RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549194.1

GNPTAB-204, Transcript of N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase subunits alpha and beta, humanhuman

TSL 3

Gene GNPTAB, Length 570 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPTAB-204ENST00000549194 TBL1XR1Q9BZK7 514 aa7.31□□□□□ -1.24
GNPTAB-204ENST00000549194 CEP295Q9C0D2 2601 aa7.31□□□□□ -1.24
GNPTAB-204ENST00000549194 CNTD2Q9H8S5 307 aa7.31□□□□□ -1.24
GNPTAB-204ENST00000549194 MOB1AQ9H8S9 216 aa7.31□□□□□ -1.24
GNPTAB-204ENST00000549194 CYTL1Q9NRR1 136 aa7.31□□□□□ -1.24
GNPTAB-204ENST00000549194 PNO1Q9NRX1 252 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
GNPTAB-204ENST00000549194 UQCC1Q9NVA1 299 aa7.31□□□□□ -1.24
GNPTAB-204ENST00000549194 LPAR3Q9UBY5 353 aa7.31□□□□□ -1.24
GNPTAB-204ENST00000549194 PISDQ9UG56 409 aa7.31□□□□□ -1.24
GNPTAB-204ENST00000549194 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
GNPTAB-204ENST00000549194 WIF1Q9Y5W5 379 aa7.31□□□□□ -1.24
GNPTAB-204ENST00000549194 LILRA5A6NI73 299 aa7.3□□□□□ -1.24
GNPTAB-204ENST00000549194 ZNF705EA8MWA4 302 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
GNPTAB-204ENST00000549194 TMEM14DPA8MWL7 114 aa7.3□□□□□ -1.24
GNPTAB-204ENST00000549194 PRSS44E7EML9 344 aa7.3□□□□□ -1.24
GNPTAB-204ENST00000549194 NPIPA5E9PKD4 350 aa7.3□□□□□ -1.24
GNPTAB-204ENST00000549194 P2RY10O00398 339 aa7.3□□□□□ -1.24
GNPTAB-204ENST00000549194 TSPAN2O60636 221 aa7.3□□□□□ -1.24
GNPTAB-204ENST00000549194 NUDT14O95848 222 aa7.3□□□□□ -1.24
GNPTAB-204ENST00000549194 ACTL6AO96019 429 aa7.3□□□□□ -1.24
GNPTAB-204ENST00000549194 IGKV3-11P04433 115 aa7.3□□□□□ -1.24
GNPTAB-204ENST00000549194 THBDP07204 575 aa7.3□□□□□ -1.24
GNPTAB-204ENST00000549194 FAM157CP0CG43 387 aa7.3□□□□□ -1.24
GNPTAB-204ENST00000549194 ZNF20P17024 532 aa7.3□□□□□ -1.24
GNPTAB-204ENST00000549194 ADCYAP1P18509 176 aa7.3□□□□□ -1.24
GNPTAB-204ENST00000549194 ABCD3P28288 659 aa7.3□□□□□ -1.24
GNPTAB-204ENST00000549194 CD1CP29017 333 aa7.3□□□□□ -1.24
GNPTAB-204ENST00000549194 ECI1P42126 302 aa7.3□□□□□ -1.24
GNPTAB-204ENST00000549194 RPL35P42766 123 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
GNPTAB-204ENST00000549194 GABRA4P48169 554 aa7.3□□□□□ -1.24
GNPTAB-204ENST00000549194 MEOX2P50222 304 aa7.3□□□□□ -1.24
GNPTAB-204ENST00000549194 CAV2P51636 162 aa7.3□□□□□ -1.24
GNPTAB-204ENST00000549194 PNLIPRP2P54317 469 aa7.3□□□□□ -1.24
GNPTAB-204ENST00000549194 GFRA1P56159 465 aa7.3□□□□□ -1.24
GNPTAB-204ENST00000549194 RAB5BP61020 215 aa7.3□□□□□ -1.24
GNPTAB-204ENST00000549194 PLCXD2Q0VAA5 305 aa7.3□□□□□ -1.24
GNPTAB-204ENST00000549194 PEA15Q15121 130 aa7.3□□□□□ -1.24
GNPTAB-204ENST00000549194 ELAVL1Q15717 326 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
GNPTAB-204ENST00000549194 ZNF542PQ5EBM4 170 aa7.3□□□□□ -1.24
GNPTAB-204ENST00000549194 CHCHD2P9Q5T1J5 151 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
GNPTAB-204ENST00000549194 OR10K2Q6IF99 312 aa7.3□□□□□ -1.24
GNPTAB-204ENST00000549194 ZNF529Q6P280 563 aa7.3□□□□□ -1.24
GNPTAB-204ENST00000549194 ZNF585AQ6P3V2 769 aa7.3□□□□□ -1.24
GNPTAB-204ENST00000549194 TMEM71Q6P5X7 295 aa7.3□□□□□ -1.24
GNPTAB-204ENST00000549194 DBX2Q6ZNG2 339 aa7.3□□□□□ -1.24
GNPTAB-204ENST00000549194 RHOUQ7L0Q8 258 aa7.3□□□□□ -1.24
GNPTAB-204ENST00000549194 DCXRQ7Z4W1 244 aa7.3□□□□□ -1.24
GNPTAB-204ENST00000549194 MARCH3Q86UD3 253 aa7.3□□□□□ -1.24
GNPTAB-204ENST00000549194 NAA40Q86UY6 237 aa7.3□□□□□ -1.24
