RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549143.5

CS-215, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 2,811 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-215ENST00000549143 FLVCR2Q9UPI3 526 aa7.3□□□□□ -1.24
CS-215ENST00000549143 TTLL8A6PVC2 850 aa7.29□□□□□ -1.24
CS-215ENST00000549143 RAB27BO00194 218 aa7.29□□□□□ -1.24
CS-215ENST00000549143 TMEM127O75204 238 aa7.29□□□□□ -1.24
CS-215ENST00000549143 TOXO94900 526 aa7.29□□□□□ -1.24
CS-215ENST00000549143 CRYABP02511 175 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
CS-215ENST00000549143 GTF2F2P13984 249 aa7.29□□□□□ -1.24
CS-215ENST00000549143 HOXC12P31275 282 aa7.29□□□□□ -1.24
CS-215ENST00000549143 BTCP35070 178 aa7.29□□□□□ -1.24
CS-215ENST00000549143 SCAND1P57086 179 aa7.29□□□□□ -1.24
CS-215ENST00000549143 CBX3Q13185 183 aa7.29□□□□□ -1.24
CS-215ENST00000549143 KLF9Q13886 244 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
CS-215ENST00000549143 TMEM53Q6P2H8 277 aa7.29□□□□□ -1.24
CS-215ENST00000549143 Q6ZT83 130 aa7.29□□□□□ -1.24
CS-215ENST00000549143 Q6ZTK2 550 aa7.29□□□□□ -1.24
CS-215ENST00000549143 SEM1Q6ZVN7 128 aa7.29□□□□□ -1.24
CS-215ENST00000549143 AKAP14Q86UN6 197 aa7.29□□□□□ -1.24
CS-215ENST00000549143 OR4S1Q8NGB4 309 aa7.29□□□□□ -1.24
CS-215ENST00000549143 BORCS8Q96FH0 119 aa7.29□□□□□ -1.24
CS-215ENST00000549143 POM121L2Q96KW2 1035 aa7.29□□□□□ -1.24
CS-215ENST00000549143 HRASLSQ9HDD0 168 aa7.29□□□□□ -1.24
CS-215ENST00000549143 RAB22AQ9UL26 194 aa7.29□□□□□ -1.24
CS-215ENST00000549143 hCG_38984A0A1B0GV85 526 aa7.29□□□□□ -1.24
CS-215ENST00000549143 LDLRAD4O15165 306 aa7.29□□□□□ -1.24
CS-215ENST00000549143 CTDSPLO15194 276 aa7.29□□□□□ -1.24
CS-215ENST00000549143 SOCS1O15524 211 aa7.29□□□□□ -1.24
CS-215ENST00000549143 CCNKO75909 580 aa7.29□□□□□ -1.24
CS-215ENST00000549143 BPNT1O95861 308 aa7.29□□□□□ -1.24
CS-215ENST00000549143 TCRBP04435 133 aa7.29□□□□□ -1.24
CS-215ENST00000549143 EIF2B2P49770 351 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
CS-215ENST00000549143 MALLQ13021 153 aa7.29□□□□□ -1.24
CS-215ENST00000549143 IGFBP7Q16270 282 aa7.29□□□□□ -1.24
CS-215ENST00000549143 CDNFQ49AH0 187 aa7.29□□□□□ -1.24
CS-215ENST00000549143 PRR30Q53SZ7 412 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
CS-215ENST00000549143 AGAP6Q5VW22 663 aa7.29□□□□□ -1.24
CS-215ENST00000549143 OLFML2AQ68BL7 652 aa7.29□□□□□ -1.24
CS-215ENST00000549143 NCCRP1Q6ZVX7 275 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
CS-215ENST00000549143 GVQW1Q8N7I0 195 aa7.29□□□□□ -1.24
CS-215ENST00000549143 OR51T1Q8NGJ9 327 aa7.29□□□□□ -1.24
CS-215ENST00000549143 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
CS-215ENST00000549143 GPR137Q96N19 417 aa7.29□□□□□ -1.24
CS-215ENST00000549143 C1QTNF5Q9BXJ0 243 aa7.29□□□□□ -1.24
CS-215ENST00000549143 OR10A4Q9H209 315 aa7.29□□□□□ -1.24
CS-215ENST00000549143 DPAGT1Q9H3H5 408 aa7.29□□□□□ -1.24
CS-215ENST00000549143 GLRX2Q9NS18 164 aa7.29□□□□□ -1.24
CS-215ENST00000549143 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa7.28□□□□□ -1.24
CS-215ENST00000549143 FIGNL2A6NMB9 653 aa7.28□□□□□ -1.24
CS-215ENST00000549143 GSTZ1O43708 216 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
CS-215ENST00000549143 CDC14BO60729 498 aa7.28□□□□□ -1.24
