RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551441.5

CS-227, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 636 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-227ENST00000551441 AP3M1Q9Y2T2 418 aa13.09□□□□□ -0.31
CS-227ENST00000551441 XPNPEP2O43895 674 aa13.08□□□□□ -0.32
CS-227ENST00000551441 IGLL1P15814 213 aa13.08□□□□□ -0.32
CS-227ENST00000551441 GNALP38405 381 aa13.08□□□□□ -0.32
CS-227ENST00000551441 GSK3AP49840 483 aa13.08□□□□□ -0.32
CS-227ENST00000551441 RAB13P51153 203 aa13.08□□□□□ -0.32
CS-227ENST00000551441 ACSM1Q08AH1 577 aa13.08□□□□□ -0.32
CS-227ENST00000551441 NCR3LG1Q68D85 454 aa13.08□□□□□ -0.32
CS-227ENST00000551441 MKXQ8IYA7 352 aa13.08□□□□□ -0.32
CS-227ENST00000551441 SLC37A3Q8NCC5 494 aa13.08□□□□□ -0.32
CS-227ENST00000551441 ZNRF1Q8ND25 227 aa13.08□□□□□ -0.32
CS-227ENST00000551441 OR4C15Q8NGM1 316 aa13.08□□□□□ -0.32
CS-227ENST00000551441 SPSB4Q96A44 273 aa13.08□□□□□ -0.32
CS-227ENST00000551441 DHRS1Q96LJ7 313 aa13.08□□□□□ -0.32
CS-227ENST00000551441 RAB3IPQ96QF0 476 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.32
CS-227ENST00000551441 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.32
CS-227ENST00000551441 FGF23Q9GZV9 251 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.32
CS-227ENST00000551441 FAM234AQ9H0X4 552 aa13.08□□□□□ -0.32
CS-227ENST00000551441 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP13.08□□□□□ -0.32
CS-227ENST00000551441 SF3B6Q9Y3B4 125 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.32
CS-227ENST00000551441 hCG_38984A0A1B0GV85 526 aa13.07□□□□□ -0.32
CS-227ENST00000551441 A0A1W2PRX2 142 aa13.07□□□□□ -0.32
CS-227ENST00000551441 ZNF850A8MQ14 1090 aa13.07□□□□□ -0.32
CS-227ENST00000551441 M0R1W7 72 aa13.07□□□□□ -0.32
CS-227ENST00000551441 CLUP10909 449 aa13.07□□□□□ -0.32
CS-227ENST00000551441 COX7A1P24310 79 aa13.07□□□□□ -0.32
CS-227ENST00000551441 DDOSTP39656 456 aa13.07□□□□□ -0.32
CS-227ENST00000551441 ENTPD1P49961 510 aa13.07□□□□□ -0.32
CS-227ENST00000551441 MXRA7P84157 204 aa13.07□□□□□ -0.32
CS-227ENST00000551441 BLMHQ13867 455 aa13.07□□□□□ -0.32
CS-227ENST00000551441 DMRTC1Q5HYR2 192 aa13.07□□□□□ -0.32
CS-227ENST00000551441 ATPAF1Q5TC12 328 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
CS-227ENST00000551441 CCBE1Q6UXH8 406 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
CS-227ENST00000551441 TMEM185AQ8NFB2 350 aa13.07□□□□□ -0.32
CS-227ENST00000551441 OR4S1Q8NGB4 309 aa13.07□□□□□ -0.32
CS-227ENST00000551441 OR2T4Q8NH00 348 aa13.07□□□□□ -0.32
CS-227ENST00000551441 ANGPTL6Q8NI99 470 aa13.07□□□□□ -0.32
CS-227ENST00000551441 RP9Q8TA86 221 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
CS-227ENST00000551441 PIFOQ8TCI5 191 aa13.07□□□□□ -0.32
CS-227ENST00000551441 C12orf43Q96C57 262 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
CS-227ENST00000551441 DDOQ99489 341 aa13.07□□□□□ -0.32
CS-227ENST00000551441 MICU1Q9BPX6 476 aa13.07□□□□□ -0.32
CS-227ENST00000551441 OPA3Q9H6K4 179 aa13.07□□□□□ -0.32
CS-227ENST00000551441 ZNF702PQ9H963 129 aa13.07□□□□□ -0.32
CS-227ENST00000551441 DHRS12A0PJE2 317 aa13.06□□□□□ -0.32
CS-227ENST00000551441 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa13.06□□□□□ -0.32
CS-227ENST00000551441 ZNF878C9JN71 531 aa13.06□□□□□ -0.32
CS-227ENST00000551441 IDH3BO43837 385 aa13.06□□□□□ -0.32