GNPTAB-204ENST00000549194 COMMD1Q8N668 190 aa7.3□□□□□ -1.24
GNPTAB-204ENST00000549194 ADAD2Q8NCV1 583 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
GNPTAB-204ENST00000549194 OR10H5Q8NGA6 315 aa7.3□□□□□ -1.24
GNPTAB-204ENST00000549194 OR4K15Q8NH41 348 aa7.3□□□□□ -1.24
GNPTAB-204ENST00000549194 LILRB1Q8NHL6 650 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
GNPTAB-204ENST00000549194 KCNG3Q8TAE7 436 aa7.3□□□□□ -1.24
GNPTAB-204ENST00000549194 GPR119Q8TDV5 335 aa7.3□□□□□ -1.24
GNPTAB-204ENST00000549194 ST7LQ8TDW4 575 aa7.3□□□□□ -1.24
GNPTAB-204ENST00000549194 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa7.3□□□□□ -1.24
GNPTAB-204ENST00000549194 ZNF721Q8TF20 911 aa7.3□□□□□ -1.24
GNPTAB-204ENST00000549194 GLYATL2Q8WU03 294 aa7.3□□□□□ -1.24
GNPTAB-204ENST00000549194 ASB10Q8WXI3 467 aa7.3□□□□□ -1.24
GNPTAB-204ENST00000549194 MRGPRFQ96AM1 343 aa7.3□□□□□ -1.24
GNPTAB-204ENST00000549194 FGGYQ96C11 551 aa7.3□□□□□ -1.24
GNPTAB-204ENST00000549194 SMIM8Q96KF7 97 aa7.3□□□□□ -1.24
GNPTAB-204ENST00000549194 C2orf50Q96LR7 162 aa7.3□□□□□ -1.24
GNPTAB-204ENST00000549194 RNF126Q9BV68 326 aa7.3□□□□□ -1.24
GNPTAB-204ENST00000549194 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
GNPTAB-204ENST00000549194 GPR27Q9NS67 375 aa7.3□□□□□ -1.24
GNPTAB-204ENST00000549194 LANCL2Q9NS86 450 aa7.3□□□□□ -1.24
GNPTAB-204ENST00000549194 SLC22A11Q9NSA0 550 aa7.3□□□□□ -1.24
GNPTAB-204ENST00000549194 FAM206AQ9NX38 181 aa7.3□□□□□ -1.24
GNPTAB-204ENST00000549194 RCC2Q9P258 522 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
GNPTAB-204ENST00000549194 MYEF2Q9P2K5 600 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
GNPTAB-204ENST00000549194 CTSFQ9UBX1 484 aa7.3□□□□□ -1.24
GNPTAB-204ENST00000549194 NPIPA1Q9UND3 350 aa7.3□□□□□ -1.24
GNPTAB-204ENST00000549194 GPR132Q9UNW8 380 aa7.3□□□□□ -1.24
GNPTAB-204ENST00000549194 FLVCR1Q9Y5Y0 555 aa7.3□□□□□ -1.24
GNPTAB-204ENST00000549194 RP1P56715 2156 aa7.29□□□□□ -1.24
GNPTAB-204ENST00000549194 IGKV3D-11A0A0A0MRZ8 115 aa7.29□□□□□ -1.24
GNPTAB-204ENST00000549194 TRAV20A0A0B4J274 112 aa7.29□□□□□ -1.24
GNPTAB-204ENST00000549194 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa7.29□□□□□ -1.24
GNPTAB-204ENST00000549194 WIPF3A6NGB9 483 aa7.29□□□□□ -1.24
GNPTAB-204ENST00000549194 SMAD9O15198 467 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
GNPTAB-204ENST00000549194 SIGLEC5O15389 551 aa7.29□□□□□ -1.24
GNPTAB-204ENST00000549194 YKT6O15498 198 aa7.29□□□□□ -1.24
GNPTAB-204ENST00000549194 SYT7O43581 403 aa7.29□□□□□ -1.24
GNPTAB-204ENST00000549194 SSX5O60225 188 aa7.29□□□□□ -1.24
GNPTAB-204ENST00000549194 DDAH2O95865 285 aa7.29□□□□□ -1.24
GNPTAB-204ENST00000549194 PLGP00747 810 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
GNPTAB-204ENST00000549194 PMP2P02689 132 aa7.29□□□□□ -1.24
GNPTAB-204ENST00000549194 S100A8P05109 93 aa7.29□□□□□ -1.24
GNPTAB-204ENST00000549194 LIPCP11150 499 aa7.29□□□□□ -1.24
GNPTAB-204ENST00000549194 GNALP38405 381 aa7.29□□□□□ -1.24
GNPTAB-204ENST00000549194 CAPZBP47756 277 aa7.29□□□□□ -1.24
GNPTAB-204ENST00000549194 ARHGDIBP52566 201 aa7.29□□□□□ -1.24
GNPTAB-204ENST00000549194 EMP2P54851 167 aa7.29□□□□□ -1.24
GNPTAB-204ENST00000549194 SUMO3P55854 103 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
GNPTAB-204ENST00000549194 TAS2R46P59540 309 aa7.29□□□□□ -1.24
GNPTAB-204ENST00000549194 PDZK1IP1Q13113 114 aa7.29□□□□□ -1.24
GNPTAB-204ENST00000549194 UNC119Q13432 240 aa7.29□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 97 ms