CS-215ENST00000549143 IL2RAP01589 272 aa7.28□□□□□ -1.24
CS-215ENST00000549143 CD3DP04234 171 aa7.28□□□□□ -1.24
CS-215ENST00000549143 SERPINA5P05154 406 aa7.28□□□□□ -1.24
CS-215ENST00000549143 GABRA1P14867 456 aa7.28□□□□□ -1.24
CS-215ENST00000549143 GABRR1P24046 479 aa7.28□□□□□ -1.24
CS-215ENST00000549143 RCVRNP35243 200 aa7.28□□□□□ -1.24
CS-215ENST00000549143 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
CS-215ENST00000549143 PDCD1Q15116 288 aa7.28□□□□□ -1.24
CS-215ENST00000549143 RFPL4BQ6ZWI9 263 aa7.28□□□□□ -1.24
CS-215ENST00000549143 DUSP18Q8NEJ0 188 aa7.28□□□□□ -1.24
CS-215ENST00000549143 OR56B4Q8NH76 319 aa7.28□□□□□ -1.24
CS-215ENST00000549143 KCNG3Q8TAE7 436 aa7.28□□□□□ -1.24
CS-215ENST00000549143 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP7.28□□□□□ -1.241e-10■■□□□ 11.5
CS-215ENST00000549143 APOBEC3DQ96AK3 386 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
CS-215ENST00000549143 DMRTB1Q96MA1 342 aa7.28□□□□□ -1.24
CS-215ENST00000549143 TP63Q9H3D4 680 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
CS-215ENST00000549143 GP6Q9HCN6 339 aa7.28□□□□□ -1.24
CS-215ENST00000549143 ETAA1Q9NY74 926 aa7.28□□□□□ -1.24
CS-215ENST00000549143 CRIM1Q9NZV1 1036 aa7.28□□□□□ -1.24
CS-215ENST00000549143 GPR160Q9UJ42 338 aa7.28□□□□□ -1.24
CS-215ENST00000549143 TINAGQ9UJW2 476 aa7.28□□□□□ -1.24
CS-215ENST00000549143 KALRNO60229 2985 aa7.28□□□□□ -1.24
CS-215ENST00000549143 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa7.28□□□□□ -1.24
CS-215ENST00000549143 OR14I1A6ND48 311 aa7.28□□□□□ -1.24
CS-215ENST00000549143 WIPF3A6NGB9 483 aa7.28□□□□□ -1.24
CS-215ENST00000549143 H7C417 338 aa7.28□□□□□ -1.24
CS-215ENST00000549143 M0QYG6 137 aa7.28□□□□□ -1.24
CS-215ENST00000549143 XRCC2O43543 280 aa7.28□□□□□ -1.24
CS-215ENST00000549143 TNFSF13O75888 250 aa7.28□□□□□ -1.24
CS-215ENST00000549143 HTR3BO95264 441 aa7.28□□□□□ -1.24
CS-215ENST00000549143 CSTBP04080 98 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
CS-215ENST00000549143 MGMTP16455 207 aa7.28□□□□□ -1.24
CS-215ENST00000549143 BMP5P22003 454 aa7.28□□□□□ -1.24
CS-215ENST00000549143 CFPP27918 469 aa7.28□□□□□ -1.24
CS-215ENST00000549143 WNT5AP41221 380 aa7.28□□□□□ -1.24
CS-215ENST00000549143 RBP2P50120 134 aa7.28□□□□□ -1.24
CS-215ENST00000549143 SNU13P55769 128 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
CS-215ENST00000549143 AP3S2P59780 193 aa7.28□□□□□ -1.24
CS-215ENST00000549143 ERVS71-1P61550 626 aa7.28□□□□□ -1.24
CS-215ENST00000549143 CD83Q01151 205 aa7.28□□□□□ -1.24
CS-215ENST00000549143 NKPD1Q17RQ9 610 aa7.28□□□□□ -1.24
CS-215ENST00000549143 PLA1AQ53H76 456 aa7.28□□□□□ -1.24
CS-215ENST00000549143 CLVS2Q5SYC1 327 aa7.28□□□□□ -1.24
CS-215ENST00000549143 NSUN5P2Q63ZY6 315 aa7.28□□□□□ -1.24
CS-215ENST00000549143 RTL6Q6ICC9 239 aa7.28□□□□□ -1.24
CS-215ENST00000549143 OR2T2Q6IF00 324 aa7.28□□□□□ -1.24
CS-215ENST00000549143 OR52W1Q6IF63 320 aa7.28□□□□□ -1.24
CS-215ENST00000549143 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
CS-215ENST00000549143 C15orf40Q8WUR7 153 aa7.28□□□□□ -1.24
CS-215ENST00000549143 STARD4Q96DR4 205 aa7.28□□□□□ -1.24
CS-215ENST00000549143 SEH1LQ96EE3 360 aa7.28□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.8 ms