CS-227ENST00000551441 RHBDL1O75783 438 aa13.06□□□□□ -0.32
CS-227ENST00000551441 HSD11B1P28845 292 aa13.06□□□□□ -0.32
CS-227ENST00000551441 GSSP48637 474 aa13.06□□□□□ -0.32
CS-227ENST00000551441 NUDT2P50583 147 aa13.06□□□□□ -0.32
CS-227ENST00000551441 ZNF121P58317 390 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
CS-227ENST00000551441 PRDX4Q13162 271 aa13.06□□□□□ -0.32
CS-227ENST00000551441 EIF2B1Q14232 305 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
CS-227ENST00000551441 C8orf82Q6P1X6 216 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
CS-227ENST00000551441 C11orf88Q6PI97 169 aa13.06□□□□□ -0.32
CS-227ENST00000551441 LHFPL4Q7Z7J7 247 aa13.06□□□□□ -0.32
CS-227ENST00000551441 TMEM219Q86XT9 240 aa13.06□□□□□ -0.32
CS-227ENST00000551441 DYNAPQ8N1N2 210 aa13.06□□□□□ -0.32
CS-227ENST00000551441 OR8D4Q8NGM9 314 aa13.06□□□□□ -0.32
CS-227ENST00000551441 OR6K6Q8NGW6 343 aa13.06□□□□□ -0.32
CS-227ENST00000551441 GNPDA2Q8TDQ7 276 aa13.06□□□□□ -0.32
CS-227ENST00000551441 PIGCQ92535 297 aa13.06□□□□□ -0.32
CS-227ENST00000551441 MED30Q96HR3 178 aa13.06□□□□□ -0.32
CS-227ENST00000551441 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
CS-227ENST00000551441 NPFFR1Q9GZQ6 430 aa13.06□□□□□ -0.32
CS-227ENST00000551441 TLNRD1Q9H1K6 362 aa13.06□□□□□ -0.32
CS-227ENST00000551441 MEGF9Q9H1U4 602 aa13.06□□□□□ -0.32
CS-227ENST00000551441 SP140LQ9H930 580 aa13.06□□□□□ -0.32
CS-227ENST00000551441 C19orf12Q9NSK7 152 aa13.06□□□□□ -0.32
CS-227ENST00000551441 SERTAD4Q9NUC0 356 aa13.06□□□□□ -0.32
CS-227ENST00000551441 DCAF13Q9NV06 445 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
CS-227ENST00000551441 K7EIL1 84 aa13.05□□□□□ -0.32
CS-227ENST00000551441 SIGLEC5O15389 551 aa13.05□□□□□ -0.32
CS-227ENST00000551441 TIPRLO75663 272 aa13.05□□□□□ -0.32
CS-227ENST00000551441 ACAA1P09110 424 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
CS-227ENST00000551441 RRM2P31350 389 aa13.05□□□□□ -0.32
CS-227ENST00000551441 FMO3P31513 532 aa13.05□□□□□ -0.32
CS-227ENST00000551441 CAPZA1P52907 286 aa13.05□□□□□ -0.32
CS-227ENST00000551441 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
CS-227ENST00000551441 CRMP1Q14194 572 aa13.05□□□□□ -0.32
CS-227ENST00000551441 TMEM95Q3KNT9 176 aa13.05□□□□□ -0.32
CS-227ENST00000551441 DEFB121Q5J5C9 76 aa13.05□□□□□ -0.32
CS-227ENST00000551441 Q6ZS46 218 aa13.05□□□□□ -0.32
CS-227ENST00000551441 PGAM5Q96HS1 289 aa13.05□□□□□ -0.32
CS-227ENST00000551441 RNF170Q96K19 258 aa13.05□□□□□ -0.32
CS-227ENST00000551441 DMRTB1Q96MA1 342 aa13.05□□□□□ -0.32
CS-227ENST00000551441 AMELYQ99218 206 aa13.05□□□□□ -0.32
CS-227ENST00000551441 RTL8AQ9BWD3 113 aa13.05□□□□□ -0.32
CS-227ENST00000551441 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
CS-227ENST00000551441 YY1AP1Q9H869 796 aa13.05□□□□□ -0.32
CS-227ENST00000551441 MRGBPQ9NV56 204 aa13.05□□□□□ -0.32
CS-227ENST00000551441 NLKQ9UBE8 527 aa13.05□□□□□ -0.32
CS-227ENST00000551441 SAMD4AQ9UPU9 718 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
CS-227ENST00000551441 IGKV1D-17A0A075B6S4 117 aa13.04□□□□□ -0.32
CS-227ENST00000551441 ANXA2P2A6NMY6 339 aa13.04□□□□□ -0.32
CS-227ENST00000551441 OR2AT4A6NND4 320 aa13.04□□□□□ -0.32
CS-227ENST00000551441 CD33P20138 364 aa13.04□□□□□ -0.32
CS-227ENST00000551441 GLRA1P23415 457 aa13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35 ms