C1orf94	Q6P1W5	598 aa		5.68	□□□□□ -1.5
FGD4-215	ENST00000551984	C11orf88	Q6PI97	169 aa		5.68	□□□□□ -1.5
FGD4-215	ENST00000551984	CXXC5	Q7LFL8	322 aa	Known RBP	5.68	□□□□□ -1.5
FGD4-215	ENST00000551984	BBS1	Q8NFJ9	593 aa		5.68	□□□□□ -1.5
FGD4-215	ENST00000551984	ABHD4	Q8TB40	342 aa		5.68	□□□□□ -1.5
FGD4-215	ENST00000551984	POC1B	Q8TC44	478 aa		5.68	□□□□□ -1.5
FGD4-215	ENST00000551984	SFXN5	Q8TD22	340 aa		5.68	□□□□□ -1.5
FGD4-215	ENST00000551984	TNFAIP8L1	Q8WVP5	186 aa		5.68	□□□□□ -1.5
FGD4-215	ENST00000551984	OR5P2	Q8WZ92	322 aa		5.68	□□□□□ -1.5
FGD4-215	ENST00000551984	RFK	Q969G6	155 aa		5.68	□□□□□ -1.5
FGD4-215	ENST00000551984	ZBTB8A	Q96BR9	441 aa		5.68	□□□□□ -1.5
FGD4-215	ENST00000551984	RAB3C	Q96E17	227 aa		5.68	□□□□□ -1.5
FGD4-215	ENST00000551984	CPNE2	Q96FN4	548 aa	Predicted RBP	5.68	□□□□□ -1.5

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